基因總覽
TNXA 的正式名稱為 tenascin XA (pseudogene)，基因類型為假基因。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物、家族特徵或結構資訊，因此不據此推定其產物性質或功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000507684 ★ | 32,008,614–32,012,472 | 13 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
資料庫摘要將 TNXA 標示為位於細胞外囊泡，但未提供定位證據、相關條件或該定位所代表的生物學作用。
Promoter 與基因調控
>TNXA ENST00000507684 GRCh38 chr6:32012372-32013472 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCACCCGCCGGCCCAGGAGCTCTGATAGGAGCAGCTCCCGGTACTTTGCCTTCCGGACCATGCCAAGGAC AGCCTGGCGCCCTAGAGGAGAAGTGGCACAGGAAAGGGGAAAGGTGAATAAGGCCTAGAGGCCTGAGGAG CCACCAAAAGGTGAGGGGCTGCAGGCTTGAGCTGCAGATGGGATACCTTTAACAAAGTACTTGTGCATTT GGTCTGAAGACAAAGATGACTGCAGGAGTGGGCAGGCCGGAGTGGGGTGACCTGGCCTGTGCCCAGGAAG GAGGAGGAGTCTGCAGCCCTGTGGGCTTCAACATCCATCAAGGAGTCCAGAGCAGGAGCCAGGCCAGGCG GGAGGGAAAGGCCCTGGGAGGGGCTCTCTAATCTCCCAGCCCCGACTCTGCCCCGTCACTGCCGCTGCTC CTCATTACTCGCTGGGGCTGCTGTCGCCTCCCCGAAGGGTGGCCTTGTCCAGATAGTGGCAAACCTCCCT GCCGTGGATGAGTCAGGAGCATTTTCTTAAGAGGAACATCACTGGAAAACAAAATGAGCGGGGACACAGA AACCAACAGCAGTGGCTGCATTTGTGGTACAGGCTCCTCTTCCAGAGCTCGCTGATGCCCACCTCAGACA GGCCTGACCACGGCACGGCTGGTGGGATTTGCCAGTCACCTCAACCAGCCAGTTCCACCCTCAGCTTCTC TCAGAAGGGAGCACCACACTCCTCAAGCTCAGTGAATGTATCCCGGCATGGGTGGGGCCAGAGCCTGTGA TATCTCGAGGTGGGCTCGGCAGGACACCGGGGTGTGGAAGGGGGAAGCGAGCACCTGACTCAGACAGCGC GGGAGCTCGCAGGAGTCACGAGGCCACAGCGACTTCATTGTCTGACTGGGCCTGGACCTATAAACTTCCC ACCTCAGCCTTGGGCCAAGCCTGGAAGATAAAAATGGAGCACCCCATGGCGCCCCTCACTCAGATTCTCC CCTGGGCTTCTCCCACGCAGCCCCAGAAGAGGACACACCAGCCCCAGAGTTAGCCCCAGAGGCCCCTGAG CCTCCTGAAGAGCCCCGCCTAGGAGTGCTGACCGTGACCGACACAACCCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_8XF64 · enhancer · 32012987–32013239 · regulatory
ENSR6_9GP4H · promoter · 32014556–32014856 · regulatory
· motif · 32013924–32013937 · motif
· motif · 32014237–32014250 · motif
· motif · 32014282–32014295 · motif
· motif · 32014567–32014577 · motif
· motif · 32014744–32014754 · motif
· motif · 32014749–32014764 · motif
· motif · 32014756–32014771 · motif
· motif · 32014766–32014779 · motif
· motif · 32015190–32015205 · motif
· motif · 32015190–32015205 · motif
· motif · 32015680–32015693 · motif
· motif · 32015947–32015960 · motif
基因座與轉錄註解
TNXA 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000507684 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 2,038 nt | 13 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNXA 被標示為位於細胞外囊泡；此項定位資訊由 Alliance of Genome Resources 提供，資料日期為 2025 年 7 月。 | 資料庫紀錄 |
DNA 與 RNA 序列
CCCCAGAAGAGGACACACCAGCCCCAGAGTTAGCCCCAGA40GGCCCCTGAGCCTCCTGAAGAGCCCCGCCTAGGAGTGCTG80ACCGTGACCGACACAACCCCAGACTCCATGCGCCTCTCGT120GGAGCGTGGCCCAGGGCCCCTTTGATTCCTTCGTGGTCCA160GTATGAGGACACGAATGGGCAGCCCCAGGCCTTGCTCGTG200GACGGCGACCAGAGCAAGATCCTCATCTCAGGCCTGGAGC240CCAGCACCCGCTACAGGTTCCTCCTCTATGGCCTCCATGA280AGGGAAGCGCCTGGGGCCCCTCTCAGCTGAGGGCACCACA320GGGCTGGCTCCTGCTGGTCAGACCTCAGAGGAGTCAAGGC360CCCGCCTGTCCCAGCTGTCTGTGACTGACGTGACCACCAG400TTCACTGAGGCTCAACTGGGAGGCCCCACCGGGGGCCTTC440GACTCCTTCCTGCTCCGCTTTGGGGTTCCATCACCAAGCA480CTCTGGAGCCGCATCCGCGTCCACTGCTGCAGCGCGAGCT520GATGGTGCCGGGGACGCGGCACTCGGCCGTGCTCCGGGAC560CTGCGTTCCGGGACTCTGTACAGCCTGACACTGTATGGGC600TGCGAGGACCCCACAAGGCCGACAGCATCCAGGGAACCGC640CCGCACCCTCAGCCCAGTTCTGGAGAGCCCCCGTGACCTC680CAATTCAGTGAAATCAGGGAGACCTCAGCCAAGGTCAACT720GGATGCCCCCACCATCCCGGGCGGACAGCTTCAAAGTCTC760CTACCAGCTGGCGGACGGAGGGGAGCCTCAGAGTGTGCAG800GTGGACGGCCGGGCCCGGACCCAGAAACTCCAGTTCCTGA840CGGTCCCACACAGTTGCGTGCACTGAACTTGACCGAGGGA880TTCGCCGTGCTGCACTGGAAGCCCCCCCAGAATCCTGTGG920ACACCTATGACGTCCAGGTCACAGCCCCTGGGGCCCCGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。