演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNNT1ANM

troponin T1, slow skeletal type

TNNT1 編碼 troponin T1, slow skeletal type,屬於 troponin T 家族,是橫紋肌細絲調節複合體中與 tropomyosin 結合的亞基。

Homo sapiens19q13.42UniProt P13805
OFFICIAL SYMBOL
TNNT1
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P13805
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNNT1 的正式名稱為 troponin T1, slow skeletal type,屬於蛋白質編碼基因;其產物為 troponin T 家族成員。TNNT1 蛋白是 troponin 複合體的一個亞基,與橫紋肌收縮裝置中的調節系統相關。其序列全長 278 個胺基酸;資料註記第 1–63 與第 105–153 個胺基酸區段為無序區。這些基本特徵界定了其家族歸屬與蛋白質序列概況。

Official symbol
TNNT1
Gene name
troponin T1, slow skeletal type
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11948
UniProt
P13805
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ANMSTNTTNTTNTSFLJ98147MGC104241NEM5

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TNNT1pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:55,131,662–55,149,351
Gene span
17,690 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000588981 ★55,132,698–55,149,20614
ENST0000096435555,131,662–55,149,35114
ENST0000096435655,131,662–55,149,35114
ENST0000058775855,131,662–55,149,35114
ENST0000029190155,131,662–55,149,35114
ENST0000035678355,131,662–55,149,35113
ENST0000058842655,131,662–55,149,35110
ENST0000096435755,131,662–55,149,35113
ENST0000096435855,131,662–55,149,35113
ENST0000096435955,131,662–55,149,35114
ENST0000096436055,131,662–55,149,35113
ENST0000096436155,131,662–55,149,35113

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Troponin T 是 troponin 複合體中負責結合 tropomyosin 的亞基。Troponin 與 tropomyosin 位於橫紋肌細絲的調節系統中,構成調控 actomyosin ATPase 活性的組件。TNNT1 的產物因此參與肌肉收縮調節,而非單獨執行整個複合體的作用。

此調節複合體使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣離子敏感性。也就是說,複合體將鈣離子訊號與細絲調控的 ATPase 活性連結;在這個過程中,Troponin T 透過與 tropomyosin 結合,成為調節複合體的一部分。來源未進一步說明 TNNT1 在不同鈣離子條件下的分子構形變化或各亞基間的詳細作用步驟,因此不宜據此推演更細的機制。

這項功能將 TNNT1 定位於橫紋肌收縮調控的分子背景中:它提供 troponin 複合體與 tropomyosin 的結合關係,使複合體得以調節細絲上的 actomyosin ATPase 活性,並賦予該活性鈣離子敏感性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 55149206 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNNT1 ENST00000588981 GRCh38 chr19:55149106-55150206 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGACAGAAATGCACAGAGAGACTGTGAGCCCCCACAGACACAAACGCTGAGAGGGGCAGACATGCAGAG
ACACCCACAGAAATGCAGAGACAAAACCACCCGGAGACACATGCCGAGAAACACACTGAGGGGCTCAGAA
AGCGACAGATGCAGAGAGAGCCCAAGACAGACCCAGCAAGGGGCCCCGAGAAATGCACAGAAACACAAAG
ACCGAGACCACCAGAGACAGAGGTACGGAGAGGCGGGGAGGGTGAGGAAGCCTGCTCTCCAGGGCTGGCT
TGAACCTAGAACTCAAGGTCATGGCTTGGCTGGGAAGCGGGAGGGGGATACCAAAAAAGATCAGCGTTAG
ATGGAGGTGGGGAGGGAGGGTAGGTTTCACCCTAATTGACACCCCACCCTCCCCCTCCCCCTCCCCACAC
CTGCTTCCCGGCTTTAGTGCCTGTTGTCACCAGGATGGAATCCTGGCGGCAGACAAAGGGGTGGGGGTGG
GAGGAGGAGACAAAAAGATGGACAGAGACAGAGGAGGAGACTAAGAAGTAGAGACAGACACACAGAGACA
CACAGATGGAGAGCCACAGAGACAACAGAAATGGGGGTCCAGAAAGAGACCTAGATAGAAAGAGGGAACA
GAGAGAAGAAAACAGGAAACATTCCTTATAGCCCATGTGTCATTAGTAGGTCCTCCAAGGACCTACTGTG
TGCCGGGCATGGGGACGTCAAAGCACAGGGAGCTATAAGGGAGGTAGTTGGAGCACCACGGGAGCCTGGG
GTGTGGGGTGGGAGCAGGGGCGGGGCTCCTGGGCCATGCAGATGGGGTTGGCATGGGGTTGGGGAGGGGC
CCACGGAGGCTTCTGGACTCTGAGTGTGGAGCCAGGGGCAGCAGGGCTGTCTCTGAACTCCCAGGCTTGT
GTTTGAGCAAAGGAATTCTCTCCCCCTCCCTCTCCCCTCGGGGCGGGCCCGAGCCTCCAGCTATAAACTC
CCCGGAGCTTCAGTGCCCTCAGCAAGGCTCAGCCTCAAGATTCACAGCATCTCAGACACAGCCTAGGTAA
GGGGCTCTGCGGAGCCCTGTGGTCTTCAAAAACCATGTCCTTGGGGGAGGG
TNNT1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNNT1_1 ↗19:55,149,206負股55,149,196–55,149,255

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDXHD · enhancer · 55146085–55146931 · regulatory

ENSR19_5GZ7WF · CTCF_binding_site · 55146829–55146850 · regulatory

ENSR19_9RTZX · promoter · 55146932–55147439 · regulatory

ENSR19_83LR2Z · enhancer · 55149037–55149182 · regulatory

ENSR19_BDXHR · promoter · 55149183–55149696 · regulatory

ENSR19_9RW3D · enhancer · 55151972–55152349 · regulatory

· motif · 55146314–55146324 · motif

· motif · 55146327–55146337 · motif

· motif · 55146831–55146847 · motif

· motif · 55152043–55152052 · motif

· motif · 55152087–55152096 · motif

· motif · 55152107–55152116 · motif

· motif · 55152127–55152136 · motif

· motif · 55152147–55152156 · motif

· motif · 55152188–55152197 · motif

· motif · 55152208–55152217 · motif

· motif · 55152228–55152237 · motif

· motif · 55152268–55152277 · motif

· motif · 55153827–55153842 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:278 aa

1 aa278 aa功能區域
依 P13805 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNNT1 產物屬於 troponin T 家族,序列長度為 278 個胺基酸。蛋白質特徵註解將第 1–63 個及第 105–153 個胺基酸標示為無序區;這些區段資訊描述序列特徵,來源未提供其他結構域或功能區域註解。

功能區域Disordered1–63 aa
功能區域Disordered105–153 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P13805…

AlphaFold · P13805

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 17 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ANMTNNT1CCDC136KRT40LDOC1MORF4L1NFE2L2TBPL1TFIP11TPM1TPM3KRT27SBK3SDCBP2TNNI1TNNI2TNNT2TPM3TSPYL2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNNT1 與 TPM3 有互作記錄。來源將此關係描述為互作,但未進一步說明是直接實體結合、複合體組成,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TNNT1 相關變異被列為造成 Nemaline myopathy 5A、5B 與 5C 的原因。5A 為常染色體隱性、嚴重嬰兒型,出生後或嬰兒早期發病,可見顫抖、肌張力低下與肩髖輕度攣縮,並可能進展至呼吸衰竭。5B 為常染色體隱性、兒童期發病,常見近端肌無力、步態異常,部分患者動作發展遲緩;多數患者成年後仍可行走,但可能出現限制性呼吸功能不全。5C 為常染色體顯性,通常較輕,常在第一或第二個十年發病,表現包括踮腳行走困難、搖擺步態與近端肌無力;患者可行走至晚年。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Troponin T 是 troponin 複合體中與 tropomyosin 結合的亞基。此複合體位於橫紋肌細絲調節系統,賦予 actomyosin ATPase 活性對鈣離子的敏感性。資料庫紀錄
證據與來源

Troponin T is the tropomyosin-binding subunit of troponin, the thin filament regulatory complex which confers calcium-sensitivity to striated muscle actomyosin ATPase activity

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNNT1 與 TPM3 有互作關係;該敘述未進一步界定互作是否為直接結合,也未提供其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TPM3

PMID 35510366 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Nemaline myopathy 5A(NEM5A)為常染色體隱性、嚴重且進展性的嬰兒型疾病,通常在出生後或嬰兒早期發病。患者可有顫抖、肌張力低下及肩髖輕度攣縮,近端攣縮與無力逐漸加重,並可能出現雞胸;患者通常在第二年因呼吸衰竭死亡。該病由影響此基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Nemaline myopathy 5A, autosomal recessive, severe infantile NEM5A A form of nemaline myopathy. Nemaline myopathies are muscular disorders characterized by muscle weakness of varying severity and onset, and abnormal thread-like or rod-shaped structures in muscle fibers on histologic examination. NEM5A is a severe and progressive form characterized by symptom onset soon after birth or in early infancy. Affected infants display tremors with hypotonia and mild contractures of the shoulders and hips. Proximal contractures progressively weaken and a pectus carinatum deformity develops before children die of respiratory insufficiency, usually in the second year. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 605355

PMID 10952871 ↗ · PMID 32994279 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Nemaline myopathy 5B(NEM5B)為常染色體隱性、兒童期發病型。患者可有上下肢近端肌無力與步態異常,部分患者動作發展遲緩;多數患者即使到晚年仍可行走,但可能出現限制性呼吸功能不全及用力肺活量下降。該病由影響此基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Nemaline myopathy 5B, autosomal recessive, childhood-onset NEM5B A form of nemaline myopathy. Nemaline myopathies are muscular disorders characterized by muscle weakness of varying severity and onset, and abnormal thread-like or rod-shaped structures in muscle fibers on histologic examination. NEM5B is characterized by proximal muscle weakness of the lower and upper limbs, gait abnormalities, and delayed motor development in some affected individuals. Most patients remain ambulatory even into late adulthood and develop restrictive respiratory insufficiency with decreased forced vital capacity. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620386

PMID 31970803 ↗ · PMID 35165004 ↗ · PMID 35510366 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Nemaline myopathy 5C(NEM5C)為常染色體顯性、相對輕微的骨骼肌疾病,通常在第一或第二個十年出現。主要表現包括踮腳行走困難、搖擺步態、上下肢近端肌無力及 Gowers 徵象;患者可維持行走能力至晚年。該病由影響此基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Nemaline myopathy 5C, autosomal dominant NEM5C A form of nemaline myopathy. Nemaline myopathies are muscular disorders characterized by muscle weakness of varying severity and onset, and abnormal thread-like or rod-shaped structures in muscle fibers on histologic examination. NEM5C is a relatively mild skeletal muscle disorder appearing in the first or second decades. Main clinical features include difficulty walking on the heels, waddling gait, proximal muscle weakness affecting the upper and lower limbs, and Gowers sign. Patients remain ambulatory into late adulthood. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620389

PMID 29178646 ↗ · PMID 35510366 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000588981 · 1,111 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAAGGCTCAGCCTCAAGATTCACAGCATCTCAGACACA40
41GCCTAGGCCGCACCAGGATGTCGGACACCGAGGAGCAGGA80
81ATATGAGGAGGAGCAGCCGGAAGAGGAGGCTGCGGAGGAG120
121GAGGAGGAAGCCCCCGAAGAGCCGGAGCCGGTGGCAGAGC160
161CAGAAGAGGAACGCCCCAAACCAAGCCGCCCCGTGGTGCC200
201TCCTTTGATCCCGCCAAAGATCCCAGAAGGGGAGCGCGTT240
241GACTTCGATGACATCCACCGCAAGCGCATGGAGAAAGACC280
281TGCTGGAGCTGCAGACACTCATCGATGTACATTTCGAGCA320
321GCGGAAGAAGGAGGAAGAGGAGCTGGTTGCCTTGAAGGAG360
361CGCATTGAGCGGCGCCGGTCAGAGAGAGCCGAGCAACAGC400
401GCTTCAGAACTGAGAAGGAACGCGAACGTCAGGCTAAGCT440
441GGCGGAGGAGAAGATGAGGAAGGAAGAGGAAGAGGCCAAG480
481AAGCGGGCAGAGGATGATGCCAAGAAAAAGAAGGTGCTGT520
521CCAACATGGGGGCCCATTTTGGCGGCTACCTGGTCAAGGC560
561AGAACAGAAGCGTGGTAAGCGGCAGACGGGGCGGGAGATG600
601AAGGTGCGCATCCTCTCCGAGCGTAAGAAGCCTCTGGACA640
641TTGACTACATGGGGGAGGAACAGCTCCGGGCCCGGTCTGC680
681CTGGCTGCCTCCATCACAGCCCTCCTGCCCTGCCAGGGAG720
721AAAGCCCAGGAGCTGTCGGACTGGATCCACCAGCTGGAGT760
761CTGAGAAGTTCGACCTGATGGCGAAGCTGAAACAGCAGAA800
801ATATGAGATCAACGTGCTGTACAACCGCATCAGCCACGCC840
841CAGAAGTTCCGGAAGGGGGCAGGGAAGGGCCGCGTTGGAG880
881GCCGCTGGAAGTGAGGATGCCGCCCCGGACAGTGGCACCT920
921GGGAAGCCTGGGAGTGTTTGTCCCATCGGTAGCTTGAAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。