基因總覽
TOMM70 的正式名稱為 translocase of outer mitochondrial membrane 70，屬於蛋白質編碼基因，產物屬 Tom70 family。它是粒線體外膜上的單次跨膜蛋白，蛋白質長度為 608 個胺基酸。其序列包含多個 TPR 重複區，並具有位於膜間腔側的短區段與朝向細胞質的較長區段。這些基本特徵構成其作為粒線體外膜受體的分子基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000284320 ★ | 100,363,431–100,401,089 | 12 |
| ENST00000906284 | 100,363,431–100,401,423 | 11 |
| ENST00000906285 | 100,363,431–100,401,423 | 12 |
| ENST00000935871 | 100,363,431–100,401,423 | 9 |
| ENST00000935872 | 100,363,431–100,401,423 | 12 |
| ENST00000957325 | 100,363,431–100,401,423 | 11 |
| ENST00001144944 | 100,363,431–100,401,423 | 12 |
| ENST00001063334 | 100,363,463–100,401,423 | 12 |
| ENST00001110914 | 100,375,589–100,401,423 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TOMM70 是粒線體外膜蛋白轉位複合體（TOM complex）的受體，負責辨識由細胞質送往粒線體的前驅蛋白，並協助其轉位進入粒線體。這項輸送作用依賴伴護蛋白；HSPA8 與 HSP90AA1 均與 TOMM70 互作，且這些互作對前驅蛋白進口具有必要性。TOMM70 因而參與粒線體蛋白質進口流程，協助將在細胞質產生的前驅蛋白導向粒線體。
Promoter 與基因調控
>TOMM70 ENST00000284320 GRCh38 chr3:100400989-100402089 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATAAAAAGCTGTGAACTGAAATTACGATTTGGGAATGAGACGAGAAGAGGGCTGAGACTGCTACTGCAAA ACAACCCGGGGGGCGTGCGGATCAGAGCGAGATGTGGGCTGACGCAGAAATCAGCTCAAGATACAAATAC GCCAAGAAAGGCTCGAAGCCGGCGGGAACCCTGACGCTTCGCATTTCTACCAACTCAGTTTAAGAAACCC CTAACAACGCAGATGTCATCGCTTCGTTAATTGGTGCCGACGATGAGCCACAGCGACCACGCTCAAACCG TTTCGACTGCAGCCAACCTAGATGTGCCATTTCCACCTAGTCTTCTGCCATCGCTATCTCCCCTATAACC TCAAATTCGTCCAAACTAAAATCTCGCTATGTTAGTGATAAGAAGTTCAGTGATGCAGCAGCCTTCTTCA GCGGTGAGCTCTTTCCTCACACATCTTTAAAAGTCCTTCTAATCCGTTGGTTTCTCGGGCACGCGGGCAG AAAACCGTGCTAACGGCCACAGAGGTTCAAGAGGTGCCAACGTGGCTATAACTGGAAAACTGGATCCGAA ATCGACCAGTAAACTGGGTAGCTCGGTCTACGCCCCGCCCACCACCCTTGCTAGCCAATAGCCTTCACAA CTCTTCTGCCACTCCCGCCCATTCCAGTGCTGTGCCGCTGCTTTTTCTTCCACTCGGATCTCTTGAGCGC CCTTAGCCCGCTGTATACGCGCCCCTCCTCGGCTTCAGTAGGCAAGAGGGCCATCTGCCCTTCTTTCCTG AAGGTAGAGGGGACAACACCAGCTACGACGGGGACTCCAGAAGTCCATCTCCCGAACAGCAGCGGGGCGA AAAGAAAGAAAAAGGGTTTCCGAAGACTCCTACTCACACCCACGCTTTCCCTTAACCCGGAAGTGATTTC CGCCCCTCCTCTCCCTCTTCGGTTGATACTGGAGGAGAAGGACGGCCAGGTCTGGCCCGGCATGCCCTGG GCTTCCGGTGACCTCTGGCCCTTTTCTGTCGTCCGCTCTCTCTGCCTAGCGTGCTCGCTCGCTCATTGCT TTCCTTCCCTCCCTCGGTCTTCCTTCGCACGCTGTTTGGTGATTGTGGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TOMM70_2 ↗ | 3:100,401,082 | 負股 | 100,401,072–100,401,131 |
| TOMM70_1 ↗ | 3:100,401,408 | 負股 | 100,401,398–100,401,457 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_BPWZM · promoter · 100401079–100401621 · regulatory
ENSR3_CCXZW · enhancer · 100401622–100403183 · regulatory
ENSR3_CCZ22 · enhancer · 100403367–100404410 · regulatory
· motif · 100396210–100396223 · motif
· motif · 100396210–100396223 · motif
· motif · 100397163–100397172 · motif
· motif · 100397163–100397172 · motif
· motif · 100401087–100401102 · motif
· motif · 100401088–100401101 · motif
· motif · 100401093–100401105 · motif
· motif · 100401101–100401110 · motif
· motif · 100401185–100401194 · motif
· motif · 100401185–100401196 · motif
· motif · 100401185–100401196 · motif
· motif · 100401202–100401215 · motif
· motif · 100401248–100401270 · motif
· motif · 100401248–100401270 · motif
· motif · 100401438–100401449 · motif
· motif · 100401442–100401452 · motif
· motif · 100401488–100401498 · motif
· motif · 100401738–100401751 · motif
· motif · 100401818–100401835 · motif
· motif · 100402505–100402516 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：608 aa
TOMM70 蛋白長 608 個胺基酸，屬於 Tom70 family。序列註解顯示其第 39–59 位胺基酸為螺旋型跨膜區；第 2–38 位位於粒線體膜間腔側，第 60–608 位朝向細胞質。蛋白質含有多個 TPR 重複區，另有第 67–107 位的無序區段註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TOMM70 位於粒線體外膜，為單次跨膜蛋白。 寄生蟲 T.gondii 感染期間，TOMM70 會在宿主粒線體與寄生液泡之間的界面富集。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HSP90AA1P07900 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- 9bP0DTD2 · UniProt INTERACTION · 28 experiments
- 9bP59636 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
TOMM70 是 TOM complex 的組成部分；該複合體至少包含 TOMM5、TOMM6、TOMM7、TOMM20、TOMM22、TOMM40 與 TOMM70。它與 HSPA8、HSP90AA1 互作，並直接結合 HSP90AA1；亦與 MAVS、TRADD、TRAF6、STING 及 PINK1 互作。粒線體去極化時，TOMM70 與 PINK1 的互作參與 PINK1-TOM-TIM23 超複合體形成。感染相關互作包括病毒蛋白 ORF9b，以及可能為間接互作的 T.gondii MAF1b1。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TOMM70 是粒線體外膜蛋白轉位複合體（TOM complex）的受體，能辨識粒線體前驅蛋白，並在伴護蛋白依賴的情況下協助其由細胞質轉位進入粒線體。Sendai virus 感染時，TOMM70 介導 MAVS 誘發的 TBK1 與 IRF3 活化，促進宿主抗病毒反應；感染後也會在粒線體招募 HSP90AA1:IRF3:BAX，該複合體可誘發細胞凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a receptor of the preprotein translocase complex of the outer mitochondrial membrane (TOM complex). Recognizes and mediates the translocation of mitochondrial preproteins from the cytosol into the mitochondria in a chaperone dependent manner. Mediates TBK1 and IRF3 activation induced by MAVS in response to Sendai virus infection and promotes host antiviral responses during virus infection. Upon Sendai virus infection, recruits HSP90AA1:IRF3:BAX in mitochondrion and the complex induces apoptosis PMID 12526792 ↗ · PMID 20628368 ↗ · PMID 25609812 ↗ · PMID 32728199 ↗ · PMID 35025629 ↗ |
| 交互作用 | TOMM70 是至少由 TOMM5、TOMM6、TOMM7、TOMM20、TOMM22、TOMM40 與 TOMM70 組成的 TOM complex 成員。它與 CAPN8（依相似性推定）、TRADD、TRAF6、STING、MAVS、HSPA8、HSP90AA1 及 PINK1 互作；MAVS 互作在 Sendai virus 感染時增強。HSPA8 與 HSP90AA1 的互作對前驅蛋白進口必要，HSP90AA1 直接結合並介導 TOMM70 與 IRF3、TBK1 的關聯。粒線體去極化時，TOMM70 與 PINK1 互作並參與 PINK1-TOM-TIM23 超複合體形成，此過程對 PINK1 穩定、激酶活化及下游粒線體自噬至關重要。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms part of the preprotein translocase complex of the outer mitochondrial membrane (TOM complex) which consists of at least 7 different proteins (TOMM5, TOMM6, TOMM7, TOMM20, TOMM22, TOMM40 and TOMM70). Interacts with CAPN8 (By similarity). Interacts with TRADD, TRAF6 and STING. Interacts with MAVS; the interaction is enhanced by Sendai virus infection. Interacts with HSPA8 and HSP90AA1; both interactions are required for preprotein mitochondrial import. The interaction with HSP90AA1 is direct and mediates the association of TOMM70 with IRF3 and TBK1. Upon mitochondrial depolarization, interacts with PINK1; the interaction is required for PINK1-TOM-TIM23 supercomplex formation which is critical for PINK1 stabilization at the outer mitochondrial membrane, kinase activation and downstream mitophagy PMID 12526792 ↗ · PMID 18331822 ↗ · PMID 20628368 ↗ · PMID 25609812 ↗ · PMID 35391620 ↗ · PMID 38416681 ↗ · PMID 38848361 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TOMM70 透過其 C 端與 SARS-CoV 及 SARS-CoV-2 病毒蛋白 ORF9b 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via C-terminus) with SARS coronaviru/SARS-CoV and SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 virus protein ORF9b PMID 33060197 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TOMM70 與寄生蟲 T.gondii RH strain 的 MAF1b1 互作；此互作可能為間接作用，會削弱 TOMM70 的進口活性，使寄生蟲得以接近宿主粒線體，並促進 MAF1b1 與 MIB 複合體成分 SAMM50 的關聯，進而促成外粒線體膜陽性結構 SPOTs 的形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with parasite T.gondii RH strain MAF1b1; the interaction impairs TOMM70 import activity, enables the parasite to associate with the host mitochondria and facilitates the association of MAF1b1 with MIB complex component SAMM50, promoting the formation of SPOTs (structures positive for outer mitochondrial membrane (OMM)); the interaction is probably indirect PMID 33723040 ↗ · PMID 35025629 ↗ |
| 細胞定位 | TOMM70 位於粒線體外膜，是單次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrion outer membrane / Single-pass membrane protein PMID 20628368 ↗ · PMID 25609812 ↗ · PMID 33723040 ↗ |
| 細胞定位 | 在 T.gondii 介導的寄生蟲感染期間，TOMM70 會在宿主粒線體與寄生液泡之間的界面富集。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源(Microbial infection) During parasite T.gondii-mediated infection, enriched at the interface between the host mitochondria and the parasitopharous vacuole |
核酸與蛋白質序列
CTTTTCTGTCGTCCGCTCTCTCTGCCTAGCGTGCTCGCTC40GCTCATTGCTTTCCTTCCCTCCCTCGGTCTTCCTTCGCAC80GCTGTTTGGTGATTGTGGCGCTCGCGACAGACAGGGAGGC120GGTGGCAGAGGACACTTGTCATGGCCGCCTCTAAACCTGT160GGAGGCAGCGGTGGTCGCAGCCGCTGTACCGAGCTCCGGG200AGTGGGGTGGGCGGCGGCGGGACTGCGGGCCCGGGCACGG240GGGGGCTGCCGCGATGGCAGCTGGCTCTGGCGGTCGGGGC280ACCCCTGCTGCTGGGCGCGGGTGCCATATACCTGTGGAGT320CGGCAGCAACGGCGCCGGGAGGCCAGAGGCCGGGGCGACG360CCAGCGGCCTGAAGCGCAACAGCGAACGGAAGACCCCGGA400GGGCAGGGCCAGTCCGGCCCCGGGCAGCGGACACCCTGAA440GGTCCCGGTGCTCACTTGGACATGAACTCTCTTGATAGAG480CCCAAGCAGCCAAGAATAAAGGCAATAAATATTTTAAAGC520AGGAAAATATGAACAAGCTATTCAGTGCTATACTGAGGCT560ATTAGCTTGTGCCCTACAGAGAAGAATGTTGACCTTTCTA600CATTTTATCAAAACAGAGCTGCTGCCTTTGAACAGTTGCA640AAAATGGAAAGAAGTGGCACAAGACTGTACAAAAGCTGTT680GAACTTAATCCCAAATATGTGAAAGCTCTCTTTAGACGTG720CAAAAGCCCATGAGAAGCTAGACAATAAGAAGGAATGTTT760AGAAGATGTCACTGCTGTGTGTATATTAGAAGGGTTCCAA800AATCAACAAAGCATGCTGTTAGCCGATAAAGTTCTTAAAC840TCCTTGGAAAAGAGAAAGCCAAAGAAAAATATAAGAATCG880TGAACCTCTGATGCCATCTCCACAGTTTATCAAATCTTAC920TTCAGTTCTTTCACGGATGATATCATTTCCCAGCCCATGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。