演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNFSF8CD153

TNF superfamily member 8

TNFSF8 編碼 TNF superfamily member 8,屬於 tumor necrosis factor family。其產物是細胞激素,可結合 TNFRSF8/CD30,並誘導 T 細胞增殖。

Homo sapiens9q32-q33.1UniProt P32971
OFFICIAL SYMBOL
TNFSF8
CHROMOSOME
9
UNIPROT
P32971
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNFSF8 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 TNF superfamily member 8。其產物屬於 tumor necrosis factor family,是一種細胞激素;來源亦記載此蛋白質可形成同源三聚體。這些資訊界定了 TNFSF8 產物的家族歸屬與基本分子性質。其功能相關的受體為 TNFRSF8/CD30,與 T 細胞增殖有關;具體作用方式見功能說明。

Official symbol
TNFSF8
Gene name
TNF superfamily member 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11938
UniProt
P32971
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD153CD30LG

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q32-q33.1
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTNFSF8pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:114,893,343–114,930,596
Gene span
37,254 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000223795 ★114,901,145–114,930,5914
ENST00000618336114,893,343–114,930,5965
ENST00001138231114,901,145–114,930,5964
ENST00000872160114,901,341–114,930,5963

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNFSF8 的產物是一種細胞激素,可結合 TNFRSF8/CD30。來源所述的細胞作用是誘導 T 細胞增殖,指出此分子與 T 細胞增殖反應相關。現有資料未提供更細的訊號傳遞機制、作用條件或其他生物學過程,因此不延伸描述其下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 114930591 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNFSF8 ENST00000223795 GRCh38 chr9:114930491-114931591 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGATTGAATGACTTAGCACGAGCTTTCAGCCAGGCAGGCTGCAAAGTGCACCCAAGTTCTTTCAGTGATC
GACACTTGCGACTTAGGTTGAGATAGTTTTCATCCTCCCTGAGCCTCAGTTTTCCCATCTGTAAAAAATA
AACATTGCCTGCCTCGGAGGGTGGAGGTGGAAGTGGAATGAAGCCACATGTAACTCCTAGCGCTGTGCCT
GAGACAGTAGAGGTTCAATTATAGTAGTCACATACACACACAACACATACATACACAAGACACAACACAC
CACACACAACACATACATACACACCACACACAACACTTACATACGCACCACACTCGGCATGCATTGCAGA
TCACAAATGCACACCACACACACACTGCATACATATACCATAGAGAACACACAACACCTACACATACCCC
CATACCACAAATACACACACACTACATAGTACACCACGCAGAACACACACAGCCCCCATATTCCACACCA
CACCATCTCACTGCCAATTCCTTCCCCTCTTCATGAGTTTTACGGCAGGTCCAGGTTCATCTGCCAGTTT
AACAGATCCCAAAACTTCTGCAGGAGTGTTTGTTCAAAAGATTGATATTTCCAGATTCCTGCTTTCTGAC
AGTATCTTTGAACCCCAAATTTCATACTGCCATGAGCCAGTCCCCCTTTGGAGAAATATCTCCATTTGTG
TGCCCTTTTTCCCCCAGGGAACCTGCAGCATGTCCCTTTTTCAGCAGTAGCCTATCAAACCGAACCCTTT
GGAGTTATTACACTGCAGTCCGAGGGATCCGGCCTCCCTGAGACCCAGCAAGGACTCATTATCTGGGGAG
GTCTTCTGAGCCACAGGCCTCGCTGAAAGAAGGTGCAGCTTCTTGAACAGGAAGGCGTTTTGTGGCAGAG
TCTAAACGAAACAGAAGTTGCTTTGTGTGTGCGCACGCATGCACACACACACACACACACACACACATAC
ACACACACAGTCGGGGAACCGTCATTTTCCTACGCGCCCTCTGACATCAGCCACCTTCTCTGTAGCTAGT
TTCTCTGCACACAACTTAATCCCTGGCAATGAAAAATGAACCTCTCCCCCA
TNFSF8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNFSF8_1 ↗9:114,930,533負股114,930,523–114,930,582

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_93NLM2 · enhancer · 114925723–114926016 · regulatory

ENSR9_BSRSJ · enhancer · 114929084–114929863 · regulatory

ENSR9_93NLNF · promoter · 114930581–114930969 · regulatory

· motif · 114930194–114930209 · motif

· motif · 114930219–114930236 · motif

· motif · 114930322–114930334 · motif

· motif · 114930564–114930577 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:234 aa

1 aa234 aa結構域跨膜區拓樸區域
依 P32971 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNFSF8 蛋白質長 234 個胺基酸,屬於 tumor necrosis factor family。其第 1–37 位為細胞質區,第 38–62 位是作為第二型膜蛋白訊號錨定的螺旋跨膜區;第 63–234 位位於細胞外。THD domain 註解於第 98–225 位。

拓樸區域Cytoplasmic1–37 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein38–62 aa
拓樸區域Extracellular63–234 aa
結構域THD98–225 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P32971…

AlphaFold · P32971

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

TNFSF8 被註解為膜蛋白,具有單次跨膜的第二型膜蛋白拓撲。 其蛋白質序列包含細胞質區、跨膜區與細胞外區;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD153TNFSF8BMP10CXCL9TNFRSF8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNFSF8 以同源三聚體形式存在。來源未提供其他複合體成分或額外的實體結合資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNFSF8 產物是一種細胞激素,可結合 TNFRSF8/CD30,並誘導 T 細胞增殖。這項描述指出其受體結合對象及與 T 細胞增殖相關的作用;來源未提供其他條件或機制細節。資料庫紀錄
證據與來源

Cytokine that binds to TNFRSF8/CD30. Induces proliferation of T-cells

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homotrimer推論支持
證據與來源

Homotrimer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNFSF8 蛋白質位於膜上,並具有單次跨膜的第二型膜蛋白拓撲。此定位描述未指出會改變定位的條件或不同異構型之間的差異。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Single-pass type II membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000223795 · 3,779 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCATTTTCCTACGCGCCCTCTGACATCAGCCACCTTCTC40
41TGTAGCTAGTTTCTCTGCACACAACTTAATCCCTGGCAAT80
81GAAAAATGAACCTCTCCCCCACCCTTGCTGCCGCCTCTCG120
121CCTCACGCCCCCAGAGAAGAGTTTCTCCACCAGGCAGCAG160
161GTGAAGGTTTTTTTCCAAGTCACATGATTCAGGATTCAGG200
201GGGAGAATCCTTCTTGGAACAGAGATGGGCCCAGAACTGA240
241ATCAGATGAAGAGAGATAAGGTGTGATGTGGGGAAGACTA280
281TATAAAGAATGGACCCAGGGCTGCAGCAAGCACTCAACGG320
321AATGGCCCCTCCTGGAGACACAGCCATGCATGTGCCGGCG360
361GGCTCCGTGGCCAGCCACCTGGGGACCACGAGCCGCAGCT400
401ATTTCTATTTGACCACAGCCACTCTGGCTCTGTGCCTTGT440
441CTTCACGGTGGCCACTATTATGGTGTTGGTCGTTCAGAGG480
481ACGGACTCCATTCCCAACTCACCTGACAACGTCCCCCTCA520
521AAGGAGGAAATTGCTCAGAAGACCTCTTATGTATCCTGAA560
561AAGGGCTCCATTCAAGAAGTCATGGGCCTACCTCCAAGTG600
601GCAAAGCATCTAAACAAAACCAAGTTGTCTTGGAACAAAG640
641ATGGCATTCTCCATGGAGTCAGATATCAGGATGGGAATCT680
681GGTGATCCAATTCCCTGGTTTGTACTTCATCATTTGCCAA720
721CTGCAGTTTCTTGTACAATGCCCAAATAATTCTGTCGATC760
761TGAAGTTGGAGCTTCTCATCAACAAGCATATCAAAAAACA800
801GGCCCTGGTGACAGTGTGTGAGTCTGGAATGCAAACGAAA840
841CACGTATACCAGAATCTCTCTCAATTCTTGCTGGATTACC880
881TGCAGGTCAACACCACCATATCAGTCAATGTGGATACATT920
921CCAGTACATAGATACAAGCACCTTTCCTCTTGAGAATGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。