演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TOR2AFLJ14771

torsin family 2 member A

TOR2A 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens9q34.11UniProt Q5JU69
OFFICIAL SYMBOL
TOR2A
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q5JU69
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TOR2A 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 torsin family 2 member A。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q34.11。

Official symbol
TOR2A
Gene name
torsin family 2 member A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11996
UniProt
Q5JU69
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ14771TORP1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.11
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTOR2Apq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:127,731,516–127,735,355
Gene span
3,840 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000373284 ★127,731,524–127,735,2945
ENST00000336067127,731,516–127,735,3394
ENST00000862308127,731,516–127,735,3395
ENST00000862309127,731,516–127,735,3392
ENST00000951408127,731,516–127,735,3554
ENST00001118086127,731,516–127,735,3393
ENST00001138083127,731,516–127,735,3395
ENST00000373281127,731,525–127,735,3393
ENST00000463577127,731,525–127,735,3392

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 127735294 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TOR2A ENST00000373284 GRCh38 chr9:127735194-127736294 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACTATGTGTTGAGGTTGGTAGGGACAGGGTCTTT
GAGGTGGGCCATGAAGGCTGTTGTCTTGGTTCCCTTACTCCAGTGGGTGGGGGAGGTGGGCAACGTGGAT
CAAAACGAATCCAGGCCAAGCTGGAGGCCTAGGGAGCCTGCGCGCTGAACCTCAAACGTCTGGAGTCCTT
TGCCTTCTGAATCCTTTGACCAAGAGAGGCTGATAACATGCAACCACGCACTACGGCTCTGGTTGCAGCC
AGACTTGGGTTTAGTTCTATTGTTTACCAGCTGCGTGACATTGGGTAAGAGGCTTAACCTCTTCGGTCCC
AAATTCCTCCTTATTAAGATGGGGACAACAACAGAACCCATCTCCCAGGACTGATACCAAGCATTTGGCC
ACAGTTGCTGCTAGGTGAGGGACAGTCCTGTTTAATACACAACGGAATGTTGATGATCATGTATTGACCA
CTTTCTGAGCCAGACAATTTGTGTGCCTTTATCTCATTGGAACACCACCATTTCTCTGGATAGCAGATAC
TATTACCATATTATAAGGTATATAGGCACTTAGCACTAATGGCACAGAGTAAGTGCTCACCAAAAGCTGT
TAGTGAGGGCACTTTTGTCATATAGAAGAAAAAAGGAGCATGGAAAAGGCGCTTTGCAAGGTGTAAGGTT
CCGCACAAGTTTTTGCTGTAATTGTTACGTCGCCCTTTGTGGTCGTGATCCTTTATTTATTCTTTCTGAG
CCACTACGATGGTCCCCTAGTTACCGTGGCCATGGAAACGCGGCCCGCCGTCCCGGATTGGACGGTTCGC
GGGTTCCCCCTGGAGGCCACCTTCTGGTCCTGCTGCGGAACGACGGGCGGGCCTTGGAGGCGGGGAGAGG
AGCGTCGGGAGTTGTAGGCGATGGGCGTGGCTGCTGCGGAGCGGTGCACGCCGGGAGTTGCAGTTCCCGG
GCGAGGCAGTTGACTGCCCCACAACGAGCTCGGGCCTCACCCGGATGGCGGCTGCGACGCGCGGCTGCCG
GCCCTGGGGCTCGCTCCTCGGGCTGCTCGGGCTGGTCTCGGCCGCGGCCGC
TOR2A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TOR2A_1 ↗9:127,735,294負股127,735,284–127,735,343

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_6K2L7B · CTCF_binding_site · 127734749–127734787 · regulatory

ENSR9_93TNWH · promoter · 127735282–127735576 · regulatory

ENSR9_53537HR · CTCF_binding_site · 127735435–127735456 · regulatory

ENSR9_BXCGB · enhancer · 127735577–127736288 · regulatory

ENSR9_53537RT · CTCF_binding_site · 127737175–127737196 · regulatory

ENSR9_CGN8H · enhancer · 127739897–127741307 · regulatory

· motif · 127734701–127734716 · motif

· motif · 127734751–127734767 · motif

· motif · 127734768–127734784 · motif

· motif · 127734794–127734807 · motif

· motif · 127734794–127734807 · motif

· motif · 127734807–127734819 · motif

· motif · 127734809–127734816 · motif

· motif · 127734814–127734829 · motif

· motif · 127734814–127734831 · motif

· motif · 127734849–127734862 · motif

· motif · 127735062–127735076 · motif

· motif · 127735132–127735141 · motif

· motif · 127735354–127735364 · motif

· motif · 127735389–127735399 · motif

· motif · 127735437–127735453 · motif

· motif · 127735485–127735500 · motif

· motif · 127735485–127735500 · motif

· motif · 127735550–127735565 · motif

· motif · 127737177–127737193 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:321 aa

1 aa321 aa訊號胜肽
依 Q5JU69 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TOR2A 的蛋白質產物 Torsin-2A 長 321 個胺基酸,具有位於第 1–26 位胺基酸的訊號序列。它屬於 ClpA/ClpB family 的 Torsin subfamily。

訊號胜肽1–26 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5JU69…

AlphaFold · Q5JU69

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum lumen

Torsin-2A 位於內質網腔;此定位註解未提供其他條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ14771TOR2A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Torsin-2A 可形成六聚體。資料亦註記它與 TOR1AIP1 互作,但此關係標示為依相似性推定。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用Torsin-2A 被註記可形成由六個亞基組成的同源六聚體,並與 TOR1AIP1 互作;其中與 TOR1AIP1 的互作標示為依相似性推定,並非此資料直接證實的互作。推論支持
證據與來源

Homohexamer. Interacts with TOR1AIP1 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Torsin-2A 的定位註解為內質網腔;此紀錄未提供定位所依賴的條件、實驗系統或其他定位變化資訊。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum lumen

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000373284 · 1,500 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAACGAGCTCGGGCCTCACCCGGATGGCGGCTGCGACGC40
41GCGGCTGCCGGCCCTGGGGCTCGCTCCTCGGGCTGCTCGG80
81GCTGGTCTCGGCCGCGGCCGCCGCCTGGGACCTGGCTTCC120
121CTGCGCTGCACCTTGGGCGCCTTTTGCGAATGCGACTTCC160
161GGCCCGACTTGCCGGGTCTGGAGTGTGACCTGGCTCAGCA200
201CCTGGCCGGCCAGCATCTGGCCAAGGCGCTGGTGGTGAAG240
241GCGCTGAAGGCCTTTGTGCGGGACCCAGCCCCCACCAAGC280
281CGCTGGTCCTCTCCCTGCACGGCTGGACCGGCACCGGCAA320
321ATCCTATGTCAGCTCCCTGCTGGCGCACTACCTCTTCCAG360
361GGCGGCCTCCGCAGCCCCCGCGTGCACCACTTTTCTCCCG400
401TCCTCCACTTCCCCCACCCCAGCCACATCGAGCGCTACAA440
441GAAGGATCTGAAGAGCTGGGTCCAAGGGAACCTCACTGCC480
481TGTGGCCGCTCCCTCTTCCTCTTCGATGAGATGGACAAGA520
521TGCCCCCAGGCCTGATGGAAGTCCTGCGGCCTTTCCTGGG560
561CTCCTCCTGGGTGGTATACGGGACCAATTACCGCAAAGCC600
601ATCTTCATCTTCATCAGCAACACGGGTGGCAAGCAGATCA640
641ACCAGGTGGCATTGGAGGCGTGGCGCAGCCGGCGGGACCG680
681CGAGGAGATCCTCCTGCAGGAGCTGGAGCCGGTCATCTCC720
721CGCGCGGTGCTGGACAACCCGCACCATGGCTTCTCAAACT760
761CGGGCATCATGGAAGAGCGCCTCCTAGACGCAGTGGTGCC800
801CTTCCTCCCGCTCCAGCGGCACCACGTCCGGCACTGCGTG840
841CTCAACGAGCTGGCCCAGCTGGGCCTGGAGCCAAGGGATG880
881AGGTTGTCCAGGCTGTGCTGGACAGCACCACCTTCTTCCC920
921TGAAGACGAGCAGCTCTTCTCCTCCAACGGCTGCAAGACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。