演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNNI2FSSV

troponin I2, fast skeletal type

TNNI2 編碼快骨骼肌型 troponin I,是 troponin 複合體的抑制次單元,參與調節橫紋肌肌動蛋白與肌球蛋白的 ATPase 活性及其對鈣離子的敏感性。

Homo sapiens11p15.5UniProt P48788
OFFICIAL SYMBOL
TNNI2
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P48788
PDB / ALPHAFOLD
7KAA
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNNI2(troponin I2, fast skeletal type)是蛋白質編碼基因,其產物為快骨骼肌型 troponin I,屬於 troponin I 家族。此蛋白是 troponin 複合體的抑制次單元;troponin 複合體位於肌絲調節系統中,與橫紋肌 actomyosin ATPase 活性的鈣敏感性有關。

Official symbol
TNNI2
Gene name
troponin I2, fast skeletal type
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11946
UniProt
P48788
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FSSVDA2BfsTnIAMCD2B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.5
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTNNI2pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:1,838,971–1,841,680
Gene span
2,710 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000381911 ★1,838,981–1,841,6788
ENST000011400571,838,971–1,841,6788
ENST000003819061,839,395–1,841,6788
ENST000002528981,839,697–1,841,6807
ENST000003819051,840,194–1,841,6786

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNNI2 的產物 troponin I 是 troponin 調節複合體中的抑制次單元。此複合體作用於細肌絲,並使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣敏感性,因此 troponin I 的角色與細肌絲調控及肌肉收縮相關的酵素活性調節相連。

來源將 troponin I 描述為抑制性次單元,並指出 troponin 複合體賦予橫紋肌 actomyosin ATPase 活性鈣敏感性。這表示其功能重點不只是構成複合體,也涉及該活性對鈣離子狀態的調節反應;現有資料未進一步說明具體分子步驟或不同條件下的作用差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1838981 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNNI2 ENST00000381911 GRCh38 chr11:1837981-1839081 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCTGCCTTAGCGGCTGGGGCCTCCACGCTGCTGTCTCCTCTGATCCTCCCCACGGGGCTGCGAAGCCGG
CAGGGCTGGGGCCAAGAGCCCCCACTCCGAGAGGGTGCCAAGTCACGGTCCAGGGGACCTCTGCAGGGCG
GGGGCCTGGGGGCTGGGGGGGCGATGGCCTCGGGCCTGGGTGAAAAGGGCAATGCCAGGCCTGCCCGGGC
AGCCAGGAGGGCCCCAAGCCCCCACGGGTGTGAGAGGCTCCCAATGCAGGTGGCGCCATTCTCCTTAGGT
TGAAGGATGTGTTCCAAGTCGCCCGGCAAGGGGACTGCAGCAGGGCGTTCTGGGCAGGCGGGAGGGGCCC
AGAGGCACGTGCGGCGTGCCCCTCACTCCTGGTCCTGCTCCCCAGGCAGGAAGATAGCATCACGCAGGGA
GGGGGCAGCCCCCAGCCCTCGGCCACTGTGGCAGGGCCCAGAAGGCCACATCTGGAGGTCCAGGCCTCAC
CCCAGAAGCCAGGCTTGCAGAAGGGGGTCAGGCCTGGGCTGAAGTGGGAAACCCATTGCAGGGGCTGAGC
CGGGGAGCTGGCCCCGCAGGGAGAGGCTGTGGCTGTCGCCAGCAAGCAGCCAGGTTGGTGGACTGGACGC
TGACCTCGGGTGAGATGGGCTGAGGCGAGGTGTGGATACTCGCAGCTACCCCTCAGCTGACCCGAGCTGT
GTGCCCGGCTGAGGCCACAGGCAAAGCCAGGGACACTGTCCTCAGGCTCCTTACGAGAACGACAGAGGCA
TCTCCAGCGCGTCACCGAGCCCTAAATAGAGTAGCCCAGCCACGGCACCCCCCACCAAGACTTCTTGGAC
TGGGCGGCAGCACGCGGCCAGGCCAGGCGGCCGGACAGGTGGGGAGGTCTCTGTGGCTCTCCACGCCCCC
ATTGGTCTGAGGAGGACTCTATGCCCTTTCTGAGCAGGGGCCCAGCCTGGGGGAGGCCATTTATACCCCT
CCCCCTGGGCCCACCAGCCCAACTCGCCGCTGCCGGCCTGACCTCGCTCCCAGCCCTGCTGCCCAGATTC
TAGGTGAGGCCCAGCCCGGCCCGCCGAGGCCGGGGGACAGGGCGTGGCTCG
TNNI2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_9PMP · promoter · 1833954–1834454 · regulatory

ENSR11_9PMT · promoter · 1834500–1835000 · regulatory

ENSR11_9PNL · promoter · 1837082–1837542 · regulatory

ENSR11_5FN42 · CTCF_binding_site · 1837503–1837524 · regulatory

ENSR11_5FN5R · CTCF_binding_site · 1837886–1837907 · regulatory

ENSR11_BCT3 · promoter · 1838491–1839491 · regulatory

ENSR11_BCT7 · promoter · 1839576–1840204 · regulatory

ENSR11_5FNJ6 · CTCF_binding_site · 1840133–1840154 · regulatory

ENSR11_BCTL · enhancer · 1842384–1843357 · regulatory

· motif · 1837505–1837521 · motif

· motif · 1837888–1837904 · motif

· motif · 1838494–1838501 · motif

· motif · 1838610–1838617 · motif

· motif · 1839911–1839923 · motif

· motif · 1839913–1839926 · motif

· motif · 1840071–1840084 · motif

· motif · 1840085–1840098 · motif

· motif · 1840112–1840125 · motif

· motif · 1840135–1840151 · motif

· motif · 1840377–1840392 · motif

· motif · 1840879–1840892 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:182 aa

1 aa182 aa功能區域
依 P48788 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNNI2 蛋白長 182 個胺基酸,屬於 troponin I 家族。序列第 2–48 位被註記為參與結合 TNC 的區域;第 97–117 位則被註記為參與結合 TNC 與 actin 的區域。

功能區域Involved in binding TNC2–48 aa
功能區域Involved in binding TNC and actin97–117 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7KAA…

PDB · 7KAA

NMR · - · A=99-148

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FSSVTNNI2AIRIMCTNNA3DCAF11EFCAB2ESRRAESRRGMNS1NME7PSMC5TNNC1TNNT1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNNI2 蛋白被註記可結合 actin 與 tropomyosin。此資料描述的是結合關係,未提供這些分子與 TNNI2 是否共同組成特定複合體的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TNNI2 相關變異被記載可造成遠端關節彎曲症 2B1(DA2B1),其遺傳方式為常染色體顯性。遠端關節彎曲症的特徵為先天性關節攣縮,主要影響兩個或以上肢體遠端部位,且沒有原發性神經或肌肉疾病。DA2B 的描述包括手足攣縮,以及明顯鼻唇溝、小口和眼裂向下傾斜等特殊臉部特徵。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Troponin I 是 troponin 調節複合體中的抑制次單元;該複合體位於細肌絲,並使橫紋肌 actomyosin ATPase 活性具有鈣敏感性。資料庫紀錄
證據與來源

Troponin I is the inhibitory subunit of troponin, the thin filament regulatory complex which confers calcium-sensitivity to striated muscle actomyosin ATPase activity

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNNI2 蛋白可與 actin 及 tropomyosin 結合;此敘述指出兩者為其結合對象,未提供其他結合條件或複合體資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Binds to actin and tropomyosin

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TNNI2 相關變異可造成常染色體顯性的遠端關節彎曲症 2B1(DA2B1)。此病以先天性關節攣縮為特徵,主要涉及兩個或以上肢體遠端部位,且沒有原發性神經或肌肉疾病;DA2B 可見手足攣縮、明顯鼻唇溝、小口及眼裂向下傾斜。含實驗來源
證據與來源

Arthrogryposis, distal, 2B1 DA2B1 A form of distal arthrogryposis, a disease characterized by congenital joint contractures that mainly involve two or more distal parts of the limbs, in the absence of a primary neurological or muscle disease. DA2B is characterized by contractures of the hands and feet, and a distinctive face characterized by prominent nasolabial folds, small mouth and downslanting palpebral fissures. DA2B1 inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601680

PMID 12592607 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000381911 · 751 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACTCGCCGCTGCCGGCCTGACCTCGCTCCCAGCCCTGCT40
41GCCCAGATTCTAGGCTCCAAGCTCAGGACCTCAGGATGGG80
81AGATGAGGAGAAGCGGAACAGGGCCATCACGGCCCGCAGG120
121CAGCACCTGAAGAGTGTGATGCTGCAGATAGCGGCCACGG160
161AGCTGGAGAAGGAGGAGAGCCGCCGTGAGGCAGAGAAGCA200
201GAACTACCTGGCGGAGCACTGCCCGCCGCTGCATATCCCG240
241GGCTCCATGTCTGAAGTGCAGGAGCTCTGCAAACAGCTGC280
281ACGCCAAGATCGATGCGGCTGAAGAGGAGAAGTACGACAT320
321GGAGGTGAGGGTGCAGAAGACCAGCAAGGAGCTGGAGGAC360
361ATGAACCAGAAGCTATTTGATCTGCGGGGCAAGTTCAAGC400
401GGCCCCCACTGCGGAGGGTGCGCATGTCGGCCGATGCCAT440
441GCTCAAGGCCCTGCTGGGCTCGAAGCACAAGGTGTGCATG480
481GACCTGAGGGCCAACCTGAAGCAGGTCAAGAAGGAGGACA520
521CAGAGAAGGAGCGGGACCTGCGAGACGTGGGTGACTGGAG560
561GAAGAACATCGAGGAGAAGTCTGGCATGGAGGGCCGGAAG600
601AAGATGTTTGAGTCCGAGTCCTAGGCCACTCGCTGCCCCT640
641ACGCCTGCCCCGGTGCCCGGCTCCCAGCAGAACATACTAG680
681GGAGATGCACCCAGAGCCTGCCAGGGAGGGCTGGCCTCAC720
721CACCACCGTCAATAAAGGATTTGAATCCCCA751

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。