基因總覽
TOB1 是蛋白質編碼基因，產物 transducer of ERBB2, 1 屬於 BTG family。此蛋白長 345 個胺基酸，含有與核定位及核輸出相關的序列訊號，也具有多段功能區域與無序區。這些特徵構成其蛋白質基本架構；其具體細胞作用則與和其他蛋白質的關聯有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000499247 ★ | 50,862,223–50,866,354 | 2 |
| ENST00000851192 | 50,861,311–50,867,814 | 2 |
| ENST00000851193 | 50,861,311–50,866,357 | 2 |
| ENST00000851194 | 50,861,311–50,865,603 | 2 |
| ENST00000851195 | 50,861,311–50,865,589 | 2 |
| ENST00000932427 | 50,861,311–50,865,582 | 2 |
| ENST00000947299 | 50,861,311–50,865,036 | 2 |
| ENST00001138465 | 50,861,311–50,866,354 | 2 |
| ENST00000268957 | 50,862,980–50,867,978 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TOB1 蛋白具有抑制細胞增殖的作用。來源指出，這項功能由其與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶次單元相互關聯所介導；這說明 TOB1 的抗增殖作用與 mRNA 去腺苷酸化相關，但來源未進一步列出其他作用機制或細胞情境。
在 CPEB3 促進的 mRNA 去腺苷酸化過程中，TOB1 會結合 CPEB3，並招募 CNOT7。這項招募使目標 mRNA 發生去腺苷酸化，接著導向其降解。換言之，TOB1 在此過程中連結 CPEB3 與去腺苷酸酶相關因子，參與調節特定 mRNA 的穩定性與命運。
因此，來源支持 TOB1 具有兩項相互關聯的功能描述：抑制細胞增殖，以及參與 CPEB3 加速的 mRNA 去腺苷酸化與降解。後者透過結合 CPEB3、招募 CNOT7 來實現；來源並指出，TOB1 的抗增殖功能與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶次單元相關。這些敘述並未提供足以將特定 mRNA 降解結果直接等同於細胞增殖變化的資訊。
Promoter 與基因調控
>TOB1 ENST00000499247 GRCh38 chr17:50866254-50867354 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCGCACATATTTCAGCCAAGAATGATCTTAAACGCGCTTTACAAGCAGGCACCGCGTTTATTCTGTGCAC CTGCGATCCAGCAAGCCCTAGAAATGCACGCATGCGTGTGTGTGTAGACATGGACACAGATACATACGCA GTTTGGCCTCGTGTCGCCACACTCTGGGCACGGCGTGGGCTGGGACATTTGGAATAAACGGATCCGAGTC GCAGCCGGGGTCGCACCGGGAGGCCTGAGGCTGCGGAAGCAGTTAAACTGCCGGCGGGGCGGGAGCTGTG GCGGCCTCCCTTCCCCACCCCCAGCCCGGCTCCACGTCTTTGGGTTCTGCAGCTGCCACTCTCTGGGTGG CGGTTGGCCTAGGCCTTGGGGTGATTAATATTCAATTAATCGGGTGCACAAGTCCCGGTCACAGTTTGCC CTTTCTCTACCCCGCCCCTGGGGTGGGCTGGAGGCCGATTTGGTAGCTATTCCACGAGCAGGATCCTCCT TGGCCGCAGACCCCCGCGGAGAGGGCACTTTCTGGGTACTCTTGCCGCTCCTCCAGCCCCGGTTCTCCTG AGCCGCTTCGCCACCAGCTTCGTCCCCCTCCCCCTCTGCCCGGCGCTCTCCGCCTAAACCGGGCGTCAGC CGCCCTACCCCACCCCTTTCTCTCTCATTGGCACGTCTGCCCCCACAGTCCCTTTCCAGACGTTCTCTTC ATTCCGTCCCCAGTGCTCCGATCGTCGGTTCATTGGCCCTCCTGGAGCCCGGAGGGTGCGGCTTCCCCAC CCCTGCGTCCGCCGCGCGTCCGGACAGGGGCAGGCGGGACTTGGCCAATGGCGTCGGGGGGCAGGGCAGG GGCGGAGCCGGCCGGCGGGGGACCGGGGTGCCGGGCGGGGAGCGCGGGGAATGGCTGCGCCGCCGGAGCT GTGTGACGCGGAGCGGGCGCGCGCACCCCGACGGAGGGGATGGGGGCGGGGAGGAGGCCATAAAACGAGA GGCGGGGCGCGCGCCGCGGCAGAAGGAGCGAAGCTCTGGCCCGGCGTGTAGCGGGCGCACTACGGGGACG CTGGGCCGGGCACCGGGCTGTGTGGAGAAGTGAGCGCGCTCGTCTGACCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TOB1_2 ↗ | 17:50,864,055 | 負股 | 50,864,045–50,864,104 |
| TOB1_1 ↗ | 17:50,866,354 | 負股 | 50,866,344–50,866,403 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_5FZ283 · CTCF_binding_site · 50862169–50862190 · regulatory
ENSR17_5FZ2GD · CTCF_binding_site · 50863541–50863562 · regulatory
ENSR17_83HD7B · enhancer · 50864165–50864315 · regulatory
ENSR17_C739H · enhancer · 50864821–50866343 · regulatory
ENSR17_9Q75B · promoter · 50866344–50866770 · regulatory
ENSR17_C739M · enhancer · 50866771–50867967 · regulatory
ENSR17_9Q75R · promoter · 50867968–50868468 · regulatory
· motif · 50861405–50861416 · motif
· motif · 50861450–50861461 · motif
· motif · 50861515–50861526 · motif
· motif · 50861651–50861662 · motif
· motif · 50862171–50862187 · motif
· motif · 50862329–50862338 · motif
· motif · 50862329–50862338 · motif
· motif · 50863362–50863377 · motif
· motif · 50863481–50863494 · motif
· motif · 50863488–50863501 · motif
· motif · 50863543–50863559 · motif
· motif · 50866252–50866264 · motif
· motif · 50866254–50866261 · motif
· motif · 50866367–50866377 · motif
· motif · 50866393–50866403 · motif
· motif · 50866507–50866517 · motif
· motif · 50866518–50866528 · motif
· motif · 50866581–50866591 · motif
· motif · 50866708–50866718 · motif
· motif · 50866761–50866771 · motif
· motif · 50866849–50866864 · motif
· motif · 50866916–50866926 · motif
· motif · 50866969–50866982 · motif
· motif · 50866969–50866982 · motif
· motif · 50867053–50867063 · motif
· motif · 50867247–50867258 · motif
· motif · 50867247–50867258 · motif
· motif · 50867280–50867289 · motif
· motif · 50867392–50867402 · motif
· motif · 50867476–50867487 · motif
· motif · 50867675–50867688 · motif
· motif · 50867707–50867718 · motif
· motif · 50867763–50867776 · motif
· motif · 50867791–50867799 · motif
· motif · 50868720–50868733 · motif
· motif · 50868720–50868733 · motif
· motif · 50868980–50868991 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：345 aa
TOB1 蛋白長 345 個胺基酸，屬於 BTG family。第 22–39 位含雙段式核定位訊號，第 82–92 位區域與核定位有關；第 226–234 位含核輸出訊號。第 144–171 位與第 231–267 位被註記為無序區，第 161–218 位則為與 CPEB3 互作所需的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TOB1 位於細胞核與細胞質，但細胞質中的比例會隨細胞週期改變：除晚期 S 期外，只有少部分蛋白位於細胞質；到了晚期 S 期，超過一半的蛋白會轉至細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- CNOT1A5YKK6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CNOT10Q9H9A5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNOT2Q9NZN8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNOT3O75175 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CNOT6LQ96LI5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CNOT7Q9UIV1 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- CNOT9Q92600 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CPEB3Q8NE35 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CPEB4Q17RY0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PABPC1P11940 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RAVER1Q8IY67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TNKS1BP1Q9C0C2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TOB1 與 ERBB2、CNOT7、CNOT8、CPEB3 及 CPEB4 有互作紀錄。其 C 端 RNA 結合區域參與與 CPEB3 的互作；TOB1 可招募 CNOT7 至 CPEB3，形成參與 mRNA 去腺苷酸化與降解所需的三元複合體。來源亦記載 TOB1 與 CNOT7、CNOT8 的互作，但未將這些互作一概描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TOB1 是具有抑制細胞增殖作用的蛋白質，此功能由其與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶次單元相關所介導。此外，TOB1 可結合 CPEB3 並招募 CNOT7，促進目標 mRNA 去腺苷酸化，進而導致其降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Anti-proliferative protein; the function is mediated by association with deadenylase subunits of the CCR4-NOT complex. Mediates CPEB3-accelerated mRNA deadenylation by binding to CPEB3 and recruiting CNOT7 which leads to target mRNA deadenylation and decay PMID 21336257 ↗ · PMID 23236473 ↗ · PMID 8632892 ↗ |
| 交互作用 | TOB1 與 ERBB2、CNOT7、CNOT8、CPEB3 及 CPEB4 有互作紀錄。TOB1 透過 C 端 RNA 結合區域與 CPEB3 互作，並招募 CNOT7 與 CPEB3 形成三元複合體；此複合體是 mRNA 去腺苷酸化與降解所需。來源未將所有互作都描述為同一複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ERBB2. Interacts with CNOT7. Interacts with CPEB3 (via C-terminal RNA-binding region); recruits CNOT7 to CPEB3 to form a ternary complex required for mRNA deadenylation and decay. Interacts with CNOT8. Interacts with CPEB4 PMID 19276069 ↗ · PMID 21336257 ↗ · PMID 23236473 ↗ · PMID 8632892 ↗ |
| 細胞定位 | TOB1 位於細胞核與細胞質。細胞質中的蛋白比例具有細胞週期相關差異：除晚期 S 期外，只有少部分位於細胞質；晚期 S 期則有超過一半的蛋白轉至細胞質。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Only a small fraction localizes to the cytoplasm except in late S-phase where more than half of proteins become cytoplasmic |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGAGCGAAGCTCTGGCCCGGCGTGTAGCGGGCGCAC40TACGGGGACGCTGGGCCGGGCACCGGGCTGTGTGGAGAAG80TGAGCGCGCTCGTCTGACCCCCGTGCCCGCCACCCCGAGC120CACTAACGGCGATCTCCCAAGGCCTGCCCGAGGCCTCTGT160CCTCTGTCCTCAGCCCCGCAGCGGCAACGTCTTGCACTCG200GCGAGCTCGCCGCTCCCGACCCTCCCGCGCCCCCGCCCTG240CCGCGCTGCTCCCCGCCCAGCCGCGGGTCTGTGGTCCAAG280CCGCCCCGAAGCAGCCCGAACAAGATCACTCAAGGTGAAG320GATAATCTACTAATACCAGCACTTTGAATGAAAATTTGTT360TCTCTGCCACAAACTGAACATCTTTTTTTTTTTTTTTTTT400TTTTGGTGGGGGAGTTGAAACCTAATTTTGTGGCGTAGCA440GCTATGCAGCTTGAAATCCAAGTAGCACTAAATTTTATTA480TTTCGTATTTGTACAATAAGCTTCCCAGGAGACGTGTCAA520CATTTTTGGTGAAGAACTTGAAAGACTTCTTAAGAAGAAA560TATGAAGGGCACTGGTATCCTGAAAAGCCATACAAAGGAT600CGGGGTTTAGATGTATACACATAGGGGAGAAAGTGGACCC640AGTGATTGAACAAGCATCCAAAGAGAGTGGTTTGGACATT680GATGATGTTCGTGGCAATCTGCCACAGGATCTTAGTGTTT720GGATCGACCCATTTGAGGTTTCTTACCAAATTGGTGAAAA760GGGACCAGTGAAGGTGCTTTACGTGGATGATAATAATGAA800AATGGATGTGAGTTGGATAAGGAGATCAAAAACAGCTTTA840ACCCAGAGGCCCAGGTTTTTATGCCCATAAGTGACCCAGC880CTCATCAGTGTCCAGCTCTCCATCGCCTCCTTTTGGTCAC920TCTGCTGCTGTAAGCCCTACCTTCATGCCCCGGTCCACTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。