演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNNT2CMPD2

troponin T2, cardiac type

TNNT2 編碼心肌型 troponin T,是肌鈣蛋白複合體中結合 tropomyosin 的亞基,參與使橫紋肌收縮調控具有鈣離子敏感性。

Homo sapiens1q32.1UniProt P45379
OFFICIAL SYMBOL
TNNT2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P45379
PDB / ALPHAFOLD
7UTI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNNT2(troponin T2, cardiac type)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 troponin T 家族,為心肌型 troponin T。這種蛋白是細肌絲調控複合體 troponin 的一個亞基,並具有結合 tropomyosin 的特性。人類 TNNT2 蛋白長 298 個胺基酸;序列註解指出,胺基酸 1–95 與 120–219 為無序區域。這些資訊界定了其家族歸屬、基本分子性質與部分序列特徵。

Official symbol
TNNT2
Gene name
troponin T2, cardiac type
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11949
UniProt
P45379
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CMPD2CMH2CMD1D

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q32.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegTNNT2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:201,356,606–201,379,773
Gene span
23,168 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000656932 ★201,359,014–201,377,68017
ENST00000455702201,359,000–201,379,77316
ENST00000660295201,359,000–201,379,77317
ENST00000714312201,359,000–201,373,25415
ENST00000367318201,359,000–201,377,68016
ENST00000422165201,359,000–201,377,68016
ENST00000714313201,359,000–201,379,77314
ENST00000714314201,359,000–201,379,77318
ENST00000367322201,359,000–201,379,77315
ENST00000658476201,359,000–201,373,26815
ENST00000412633201,359,000–201,379,77315
ENST00000367320201,359,000–201,379,77315

顯示 12/42 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNNT2 的產物 troponin T 是 troponin 複合體中結合 tropomyosin 的亞基。Troponin 位於橫紋肌細肌絲,作為調控複合體,參與控制 actomyosin ATPase 活性對鈣離子的反應。由於 TNNT2 產物位於這個調控複合體中,其分子角色與肌肉收縮調節的鈣離子敏感性相關。

此來源將其功能描述為使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣離子敏感性;也就是說,這項調控複合體的作用與鈣離子訊號如何反映於肌絲的酵素活性有關。TNNT2 產物在其中提供 tropomyosin 結合功能,屬於複合體的組成與調控角色,而非單獨被描述為執行 ATPase 反應的酵素。

因此,來源所支持的功能重點在於:TNNT2 編碼的 troponin T 透過結合 tropomyosin,成為細肌絲調控系統的一部分,並參與橫紋肌收縮相關活動的鈣離子敏感性調節。現有資料未進一步說明其調控步驟、與其他亞基的具體作用方式,或不同生理條件下的效應,故不延伸推論更細部的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 201377680 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNNT2 ENST00000656932 GRCh38 chr1:201377580-201378680 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGACCATTCCTGCTTCAGAGCCAAGCAGGACCTAGGCTGTGAAGATTCGGAGAAAGAGATGGAGGGGAG
AGTCAGCTCAGCTGCTTACTGGCTTGCTTTCCTCCTGTCTCTTTCATTTTCATAATCTACCAAACCCTGC
AATGGGCCAGCCTTGAACATACAAGTGCATGTGCATGGTCAGACACAGGCAAGCAAGCAAGACCCCTAGG
CCTGACCTATGCATCTGCAATCTAGTAGGTTTAGCAGATCATAGCCCCGCACTGCTTGATTTTAAAGCCG
TTAGGGGATGACCTTTGACAGTCCGCATCACCCCTCTCACACAACGAGCGCCTGTTCAAGGTTCTTGACT
GGAAGTTCTACCTTGTATCTGGCCTCCTGTAGCAGTTTCAGTCCATTCCCTGTGAGGAGGGTGTGCCACA
TGGCTTTGGGGGTCATGGAGAAGACCCACCTTGCAGATGTCCTCACTGGGGCTGGCAGAGCCGGCAACCT
GCCTAAGGCTGCTCAGTCCATTAGGAGCCAGTAGCCTGGAAGATGTCTTTACCCCCAGCATCAGTTCAAG
TGGAGCAGCACATAACTCTTGCCCTCTGCCTTCCAAGATTCTGGTGCTGAGACTTATGGAGTGTCTTGGA
GGTTGCCTTCTGCCCCCCAACCCTGCTCCCAGCTGGCCCTCCCAGGCCTGGGTTGCTGGCCTCTGCTTTA
TCAGGATTCTCAAGAGGGACAGCTGGTTTATGTTGCATGACTGTTCCCTGCATATCTGCTCTGGTTTTAA
ATAGCTTATCTGAGCAGCTGGAGGACCACATGGGCTTATATGGCGTGGGGTACATGTTCCTGTAGCCTTG
TCCCTGGCACCTGCCAAAATAGCAGCCAACACCCCCCACCCCCACCGCCATCCCCCTGCCCCACCCGTCC
CCTGTCGCACATTCCTCCCTCCGCAGGGCTGGCTCACCAGGCCCCAGCCCACATGCCTGCTTAAAGCCCT
CTCCATCCTCTGCCTCACCCAGTCCCCGCTGAGACTGAGCAGACGCCTCCAGGATCTGTCGGCAGCTGCT
GTTCTGAGGTAAGGCTCGGGCAGGGCTCTGGGGAAGAGGAGAGCAGAGAAT
TNNT2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNNT2_1 ↗1:201,377,680負股201,377,670–201,377,729

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_53QCTDD · CTCF_binding_site · 201375360–201375381 · regulatory

ENSR1_B3GZ3J · promoter · 201377642–201378254 · regulatory

ENSR1_B3GZ3N · enhancer · 201378598–201379173 · regulatory

ENSR1_94XX5N · enhancer · 201379768–201380208 · regulatory

ENSR1_B3GZ42 · enhancer · 201381024–201381613 · regulatory

· motif · 201375362–201375378 · motif

· motif · 201376415–201376425 · motif

· motif · 201376629–201376638 · motif

· motif · 201376671–201376680 · motif

· motif · 201376990–201377004 · motif

· motif · 201376990–201377004 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:298 aa

1 aa298 aa功能區域
依 P45379 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNNT2 蛋白長 298 個胺基酸,屬於 troponin T 家族。序列註解將胺基酸 1–95 與 120–219 標示為無序區域;此為序列特徵註解,來源未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered1–95 aa
功能區域Disordered120–219 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7UTI…

PDB · 7UTI

EM · 4.80 A · X/Y/c/d=1-298

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CMPD2TNNT2MORF4L2KDM1AMLXMORF4L1PPP2R5ATNNI1TNNT1TRIM69
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TNNT2 相關變異被列為家族性肥厚型心肌病 2、擴張型心肌病 1D 與家族性限制型心肌病 3 的致病原因。肥厚型心肌病常見不對稱心室肥厚,症狀可能由運動誘發,嚴重程度可由良性至高風險不等;擴張型心肌病以心室擴大及收縮功能受損為特徵,可能導致心衰竭與心律不整;限制型心肌病則有心室充盈受損及舒張容積降低,而心室壁厚與收縮功能正常或接近正常。這些是變異與疾病的關聯描述,來源未提供特定變異細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Troponin T 是 troponin 複合體中與 tropomyosin 結合的亞基。Troponin 位於細肌絲,具有調控作用,使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性對鈣離子具有敏感性。資料庫紀錄
證據與來源

Troponin T is the tropomyosin-binding subunit of troponin, the thin filament regulatory complex which confers calcium-sensitivity to striated muscle actomyosin ATPase activity

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯家族性肥厚型心肌病 2(CMH2)是遺傳性心臟疾病,特徵為心室肥厚,通常呈不對稱,且常涉及心室中隔。症狀包括呼吸困難、暈厥、昏倒、心悸與胸痛,且可能由運動誘發。疾病在家族間及家族內表現不一,嚴重程度從良性至惡性,並可能具有心衰竭與心因性猝死的高風險;來源將影響 TNNT2 的變異列為致病原因。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 2 CMH2 A hereditary heart disorder characterized by ventricular hypertrophy, which is usually asymmetric and often involves the interventricular septum. The symptoms include dyspnea, syncope, collapse, palpitations, and chest pain. They can be readily provoked by exercise. The disorder has inter- and intrafamilial variability ranging from benign to malignant forms with high risk of cardiac failure and sudden cardiac death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 115195

PMID 10525521 ↗ · PMID 11034944 ↗ · PMID 12707239 ↗ · PMID 12974739 ↗ · PMID 15563892 ↗ · PMID 16199542 ↗ · PMID 21846512 ↗ · PMID 7898523 ↗ · PMID 8205619 ↗ · PMID 8989109 ↗ · PMID 9060892 ↗ · PMID 9140840 ↗ · PMID 9482583 ↗

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疾病關聯擴張型心肌病 1D(CMD1D)以心室擴大及收縮功能受損為特徵,可導致充血性心衰竭與心律不整,患者有早逝風險。來源將影響 TNNT2 的變異列為此病的致病原因。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, dilated, 1D CMD1D A disorder characterized by ventricular dilation and impaired systolic function, resulting in congestive heart failure and arrhythmia. Patients are at risk of premature death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601494

PMID 11106718 ↗ · PMID 11684629 ↗ · PMID 15542288 ↗ · PMID 15769782 ↗ · PMID 21846512 ↗

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疾病關聯家族性限制型心肌病 3(RCM3)是一種心臟疾病,特徵為心室充盈受損、舒張容積降低,同時心室壁厚與收縮功能正常或接近正常。來源將影響 TNNT2 的變異列為此病的致病原因。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial restrictive 3 RCM3 A heart disorder characterized by impaired filling of the ventricles with reduced diastolic volume, in the presence of normal or near normal wall thickness and systolic function. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612422

PMID 16651346 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000656932 · 1,165 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCCGCTGAGACTGAGCAGACGCCTCCAGGATCTGTC40
41GGCAGCTGCTGTTCTGAGGGAGAGCAGAGACCATGTCTGA80
81CATAGAAGAGGTGGTGGAAGAGTACGAGGAGGAGGAGCAG120
121GAAGAAGCAGCTGTTGAAGAAGAGGAGGACTGGAGAGAGG160
161ACGAAGACGAGCAGGAGGAGGCAGCGGAAGAGGATGCTGA200
201AGCAGAGGCTGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGAT240
241GAAGAAGAAGAGGAAGCAAAGGAGGCTGAAGATGGCCCAA280
281TGGAGGAGTCCAAACCAAAGCCCAGGTCGTTCATGCCCAA320
321CTTGGTGCCTCCCAAGATCCCCGATGGAGAGAGAGTGGAC360
361TTTGATGACATCCACCGGAAGCGCATGGAGAAGGACCTGA400
401ATGAGTTGCAGGCGCTGATCGAGGCTCACTTTGAGAACAG440
441GAAGAAAGAGGAGGAGGAGCTCGTTTCTCTCAAAGACAGG480
481ATCGAGAGACGTCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCA520
521TCCGGAATGAGCGGGAGAAGGAGCGGCAGAACCGCCTGGC560
561TGAAGAGAGGGCTCGACGAGAGGAGGAGGAGAACAGGAGG600
601AAGGCTGAGGATGAGGCCCGGAAGAAGAAGGCTTTGTCCA640
641ACATGATGCATTTTGGGGGTTACATCCAGAAGCAGGCCCA680
681GACAGAGCGGAAAAGTGGGAAGAGGCAGACTGAGCGGGAA720
721AAGAAGAAGAAGATTCTGGCTGAGAGGAGGAAGGTGCTGG760
761CCATTGACCACCTGAATGAAGATCAGCTGAGGGAGAAGGC800
801CAAGGAGCTGTGGCAGAGCATCTATAACTTGGAGGCAGAG840
841AAGTTCGACCTGCAGGAGAAGTTCAAGCAGCAGAAATATG880
881AGATCAATGTTCTCCGAAACAGGATCAACGATAACCAGAA920
921AGTCTCCAAGACCCGCGGGAAGGCTAAAGTCACCGGGCGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。