演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNP2TP2

transition protein 2

TNP2 編碼 transition protein 2,屬於 Nuclear transition protein 2 家族。它在哺乳類精子細胞發育期間參與組蛋白逐步由 protamine 取代的過程。

Homo sapiens16p13.13UniProt Q05952
OFFICIAL SYMBOL
TNP2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q05952
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNP2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 transition protein 2,產物屬於 Nuclear transition protein 2 家族。這項蛋白質與哺乳類精子細胞成熟過程中的染色質蛋白轉換有關;來源指出,它在延長中的精子細胞參與組蛋白由 protamine 取代的過程。其作用涉及精子細胞染色質逐步凝縮時的核小體,並與 protamine 的招募及處理相關。這些特性使 TNP2 成為精子細胞發育期間染色質重整相關的蛋白質。

Official symbol
TNP2
Gene name
transition protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11952
UniProt
Q05952
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.13
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTNP2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:11,267,748–11,269,533
Gene span
1,786 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000312693 ★11,267,857–11,269,3252
ENST0000056075111,267,748–11,269,5331

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNP2 在哺乳類精子細胞發育過程中,參與延長中的精子細胞內組蛋白被 protamine 取代。這項轉換與染色質凝縮相連:組蛋白離開染色質,而 protamine 負責促成組蛋白的移除。來源將 TNP2 描述為此替換過程中的重要參與者,但未進一步界定它如何直接影響組蛋白移除。

在染色質凝縮中的精子細胞內,TNP2 會被載入核小體,並促進 protamine 的招募與處理。換言之,TNP2 所述的功能不只是與精子細胞中的染色質相關,也包括協助 protamine 到達並經過處理,使其能參與後續的組蛋白置換。來源未提供處理步驟的具體分子機制,因此不宜將其描述為由 TNP2 直接完成組蛋白移除。

依據來源,TNP2 的作用可放在精子細胞染色質由組蛋白配置轉向 protamine 參與的脈絡中理解。它在凝縮階段與核小體相連,並促進 protamine 招募和處理;protamine 則負責組蛋白移除。這些資訊支持 TNP2 參與精子細胞染色質轉換的角色,但未說明其作用以外的生理結果,也未提供可延伸至其他物種或細胞類型的證據。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 11269325 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNP2 ENST00000312693 GRCh38 chr16:11269225-11270325 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCCAAAGACTAGAAGATCAAATGGCTTAGTGTTCAAACATAAGTCTGGGCTTTCTTCTAGAGGTACTGG
GGTATCTGAGCAGGGACGGCGTGATTCAAACGGTATGGCGAGGCTTCGTTAGCAGGAAGGGGAGGAGAAT
CAAGAGGCAGAAACTGAAGGAGAGAGACGGGTTTCCAAGGGCCTCCTGTAGCTTGACAGGCATCTCAGGC
TCACGAGAATACCAGGAAAGAAGGAAAGACACCCCTTTGTCACATACGGCAATTAAGCCTCAGAAACCAC
AATGGCCTACCCAAGACTGGACATCAGTGCAAACTGGGATTTGAACCCGGCTCTGAATTTCCCGACTTTA
GATCTGGCTGGGGAGGTAGGCTTGCCAAGCGAGCCCCAGGACCACCCCTTGGTCCATGTGGTTACTCATC
TTTCATCCATCCACCAAGCCATCTGACCAATTCATCACCTCCCCATCATCTGGGCACTAATCATCTGTCT
TAACAACTGCCCACCATTCAGCTGCCATCACCAGGGTCAGGGCTGCACTCCTGGTACCCAAGTTGCCCAG
GGCGTTAAGAAAAACACCTGATGATGCTGGTCAGTGATGTTTACTGAGCTCTTATTGTGGGCTGGGCCTG
AGCTAACTGCTTGATATAAATTCTCTCCTTTATTAATAATTCTTCTAATGTCCGAATGAGGTCAGTACAA
TTATTATCCCTATTCTGCAGAGATGGGGAAACTGGGACTTGTTCAGGCGAATTCCCAGGGCTGACCATGT
GGAAAAAGCAGATCTGGGATGCAGACTCAGCTTAATCTGACCCAAGGGCTCCTACCCTGAACCAGTAGCT
GGGACTATCCCCAGGGTACCCCTGAGAGCTGCCCCAGCCTGGGGGTGAGGGTAAGGGGTAGGGGGCTTTG
TCTTGGCTGAGCCACATCTCTCACACCCCTGTGGCCTGGGCCATCATAATCAGCCCCAACTATATAACCA
GGTGGGCTGCCAGGGCCTCTGTAAAGCTAGGCCTGCTGGGAGAGGATGAGGAGGAGGCCCTGCCCCTCCA
AACGTGGCCTCCTATGGACACCCAGACTCACAGCCTTCCTATCACCCACAC
TNP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNP2_1 ↗16:11,269,325負股11,269,315–11,269,374

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_96GPR · enhancer · 11265670–11265950 · regulatory

ENSR16_8BXM8 · enhancer · 11273792–11273969 · regulatory

· motif · 11264364–11264375 · motif

· motif · 11264366–11264375 · motif

· motif · 11264434–11264445 · motif

· motif · 11264434–11264445 · motif

· motif · 11264434–11264447 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:138 aa

1 aa138 aa功能區域基序
依 Q05952 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

transition protein 2 長 138 個胺基酸,屬於 Nuclear transition protein 2 家族。來源將整段胺基酸序列(第 1–138 位)註記為無序區域;第 111–119 位則標示為核定位訊號。這些序列特徵提供蛋白質區域的註解,並未額外界定其結構或功能機制。

功能區域Disordered1–138 aa
基序Nuclear localization signal111–119 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q05952…

AlphaFold · Q05952

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Nucleus, nucleolus;Chromosome

來源列出 TNP2 位於細胞核、核仁及染色體,並指出它會載入凝縮中的精子細胞核小體;此載入資訊標註為相似性推定。 其核輸入由 IPO4 介導。 核仁定位則有條件限制:蛋白質必須經磷酸化;此項定位條件同樣屬相似性推定。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TP2TNP2APPBP2KRTAP1-1KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP12-3KRTAP2-4MDFI
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNP2 在哺乳類延長中的精子細胞內,參與組蛋白被 protamine 取代。在染色質凝縮中的精子細胞裡,TNP2 載入核小體,並促進 protamine 的招募與處理;protamine 負責移除組蛋白。推論支持
證據與來源

Plays a key role in the replacement of histones to protamine in the elongating spermatids of mammals. In condensing spermatids, loaded onto the nucleosomes, where it promotes the recruitment and processing of protamines, which are responsible for histone eviction

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源列出 TNP2 位於細胞核、核仁與染色體,並指出它可載入凝縮中精子細胞的核小體;該載入定位為相似性推定。IPO4 介導其核輸入,而核仁定位需要蛋白質經磷酸化;後兩項也標註為相似性推定。推論支持
證據與來源

Nucleus; Nucleus, nucleolus; Chromosome; Loaded onto the nucleosomes of condensing spermatids (By similarity). Nuclear import is mediated by IPO4. Nucleolar localization requires the protein to be phosphorylated (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000312693 · 619 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTAAAGCTAGGCCTGCTGGGAGAGGATGAGGAGGAGGCCC40
41TGCCCCTCCAAACGTGGCCTCCTATGGACACCCAGACTCA80
81CAGCCTTCCTATCACCCACACTCAGCTCCATAGCAACTCT120
121CAGCCCCAAAGCCGCACCTGCACCCGCCATTGCCAAACCT160
161TCAGCCAGAGTTGCAGACAGAGCCATCGTGGCAGCCGGAG200
201CCAGAGCTCCAGCCAGAGCCCGGCCAGCCACCGCAACCCA240
241ACTGGAGCCCACAGCTCATCCGGCCACCAGAGCCAGAGTC280
281CCAACACTAGTCCACCACCAAAGCGCCACAAAAAGACTAT320
321GAACTCCCACCACTCTCCCATGCGGCCCACCATCCTGCAC360
361TGCCGCTGCCCCAAGAACAGAAAGAACTTGGAAGGCAAGC400
401TGAAAAAGAAAAAAATGGCCAAGAGGATCCAGCAGGTGTA440
441CAAAACCAAGACGCGGAGCTCAGGATGGAAATCCAACTAA480
481TGAGACCGCACTCCTTGGCTTGTTCCTGCGTGTTTCACCC520
521AAAGGAGAAAATGCTAGGATGAAGTCAATCTTCTTGCAGG560
561AACATGTTACTATGGTGATTTCTACGCAACACTAATTAAA600
601GCTTGTACCTGGAAGACTA619

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。