演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNK1KOS1

tyrosine kinase non receptor 1

TNK1 是蛋白質激酶家族成員,參與細胞生長的負向調控,並在 Ras-MAPK 訊息路徑中扮演負調節角色。

Homo sapiens17p13.1UniProt Q13470
OFFICIAL SYMBOL
TNK1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q13470
PDB / ALPHAFOLD
7TCY
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNK1(tyrosine kinase non receptor 1)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白質激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族。來源指出,TNK1 具有抑制細胞生長的特性;至於其訊息作用可能涉及的發育與成人組織情境,則仍帶有不確定性。

Official symbol
TNK1
Gene name
tyrosine kinase non receptor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11940
UniProt
Q13470
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOS1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegTNK1pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:7,380,534–7,389,779
Gene span
9,246 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000688331 ★7,381,089–7,389,74213
ENST000005708967,380,534–7,389,77914
ENST000005768127,380,837–7,389,77913
ENST000011352767,380,837–7,389,77913
ENST000005767167,387,134–7,388,6993

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNK1 參與細胞生長的負向調控,並具有腫瘤抑制特性。來源亦指出,它在 Ras-MAPK 訊息路徑中扮演負向調節角色;這些描述支持 TNK1 參與限制細胞生長相關訊息活動,但未提供更細部的作用機制。

TNK1 的酵素反應為將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的酪胺酸殘基,使其形成磷酸化酪胺酸蛋白,同時產生 ADP 與 H⁺。這項反應描述了其酪胺酸激酶活性;來源未進一步指出此反應的特定受質或其如何連結至細胞生長調控。

TNK1 可能參與胎兒發育期間廣泛使用的訊息路徑,也可能在成人組織及淋巴造血系統細胞中,較具選擇性地參與訊息傳遞。來源以「可能」描述這些情境,未將其表述為已確立的普遍功能。此外,TNK1 也可能特別參與磷脂訊號傳導;此項功能同樣屬於推測,尚無來源提供更具體的分子步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 7381089 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNK1 ENST00000688331 GRCh38 chr17:7380089-7381189 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAGACATCTGGACCCCTCCCTTACCCCACATTATAAGCAAGGAGGAAGAAGAGGACCCGAGGCTGGGAA
ACGTGGAGGTGGCAGTTGGGATCAAACATCCTACATGTTTACCAAGACCAGGAGGGCTTTTCCCTCCAAG
GGACCCTTGGGACAGCAGCTGCTATGTTCACGCGTCCTTCCTTGGGACAGGGGACAGACTAGATGTCCTA
AGACTGGCAGCTTCCTCTCTGGGACCCCTGAGAGAAGCGGAGACAAATGGTCCTCCTCAGGGCCTTCTTC
AAGGTCCTGGACTTAGTCCCAGTGGCCACAGGCTAGGTAGCAGTGTGCAGGGCCCTGAGTTCTGCAGAGC
TTGCATGGAGAGCAGGCGTTACGCTGGAAGGAAGCCCAGGAGTGTCAGTAATGGGGAAGCGTGCCCTGAG
GCATGGAATGCTGCCGGTGATCAACAACAGCTTCAACTGTAGACTCTGTCTAGGCCAGGGCCAACTCTCC
GTACCAGCATCAACATCTCTCTGCCCTGGCCCCATTCCAGGGTTCATTAAGTAAAGCCTGCTAGGAAGCT
CTGAACCCCCTGCCATGGGGCAGGAACTGTGTCCTATTTAGCCTTATATTCCCTGTGCGTGGACAGGATA
GCTCTATCGGGCGCTTATTCATGTAAGAGGTAGGGTCCTGGCTGAGAGGTGAAGGATTTGGCGAGAGGGC
ATGGGGGACAGAGACAGAGGAGTGAAGTCTGGGGAGGGCTGGGAAGCTATTCGGAGAAGGCTGGAAAGAC
GTGAAGGAAGACGAGCAGAGGAGAAGGGAAGGGGGCTTCTCACAGTCGGGGCGATCTGGTCTGGAGGAGG
GAGGGGCCGCCAGTCGCCCTGGGGACCGTCACCTTGTCCCACTAGGGAACTCGGGGTGCGGCCCTCGCCG
GCCCCGGGCCAGCGGCCAGGTCCCCGCCCTCCGCGGGATTTACTCCTGTCCCGCCTCCTCGGATTTAGCC
CAGGCAGCCTGGGAGGTTCCGCAGTCGCCGCTTCCGCCTTGACCAGGTGAGGGTCCGGACCGAGCAGGGG
GCCCGGGCTGGGGAGAGCCGGCGGAGCAGCCGTCGCTGGGGGCGCGTCCGG
TNK1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNK1_1 ↗17:7,381,091正股7,381,042–7,381,101

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B3GJR · promoter · 7380317–7381099 · regulatory

ENSR17_B3GJX · enhancer · 7381100–7381959 · regulatory

ENSR17_53PW5S · CTCF_binding_site · 7384128–7384149 · regulatory

· motif · 7383815–7383824 · motif

· motif · 7383815–7383824 · motif

· motif · 7383908–7383921 · motif

· motif · 7384026–7384039 · motif

· motif · 7384130–7384146 · motif

· motif · 7384443–7384452 · motif

· motif · 7384443–7384452 · motif

· motif · 7384443–7384452 · motif

· motif · 7384443–7384452 · motif

· motif · 7384479–7384488 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:666 aa

1 aa666 aa結構域功能區域
依 Q13470 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNK1 蛋白長 666 個胺基酸,屬於酪胺酸蛋白激酶家族。其蛋白激酶結構域位於第 116–377 個胺基酸,SH3 結構域位於第 380–445 個胺基酸;第 446–493 與第 506–579 個胺基酸區段則被註記為無序區域。

結構域Protein kinase116–377 aa
結構域SH3380–445 aa
功能區域Disordered446–493 aa
功能區域Disordered506–579 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7TCY…

PDB · 7TCY

X-ray · 1.54 A · A/B=589-666

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Membrane

TNK1 位於細胞質,也可作為周邊膜蛋白出現在膜上。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOS1TNK1SFNYWHAEFAM168AGRB10SAXO1SS18L1ZNF250ZNF329
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNK1 的 Pro-rich domain 與 PLCG1 的 SH3 domain 互相作用。來源指出這項結合關係,但未說明兩者是否形成更大的複合體,亦未提供其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNK1 參與細胞生長的負向調控,具有腫瘤抑制特性,並在 Ras-MAPK 路徑中負向調節訊息。它可能參與胎兒發育期間廣泛使用的訊息路徑,以及成人組織和淋巴造血系統細胞中較具選擇性的路徑;也可能涉及磷脂訊號傳導。含實驗來源
證據與來源

Involved in negative regulation of cell growth. Has tumor suppressor properties. Plays a negative regulatory role in the Ras-MAPK pathway. May function in signaling pathways utilized broadly during fetal development and more selectively in adult tissues and in cells of the lymphohematopoietic system. Could specifically be involved in phospholipid signal transduction

PMID 10873601 ↗ · PMID 18974114 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)推論支持
證據與來源

L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNK1 透過自身的 Pro-rich domain 與 PLCG1 的 SH3 domain 互相作用;來源未描述此結合的功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with the SH3 domain of PLCG1 via its Pro-rich domain

PMID 10873601 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNK1 位於細胞質,也可定位於膜上,並屬於周邊膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Membrane / Peripheral membrane protein

PMID 10873601 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000688331 · 2,761 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAGTCGCCGCTTCCGCCTTGACCAGGTGGAGCTGGAGAC40
41CTGGTCTCTCTAGGGCCTACCCTGAGCTCACCATCTGAAG80
81GAGAGTGCCATCATCCTTAGGAACTCCTTCTCCAGACATG120
121CTTCCTGAGGCTGGCTCCCTGTGGCTACTGAAGCTGCTCC160
161GGGACATCCAGTTGGCCCAGTTTTACTGGCCCATCCTTGA200
201GGAGCTTAATGTCACTCGGCCAGAGCACTTCGACTTTGTA240
241AAGCCTGAGGACCTGGACGGCATTGGCATGGGCCGGCCTG280
281CCCAGCGCAGACTGTCCGAAGCTCTGAAAAGGCTACGTTC320
321TGGGCCTAAGTCTAAGAACTGGGTCTACAAGATCCTTGGA360
361GGTTTTGCCCCTGAGCACAAGGAGCCCACCCTGCCCTCGG400
401ACAGCCCACGGCACCTCCCTGAGCCAGAGGGGGGCCTCAA440
441GTGTCTGATCCCAGAGGGTGCTGTTTGCAGAGGGGAGCTG480
481CTGGGTTCAGGCTGCTTCGGTGTGGTGCACCGAGGGCTGT520
521GGACGCTGCCCAGTGGCAAGAGTGTCCCAGTGGCTGTCAA560
561GTCCCTCCGGGTAGGTCCCGAAGGCCCGATGGGCACAGAA600
601CTGGGGGACTTCCTGCGAGAGGTATCGGTCATGATGAACT640
641TGGAGCACCCACACGTGCTGCGTCTGCACGGCCTTGTACT680
681GGGCCAGCCTCTGCAGATGGTGATGGAGCTGGCGCCACTG720
721GGCTCCCTGCACGCGCGCCTAACGGCCCCGGCCCCGACAC760
761CCCCGCTGCTCGTGGCCCTGCTCTGCCTCTTCCTGCGGCA800
801GCTGGCGGGAGCCATGGCGTACCTGGGGGCCCGCGGGCTG840
841GTGCACCGAGACCTCGCTACGCGCAACCTACTGCTGGCGT880
881CGCCGCGCACCATCAAGGTGGCTGACTTCGGGCTGGTGCG920
921GCCTCTGGGCGGTGCCCGGGGCCGCTACGTCATGGGCGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。