基因總覽
TNFSF18 是蛋白質編碼基因，產物為 TNF superfamily member 18，屬於腫瘤壞死因子家族。這是一種細胞激素，能與 TNFRSF18/AITR/GITR 結合。蛋白質長 177 個胺基酸，具有單次跨膜的第二型膜蛋白拓樸：N 端位於細胞質側，跨膜區之後為細胞外區域；細胞外區包含 THD 結構域。這些特徵構成其膜相關細胞激素的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000404377 ★ | 173,039,202–173,050,941 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFSF18 的產物是一種可結合 TNFRSF18/AITR/GITR 的細胞激素，參與調節 T 細胞反應。它可作為共刺激因子，降低 T 細胞活化的門檻，並促進 T 細胞增殖，因此能影響 T 細胞對活化訊號的反應程度。
TNFSF18 也與活化 T 淋巴球和內皮細胞之間的作用有關。在這項脈絡下，它可介導 NF-κB 活化，並引發 STAT1 磷酸化增加，同時上調 VCAM1 與 ICAM1 的表現。VCAM1 和 ICAM1 表現增加伴隨白血球黏附內皮細胞的促進作用，顯示 TNFSF18 參與調節免疫細胞與內皮細胞的互動。
此外，依序列相似性推定，TNFSF18 也參與調節單核球由脾臟儲存庫移往發炎部位的過程；此項功能屬於 By similarity 的推論，不應視為已在此來源中直接證實。整體而言，現有資料指出 TNFSF18 涉及 T 細胞共刺激，以及免疫細胞與內皮細胞互動等不同面向。
Promoter 與基因調控
>TNFSF18 ENST00000404377 GRCh38 chr1:173050841-173051941 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGGAAACTGAAGCTCAGAGAACTCAAGTAACATGCCTAAGGCCACAGAGCAGGTAGGAACTGGGCAGT GCCAGCCTCTGCTCTTGAGGTCTGTCTGATTTAAAAGCCTGTGTGACTGAGGTCCATAGAACCAGGAGAC TTCCTCAATTTTGTAGTAAACCCATATTTTTGGGCCCAGGAAGAAAACCCAAGGTTTTTTTTTTTTTTTT TTTGGAATAGAGTATAAGCTCTGGCTGAGGGCAGGATGCAGGAAAATATCCTTCTGTAAAATAACTTCTT ATGCCAGAACTAGATTATCAGAGTTTAAAAATGATGAAATATAAAATTGAGCTTGTTGTATTTACAATTT TTTATTAAATTCTTGTAATACACTTGATATTTTCTAGAGACTCAGAATGAACGCATTCTATACACTAGAA ATTGATGAAACATTTTTGTGAGTATAGATTTTATTTTTCCAGGTTTACTGAAGTATAATTGACAAATAAA AATTGTGGGTATTTAAGGTAAACAAGATGATGACTTGATTAAAACTCTATTTTTTCCAAACTAGAGATCC TAGCCTCTCCAACTTCCTAACACTCTGCCGCTCATGTACATGATATCTGGAGTATGGTAGGGGGATTAAT CTCAAACTTTATTTTTTCTTATAAAAAGTGATTTTCTTATCTAGAAATAATCTGGAATACTTTCTTAGAT GAGAGCACACCACTTTATTCTCCCAAGCCTCCTCTACACGTGCACTGTACTGCCGTTTGATTTAGGAAAG AAATTTTTTTCCCCTCTGAACTTCCCTTGTGCTTTTTTTTTTATGTTCTGAGTTTGTGTTGGCTTTCAGC CTTCCGTTCCTTTTGTTGTATTTGATCTGGTGCCAAATGAGAGTCAGCACTTAAGTTATAAGTATCATTT TCTAACACAGTGACAGAAGGAAAACTCCGCCTTCCACACCCACTACTAATTACCATATTGCTACAAAACA TGACATTGCATCCTTCACCCATCACTTGTGAATTTTTGTTTTCCACAGCTCTCATTTCTCCAAAAATGTG TTTGAGCCACTTGGAAAATATGCCTTTAAGCCATTCAAGAACTCAAGGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF18_1 ↗ | 1:173,050,938 | 負股 | 173,050,928–173,050,987 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B39C92 · enhancer · 173048693–173049322 · regulatory
ENSR1_94JNJM · promoter · 173050931–173051229 · regulatory
ENSR1_B39C9K · enhancer · 173052622–173053183 · regulatory
· motif · 173051048–173051059 · motif
· motif · 173055303–173055312 · motif
· motif · 173055303–173055312 · motif
細菌脂多醣（LPS）刺激後，TNFSF18 表現會上調；來源未提供其他調控條件或作用機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：177 aa
TNFSF18 蛋白質長 177 個胺基酸。其第 1–27 位為細胞質區，第 28–48 位為螺旋狀跨膜區，並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區；第 49–177 位位於細胞外。THD 結構域標註於第 47–170 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFSF18 位於細胞膜，屬單次跨膜的第二型膜蛋白；來源未指出定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- EXOC3L2Q2M3D2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFRSF18Q9Y5U5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TNFSF18 可形成同源三聚體；另有依序列相似性推定其可形成同源二聚體。來源未提供其他複合體或實體結合夥伴的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFSF18 是可結合 TNFRSF18/AITR/GITR 的細胞激素，能調節 T 細胞反應，並可作為共刺激因子降低 T 細胞活化門檻、促進增殖。它也參與活化 T 淋巴球與內皮細胞的互動，介導 NF-κB 活化、增加 STAT1 磷酸化及上調 VCAM1、ICAM1，並促進白血球黏附內皮細胞。調節單核球移往發炎部位的功能為 By similarity 推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that binds to TNFRSF18/AITR/GITR. Regulates T-cell responses. Can function as costimulator and lower the threshold for T-cell activation and T-cell proliferation. Important for interactions between activated T-lymphocytes and endothelial cells. Mediates activation of NF-kappa-B. Triggers increased phosphorylation of STAT1 and up-regulates expression of VCAM1 and ICAM1. Promotes leukocyte adhesion to endothelial cells. Regulates migration of monocytes from the splenic reservoir to sites of inflammation (By similarity) PMID 17449724 ↗ · PMID 18040044 ↗ · PMID 23892569 ↗ |
| 交互作用 | TNFSF18 被註記可形成同源三聚體；另有依序列相似性推定其可形成同源二聚體，後者屬推論性描述。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TNFSF18 位於細胞膜，屬於單次跨膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 細菌脂多醣（LPS）刺激後，TNFSF18 的表現會上調。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATCACTTGTGAATTTTTGTTTTCCACAGCTCTCATTTCTC40CAAAAATGTGTTTGAGCCACTTGGAAAATATGCCTTTAAG80CCATTCAAGAACTCAAGGAGCTCAGAGATCATCCTGGAAG120CTGTGGCTCTTTTGCTCAATAGTTATGTTGCTATTTCTTT160GCTCCTTCAGTTGGCTAATCTTTATTTTTCTCCAATTAGA200GACTGCTAAGGAGCCCTGTATGGCTAAGTTTGGACCATTA240CCCTCAAAATGGCAAATGGCATCTTCTGAACCTCCTTGCG280TGAATAAGGTGTCTGACTGGAAGCTGGAGATACTTCAGAA320TGGCTTATATTTAATTTATGGCCAAGTGGCTCCCAATGCA360AACTACAATGATGTAGCTCCTTTTGAGGTGCGGCTGTATA400AAAACAAAGACATGATACAAACTCTAACAAACAAATCTAA440AATCCAAAATGTAGGAGGGACTTATGAATTGCATGTTGGG480GACACCATAGACTTGATATTCAACTCTGAGCATCAGGTTC520TAAAAAATAATACATACTGGGGTATCATTTTACTAGCAAA560TCCCCAATTCATCTCCTAGAGACTTGATTTGATCTCCTCA600TTCCCTTCAGCACATGTAGAGGTGCCAGTGGGTGGATTGG640AGGGAGAAGATATTCAATTTCTAGAGTTTGTCTGTCTACA680AAAATCAACACAAACAGAACTCCTCTGCACGTGAATTTTC720ATCTATCATGCCTATCTGAAAGAGACTCAGGGGAAGAGCC760AAAGACTTTTGGTTGGATCTGCAGAGATACTTCATTAATC800CATGATAAAACAAATATGGATGACAGAGGACATGTGCTTT840TCAAAGAATCTTTATCTAATTCTTGAATTCATGAGTGGAA880AAATGGAGTTCTATTCCCATGGAAGATTTACCTGGTATGC920AAAAAGGATCTGGGGCAGTAGCCTGGCTTTGTTCTCATAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。