基因總覽
TNFSF9 是蛋白質編碼基因，其產物 TNF superfamily member 9 屬於腫瘤壞死因子家族，是一種可與 TNFRSF9 結合的細胞激素。其蛋白質長 254 個胺基酸，具有單次穿膜的第二型膜蛋白拓撲結構，包含細胞質區、跨膜區與細胞外區；細胞外區中另有標註為 THD 的結構域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000245817 ★ | 6,531,026–6,535,924 | 3 |
| ENST00001122907 | 6,530,985–6,535,926 | 2 |
| ENST00001136559 | 6,530,985–6,535,926 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNF superfamily member 9 是可結合 TNFRSF9 的細胞激素。這項結合關係是來源所述的主要分子特性；來源未進一步說明結合如何傳遞訊號或涉及哪些下游分子，因此不宜延伸推定其機制。
在細胞功能方面，TNF superfamily member 9 可誘導已活化的周邊血液 T 細胞增殖。此作用描述限定於已活化的周邊血液 T 細胞，並不代表來源指出它會促進所有 T 細胞或其他細胞增殖。來源也未交代誘導增殖的具體條件與分子步驟。
此外，TNF superfamily member 9 可能參與活化誘導細胞死亡（AICD），但此處僅指出可能具有角色，未提供其作用方向、發生條件或具體機制。它也可能參與 T 細胞與 B 細胞或巨噬細胞之間的同源性互動；此項功能同樣以可能性表述，來源沒有進一步界定互動過程或其結果。這些描述顯示其功能涉及免疫細胞增殖及細胞間互動，但不應將未明確指出的作用細節視為已確立。
Promoter 與基因調控
>TNFSF9 ENST00000245817 GRCh38 chr19:6530026-6531126 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGACATAGATAAAAGAGCCAGAGACAGGGAGAGAGACACAGAGACAGAGACATAGAGACAGAGATAAC AGAGCCAGAGACAGAGTCAGAGACAGAGACAGAGAGAGCCAGACACAGAGACAGAGAGAGAGAGTCACAG CCAGAGACAGCGACAGAGATAACAGAAGCAGAGAGAGGGAGAAAGATAACAGAGCCAGAGACAGTCAGAG ACAGAGATAGAGAGACAGAGATAACAGAGCCAGAGACAGATACAGAGACAGAGATAACGGAGCCAGAGAT AGGGAGAGAGAGTCAGAGACAGAGAGAGATATATAGACAGAGATAACAGAGCCAGACATGGGGAGAGAGA GTCAGAGGCAGAGAGAGAGAAGACAGATAGAGAGACAGAGCCAGTGATAACAGAGCCAGAGACAGGGAGA GAGAGTCAGAGAGAGATACAATGAGAGACAGAGATAACAGCCAGAGACAGAGTTAGACAGAGAGATACAG AGACAGAGATAACAGAGCCAGAGACAGGGAGAGAGAATTAGAGACAGAGATAGAGAGAGACAGAGACAGA GATAATACAGGCACAGAGGCACGCATAGACATAAATTGGCAGAGAGAGAGAAAGATCTCTTTCCACCCAC TGCAGAGGCAATCAACAGAGACAGAGAAAGACGTTAACGGGGAGACACAGAGAGCAAAGGAGACTGAGTC AGCAAGAGACCCACAGAGATACCGGGAAAGAGCGGCAGAGAGGGAGAACCAGGGCGATGGAGAGACAGCA GGGAGAAAGGAACCTGGAGCCGAGCTTGGAAGGCCGGAAACGGAAAGGAGAGCGAAAAGCGGAGAGAGAT CCGAGTGGAGAAAATTCCGCAGAGTCACGGGGACGAGGGGAAAGGCTCTGGGCTGGGAAGGGGCGTGGCC GCGGGCGGAGGGGCGTGGCCGCGGGCGGAGGGGCGTGGCCTCCTTTTGTAGCCAAGCAGCTATAAAAAGC GGCGCGCTGTGTCTTCCCGCAGTCTCTCGTCATGGAATACGCCTCTGACGCTTCACTGGACCCCGAAGCC CCGTGGCCTCCCGCGCCCCGCGCTCGCGCCTGCCGCGTACTGCCTTGGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF9_1 ↗ | 19:6,531,026 | 正股 | 6,530,977–6,531,036 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_B39ZG · enhancer · 6527828–6528560 · regulatory
ENSR19_B39ZL · enhancer · 6528700–6529413 · regulatory
ENSR19_94KZN · promoter · 6530536–6531036 · regulatory
ENSR19_B3B2M · enhancer · 6535890–6536828 · regulatory
· motif · 6527708–6527723 · motif
· motif · 6527713–6527725 · motif
· motif · 6527716–6527723 · motif
· motif · 6528022–6528037 · motif
· motif · 6528032–6528043 · motif
· motif · 6528034–6528043 · motif
· motif · 6528087–6528095 · motif
· motif · 6528239–6528252 · motif
· motif · 6528303–6528318 · motif
· motif · 6528303–6528318 · motif
· motif · 6528380–6528393 · motif
· motif · 6528380–6528393 · motif
· motif · 6528474–6528490 · motif
· motif · 6528836–6528849 · motif
· motif · 6528836–6528849 · motif
· motif · 6528960–6528973 · motif
· motif · 6529138–6529151 · motif
· motif · 6529138–6529151 · motif
· motif · 6530716–6530730 · motif
· motif · 6530716–6530730 · motif
· motif · 6530924–6530934 · motif
· motif · 6530944–6530954 · motif
· motif · 6530964–6530974 · motif
· motif · 6531393–6531402 · motif
· motif · 6532061–6532074 · motif
· motif · 6532163–6532176 · motif
· motif · 6532163–6532176 · motif
· motif · 6532177–6532190 · motif
· motif · 6532177–6532190 · motif
· motif · 6532832–6532841 · motif
· motif · 6532832–6532843 · motif
· motif · 6532832–6532843 · motif
· motif · 6532917–6532929 · motif
· motif · 6532920–6532927 · motif
· motif · 6532921–6532934 · motif
· motif · 6532927–6532940 · motif
· motif · 6532954–6532967 · motif
· motif · 6533876–6533886 · motif
· motif · 6533882–6533892 · motif
· motif · 6535016–6535028 · motif
· motif · 6535019–6535026 · motif
· motif · 6535500–6535522 · motif
· motif · 6535500–6535522 · motif
· motif · 6535725–6535733 · motif
· motif · 6535810–6535825 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：254 aa
TNF superfamily member 9 長 254 個胺基酸。其 N 端第 1–28 位為細胞質區，第 29–49 位為具有訊號錨定功能的螺旋跨膜區；第 50–254 位位於細胞外。細胞外第 91–240 位標註為 THD。此蛋白質屬於腫瘤壞死因子家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNF superfamily member 9 是膜蛋白，具有單次穿膜的第二型膜蛋白拓撲結構。 其蛋白質區段分布為 N 端細胞質區、跨膜區及較大的細胞外區；來源未提供定位變化或異構型差異資訊。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RARRES2Q99969 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TNFRSF9Q07011 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TNF superfamily member 9 以同源三聚體形式存在。這項資料描述其自身亞基組成；來源未指出其他複合體成員，也未提供其與 TNFRSF9 結合的互作細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNF superfamily member 9 是可結合 TNFRSF9 的細胞激素，能誘導已活化的周邊血液 T 細胞增殖；它可能參與活化誘導細胞死亡，也可能參與 T 細胞與 B 細胞或巨噬細胞之間的同源性互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that binds to TNFRSF9. Induces the proliferation of activated peripheral blood T-cells. May have a role in activation-induced cell death (AICD). May play a role in cognate interactions between T-cells and B-cells/macrophages PMID 20032458 ↗ |
| 交互作用 | Homotrimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TNF superfamily member 9 位於細胞膜，屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTCTCTCGTCATGGAATACGCCTCTGACGCTTCACTGGA40CCCCGAAGCCCCGTGGCCTCCCGCGCCCCGCGCTCGCGCC80TGCCGCGTACTGCCTTGGGCCCTGGTCGCGGGGCTGCTGC120TGCTGCTGCTGCTCGCTGCCGCCTGCGCCGTCTTCCTCGC160CTGCCCCTGGGCCGTGTCCGGGGCTCGCGCCTCGCCCGGC200TCCGCGGCCAGCCCGAGACTCCGCGAGGGTCCCGAGCTTT240CGCCCGACGATCCCGCCGGCCTCTTGGACCTGCGGCAGGG280CATGTTTGCGCAGCTGGTGGCCCAAAATGTTCTGCTGATC320GATGGGCCCCTGAGCTGGTACAGTGACCCAGGCCTGGCAG360GCGTGTCCCTGACGGGGGGCCTGAGCTACAAAGAGGACAC400GAAGGAGCTGGTGGTGGCCAAGGCTGGAGTCTACTATGTC440TTCTTTCAACTAGAGCTGCGGCGCGTGGTGGCCGGCGAGG480GCTCAGGCTCCGTTTCACTTGCGCTGCACCTGCAGCCACT520GCGCTCTGCTGCTGGGGCCGCCGCCCTGGCTTTGACCGTG560GACCTGCCACCCGCCTCCTCCGAGGCTCGGAACTCGGCCT600TCGGTTTCCAGGGCCGCTTGCTGCACCTGAGTGCCGGCCA640GCGCCTGGGCGTCCATCTTCACACTGAGGCCAGGGCACGC680CATGCCTGGCAGCTTACCCAGGGCGCCACAGTCTTGGGAC720TCTTCCGGGTGACCCCCGAAATCCCAGCCGGACTCCCTTC760ACCGAGGTCGGAATAACGTCCAGCCTGGGTGCAGCCCACC800TGGACAGAGTCCGAATCCTACTCCATCCTTCATGGAGACC840CCTGGTGCTGGGTCCCTGCTGCTTTCTCTACCTCAAGGGG880CTTGGCAGGGGTCCCTGCTGCTGACCTCCCCTTGAGGACC920CTCCTCACCCACTCCTTCCCCAAGTTGGACCTTGATATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。