演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNNI3TNNC1

troponin I3, cardiac type

TNNI3 編碼心臟型 troponin I,是 troponin 複合體中的抑制次單元,參與調節具鈣離子敏感性的肌肉收縮相關活性。

Homo sapiens19q13.42UniProt P19429
OFFICIAL SYMBOL
TNNI3
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P19429
PDB / ALPHAFOLD
4Y99
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNNI3(troponin I3, cardiac type)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 troponin I 家族,為心臟型 troponin I。它是 troponin 複合體的抑制次單元;此複合體位於肌肉細絲的調節系統中,與橫紋肌收縮調控相關。現有資料指出,TNNI3 蛋白長 210 個胺基酸,部分區域具有無序特徵,另有區段涉及與 TNC 或 actin 的結合。來源未提供更完整的基因轉錄、蛋白質結構或表現資訊。

Official symbol
TNNI3
Gene name
troponin I3, cardiac type
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11947
UniProt
P19429
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TNNC1CMH7cTNICMD2A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TNNI3pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:55,151,763–55,157,774
Gene span
6,012 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000344887 ★55,151,767–55,157,7328
ENST0000071423655,151,767–55,157,7747
ENST0000071423755,151,767–55,157,7747
ENST0000071423855,151,767–55,157,7748
ENST0000095527955,151,767–55,157,7747
ENST0000095528255,151,767–55,157,7747
ENST0000095528055,151,767–55,157,7748
ENST0000058888255,151,767–55,156,7255
ENST0000071424055,151,767–55,156,7254
ENST0000066507055,151,767–55,157,7748
ENST0000095528155,151,767–55,157,7748
ENST0000101787855,151,767–55,157,7748

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNNI3 的蛋白質產物是 troponin I 的心臟型成員,在 troponin 複合體中擔任抑制次單元。troponin 是肌肉細絲上的調節複合體,其作用之一是使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣離子敏感性。這表示 TNNI3 所屬的調節系統與鈣離子訊號如何連結至肌肉收縮相關酵素活性有關。

來源所述的功能定位限於 troponin I 的抑制角色,以及 troponin 複合體賦予 actomyosin ATPase 活性鈣離子敏感性;並未進一步說明 TNNI3 如何感知鈣離子、其抑制作用的分子步驟或活性變化的方向。因此,不能據此延伸出更細緻的調控機制。

就生物學脈絡而言,這項功能涉及橫紋肌細絲調節系統,而非獨立於複合體之外的作用。現有資料沒有提供特定實驗條件、不同物種比較或 TNNI3 異構型差異,也未交代該功能在不同生理狀態下的變化;相關描述應限於所述的複合體角色與鈣離子敏感性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 55157732 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNNI3 ENST00000344887 GRCh38 chr19:55157632-55158732 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGGGGTGTCTCCTCACCAGGGCCTGGTCAGCACCCAGATGGTTCAAGTAAAGCAAGTTGTGTCCACCCT
TCTGTGTGTCCAAGCGTCTTTCCTGTCCTATGTCCGTCTCCAGGGCTGGGAGAGAAAGGCCCAGGAGTGC
TGGACAGAGGAAGCCAGAAACCAGATTCCTGGGTTTCCAAGTGGACGAGGGATGGATTTCCCAGTGCTAT
TGACTGAGAGCTAGCCCCGAGCACAGCTGCATCCTCAAATTAATCAACAACATTTATTGAGTGGCCTGGA
CTCCTGGGTCTGAGGGGAGAGGGATTGGGGTCCTGGACTCCTCGGTCTGAGGGGAGAGGGATTGGGGTCC
TGGACTCCTGGTCTGAGGGAGGAGGAGCTGAGGGTGCAGACTCTTGAGTCTGAGAGAGGAAGTGTGCTGG
GGGCCTGCCTGGACTCCCTTGTCTGAGGGAGGGGCTGGGGGCCTGGACCCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGG
GCTGGGGGCCTGGACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCTGGGGCCTGGACTCTTGGGTCTGAGGGAGGA
GGGGCTGGGGCCTGGACTCTTGGGTCTGAGGGAAGAGGAGCTGGGGGCCTGGACTCTTGGGTCTGAGGGA
GGAGGGGCTGGGGGCCTGGACTCTTGGGTCTGAGGGAAGAGGAGCTGGGGGCCCAGACACTTGAGTCTGA
GGGAAAAGGGGGCTGGGGGCCTGGACTCCTTGTGTGAGGGAGTGGCCAGGGTCTCCCAGGGTCCTGGGAC
TGAGGGAGGAGGAGGTTGGGAGGTCGGGCATTCTCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGTCTAGGACTCCAGGA
TCAGAGGGAGGAGGGTCCGGATTCCTGTGCCCGGAGGTGGCTGGTGATCCAGCTGGAGCAGGGCCCACCC
CGCCCCTCACGCGCCCCCGTTATCTGGCATAGTGGGCAGGGGGAGGAGGAGGTGACAGTATATTTAGTCT
GTGTCCTCGCCCTTTATCTCAGTGTCCTCGGGGAGTCTCAAGCAGCCCGGAGGAGACTGACGGTCCCTGG
GACCCTGAAGGTCACCCGGGCGGCCCCCTCACTGACCCTCCAAACGCCCCT
TNNI3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNNI3_3 ↗19:55,156,332負股55,156,322–55,156,381
TNNI3_2 ↗19:55,157,732負股55,157,722–55,157,781
TNNI3_1 ↗19:55,160,678負股55,160,668–55,160,727

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9RW4Q · promoter · 55156715–55157215 · regulatory

ENSR19_83LR82 · promoter · 55157722–55157901 · regulatory

ENSR19_BDXK6 · promoter · 55158449–55159321 · regulatory

ENSR19_5GZB9N · CTCF_binding_site · 55160707–55160728 · regulatory

· motif · 55153827–55153842 · motif

· motif · 55156482–55156492 · motif

· motif · 55156502–55156512 · motif

· motif · 55156534–55156544 · motif

· motif · 55156551–55156561 · motif

· motif · 55156786–55156796 · motif

· motif · 55156954–55156964 · motif

· motif · 55159037–55159043 · motif

· motif · 55160709–55160725 · motif

· motif · 55160787–55160797 · motif

· motif · 55160819–55160829 · motif

· motif · 55160976–55160986 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:210 aa

1 aa210 aa功能區域
依 P19429 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNNI3 蛋白長 210 個胺基酸,屬於 troponin I 家族。第 1–43 位胺基酸區段註記為無序區;第 32–79 位涉及與 TNC 結合,第 129–149 位則涉及與 TNC 及 actin 結合。

功能區域Disordered1–43 aa
功能區域Involved in binding TNC32–79 aa
功能區域Involved in binding TNC and actin129–149 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4Y99…

PDB · 4Y99

X-ray · 2.00 A · C=1-210

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TNNC1TNNI3IFNA4PDE4DIPPEX1RASSF10RCAN3TNNC1TNNC2TNNI3KWFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNNI3 可與 actin 和 tropomyosin 結合;來源另記載其與 TRIM63 及 STK4/MST1 有互作,但未在此資料中說明這些互作是否代表直接結合或共同組成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 TNNI3 的變異與多種家族性心肌病相關。家族性肥厚型心肌病 7(CMH7)可見心室肥厚,常呈不對稱並可能涉及心室中隔;症狀與嚴重程度可在家族內及家族間變動,運動可能誘發呼吸困難、暈厥、心悸或胸痛,嚴重者有心衰竭及猝死風險。家族性限制型心肌病 1(RCM1)則與心室充盈受損、舒張容積降低相關,心室壁厚度及收縮功能可正常或近乎正常。此外,擴張型心肌病 2A(CMD2A)及 1FF(CMD1FF)均描述為心室擴張與收縮功能受損,可能導致充血性心衰竭及心律不整,患者有早逝風險。這些疾病條目將其歸因於影響該基因的變異;資料未提供特定變異的細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Troponin I 是 troponin 複合體中的抑制次單元;該複合體位於肌肉細絲的調節系統,能使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣離子敏感性。資料庫紀錄
證據與來源

Troponin I is the inhibitory subunit of troponin, the thin filament regulatory complex which confers calcium-sensitivity to striated muscle actomyosin ATPase activity

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交互作用TNNI3 與 actin 及 tropomyosin 結合;來源亦記載它與 TRIM63、STK4/MST1 互作,但未進一步界定這些互作的形式。含實驗來源
證據與來源

Binds to actin and tropomyosin. Interacts with TRIM63. Interacts with STK4/MST1

PMID 12060657 ↗ · PMID 15601779 ↗ · PMID 18986304 ↗

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疾病關聯TNNI3 相關變異與家族性肥厚型心肌病 7(CMH7)有關。此遺傳性心臟疾病以心室肥厚為特徵,通常不對稱且常涉及心室中隔;症狀包括呼吸困難、暈厥、昏倒、心悸及胸痛,運動容易誘發症狀。疾病嚴重度在家族間及家族內均有差異,從良性到惡性不等,嚴重者有心衰竭及猝死的高風險。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 7 CMH7 A hereditary heart disorder characterized by ventricular hypertrophy, which is usually asymmetric and often involves the interventricular septum. The symptoms include dyspnea, syncope, collapse, palpitations, and chest pain. They can be readily provoked by exercise. The disorder has inter- and intrafamilial variability ranging from benign to malignant forms with high risk of cardiac failure and sudden cardiac death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613690

PMID 11815426 ↗ · PMID 12707239 ↗ · PMID 12974739 ↗ · PMID 16199542 ↗ · PMID 9241277 ↗

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疾病關聯影響 TNNI3 的變異與家族性限制型心肌病 1(RCM1)相關。此心臟疾病的特徵是心室充盈受損、舒張容積降低,同時心室壁厚度與收縮功能維持正常或接近正常。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial restrictive 1 RCM1 A heart disorder characterized by impaired filling of the ventricles with reduced diastolic volume, in the presence of normal or near normal wall thickness and systolic function. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 115210

PMID 12531876 ↗

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疾病關聯影響 TNNI3 的變異與擴張型心肌病 2A(CMD2A)相關。此疾病具有心室擴張及收縮功能受損的特徵,可導致充血性心衰竭與心律不整,患者有早逝風險。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, dilated, 2A CMD2A A disorder characterized by ventricular dilation and impaired systolic function, resulting in congestive heart failure and arrhythmia. Patients are at risk of premature death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611880

PMID 19590045 ↗ · PMID 21846512 ↗

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疾病關聯影響 TNNI3 的變異與擴張型心肌病 1FF(CMD1FF)相關。此疾病具有心室擴張及收縮功能受損的特徵,可導致充血性心衰竭與心律不整,患者有早逝風險。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, dilated, 1FF CMD1FF A disorder characterized by ventricular dilation and impaired systolic function, resulting in congestive heart failure and arrhythmia. Patients are at risk of premature death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613286

PMID 19590045 ↗ · PMID 21846512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000344887 · 843 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGTCCTCGGGGAGTCTCAAGCAGCCCGGAGGAGACTGA40
41CGGTCCCTGGGACCCTGAAGGTCACCCGGGCGGCCCCCTC80
81ACTGACCCTCCAAACGCCCCTGTCCTCGCCCTGCCTCCTG120
121CCATTCCCGGCCTGAGTCTCAGCATGGCGGATGGGAGCAG160
161CGATGCGGCTAGGGAACCTCGCCCTGCACCAGCCCCAATC200
201AGACGCCGCTCCTCCAACTACCGCGCTTATGCCACGGAGC240
241CGCACGCCAAGAAAAAATCTAAGATCTCCGCCTCGAGAAA280
281ATTGCAGCTGAAGACTCTGCTGCTGCAGATTGCAAAGCAA320
321GAGCTGGAGCGAGAGGCGGAGGAGCGGCGCGGAGAGAAGG360
361GGCGCGCTCTGAGCACCCGCTGCCAGCCGCTGGAGTTGGC400
401CGGGCTGGGCTTCGCGGAGCTGCAGGACTTGTGCCGACAG440
441CTCCACGCCCGTGTGGACAAGGTGGATGAAGAGAGATACG480
481ACATAGAGGCAAAAGTCACCAAGAACATCACGGAGATTGC520
521AGATCTGACTCAGAAGATCTTTGACCTTCGAGGCAAGTTT560
561AAGCGGCCCACCCTGCGGAGAGTGAGGATCTCTGCAGATG600
601CCATGATGCAGGCGCTGCTGGGGGCCCGGGCTAAGGAGTC640
641CCTGGACCTGCGGGCCCACCTCAAGCAGGTGAAGAAGGAG680
681GACACCGAGAAGGAAAACCGGGAGGTGGGAGACTGGCGCA720
721AGAACATCGATGCACTGAGTGGAATGGAGGGCCGCAAGAA760
761AAAGTTTGAGAGCTGAGCCTTCCTGCCTACTGCCCCTGCC800
801CTGAGGAGGGCCCTGAGGAATAAAGCTTCTCTCTGAGCTG840
841AAA843

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。