基因總覽
TOB2 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 transducer of ERBB2, 2,其產物為 Protein Tob2。Protein Tob2 屬於 BTG 家族,並具有抗增殖特性。蛋白質全長為 344 個胺基酸;序列中有兩段被註記為無序區域,分別位於第 144–169 與第 191–225 個胺基酸。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000327492 ★ | 41,433,494–41,446,801 | 2 |
| ENST00000434408 | 41,433,489–41,447,602 | 2 |
| ENST00000901392 | 41,433,489–41,445,889 | 2 |
| ENST00000901393 | 41,433,489–41,445,852 | 2 |
| ENST00000901394 | 41,433,489–41,444,448 | 2 |
| ENST00000901395 | 41,433,489–41,447,602 | 3 |
| ENST00000901396 | 41,433,489–41,447,602 | 3 |
| ENST00000901397 | 41,433,489–41,447,602 | 3 |
| ENST00000901398 | 41,433,489–41,445,568 | 2 |
| ENST00000937566 | 41,433,489–41,447,602 | 3 |
| ENST00000937567 | 41,433,489–41,447,602 | 3 |
| ENST00001133989 | 41,433,489–41,447,602 | 2 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Protein Tob2 是具有抗增殖作用的蛋白質,能抑制細胞週期由 G0/G1 期進入 S 期的進程。此作用指出,TOB2 產物可限制細胞由較早期的週期階段轉入 DNA 合成期。
現有資料支持其對細胞週期進程的抑制作用,但未提供具體分子機制、調控條件或實驗系統,因此無法進一步界定它如何影響細胞週期各步驟,也不宜據此推論其他生物學作用。
Promoter 與基因調控
>TOB2 ENST00000327492 GRCh38 chr22:41446701-41447801 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCGTTGCACGGTCAGGGGCCACCCCACGCCGGCGGGACTGCGACTAGAAGAAATGTGGGGCTCTCCCG CGTGCCCCACACTGGGGTCGCTGGCCAGAAAGAGCAAACAAGAGTTGGGAGAGGGGCTGCGCCCGCGCGC CTGCGCAGAGCCAGAGCCGGCCCTCCAGGCTGCAAGGAAAGGAGCGCCAGAGGCGGTGAGGGGAAGGTCC TTTGTGGCACTCGGCTAGTTTCACGGCCGTCAGCCTCGTCCTCGGCTCCTCTTACTCCCGCACAGCGTGG CCCAGGCCCCAGAGTCTCCCTCGCCTTTCTTTCGACGTTGAGCCCCCCGAGGAATCACAAGGCGCTCGGA AGACTCATGCCTGCCCGAAACGGGTCCGAAATGTTTCCAGAGCCCGCGTCGTCCCCTCAGTTCCCCCTCC CGCAGAGGCCGTAACGGGGCGATGCTATCGCCGCGGACACGGCCAGACGCTCGGAGCTGGAGGGAAGGCC CCGGGAAACGGCTCGGGCAAACGTCCGAACCATGGGCTCCGAGGCAGGTGCAGGGCGGACGACTCAGCGG GGGGTTTCCGGCGGGCATGGTGACTCCCTCCCCTCCCCCGCGATACTCGTCCCCCAAACACAACTAAAGG GAGAGTGCACTGTGCCCGGCTCGTGAGCAACCCGGCCCCAGGTGGTCCCCGGCCCTCACGGAGCGCCCCT GGGAGAACACCTCACACGACGCGCACAAGTTCAGAGTGGTATGGGAATGAAGGAAAGGAGTGCGGCGCGG CGCTGTGACAGGGAGGGGAAGACGGGGAGCCGGACGCACGACCGGCGAGCACAGAAGGGCACAGGAGCTG CTCCGCGAGATACCAGCGAGCTGAGGCGCGGGGCTGGCTGGGAAGTAGTCCCGGCCGGGCCCTGGCCCCG CCCCTGCAGGGCGGAGGGACGCATCACGCAGGGGTGGGGAAGCCGGATCCGTGCGCAGGGTTGCTAAGGG TGAAACTTTTCATTGACTTTGCTCACTTCGGGCCGGGGCGCGGGAAGGTGCGGGTTGTTGGCTGAGGCAA GCCGTGGCTCGGGCGACGCGGGGCCAGGAGGGCAGGACCGTCTGCCGGCGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TOB2_1 ↗ | 22:41,446,797 | 負股 | 41,446,787–41,446,846 |
| TOB2_2 ↗ | 22:41,448,295 | 負股 | 41,448,285–41,448,344 |
| TOB2_3 ↗ | 22:41,448,549 | 負股 | 41,448,539–41,448,598 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_5CQ7BS · CTCF_binding_site · 41444090–41444111 · regulatory
ENSR22_5CQ7MP · CTCF_binding_site · 41446010–41446031 · regulatory
ENSR22_837WCG · promoter · 41446775–41446945 · regulatory
ENSR22_9LG6X · promoter · 41447340–41447840 · regulatory
ENSR22_BB84K · enhancer · 41447841–41448559 · regulatory
ENSR22_5CQ83Z · CTCF_binding_site · 41448438–41448459 · regulatory
ENSR22_9LG79 · promoter · 41448560–41449060 · regulatory
· motif · 41444092–41444108 · motif
· motif · 41444569–41444584 · motif
· motif · 41444578–41444589 · motif
· motif · 41444578–41444589 · motif
· motif · 41444637–41444648 · motif
· motif · 41444637–41444648 · motif
· motif · 41445420–41445431 · motif
· motif · 41446012–41446028 · motif
· motif · 41446449–41446462 · motif
· motif · 41446717–41446732 · motif
· motif · 41446852–41446862 · motif
· motif · 41446887–41446897 · motif
· motif · 41447073–41447089 · motif
· motif · 41447073–41447089 · motif
· motif · 41447203–41447213 · motif
· motif · 41447260–41447269 · motif
· motif · 41447368–41447385 · motif
· motif · 41447655–41447666 · motif
· motif · 41447655–41447666 · motif
· motif · 41447663–41447674 · motif
· motif · 41447663–41447674 · motif
· motif · 41447968–41447983 · motif
· motif · 41448018–41448031 · motif
· motif · 41448018–41448031 · motif
· motif · 41448019–41448032 · motif
· motif · 41448019–41448032 · motif
· motif · 41448089–41448099 · motif
· motif · 41448302–41448317 · motif
· motif · 41448438–41448448 · motif
· motif · 41448440–41448456 · motif
· motif · 41448452–41448463 · motif
· motif · 41448452–41448463 · motif
· motif · 41448479–41448489 · motif
· motif · 41448568–41448579 · motif
· motif · 41448667–41448680 · motif
· motif · 41449652–41449660 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:344 aa
Protein Tob2 全長為 344 個胺基酸,屬於 BTG 家族。序列第 144–169 與第 191–225 個胺基酸區段均標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Protein Tob2 定位於細胞質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- BHLHE40O14503 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNOT7Q9UIV1 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CNOT8Q9UFF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PABPC1P11940 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- Cnot7Q60809 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
Protein Tob2 與 CAF1 有關聯;來源未進一步說明此關聯是否代表直接結合,亦未提供複合體組成或功能後果的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Protein Tob2 具有抗增殖作用,可抑制細胞週期由 G0/G1 期進展至 S 期。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Protein Tob2 與 CAF1 有關聯;此敘述未進一步界定關聯形式。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Protein Tob2 位於細胞質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCTCACTTCGGGCCGGGGCGCGGGAAGGTGCGGGTTGTTG40GCTGAGGCAAGCCGTGGCTCGGGCGACGCGGGGCCAGGAG80GGCAGGACCGTCTGCCGGCGACAGCCCATACCGTCTGCCG120TTGCGCGACACGAACCACCCTCCGATCCGCCATCCCCGCG160TCGTCGCCGCTAGTCCGCCCGCCCGCCCTCGGGCCCCCCG200CTGCCGAGCCCGACCTCCTAAGAGCTGAAAGAAATTATTG240AGAGTCATAGTCCATAGCCCCCTGCTTCGTCCCCCAACCC280TCAACGACGAAAAGGACTTCGGTCCCCTGGCCCGGCGACG320CCCGGGAAGGAAAGGAGAGCGACCTCCGCCCCGCGCTCAG360GCCACCCTGGAGGGAGAAGCCGCCCCGCGGCCGGTAGAGC400GCCCCGCCGCCGCGGAGACCCGAAGCCGCCTGGAGCCCAA440GGCTGTACACGTGCCCTGTGCTGATTCTCTGCCTAGGAAA480GGACCATGCAGCTAGAGATCAAAGTGGCCCTGAACTTCAT520CATCTCCTACTTGTACAACAAGCTGCCCCGGCGCCGGGCA560GACCTGTTTGGGGAGGAGCTAGAGCGGCTTTTGAAAAAGA600AATATGAAGGCCACTGGTACCCTGAGAAGCCACTGAAAGG640CTCTGGCTTCCGCTGTGTTCACATTGGGGAGATGGTGGAC680CCCGTGGTGGAGCTGGCCGCCAAGCGGAGTGGCCTGGCGG720TGGAAGATGTGCGGGCCAATGTGCCTGAGGAGCTGAGTGT760CTGGATTGATCCCTTTGAGGTGTCCTACCAGATTGGTGAG800AAGGGAGCTGTGAAAGTGCTGTACCTGGATGACAGTGAGG840GTTGCGGTGCCCCAGAGCTGGACAAGGAGATCAAGAGCAG880CTTCAACCCTGACGCCCAGGTGTTCGTGCCCATTGGCAGC920CAGGACAGCTCCCTGTCCAACTCCCCATCGCCATCCTTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。