基因總覽
TOP3BP1 的正式名稱為 DNA topoisomerase III beta pseudogene 1，分類為假基因。自動化計算分析預測，這個基因與人類 topoisomerase (DNA) III beta 具有相似性，並稱其編碼與該酵素相似的蛋白質；然而，現有資料將此描述標示為預測，不能據此視為已確認的蛋白質產物或功能。此基因位於第 22 號染色體，資料分別記載其所在區域為 22q11.21 的免疫球蛋白 lambda 基因群，以及 22q11.22。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000420768 ★ | 22,223,187–22,224,566 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
TOP3BP1 的功能資訊來自自動化計算分析，屬於預測性描述。該分析預測此基因編碼一種與人類 topoisomerase (DNA) III beta 相似的蛋白質；來源並未提供實驗結果來確認這種蛋白質是否存在，或 TOP3BP1 是否實際執行所述作用。因此，相關機制應視為相似性推論，而非已證實的基因功能。
依來源對相似蛋白質的描述，topoisomerase (DNA) III beta 被認為可使超螺旋 DNA 鬆弛。這項作用被連結到 DNA 複製、轉錄與細胞分裂期間；但來源沒有進一步說明 TOP3BP1 是否參與這些過程、作用如何發生，或其對細胞活動的具體影響。
Promoter 與基因調控
>TOP3BP1 ENST00000420768 GRCh38 chr22:22224466-22225566 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCAGGAGACTGAGACATGAGGATCACTTGACCCCAGGAGGTCAAAGCTGCAGTGAGCCATGATCATGAC ACTGCACTCCAGTCTAGGGGACAGAAAAGACCCTGTCTCAAAACATTTTTTAAAAGGGGAAGAAAAGGGA CTACACACCAGAGGAGCCATAAGACCTAACCAGCAGGTACCAGCAGGAGTCAAGGGACTAGGCATGGGAC TGGATCATGAGGGTGGGTGATAGAGGGGGACCAGAACATGAAGATTAGATAAGGGTGAGTTTTATTGATG TGGGAGCATTCTGCCATCTGAGCACCCCACAAAATATCCCATTGATTGACTGTGTTGTTGACATCATGCT AGTTGAGTTAGTTTAGTAGGAAATGGCTAGCATGTTGGAGGCCTTCATAAGAAACATGCACTATAAAGGG TAGGAGATAATCTGTATGAAGATTCAGGGAACTGTCACGTGAGTACAGTTTTGAGTGCCTAAGTGGTCAA GGCAGGATGGGTCAGATCGTCCAAACATAATGCCTGGCAGAACTCTTCAGGTTTTGGGAACAGCATGTTC CACTTCTGGCCTATGTCGTTGGTCTACAGAAGGCTGCCACCTTTGAATGCAGCCTGGCGTAGAAAAGTCA TCTGCTGCCTGACAAGGCTGCAGTGAAAACAGCCCTGCTGCTTGGGCCATAAGACTCGGCAGAATTTAGG GGACTGGAGGGGTCGGTGGTAAGAAAAGATGCCATGTGGAATTTGCAGTGAGCTCCAGTGGGAGAATCAC AGCACAGGCCCTCCAGCCCTGCACTTAGCAGGGCTAAGTGCAGTCTGCAGTAATGAATTACATGTGTTTT GTAAAACAACTTCTGCAGTGCTGTTGGCCCTAGCGGAGGACCATAAGATACCTGTTGACCACACATTCAC ATCTGCCTATCACAAGGTAAGTTGTGTCAAGCCCACCAAGTCTTAAAGTTGGTTAGGCGCAACAGCAATC CATTGTTGAACAGCAGCATCAAGGTGAGTGCAGCCGCTCCCTCCTGTCCACAGGTAGCTGCAGTCTCTGT TCAGTGCCAACCCCTGCCTTGCACCAGGCTGGACTCTGAGGGGACCCCTCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
TOP3BP1 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000420768 ★ | processed_pseudogene | 1,380 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TOP3BP1 的功能描述來自自動化計算預測：分析推測它與人類 topoisomerase (DNA) III beta 相似，並稱其編碼相似蛋白質。該相似酵素被認為可在 DNA 複製、轉錄及細胞分裂期間鬆弛超螺旋 DNA；此功能並非 TOP3BP1 已確認的實驗結果。來源另記載此基因位於第 22 號染色體 22q11.21 的免疫球蛋白 lambda 基因群。 | 推論支持 | 證據與來源This gene was predicted by automated computational analysis. It encodes a protein with similarity to human topoisomerase (DNA) III beta, which is thought to relax supercoiled DNA upon replication, transcription, and cell division. This gene lies in the immunoglobulin lambda gene cluster on chromosome 22q11.21. |
DNA 與 RNA 序列
AAGGTGAGTGCAGCCGCTCCCTCCTGTCCACAGGTAGCTG40CAGTCTCTGTTCAGTGCCAACCCCTGCCTTGCACCAGGCT80GGACTCTGAGGGGACCCCTCACCCTGGCCTTTCCTGCACT120CATTGGCACTGAGACGAGAGACCCTGGATGTAGCTGGGGC160ACTGCTTAGGCCTCAGCCAGTGGTGCCACCCTCTCTCTGT200GTCAGAATCGAGCAGGCAACCCTAGTCCACCCTCAGGACC240TGGGCGCAGGTGTGCAGTGCTCCCTCTGGAGCTGAGTCAG280CAAGAGGATGCAGCAGTCGGGGGACCCACCCGGTGAGCGG320GCACCCCCAGTCAGCGTCCACCACTGTCCTCCATCCTCAT360CCTCGTCCTCATTACTGGAGGAGGGAGCGCATGTCCAGGC400AGGCAGGACAGAGCACCGAGCCAGACCAGGAATCAGCGGG440AGTGAGGCATCTGCCCACATTCACCGTGTGCTCTGCAGAA480AGCCCCCTCAGGCCTCAGTCTGCACCCAGGCTGCCCCGGG520AGTGAGACCCCATCCCTGCCCTCCTGCTGCCGCCAGAGTA560GCTGACAGGGTGGTCCCATGTGGCCCAGTGACATGAGGGT600CATGTGGCATTACCAGTAACAAGCTGGCAGCAAAGCAAAG640GGGGGATGGAGTCAGCTGAAACCCACTGGGATGGCGCCAG680CGAGGGGCCTTGAAAGTTGAGGAGGTTTCAGGTAAGCAGA720AAACAGGGGTAATGGCAGCCAGGAGCCGAAACATGAGCAA760GGCTGTCCCCAAGAGCAAGGCCAAGAAGAGTTCCTTCTGC800TGGGACGAGGGATCCAGGAGCTTGAGGCATTGGGAGCAGG840CAGCAGAGGGCAGGTGGGCACAGTGGGCGTGCCTTTACAG880GGCTCCCTTCTCCCGCCAGGCATGGGCTGCAACGAGTGTA920CGCACCCCTCCTGCCAGCACTCGCTGAGCATGCTGGGCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。