基因總覽
TOX3（TOX high mobility group box family member 3）是蛋白質編碼基因，所產生的蛋白質長 576 個胺基酸，屬於含有 high mobility group box（HMG box）的蛋白質。其已知特色包括可參與 p300/CBP-mediated transcription complex 的轉錄共活化，並具有 DNA 結合區域。蛋白質序列中另有數段被註解為無序區域。這些基本特徵構成 TOX3 蛋白質的分子概貌；其轉錄調控作用及相關生物學意義見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000219746 ★ | 52,436,417–52,547,143 | 7 |
| ENST00000407228 | 52,436,417–52,547,802 | 8 |
| ENST00000873102 | 52,436,417–52,547,173 | 7 |
| ENST00000912162 | 52,436,417–52,547,173 | 5 |
| ENST00000912163 | 52,436,417–52,547,173 | 8 |
| ENST00001140070 | 52,436,417–52,547,173 | 7 |
| ENST00000563091 | 52,450,348–52,547,419 | 4 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TOX3 是 p300/CBP-mediated transcription complex 的轉錄共活化因子，能促進經由 cAMP response element（CRE）位點的轉錄活化。來源亦指出，TOX3 可刺激 estrogen-responsive promoter 或 BCL-2 promoter 的轉錄，並與染色質上的 estrogen-responsive C3 promoter 區域相關聯，顯示其作用涵蓋多種轉錄調控情境。
在細胞存活相關的基因表現方面，TOX3 可透過誘導抗凋亡轉錄本、抑制促凋亡轉錄本而提供細胞死亡保護。與 CITED1 的互作會增加 estrogen-response element（ERE）依賴的轉錄作用及細胞死亡保護；來源描述的是功能增強，並未提供更廣泛的適用條件。
在神經元中，TOX3 是去極化誘導 C-FOS promoter 轉錄活化所必需的因子。此項功能指向神經元受去極化刺激時的轉錄反應；來源未進一步界定其下游效應或其他細胞類型中的相同作用。因此，TOX3 的功能敘述包括 CRE 位點與特定 promoter 的轉錄調控，以及與抗凋亡表現相關的細胞保護作用，但各項描述應限於所列的調控元件與細胞情境。
Promoter 與基因調控
>TOX3 ENST00000219746 GRCh38 chr16:52547043-52548143 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCTGGCAGATAACTAAACTGGGGAGGGCGCAGATCTCACGGCCTCTCCACAACGTTCCCATTTAGTATA AAGCCCCTTCCCTTCGCCAAGGCTGAAGGCCAAACTCTCAGATTAACTCAAAGCAATAAAGCCGATGAGA AAAAAAATTAAATAAAAAGATGGAGCTTAAGAAAGATAAAGAAATAAAGAGGGGTGGGTGAGTGTAGAGT GGGGAAGTTAATCAGCTAGGACCTTTTAGGAAAATAGGGACATTTTCTCTCCCAGAGCAGTGAATGATCT GCCTAGATCCAGTTACTCAAATGCCTTTCGAATACAAACAAGAGCAAAGAGAATACGAAGAGAACCGACA CGAGGCTTCACCTGGGAAGCTTCAAGTCTGCCTACCTGTGAAAGGTCAGGCCCCAACACCCCTTCTGGGA AATCCTACAGGTGAACTTGGGGTCCCGGCTCCCGGCTACCGGGAGACACTCGTGCAGGTTGGCGTCTGGG TTAGGTGTGTCCACGCAGGGGACATTCGAAAGGCAAGGCGGGGTCGAGGAGAGGGGCCCGGGGACAGGCA CCCATGAAGAAGGAAGGGGGTCATGGGGAGGAAAGCGACAGGAAGGGAGCAGACGGCTTGGGGATGCTGG GGCCCGGGGAAGCTGTGGTCGCGCAGGAGGAGGGTGGGACACACGGGACGCAGGGCTGGCGTCCGCTTCG GCCGAGGAAAGGAGGGGAGAGAGGAGCGCTCCGAGGCAGTGGGGACAAAGAGGACCGGAGCGGGAAGGGG GGCGAGGTAGGGAGAAGAGGGGCCCCGGAGAGGGGGCGGCCGCGGCGGGGGTGATGGGGCCGGCGGGGCG GGGTGGGCGCTCCCGGAGGCGGTCCGGGCCGAGGAGCGCACCGGCGGGGCGGGCGGCGCGCCAGCTGCCC GCGGTGGGAGGGGCGGAGCGGCGGCGGCGCGGGGAGGGGACCGGCGGCTGAGGCAGGAGGGGGAGAAGGA GGGGAGGGGCCGGGCCCCTTGTCTCCGCGGCTCGTCTCCTCAGTCCGCCCGGGGAGGAGGAGGAGGAGCG GGGCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCAGCCTCGCCCAGCGCACCTGAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_BDFK4 · enhancer · 52545375–52545887 · regulatory
ENSR16_9QT5C · promoter · 52546156–52546434 · regulatory
ENSR16_83JP96 · enhancer · 52546992–52547132 · regulatory
ENSR16_9QT5M · promoter · 52547133–52547402 · regulatory
ENSR16_9QT5Q · enhancer · 52547403–52547791 · regulatory
ENSR16_754FK9 · promoter · 52547792–52547892 · regulatory
ENSR16_5GCPDH · CTCF_binding_site · 52548579–52548600 · regulatory
ENSR16_9QT67 · enhancer · 52549003–52549310 · regulatory
· motif · 52543762–52543776 · motif
· motif · 52543763–52543776 · motif
· motif · 52548581–52548597 · motif
在神經細胞中，GPR39 會上調 TOX3。來源未提供此調控的其他條件或作用機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：576 aa
TOX3 蛋白質長 576 個胺基酸，含有位於第 255 至 323 位胺基酸的 HMG box，並註解為 DNA 結合區域。另有三段序列被預測為無序區域，分別位於第 189 至 258、第 422 至 443 及第 519 至 563 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TOX3 可形成同源二聚體，並與 CREB1 互作；此互作不依賴去極化。來源另述 TOX3 會與磷酸化形式的 CREB1 互作。TOX3 透過 C 端與 CREBBP 互作，此項關係標示為依相似性推定。TOX3 亦可透過 HGM box 與 CITED1 的 C 端互作；該互作與 ERE 依賴的轉錄增強及細胞死亡保護增加相關。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TOX3 是 p300/CBP-mediated transcription complex 的轉錄共活化因子，可促進 CRE 位點的轉錄活化；它能誘導抗凋亡、抑制促凋亡轉錄本以保護細胞，並刺激 estrogen-responsive 或 BCL-2 promoter 的轉錄。在神經元中，TOX3 是去極化誘導 C-FOS promoter 活化所必需，且會與染色質上的 estrogen-responsive C3 promoter 區域相關聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional coactivator of the p300/CBP-mediated transcription complex. Activates transactivation through cAMP response element (CRE) sites. Protects against cell death by inducing antiapoptotic and repressing pro-apoptotic transcripts. Stimulates transcription from the estrogen-responsive or BCL-2 promoters. Required for depolarization-induced transcription activation of the C-FOS promoter in neurons. Associates with chromatin to the estrogen-responsive C3 promoter region PMID 21172805 ↗ |
| 交互作用 | TOX3 可形成同源二聚體，並與 CREB1 互作，該互作不依賴去極化；亦與磷酸化 CREB1 互作。TOX3 透過 C 端與 CREBBP 互作，此關係依相似性推定；並透過 HGM box 與 CITED1 的 C 端互作，後者會增強 ERE 依賴的轉錄及細胞死亡保護。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with CREB1; the interaction is not depolarization dependent. Interacts with CREBBP (via C-terminus) (By similarity). Interacts (via HGM box) with CITED1 (via C-terminus); the interaction increases estrogen-response element (ERE)-dependent transcription and protection against cell death. Interacts with CREB1 (phosphorylated form) PMID 21172805 ↗ |
| 細胞定位 | TOX3 定位於細胞核。 | 推論支持 | |
| 調控 | 在神經細胞中，GPR39 會上調 TOX3；來源未提供其他調控條件或機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCTCCGCGGCTCGTCTCCTCAGTCCGCCCGGGGAGGAGG40AGGAGGAGCGGGGCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCA80GCCTCGCCCAGCGCACCTGAACTCGCCTCGCCGACCCGGG120CCCCAGCGCCGCGCCCCGCGCCCCCGGCGCCCGGCCCGCG160CGCAGCGCTGCCTCGGTGCCCCGGCGGGGCGCGTCCCCCC200GGCCGCCTCCCGCTCTCCCGCGGCTCGCGTGGCCGCGCCT240TTGTGTGCGGCGGCCGCGGCTCCCGAGCTCCTCGGGCTCT280GGGTCCCGGCGCCCCTCCGGCCGCGAGTCCCACGCGCCAC320CCCCGGGCGCCCTCGACGGTGGATCTAGCGGCGGCGAGGA360GGCGGGTCCCGGCCCCGGCGAACCCCAGTCCCGGCCCCCG400GCCCCGGGCCCAGCTTCGGCATGGATGTGAGGTTCTACCC440CGCGGCGGCCGGGGACCCTGCCAGCCTGGACTTCGCGCAG480TGCCTGGGGTACTACGGCTACAGCAAGTTTGGAAATAATA520ATAACTATATGAATATGGCTGAGGCGAACAATGCGTTCTT560CGCTGCCAGTGAGCAGACATTCCACACACCAAGCCTTGGG600GACGAGGAATTCGAAATTCCACCAATCACGCCTCCTCCAG640AGTCAGACCCTGCCCTAGGCATGCCGGATGTACTGCTACC680CTTTCAAGCCCTCAGCGATCCATTGCCTTCCCAGGGAAGT720GAATTCACACCCCAGTTTCCCCCTCAAAGCCTGGACCTCC760CTTCCATTACAATCTCAAGAAATCTCGTGGAACAAGATGG800CGTGCTTCATAGCAGTGGGTTGCATATGGATCAGAGCCAC840ACACAAGTGTCCCAGTACCGGCAGGATCCCTCCCTGATCA880TGCGGTCCATCGTCCACATGACCGATGCTGCGCGTTCTGG920GGTCATGCCTCCTGCCCAGCTCACCACCATCAACCAGTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。