基因總覽
TNP1 是蛋白質編碼基因，其產物 transition protein 1 屬於 nuclear transition protein 1 家族。此蛋白質在哺乳類精子細胞發育過程中具有特定角色，與精子細胞核內核小體的轉變有關。成熟中的精子細胞會經歷染色質組成改變；transition protein 1 是此過程相關的蛋白質之一。序列註解顯示，transition protein 1 長 55 個胺基酸，整條序列被標註為無序區域。這些基本特徵界定了它的家族歸屬、長度與序列性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000236979 ★ | 216,859,458–216,860,064 | 2 |
| ENST00001095776 | 216,859,458–216,865,732 | 6 |
| ENST00001095777 | 216,859,458–216,860,070 | 2 |
| ENST00001095778 | 216,859,458–216,860,069 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
transition protein 1 在哺乳類精子細胞延長階段參與組蛋白轉換為 protamine 的過程。這項轉換與精子細胞核內染色質的重組有關，來源將其描述為一項關鍵角色，但未提供其他物種或細胞類型中的功能資訊。
在精子細胞凝縮階段，transition protein 1 會載入核小體。此位置使它參與 protamine 的募集與處理；而 protamine 負責使組蛋白離開染色質。依此描述，transition protein 1 並非直接被指出負責驅逐組蛋白，而是促進 protamine 到達並經處理，支持後續的組蛋白移除。
來源呈現的功能順序，是 transition protein 1 在凝縮中的精子細胞核小體上作用，促進 protamine 募集與處理，並與組蛋白被 protamine 取代相連。這項描述說明其參與精子細胞染色質轉換的方式；來源未進一步交代該過程的分子細節、其他調控因子或其對成熟結果的具體影響。
Promoter 與基因調控
>TNP1 ENST00000236979 GRCh38 chr2:216859964-216861064 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATCTCACATGCCATCCTCTTAACATTTTTAAAGGCTTCCCAATGTACTTGATCATGGTTTGATCTCTGT CTCTCCCTCCAGCCTCATCCTGTACCATGTAGGGAGTTTCCCTCTGCCCTTCTCCAGCCAAAATGACTCC GTAAGTACTTACTCACTGATTTATGTAGACATCTGATGAATGGCTTTCTCCCCAGTGGGCTGAGAGTTCC ATGAGCACAGTATCTACGTGTGTTTATCCTCCACTAATTTTCTACCACCTAAATGTATGGCATATGCTAT GTGATCAATATCTGTGACTGAATTTTAAAAAATGATTAGGTTAATTGTTCTGAACCAGAGCCATTTTTTC CCTCACTTCCCCAGCCTCCCAAAGAAACAGGTGGCAATGTTTGGGAATATTTTGGGTTGTCATAGCTGCC AGGCTTCTCTGGTGTCCAGTGGGTAATGGCCAGGGATGTTGCCAAACATCCTAGGGTGCACAAGACAGCC CACTGAAAGTTACCCTGCCCATTGTGTCAACAGTGCCAAGACTGAGAAATCCTGACCTAGATGAAAAAGA AGGAATATTTCTATTTTGATCATATTGAATTGGGTTCTGTAGAGTCAAGTCCTTACAGAAATAAATTTAT TATCTCTGGATGCTGTGAGAGACTTAAACAGTCATGCATACACACACACTCAATGACTGTTACATTTCCT ACAGGCAGGAGAAGCATATCTGAATGGTCTCTTGTACTCATCCAATGCCTGGCACAGGGCTGGGATTCAG TTTCTCAATAACACCTCTCTGGGAAAGCCTCACTTAACATAAAAAGGACCTCAAAACTGAGGGCAGCCCT TGAGCTGCACGAAAAGGACCACCTTATTTCACAAATGTGACCAAAGTGCAGCAAAGGTGAGTGACAGCAC AGTAGAGCCCCGCCCACCTGCTGAGCCATGCCCCTTCCCTGTCACAATGGCCAAGGCCTTAAATACCCAG ACTCCTGGCCCCCGGGCCTTGCAAAGCCCCTCATTTTGGCAGAACTTACCATGTCGACCAGCCGCAAATT AAAGAGTCATGGCATGAGGAGGAGCAAGAGCCGATCTCCTCACAAGGGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNP1_1 ↗ | 2:216,860,064 | 負股 | 216,860,054–216,860,113 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_957423 · enhancer · 216857067–216857525 · regulatory
· motif · 216857192–216857206 · motif
· motif · 216857192–216857206 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：55 aa
transition protein 1 屬於 nuclear transition protein 1 家族，長 55 個胺基酸。序列註解將第 1 至第 55 個胺基酸，也就是全長序列，標示為無序區域；來源未列出其他結構域或功能區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
transition protein 1 位於細胞核與染色體，並在凝縮中的精子細胞內載入核小體。 此定位描述涵蓋其與核小體的關聯；來源未提供不同異構型或其他條件下的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBP2Q9H190 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | transition protein 1 在哺乳類延長中的精子細胞裡，對組蛋白轉換為 protamine 扮演關鍵角色。在凝縮中的精子細胞內，它會載入核小體，並促進 protamine 的募集與處理；protamine 則負責使組蛋白離開。 | 推論支持 | 證據與來源Plays a key role in the replacement of histones to protamine in the elongating spermatids of mammals. In condensing spermatids, loaded onto the nucleosomes, where it promotes the recruitment and processing of protamines, which are responsible for histone eviction |
| 細胞定位 | transition protein 1 位於細胞核與染色體；在凝縮中的精子細胞內，會載入核小體。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCAAAGCCCCTCATTTTGGCAGAACTTACCATGTCGACCA40GCCGCAAATTAAAGAGTCATGGCATGAGGAGGAGCAAGAG80CCGATCTCCTCACAAGGGAGTCAAGAGAGGTGGCAGCAAA120AGAAAATACCGTAAGGGCAACCTGAAAAGTAGGAAACGGG160GCGATGACGCCAATCGCAATTACCGCTCCCACTTGTGAGC200CCCCAGCGGGCTCTGCCCTGGTGCGCTTCACACAGCACCA240AGCAGCAACAAGAACAGCAGAAGGGGAACTGCCAAGGAGA280CCTGATGTTAGATCAAAGCCAGAGAGGAGCCTATGGAATG320TGGATCAAATGCCAGTTGTGACGAAATGAGGAATGTATAT360GTTGGCTGTTTTTCCCCAACATCTCAATAAAACTTTGAAA400GCAGAAA407cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。