基因總覽
TNS1（tensin 1）是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質，屬於 PTEN phosphatase protein family。其序列長 1,839 個胺基酸，具有多種結構區域，包括 N 端的 Phorbol-ester/DAG-type zinc finger、Phosphatase tensin-type 與 C2 tensin-type domains，以及 C 端的 SH2 和 PTB domains；序列中另有多段被註釋為無序區域。這些結構特色構成 TNS1 的分子架構；其生物學作用包含參與細胞黏附與細胞骨架相關過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000682258 ★ | 217,799,791–218,002,995 | 33 |
| ENST00000646520 | 217,799,588–218,010,421 | 33 |
| ENST00000171887 | 217,799,588–217,944,128 | 33 |
| ENST00000705226 | 217,799,588–217,944,128 | 34 |
| ENST00000446688 | 217,799,588–217,842,160 | 15 |
| ENST00000615025 | 217,799,588–217,944,070 | 31 |
| ENST00000419504 | 217,799,588–217,944,070 | 32 |
| ENST00001144775 | 217,799,588–218,002,995 | 33 |
| ENST00000651849 | 217,799,795–217,991,014 | 33 |
| ENST00000446903 | 217,848,176–218,002,995 | 19 |
| ENST00000413554 | 217,848,884–217,905,461 | 14 |
| ENST00000310858 | 217,859,229–217,903,813 | 14 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNS1 參與纖維狀黏附（fibrillar adhesion）的形成，也與細胞極性及移動有關。來源指出它可能參與把訊息傳遞途徑連結至細胞骨架，並可能參與軟骨發育；這些作用的描述保留「可能」的不確定性。
在肌成纖維細胞相關過程中，TNS1 對肌成纖維細胞分化及其介導的細胞外基質沉積是必要的。這使 TNS1 與細胞外基質的形成及肌成纖維細胞功能相連，但來源未進一步說明其中的分子機制。
TNS1 也可能具有蛋白質磷酸酶和／或脂質磷酸酶活性，這項功能標註為可能性，而非確定結論。此外，在 DLC1 存在時，TNS1 可增強 RHOA 活化；來源未提供此作用的其他條件或下游結果。
Promoter 與基因調控
>TNS1 ENST00000682258 GRCh38 chr2:218002895-218003995 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGCTGGATTCCCCCTTAGTGCTCCGTGGGAATACTTTTGGGTTTTGACCCAGCCTCCTTTCCACCCTCT AGACCCCCAACAATTGTCCCTGGGCAGAGGTGGGGGCGAGGGGAGGGGAGGGCTGGTGGGCAGGGGACAC TGAGGGGAAGAAATAGGCCTGTGGAATGGTGGGAGGGGAGAACTGGGCCCAGGGAGGGGGAGAGGGGAGG AGGGGGAGGAAGTGGGGAAATGCAAACCAAATGTTGGCCCCGGGTACAGTCAAGAAAAACACACTCTCGC GGGAGCCTGGAGCGGGGCTCCCTTTCAGAAGGGCAGGAAAGGCTGGGACAGATGTTTGCAGGAAAGAAAG AAAGAAGGGGGAAAAAAAAAGAAATAGGAAAAAAATTGGAATGAAACCCACAGCCTGGGGGCAGGGCCAT TCTTCCCCAGTCTCGGGCCCTATTTCTTCTGTGTTAAGGCCTGTCCTGGGCTCTGAGCTTGGCGCGTGGG CACCAGAGTCTGTCCCAGTCTGTGTGTGCAAATGCATGTGTGTTCCGAGGAGGCCAGGAAGGCAGGCACG GGTACTCAGAGAAGGGGAGGGGCCAAGGCACCCTGAGTGTGCTGATTGTGTGGGCCTGGGGCTGTCTGTT CATCCATCAGTGGTCTGGAGGGTTCCAGGAGTGAAGGCCCCCAGGCTGGTTTGCCAGGGGCGGGGGTCTG CAGTGAGGAGGGAGGACTCCAGGCCTACCAGCACCAGATCAGAAGACTGAGGAGCCTTGGTGGCACACAG GGGTTGTGTGTCCGGGGGTGGGGGGCACGGCCTGGGGGGGCCCTGCCTCTGGTAGCTTTCCCTTTTCCCT GTCCCCTTTACACCCCCTGCAAAGCAGGGTTCCTGACCCTCAAGGCCACCGGTGGAGCCTGGGAGGAGGG AGGAGAGAGGAGGCTGGGACGAGGGGTGGAGTGGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGGAGGGTGAGCTGGAGGC AGCAGGGCGAGAGGCCCAGCAGATGCTGGCGGAGCCGGAGCAGCCGCGGACTCAGAGAGCCCTTCTGCCA GCGCCGCGGGGACTCTAGCTTCAGGGGCTCTTCACAGGCCCTGGGCGTGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNS1_4 ↗ | 2:217,842,198 | 負股 | 217,842,188–217,842,247 |
| TNS1_3 ↗ | 2:217,905,461 | 負股 | 217,905,451–217,905,510 |
| TNS1_1 ↗ | 2:217,944,070 | 負股 | 217,944,060–217,944,119 |
| TNS1_2 ↗ | 2:218,002,995 | 負股 | 218,002,985–218,003,044 |
| TNS1_5 ↗ | 2:218,033,982 | 負股 | 218,033,972–218,034,031 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_957J8L · enhancer · 217999458–217999864 · regulatory
ENSR2_957J8R · enhancer · 218000182–218000566 · regulatory
ENSR2_88F3JQ · enhancer · 218002224–218002468 · regulatory
ENSR2_957J9M · promoter · 218002985–218003485 · regulatory
ENSR2_957JB3 · enhancer · 218004486–218004766 · regulatory
ENSR2_957JB7 · enhancer · 218005085–218005341 · regulatory
ENSR2_957JBC · enhancer · 218005532–218005793 · regulatory
ENSR2_88F3MD · promoter · 218006807–218007011 · regulatory
TGFB 可誘導 TNS1，且此誘導依賴 TGFBR1 訊號，但不依賴 SMAD 訊號。ROCK 活化、肌動蛋白聚合及 MRTFA/MLK1 活化也是 TGFB 誘導 TNS1 所必需的條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1839 aa
TNS1 長 1,839 個胺基酸，屬於 PTEN phosphatase protein family。其註釋結構包含 Phorbol-ester/DAG-type zinc finger、Phosphatase tensin-type、C2 tensin-type、SH2 與 PTB domains；序列中另有多段無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNS1 位於細胞周邊時，較偏向纖維狀黏附，而非 focal adhesions；它也可由細胞邊緣移至細胞中心，此轉位依賴 ITGB1BP1。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell surface；Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ARP10275 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KITP10721 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- METP08581 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TNS1 可結合肌動蛋白絲，並與含磷酸酪胺酸的蛋白質互動；已列出的互作對象包括 STARD8、PPP1CA、DLC1、BCAR1/p130Cas 與 PTK2/FAK。TNS1 透過 N 端與 DLC1 互動，而 TNS1 磷酸化會降低此互動；相對地，TNS1 磷酸化會增強其與 BCAR1/p130Cas 及 PTK2/FAK 的互動。這些資料描述的是結合或互作關係，未指出所有互作對象均屬同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNS1 可能具有蛋白質磷酸酶和／或脂質磷酸酶活性，並參與纖維狀黏附形成。它對肌成纖維細胞分化及肌成纖維細胞介導的細胞外基質沉積是必要的；在 DLC1 存在時可增強 RHOA 活化，也參與細胞極性與移動。其參與軟骨發育及連結訊息傳遞與細胞骨架的作用仍以可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源May act as a protein phosphatase and/or a lipid phosphatase (Probable). Involved in fibrillar adhesion formation. Essential for myofibroblast differentiation and myofibroblast-mediated extracellular matrix deposition. Enhances RHOA activation in the presence of DLC1. Plays a role in cell polarization and migration. May be involved in cartilage development and in linking signal transduction pathways to the cytoskeleton PMID 19826001 ↗ · PMID 21768292 ↗ · PMID 26427649 ↗ · PMID 28005397 ↗ |
| 交互作用 | TNS1 結合肌動蛋白絲，並與含磷酸酪胺酸的蛋白質互動；互作對象包括 STARD8、PPP1CA、DLC1、BCAR1/p130Cas 與 PTK2/FAK。TNS1 以 N 端與 DLC1 互動，其磷酸化會降低此互動；TNS1 磷酸化則會增強與 BCAR1/p130Cas 及 PTK2/FAK 的互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds to actin filaments and interacts with phosphotyrosine-containing proteins. Interacts with STARD8. Interacts with protein phosphatase PPP1CA. Interacts (via N-terminus) with Rho GTPase-activating protein DLC1; the interaction is decreased by phosphorylation of TNS1. Interacts with tyrosine-phosphorylated proteins BCAR1/p130Cas and PTK2/FAK; the interactions are increased by phosphorylation of TNS1 PMID 17517630 ↗ · PMID 19826001 ↗ · PMID 20798394 ↗ · PMID 26427649 ↗ |
| 細胞定位 | TNS1 位於細胞周邊時，較常見於纖維狀黏附而非 focal adhesions；它也可由細胞邊緣轉移至細胞中心，且此轉位依賴 ITGB1BP1。來源另將其定位註釋於細胞表面、細胞連結中的 focal adhesions，以及細胞質細胞骨架。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell surface; Cell junction, focal adhesion; Cytoplasm, cytoskeleton; Localizes to both focal adhesions and fibrillar adhesions. Localized at the cell periphery preferentially to fibrillar adhesions rather than to focal adhesions. Translocates from the cell edge to the cell center in an ITGB1BP1-dependent manner PMID 21768292 ↗ · PMID 19826001 ↗ · PMID 20069572 ↗ |
| 調控 | TGFB 誘導 TNS1 的作用依賴 TGFBR1 訊號，但不依賴 SMAD 訊號。ROCK 活化、肌動蛋白聚合及 MRTFA/MLK1 活化也都是 TNS1 對 TGFB 產生誘導反應所必需的條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源By transforming growth factor beta (TGFB) which is dependent on signaling through the transforming growth factor receptor TGFBR1 but is independent of SMAD signaling. ROCK activation, actin polymerization and MRTFA/MLK1 activation are required for TNS1 inducibility by TGFB PMID 28005397 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGATGCTGGCGGAGCCGGAGCAGCCGCGGACTCAGAGAGC40CCTTCTGCCAGCGCCGCGGGGACTCTAGCTTCAGGGGCTC80TTCACAGGCCCTGGGCGTGCCTCAGTGACGGGACCCAGCA120AAGATGACGTGGATCTGTCTGTCCTGCATGCTCTGGCCAG160AGGATCTGGAGGCCCCCAAGACACACCGCTTCAAGGTGAA200GACCTTCAAGAAGGTGAAGCCCTGTGGGATCTGCCGCCAG240GTCATCACCCAGGAAGGCTGCACCTGCAAAGTCTGCAGCT280TCTCCTGTCATCGGAAATGCCAGGCCAAGGTGGCTGCCCC320CTGCGTTCCTCCATCCAACCATGAGCTGGTGCCCATCACC360ACTGAGAATGCACCAAAGAATGTAGTGGACAAGGGAGAAG400GAGCCTCCCGGGGTGGAAACACACGGAAAAGCCTCGAGGA440CAACGGCTCCACCAGGGTCACCCCGAGTGTCCAGCCCCAC480CTCCAGCCCATCAGAAACATGAGTGTGAGCCGGACCATGG520AGGACAGCTGTGAGCTGGACCTGGTGTACGTCACAGAGAG560GATCATCGCTGTCTCCTTCCCCAGCACAGCCAATGAGGAG600AACTTCCGGAGCAACCTCCGTGAGGTGGCGCAGATGCTCA640AGTCCAAACATGGAGGCAACTACCTGCTGTTCAACCTCTC680TGAGCGGAGACCTGACATCACGAAGCTCCATGCCAAGGTA720CTGGAATTTGGCTGGCCCGACCTCCACACCCCAGCCCTGG760AGAAGATCTGCAGCATCTGTAAGGCCATGGACACATGGCT800CAATGCAGACCCTCACAATGTCGTTGTTCTACACAACAAG840GGAAACCGAGGCAGGATAGGAGTTGTCATCGCGGCTTACA880TGCACTACAGCAACATTTCTGCCAGTGCGGACCAGGCTCT920GGACCGGTTTGCAATGAAGCGGTTCTATGAGGATAAGATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。