基因總覽
TNK1(tyrosine kinase non receptor 1)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白質激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族。來源指出,TNK1 具有抑制細胞生長的特性;至於其訊息作用可能涉及的發育與成人組織情境,則仍帶有不確定性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000688331 ★ | 7,381,089–7,389,742 | 13 |
| ENST00000570896 | 7,380,534–7,389,779 | 14 |
| ENST00000576812 | 7,380,837–7,389,779 | 13 |
| ENST00001135276 | 7,380,837–7,389,779 | 13 |
| ENST00000576716 | 7,387,134–7,388,699 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNK1 參與細胞生長的負向調控,並具有腫瘤抑制特性。來源亦指出,它在 Ras-MAPK 訊息路徑中扮演負向調節角色;這些描述支持 TNK1 參與限制細胞生長相關訊息活動,但未提供更細部的作用機制。
TNK1 的酵素反應為將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的酪胺酸殘基,使其形成磷酸化酪胺酸蛋白,同時產生 ADP 與 H⁺。這項反應描述了其酪胺酸激酶活性;來源未進一步指出此反應的特定受質或其如何連結至細胞生長調控。
TNK1 可能參與胎兒發育期間廣泛使用的訊息路徑,也可能在成人組織及淋巴造血系統細胞中,較具選擇性地參與訊息傳遞。來源以「可能」描述這些情境,未將其表述為已確立的普遍功能。此外,TNK1 也可能特別參與磷脂訊號傳導;此項功能同樣屬於推測,尚無來源提供更具體的分子步驟。
Promoter 與基因調控
>TNK1 ENST00000688331 GRCh38 chr17:7380089-7381189 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAGACATCTGGACCCCTCCCTTACCCCACATTATAAGCAAGGAGGAAGAAGAGGACCCGAGGCTGGGAA ACGTGGAGGTGGCAGTTGGGATCAAACATCCTACATGTTTACCAAGACCAGGAGGGCTTTTCCCTCCAAG GGACCCTTGGGACAGCAGCTGCTATGTTCACGCGTCCTTCCTTGGGACAGGGGACAGACTAGATGTCCTA AGACTGGCAGCTTCCTCTCTGGGACCCCTGAGAGAAGCGGAGACAAATGGTCCTCCTCAGGGCCTTCTTC AAGGTCCTGGACTTAGTCCCAGTGGCCACAGGCTAGGTAGCAGTGTGCAGGGCCCTGAGTTCTGCAGAGC TTGCATGGAGAGCAGGCGTTACGCTGGAAGGAAGCCCAGGAGTGTCAGTAATGGGGAAGCGTGCCCTGAG GCATGGAATGCTGCCGGTGATCAACAACAGCTTCAACTGTAGACTCTGTCTAGGCCAGGGCCAACTCTCC GTACCAGCATCAACATCTCTCTGCCCTGGCCCCATTCCAGGGTTCATTAAGTAAAGCCTGCTAGGAAGCT CTGAACCCCCTGCCATGGGGCAGGAACTGTGTCCTATTTAGCCTTATATTCCCTGTGCGTGGACAGGATA GCTCTATCGGGCGCTTATTCATGTAAGAGGTAGGGTCCTGGCTGAGAGGTGAAGGATTTGGCGAGAGGGC ATGGGGGACAGAGACAGAGGAGTGAAGTCTGGGGAGGGCTGGGAAGCTATTCGGAGAAGGCTGGAAAGAC GTGAAGGAAGACGAGCAGAGGAGAAGGGAAGGGGGCTTCTCACAGTCGGGGCGATCTGGTCTGGAGGAGG GAGGGGCCGCCAGTCGCCCTGGGGACCGTCACCTTGTCCCACTAGGGAACTCGGGGTGCGGCCCTCGCCG GCCCCGGGCCAGCGGCCAGGTCCCCGCCCTCCGCGGGATTTACTCCTGTCCCGCCTCCTCGGATTTAGCC CAGGCAGCCTGGGAGGTTCCGCAGTCGCCGCTTCCGCCTTGACCAGGTGAGGGTCCGGACCGAGCAGGGG GCCCGGGCTGGGGAGAGCCGGCGGAGCAGCCGTCGCTGGGGGCGCGTCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNK1_1 ↗ | 17:7,381,091 | 正股 | 7,381,042–7,381,101 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_B3GJR · promoter · 7380317–7381099 · regulatory
ENSR17_B3GJX · enhancer · 7381100–7381959 · regulatory
ENSR17_53PW5S · CTCF_binding_site · 7384128–7384149 · regulatory
· motif · 7383815–7383824 · motif
· motif · 7383815–7383824 · motif
· motif · 7383908–7383921 · motif
· motif · 7384026–7384039 · motif
· motif · 7384130–7384146 · motif
· motif · 7384443–7384452 · motif
· motif · 7384443–7384452 · motif
· motif · 7384443–7384452 · motif
· motif · 7384443–7384452 · motif
· motif · 7384479–7384488 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:666 aa
TNK1 蛋白長 666 個胺基酸,屬於酪胺酸蛋白激酶家族。其蛋白激酶結構域位於第 116–377 個胺基酸,SH3 結構域位於第 380–445 個胺基酸;第 446–493 與第 506–579 個胺基酸區段則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNK1 位於細胞質,也可作為周邊膜蛋白出現在膜上。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- SFNP31947 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAEP62258 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FAM168AQ92567-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB10Q13322-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SAXO1Q8IYX7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SS18L1O75177-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF250P15622-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF329Q86UD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TNK1 的 Pro-rich domain 與 PLCG1 的 SH3 domain 互相作用。來源指出這項結合關係,但未說明兩者是否形成更大的複合體,亦未提供其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNK1 參與細胞生長的負向調控,具有腫瘤抑制特性,並在 Ras-MAPK 路徑中負向調節訊息。它可能參與胎兒發育期間廣泛使用的訊息路徑,以及成人組織和淋巴造血系統細胞中較具選擇性的路徑;也可能涉及磷脂訊號傳導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in negative regulation of cell growth. Has tumor suppressor properties. Plays a negative regulatory role in the Ras-MAPK pathway. May function in signaling pathways utilized broadly during fetal development and more selectively in adult tissues and in cells of the lymphohematopoietic system. Could specifically be involved in phospholipid signal transduction PMID 10873601 ↗ · PMID 18974114 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | TNK1 透過自身的 Pro-rich domain 與 PLCG1 的 SH3 domain 互相作用;來源未描述此結合的功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TNK1 位於細胞質,也可定位於膜上,並屬於周邊膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAGTCGCCGCTTCCGCCTTGACCAGGTGGAGCTGGAGAC40CTGGTCTCTCTAGGGCCTACCCTGAGCTCACCATCTGAAG80GAGAGTGCCATCATCCTTAGGAACTCCTTCTCCAGACATG120CTTCCTGAGGCTGGCTCCCTGTGGCTACTGAAGCTGCTCC160GGGACATCCAGTTGGCCCAGTTTTACTGGCCCATCCTTGA200GGAGCTTAATGTCACTCGGCCAGAGCACTTCGACTTTGTA240AAGCCTGAGGACCTGGACGGCATTGGCATGGGCCGGCCTG280CCCAGCGCAGACTGTCCGAAGCTCTGAAAAGGCTACGTTC320TGGGCCTAAGTCTAAGAACTGGGTCTACAAGATCCTTGGA360GGTTTTGCCCCTGAGCACAAGGAGCCCACCCTGCCCTCGG400ACAGCCCACGGCACCTCCCTGAGCCAGAGGGGGGCCTCAA440GTGTCTGATCCCAGAGGGTGCTGTTTGCAGAGGGGAGCTG480CTGGGTTCAGGCTGCTTCGGTGTGGTGCACCGAGGGCTGT520GGACGCTGCCCAGTGGCAAGAGTGTCCCAGTGGCTGTCAA560GTCCCTCCGGGTAGGTCCCGAAGGCCCGATGGGCACAGAA600CTGGGGGACTTCCTGCGAGAGGTATCGGTCATGATGAACT640TGGAGCACCCACACGTGCTGCGTCTGCACGGCCTTGTACT680GGGCCAGCCTCTGCAGATGGTGATGGAGCTGGCGCCACTG720GGCTCCCTGCACGCGCGCCTAACGGCCCCGGCCCCGACAC760CCCCGCTGCTCGTGGCCCTGCTCTGCCTCTTCCTGCGGCA800GCTGGCGGGAGCCATGGCGTACCTGGGGGCCCGCGGGCTG840GTGCACCGAGACCTCGCTACGCGCAACCTACTGCTGGCGT880CGCCGCGCACCATCAAGGTGGCTGACTTCGGGCTGGTGCG920GCCTCTGGGCGGTGCCCGGGGCCGCTACGTCATGGGCGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。