基因總覽
TNRC6A（trinucleotide repeat containing adaptor 6A）是人類的蛋白質編碼基因，其產物 Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein 屬於 GW182 family。這種大型蛋白具有多個與 Argonaute family proteins 互作相關的區域，也含有 RRM、PABPC1-interacting motif-2（PAM2）及多段預測為無序的區域。這些結構註解呈現其作為分子支架的特性；具體如何參與 RNA 介導的基因沉默，見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395799 ★ | 24,729,651–24,826,218 | 25 |
| ENST00000315183 | 24,729,651–24,826,227 | 24 |
| ENST00000895467 | 24,729,651–24,826,227 | 23 |
| ENST00000938481 | 24,729,651–24,826,227 | 22 |
| ENST00000938482 | 24,729,651–24,826,227 | 23 |
| ENST00000938483 | 24,729,651–24,826,227 | 24 |
| ENST00000938484 | 24,729,651–24,826,227 | 24 |
| ENST00000938485 | 24,729,651–24,826,227 | 22 |
| ENST00000949507 | 24,729,651–24,826,227 | 25 |
| ENST00001109065 | 24,729,651–24,790,724 | 4 |
| ENST00001109066 | 24,729,651–24,759,065 | 4 |
| ENST00001113431 | 24,729,651–24,792,439 | 6 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNRC6A 參與由 micro-RNAs（miRNAs）與 short interfering RNAs（siRNAs）介導的 RNA 基因沉默。它在 miRNA 依賴的翻譯抑制，以及 siRNA 依賴、由 Argonaute family proteins 執行的互補 mRNA 內切核酸酶切割中具有必要作用。這兩類小 RNA 引導的沉默途徑雖有不同的 mRNA 調控結果，TNRC6A 都參與其中。
在分子作用上，TNRC6A 作為支架蛋白，與結合在部分互補 mRNA 上的 Argonaute 蛋白相連。它還能同時招募 CCR4-NOT 與 PAN deadenylase complexes，將 RNA 辨識相關的 Argonaute 蛋白連結至去腺苷化複合體。來源指出這些複合體可由 TNRC6A 同時招募，但未進一步說明各複合體在不同條件下的相對貢獻。
因此，TNRC6A 的作用不僅是與 Argonaute 蛋白結合，也包括協調小 RNA 導引的辨識與 mRNA 調控機制。miRNA 路徑的結果是翻譯受到抑制；siRNA 路徑則涉及互補 mRNA 的內切切割。來源所支持的功能範圍包括這兩種沉默方式及與去腺苷化複合體的連結，未提供更廣泛的生理效應或其他作用途徑。
Promoter 與基因調控
>TNRC6A ENST00000395799 GRCh38 chr16:24728651-24729751 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATCTTACTGTATCTACATGTATGTGTATTGTTGTATCTACCTGCAGATATGTATGTCTTATTGTATCTA CATGTAGGTATGTATGTATACTTTTAATGTACACATATGCATCTGTGTCTACATATATACATATCTTAGT CTATCTACATGTATGTATCTTACTGTGTCTACACTAAGATGTTTCTTACTGTGTGAGCTACGTTGGAACC TGCTTTTTCATTTATTCTATTGCAACCATTTCCTCCATGCCGGGATTATTCCTCCACATCATTTTTACAG TGTCCTAATACATGCCAGTAGCTGTTTTTGAAGCCATCTAGTAGCGCTGGACATTTTGGCTGTTTGCAAT TTTTCACCATCATCAATACCACAGCTTAGTATCTCGAAGGTGAAATATTTGCAGATACCCAGAATTATTT CCTGAGCAGAAAATCCGTGCAGGCGGAACTGCTGAGTCAAAGGTCGGTGGATAAAAATCGCTTTTAAGCC TCACAACCCGCCTCAGGTATGCATTCTTTACCTGAGGAGGAACAGAGAAGCAGAGAGGTTAAATAACTGG CCCAAGGTCAAAAATAATTAGAAGTGGCTGAATTCAAAAGCCGCGCGGGCTCATCAGGCTGCAGTTGGGG TAAAATTTGCGTTTTAGGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCGTGTGTCAGTGGGGGAGGGGCCGGGC GGCGGGTAGGAAACTTGTGTCGCAGCAAAGAAGGAGGAGGAGGGGAGGGACTCCCCTCCTCGGTCAGACC GGAGCCGGCCGCACCGAAAAAGGTTGGACTCGGGACTCCGCAGGCCCCCCCAGCCACTCCGCGGGGCGCC TCGGAGGCTGTGACCTCCAGGGAGGTCCGGCTGGGTGCAGCGTGACACGCCGGGGCGGTTGCCAAGGACC TGCCCAATCTGCGGGTCCAGTTGCTAGGGCCTCCATCTTGGGGGCCAGTGGCCGTGGCGCCCCCGGAAGG GGTTGCCGAGTGGGGCATTCACTTCCGGTCTGGGGCCTGCGGCGGCGGCGGTGTCGGCGGCGGCGGCGGC GGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGGTCGGTGTAGAAAATGGCGCTGGTGCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNRC6A_1 ↗ | 16:24,777,224 | 正股 | 24,777,175–24,777,234 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_B6WHQ · promoter · 24729161–24729705 · regulatory
ENSR16_C4G8X · enhancer · 24729706–24731019 · regulatory
ENSR16_9CS3Z · enhancer · 24734344–24734701 · regulatory
· motif · 24729095–24729106 · motif
· motif · 24729103–24729116 · motif
· motif · 24729136–24729153 · motif
· motif · 24729212–24729224 · motif
· motif · 24729622–24729631 · motif
· motif · 24729650–24729659 · motif
· motif · 24729650–24729661 · motif
· motif · 24729650–24729661 · motif
· motif · 24729653–24729668 · motif
· motif · 24729660–24729675 · motif
· motif · 24729667–24729684 · motif
· motif · 24729676–24729693 · motif
· motif · 24729735–24729745 · motif
· motif · 24729893–24729910 · motif
· motif · 24729902–24729917 · motif
· motif · 24731619–24731631 · motif
· motif · 24732999–24733011 · motif
· motif · 24733001–24733008 · motif
· motif · 24733001–24733016 · motif
來源記載 TNRC6A 可受外源性 short interfering RNA（siRNA）作用；此項資訊描述的是外加 siRNA，未提供其他調控方式或更詳細的表現變化條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1962 aa
Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein 屬於 GW182 family，長 1,962 個胺基酸。其 N 端至中段含多個註記為可與 Argonaute family proteins 互作的區域；C 端另有 RRM 與 PABPC1-interacting motif-2（PAM2）。序列中多處區段被註記為無序，其中部分預測性註記來自序列分析資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNRC6A 定位於細胞質的 P-body；哺乳類的 P-body 也稱為 GW bodies（GWBs）。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
- AGO1Q9UL18 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- AGO2Q9UKV8 · UniProt INTERACTION · 23 experiments
- AGO3Q9H9G7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- AGO4Q9HCK5 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CNOT1A5YKK6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PABPC1P11940 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAN3Q58A45 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
TNRC6A 與 AGO1、AGO2、AGO3 及 AGO4 有互作記錄；此外也與 ZC3H12A、SND1 和 GARRE1 互作。它與 CNOT1 的互作被記載為直接，並介導 TNRC6A 與 CCR4-NOT complex 的關聯。另在微生物感染情境下，TNRC6A 與 human herpesvirus 8 蛋白 MTA/ORF57 互作；該互作會抑制 P-body 形成。
疾病與遺傳關聯
TNRC6A 相關變異被記載可造成 familial adult myoclonic epilepsy 6（FAME6），其遺傳方式為體染色體顯性。此神經疾病通常以肌陣攣性顫抖為初始症狀，可能伴隨手指顫動及肢體肌陣攣，並可因動作或姿勢而加劇；部分患者則以癲癇發作為首發表現。發作可為全身性或局部性，病程通常不進展或進展非常緩慢，部分患者有輕度認知障礙。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNRC6A 參與 miRNA 與 siRNA 介導的 RNA 基因沉默；它是 miRNA 依賴翻譯抑制及 siRNA 依賴、由 Argonaute family proteins 執行的互補 mRNA 內切切割所必需。作為支架蛋白，TNRC6A 連結結合部分互補 mRNA 的 Argonaute 蛋白，並可同時招募 CCR4-NOT 與 PAN deadenylase complexes。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in RNA-mediated gene silencing by both micro-RNAs (miRNAs) and short interfering RNAs (siRNAs). Required for miRNA-dependent repression of translation and for siRNA-dependent endonucleolytic cleavage of complementary mRNAs by argonaute family proteins. As a scaffolding protein, associates with argonaute proteins bound to partially complementary mRNAs, and can simultaneously recruit CCR4-NOT and PAN deadenylase complexes PMID 16284622 ↗ · PMID 16284623 ↗ · PMID 17596515 ↗ · PMID 17671087 ↗ · PMID 19056672 ↗ · PMID 19304925 ↗ |
| 交互作用 | TNRC6A 與 AGO2、AGO1、AGO3 及 AGO4 互作，也與 ZC3H12A、SND1 和 GARRE1 互作。它與 CNOT1 的互作為直接互作，並介導 TNRC6A 與 CCR4-NOT complex 的關聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with AGO2. Interacts with AGO1, AGO3 and AGO4. Interacts with CNOT1; the interaction is direct and mediates the association with the CCR4-NOT complex. Interacts with ZC3H12A. Interacts with SND1. Interacts with GARRE1 PMID 16284622 ↗ · PMID 16284623 ↗ · PMID 18690212 ↗ · PMID 19304925 ↗ · PMID 19324964 ↗ · PMID 19383768 ↗ · PMID 21981923 ↗ · PMID 26134560 ↗ · PMID 28546213 ↗ · PMID 29395067 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TNRC6A 與 human herpesvirus 8 蛋白 MTA/ORF57 互作；此互作會抑制 P-body 的形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with human herpesvirus 8 protein MTA/ORF57; this interaction inhibits P-body formation PMID 31400113 ↗ |
| 細胞定位 | TNRC6A 位於細胞質的 P-body；哺乳類 P-body 亦稱為 GW bodies（GWBs）。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, P-body; Mammalian P-bodies are also known as GW bodies (GWBs) PMID 11950943 ↗ · PMID 13130130 ↗ · PMID 15494374 ↗ · PMID 15908945 ↗ · PMID 16284622 ↗ · PMID 16284623 ↗ · PMID 16906129 ↗ · PMID 18946079 ↗ · PMID 19056672 ↗ · PMID 19324964 ↗ · PMID 31400113 ↗ |
| 調控 | TNRC6A 的調控資料記載外源性 short interfering RNA（siRNA）這項因素；來源未提供其他調控條件或變化方向。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | TNRC6A 相關變異可造成體染色體顯性的 familial adult myoclonic epilepsy 6（FAME6）。患者通常先出現動作或姿勢加劇的肌陣攣性顫抖，也可能以全身性或局部性癲癇發作為首發症狀；病程通常不進展或進展極慢，部分患者有輕度認知障礙。 | 含實驗來源 | 證據與來源Epilepsy, familial adult myoclonic, 6 FAME6 A form of familial myoclonic epilepsy, a neurologic disorder characterized by cortical hand tremors, myoclonic jerks and occasional generalized or focal seizures with a non-progressive or very slowly progressive disease course. Usually, myoclonic tremor is the presenting symptom, characterized by tremulous finger movements and myoclonic jerks of the limbs increased by action and posture. In a minority of patients, seizures are the presenting symptom. Some patients exhibit mild cognitive impairment. FAME6 inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618074 PMID 29507423 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTTCCGGTCTGGGGCCTGCGGCGGCGGCGGTGTCGGCGG40CGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGGTCGGTG80TAGAAAATGGCGCTGGTGCAGCGGCTCGGGCCTCTCCCCG120CGGCGCTGCGGAGGGCTTGAGGCTCGCGAGCCTCCTTCGC160CGCGCCCCACTTGCTCGTGCACTTTACACACATGAGAGAA200TTGGAAGCTAAAGCTACCAAAGACGTAGAAAGAAATCTTA240GCAGGGATTTAGTGCAAGAAGAAGAACAGTTGATGGAAGA280AAAGAAAAAGAAAAAAGACGACAAGAAAAAGAAGGAAGCT320GCTCAAAAGAAGGCCACTGAACAAAAAATCAAAGTGCCAG360AACAGATAAAGCCCAGTGTAAGCCAGCCTCAGCCTGCCAA400CTCTAATAACGGCACTTCCACAGCAACCAGCACTAATAAT440AATGCCAAGCGAGCTACAGCCAACAATCAGCAGCCACAGC480AGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCCACA520GCAGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCCACAG560CAGCAGCCACAGGCCTTGCCTCGGTATCCTCGTGAAGTAC600CTCCACGATTTCGCCACCAGGAACACAAACAGCTTCTAAA640GAGGGGTCAGCATTTTCCTGTTATAGCAGCAAACCTTGGA680TCTGCTGTTAAGGTGTTAAACAGCCAGTCAGAAAGCAGTG720CTTTAACAAATCAACAGCCACAAAATAACGGAGAGGTGCA760GAACAGCAAAAACCAGTCAGATATAAACCACAGTACTTCA800GGATCCCATTATGAAAATTCCCAGCGGGGACCTGTGTCTT840CTACAAGTGATTCTAGCACAAACTGTAAGAATGCTGTTGT880AAGTGACTTGTCGGAAAAAGAAGCATGGCCCTCAGCCCCT920GGCAGTGATCCGGAGTTGGCTTCAGAATGTATGGATGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。