演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TOB2TOBL

transducer of ERBB2, 2

TOB2(transducer of ERBB2, 2)編碼 BTG 家族蛋白 Protein Tob2,具有抑制細胞增殖的作用,並可與 CAF1 結合。

Homo sapiens22q13.2UniProt Q14106
OFFICIAL SYMBOL
TOB2
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q14106
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TOB2 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 transducer of ERBB2, 2,其產物為 Protein Tob2。Protein Tob2 屬於 BTG 家族,並具有抗增殖特性。蛋白質全長為 344 個胺基酸;序列中有兩段被註記為無序區域,分別位於第 144–169 與第 191–225 個胺基酸。

Official symbol
TOB2
Gene name
transducer of ERBB2, 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11980
UniProt
Q14106
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TOBLTOB4bK223H9APRO5TROB2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.2
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegTOB2pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:41,433,489–41,447,602
Gene span
14,114 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000327492 ★41,433,494–41,446,8012
ENST0000043440841,433,489–41,447,6022
ENST0000090139241,433,489–41,445,8892
ENST0000090139341,433,489–41,445,8522
ENST0000090139441,433,489–41,444,4482
ENST0000090139541,433,489–41,447,6023
ENST0000090139641,433,489–41,447,6023
ENST0000090139741,433,489–41,447,6023
ENST0000090139841,433,489–41,445,5682
ENST0000093756641,433,489–41,447,6023
ENST0000093756741,433,489–41,447,6023
ENST0000113398941,433,489–41,447,6022

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Protein Tob2 是具有抗增殖作用的蛋白質,能抑制細胞週期由 G0/G1 期進入 S 期的進程。此作用指出,TOB2 產物可限制細胞由較早期的週期階段轉入 DNA 合成期。

現有資料支持其對細胞週期進程的抑制作用,但未提供具體分子機制、調控條件或實驗系統,因此無法進一步界定它如何影響細胞週期各步驟,也不宜據此推論其他生物學作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 41446801 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TOB2 ENST00000327492 GRCh38 chr22:41446701-41447801 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCCGTTGCACGGTCAGGGGCCACCCCACGCCGGCGGGACTGCGACTAGAAGAAATGTGGGGCTCTCCCG
CGTGCCCCACACTGGGGTCGCTGGCCAGAAAGAGCAAACAAGAGTTGGGAGAGGGGCTGCGCCCGCGCGC
CTGCGCAGAGCCAGAGCCGGCCCTCCAGGCTGCAAGGAAAGGAGCGCCAGAGGCGGTGAGGGGAAGGTCC
TTTGTGGCACTCGGCTAGTTTCACGGCCGTCAGCCTCGTCCTCGGCTCCTCTTACTCCCGCACAGCGTGG
CCCAGGCCCCAGAGTCTCCCTCGCCTTTCTTTCGACGTTGAGCCCCCCGAGGAATCACAAGGCGCTCGGA
AGACTCATGCCTGCCCGAAACGGGTCCGAAATGTTTCCAGAGCCCGCGTCGTCCCCTCAGTTCCCCCTCC
CGCAGAGGCCGTAACGGGGCGATGCTATCGCCGCGGACACGGCCAGACGCTCGGAGCTGGAGGGAAGGCC
CCGGGAAACGGCTCGGGCAAACGTCCGAACCATGGGCTCCGAGGCAGGTGCAGGGCGGACGACTCAGCGG
GGGGTTTCCGGCGGGCATGGTGACTCCCTCCCCTCCCCCGCGATACTCGTCCCCCAAACACAACTAAAGG
GAGAGTGCACTGTGCCCGGCTCGTGAGCAACCCGGCCCCAGGTGGTCCCCGGCCCTCACGGAGCGCCCCT
GGGAGAACACCTCACACGACGCGCACAAGTTCAGAGTGGTATGGGAATGAAGGAAAGGAGTGCGGCGCGG
CGCTGTGACAGGGAGGGGAAGACGGGGAGCCGGACGCACGACCGGCGAGCACAGAAGGGCACAGGAGCTG
CTCCGCGAGATACCAGCGAGCTGAGGCGCGGGGCTGGCTGGGAAGTAGTCCCGGCCGGGCCCTGGCCCCG
CCCCTGCAGGGCGGAGGGACGCATCACGCAGGGGTGGGGAAGCCGGATCCGTGCGCAGGGTTGCTAAGGG
TGAAACTTTTCATTGACTTTGCTCACTTCGGGCCGGGGCGCGGGAAGGTGCGGGTTGTTGGCTGAGGCAA
GCCGTGGCTCGGGCGACGCGGGGCCAGGAGGGCAGGACCGTCTGCCGGCGA
TOB2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TOB2_1 ↗22:41,446,797負股41,446,787–41,446,846
TOB2_2 ↗22:41,448,295負股41,448,285–41,448,344
TOB2_3 ↗22:41,448,549負股41,448,539–41,448,598

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_5CQ7BS · CTCF_binding_site · 41444090–41444111 · regulatory

ENSR22_5CQ7MP · CTCF_binding_site · 41446010–41446031 · regulatory

ENSR22_837WCG · promoter · 41446775–41446945 · regulatory

ENSR22_9LG6X · promoter · 41447340–41447840 · regulatory

ENSR22_BB84K · enhancer · 41447841–41448559 · regulatory

ENSR22_5CQ83Z · CTCF_binding_site · 41448438–41448459 · regulatory

ENSR22_9LG79 · promoter · 41448560–41449060 · regulatory

· motif · 41444092–41444108 · motif

· motif · 41444569–41444584 · motif

· motif · 41444578–41444589 · motif

· motif · 41444578–41444589 · motif

· motif · 41444637–41444648 · motif

· motif · 41444637–41444648 · motif

· motif · 41445420–41445431 · motif

· motif · 41446012–41446028 · motif

· motif · 41446449–41446462 · motif

· motif · 41446717–41446732 · motif

· motif · 41446852–41446862 · motif

· motif · 41446887–41446897 · motif

· motif · 41447073–41447089 · motif

· motif · 41447073–41447089 · motif

· motif · 41447203–41447213 · motif

· motif · 41447260–41447269 · motif

· motif · 41447368–41447385 · motif

· motif · 41447655–41447666 · motif

· motif · 41447655–41447666 · motif

· motif · 41447663–41447674 · motif

· motif · 41447663–41447674 · motif

· motif · 41447968–41447983 · motif

· motif · 41448018–41448031 · motif

· motif · 41448018–41448031 · motif

· motif · 41448019–41448032 · motif

· motif · 41448019–41448032 · motif

· motif · 41448089–41448099 · motif

· motif · 41448302–41448317 · motif

· motif · 41448438–41448448 · motif

· motif · 41448440–41448456 · motif

· motif · 41448452–41448463 · motif

· motif · 41448452–41448463 · motif

· motif · 41448479–41448489 · motif

· motif · 41448568–41448579 · motif

· motif · 41448667–41448680 · motif

· motif · 41449652–41449660 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:344 aa

1 aa344 aa功能區域
依 Q14106 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein Tob2 全長為 344 個胺基酸,屬於 BTG 家族。序列第 144–169 與第 191–225 個胺基酸區段均標註為無序區域。

功能區域Disordered144–169 aa
功能區域Disordered191–225 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q14106…

AlphaFold · Q14106

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

Protein Tob2 定位於細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TOBLTOB2BHLHE40CEP76CNOT7CNOT8PABPC1Cnot7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Protein Tob2 與 CAF1 有關聯;來源未進一步說明此關聯是否代表直接結合,亦未提供複合體組成或功能後果的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Protein Tob2 具有抗增殖作用,可抑制細胞週期由 G0/G1 期進展至 S 期。資料庫紀錄
證據與來源

Anti-proliferative protein inhibits cell cycle progression from the G0/G1 to S phases

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Protein Tob2 與 CAF1 有關聯;此敘述未進一步界定關聯形式。資料庫紀錄
證據與來源

Associates with CAF1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Protein Tob2 位於細胞質。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000327492 · 4,337 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCACTTCGGGCCGGGGCGCGGGAAGGTGCGGGTTGTTG40
41GCTGAGGCAAGCCGTGGCTCGGGCGACGCGGGGCCAGGAG80
81GGCAGGACCGTCTGCCGGCGACAGCCCATACCGTCTGCCG120
121TTGCGCGACACGAACCACCCTCCGATCCGCCATCCCCGCG160
161TCGTCGCCGCTAGTCCGCCCGCCCGCCCTCGGGCCCCCCG200
201CTGCCGAGCCCGACCTCCTAAGAGCTGAAAGAAATTATTG240
241AGAGTCATAGTCCATAGCCCCCTGCTTCGTCCCCCAACCC280
281TCAACGACGAAAAGGACTTCGGTCCCCTGGCCCGGCGACG320
321CCCGGGAAGGAAAGGAGAGCGACCTCCGCCCCGCGCTCAG360
361GCCACCCTGGAGGGAGAAGCCGCCCCGCGGCCGGTAGAGC400
401GCCCCGCCGCCGCGGAGACCCGAAGCCGCCTGGAGCCCAA440
441GGCTGTACACGTGCCCTGTGCTGATTCTCTGCCTAGGAAA480
481GGACCATGCAGCTAGAGATCAAAGTGGCCCTGAACTTCAT520
521CATCTCCTACTTGTACAACAAGCTGCCCCGGCGCCGGGCA560
561GACCTGTTTGGGGAGGAGCTAGAGCGGCTTTTGAAAAAGA600
601AATATGAAGGCCACTGGTACCCTGAGAAGCCACTGAAAGG640
641CTCTGGCTTCCGCTGTGTTCACATTGGGGAGATGGTGGAC680
681CCCGTGGTGGAGCTGGCCGCCAAGCGGAGTGGCCTGGCGG720
721TGGAAGATGTGCGGGCCAATGTGCCTGAGGAGCTGAGTGT760
761CTGGATTGATCCCTTTGAGGTGTCCTACCAGATTGGTGAG800
801AAGGGAGCTGTGAAAGTGCTGTACCTGGATGACAGTGAGG840
841GTTGCGGTGCCCCAGAGCTGGACAAGGAGATCAAGAGCAG880
881CTTCAACCCTGACGCCCAGGTGTTCGTGCCCATTGGCAGC920
921CAGGACAGCTCCCTGTCCAACTCCCCATCGCCATCCTTTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。