演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TOR1BDQ1

torsin family 1 member B

TOR1B 編碼 torsin family 1 member B,屬於 torsin 家族;其產物可能協助分泌蛋白或膜蛋白正確摺疊,並參與非神經細胞核膜與內質網的完整性。

Homo sapiens9q34.11UniProt O14657
OFFICIAL SYMBOL
TOR1B
CHROMOSOME
9
UNIPROT
O14657
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TOR1B 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 torsin family 1 member B。其蛋白質產物 Torsin-1B 屬於 ClpA/ClpB 家族中的 Torsin subfamily,長度為 336 個胺基酸,並具有位於第 1 至第 24 個胺基酸的訊號區段。來源將其主要角色描述為可能協助分泌蛋白或膜蛋白正確摺疊,並指出它與非神經細胞的核膜及內質網完整性有關;具體作用方式見功能說明。

Official symbol
TOR1B
Gene name
torsin family 1 member B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11995
UniProt
O14657
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DQ1MGC4386

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.11
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTOR1Bpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:129,803,131–129,813,640
Gene span
10,510 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000259339 ★129,803,184–129,811,2815
ENST00000931518129,803,131–129,811,2805
ENST00000983640129,803,131–129,811,4245
ENST00001106568129,803,131–129,807,8613
ENST00001119447129,803,131–129,811,4244
ENST00001126626129,803,131–129,805,9182
ENST00001134401129,803,131–129,811,2815
ENST00000427860129,803,268–129,810,5183

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Torsin-1B 可能作為分子伴護蛋白,協助分泌蛋白及/或膜蛋白形成正確的摺疊構形。這項描述指出其可能參與蛋白質成熟過程,但來源未進一步說明受影響的特定蛋白質或摺疊步驟。

Torsin-1B 也參與非神經細胞的核膜與內質網完整性。此角色將其與這些細胞內膜結構的維持相連,但現有資料未提供更具體的作用機制或條件。

在非神經組織中,TOR1B 可能與 TOR1A 具有冗餘功能;來源以「可能」描述這種關係,因此不能據此視為已確立的完全替代作用。Torsin-1B 具有 ATP 水解活性,其反應為 ATP 與水轉化為 ADP、磷酸及氫離子。來源未進一步界定此反應如何連結至蛋白質摺疊或膜結構完整性的維持。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 129803184 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TOR1B ENST00000259339 GRCh38 chr9:129802184-129803284 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGACCCTGTCCCCAATATACATATCAGATAAGAAAAAAATATAAGAAAGTTTAAAAAAATTTTTTTTGG
CTTTTTTTTGTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCG
GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTA
CAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTGATTTTTTCTATTTTTCGTAGTGATGGGATTTCACTGTGTTAGCC
AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG
TGAGCCGCCGCGCCCGGCCAGCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGA
GTGCAGTGGCACGATCTCGGCTAACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAACC
TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCACACCCATCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG
GGGTTTCGCCACGTTGAGCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACATCAGGTGATCCGCCCGCTTCAGCTTCCC
AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCGCCCGGCCAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTA
GATATTTTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCGGCCTCCCAAAGTCC
TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCGAAAAAATTTTTTTAAAAGAAAAGGGAAACAAAACA
GTCTCCTACACCTTCGGACCACTCCCAAGAACGATGGCACCGCCCTCCTCTCCGCCCCTCACCAACATGG
CCGCCCCCAAGGGAGTGGGCGGGTCTGCGGGGCGGAAGTGACGCACGAGAGGAAGTCCGTCCTGCCGCTT
GGCCGCGGGGCGCCTGGCTCAGTGGCTTCTGCGGGCTTCGAGGAGCGGGATGTTGCGGGCTGGGTGGCTC
CGGGGCGCGGCGGCGCTGGCGCTGCTGCTGGCGGCCCGAGTGGTGGCGGCG
TOR1B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TOR1B_1 ↗9:129,803,184正股129,803,135–129,803,194

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_93WJ3P · promoter · 129802694–129803194 · regulatory

ENSR9_535JC4G · CTCF_binding_site · 129803349–129803370 · regulatory

ENSR9_535JC58 · CTCF_binding_site · 129803512–129803533 · regulatory

· motif · 129801846–129801855 · motif

· motif · 129802999–129803019 · motif

· motif · 129803004–129803024 · motif

· motif · 129803096–129803109 · motif

· motif · 129803096–129803109 · motif

· motif · 129803103–129803116 · motif

· motif · 129803122–129803133 · motif

· motif · 129803124–129803133 · motif

· motif · 129803183–129803200 · motif

· motif · 129803216–129803233 · motif

· motif · 129803351–129803367 · motif

· motif · 129803514–129803530 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:336 aa

1 aa336 aa訊號胜肽
依 O14657 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Torsin-1B 長 336 個胺基酸,屬於 ClpA/ClpB 家族的 Torsin subfamily。序列註解指出其第 1 至第 24 個胺基酸為訊號區段;來源未提供其他結構域或功能區域的描述。

訊號胜肽1–24 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14657…

AlphaFold · O14657

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum lumen;Nucleus membrane

Torsin-1B 位於內質網腔與核膜。 來源未描述其定位隨細胞狀態或其他條件改變的情形;另指出 TOR1AIP1 是 TOR1B 定位於核膜所必需,但不宜將 TOR1AIP1 的定位視為 TOR1B 的定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DQ1TOR1B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Torsin-1B 形成六聚體。它與 TOR1A 互作,而此互作可能具有神經組織特異性;也與 TOR1AIP1 互作,TOR1AIP1 是 TOR1B 位於核膜所必需的因子。此外,ATP 結合狀態下的 TOR1B 與 TOR1AIP2 互作,此關係與內質網完整性有關。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Torsin-1B 可能作為分子伴護蛋白,協助分泌蛋白及/或膜蛋白正確摺疊;它也參與非神經細胞核膜與內質網完整性,並可能在非神經組織中與 TOR1A 具有冗餘功能。含實驗來源
證據與來源

May serve as a molecular chaperone assisting in the proper folding of secreted and/or membrane proteins. Plays a role in non-neural cells nuclear envelope and endoplasmic reticulum integrity. May have a redundant function with TOR1A in non-neural tissues

PMID 23569223 ↗ · PMID 24275647 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)

PMID 23569223 ↗ · PMID 24275647 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Torsin-1B 形成六聚體,並與 TOR1A、TOR1AIP1 及 TOR1AIP2 互作;TOR1A 的互作可能限於神經組織,TOR1AIP1 是其定位於核膜所必需,而 ATP 結合狀態下與 TOR1AIP2 的互作與內質網完整性有關。含實驗來源
證據與來源

Homohexamer. Interacts with TOR1A; the interaction may be specific of neural tissues. Interacts with TOR1AIP1; TOR1AIP1 is required for TOR1B location on the nuclear membrane. Interacts (ATP-bound) with TOR1AIP2; important for endoplasmic reticulum integrity

PMID 15147511 ↗ · PMID 20015956 ↗ · PMID 24275647 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Torsin-1B 的細胞內定位包括內質網腔與核膜。含實驗來源
證據與來源

Endoplasmic reticulum lumen; Nucleus membrane

PMID 15147511 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000259339 · 2,738 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGGCTTCTGCGGGCTTCGAGGAGCGGGATGTTGCGGGC40
41TGGGTGGCTCCGGGGCGCGGCGGCGCTGGCGCTGCTGCTG80
81GCGGCCCGAGTGGTGGCGGCGTTCGAGCCCATCACCGTGG120
121GCCTAGCCATCGGGGCCGCGTCGGCCATCACCGGCTACCT160
161GTCCTACAATGACATCTACTGCCGCTTCGCCGAGTGCTGC200
201CGCGAGGAGCGGCCGCTCAACGCTTCGGCTCTCAAGCTGG240
241ATTTGGAGGAGAAGCTGTTTGGACAGCATCTAGCCACGGA280
281AGTGATTTTCAAGGCGCTGACTGGCTTCAGGAACAACAAA320
321AATCCCAAGAAACCACTGACCCTTTCCTTACACGGCTGGG360
361CTGGCACAGGCAAGAATTTTGTCAGTCAAATTGTGGCTGA400
401AAATCTTCACCCAAAAGGTCTGAAGAGTAACTTTGTCCAC440
441CTGTTTGTATCGACTCTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGA480
481TAAAACTGTACCAGGACCAGTTACAGAAGTGGATCCGCGG520
521TAATGTGAGTGCATGTGCGAACTCTGTTTTCATATTTGAC560
561GAGATGGATAAATTGCACCCCGGGATCATTGACGCAATCA600
601AGCCGTTTCTAGACTACTACGAGCAGGTTGACGGAGTGTC640
641TTACCGCAAAGCCATCTTCATCTTTCTCAGCAATGCAGGC680
681GGGGACCTTATAACTAAGACGGCTCTTGACTTTTGGCGGG720
721CCGGAAGAAAGAGGGAAGACATTCAGCTGAAGGACCTGGA760
761ACCTGTACTGTCTGTCGGAGTCTTCAATAATAAACACAGT800
801GGCCTGTGGCACAGTGGACTGATCGACAAAAACCTCATTG840
841ATTACTTTATCCCCTTCCTGCCTTTGGAGTACAGACATGT880
881GAAAATGTGTGTGAGGGCCGAGATGAGGGCCCGTGGTTCT920
921GCCATAGATGAAGACATTGTCACAAGAGTGGCAGAGGAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。