基因總覽
TNFSF15 是蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 TNF superfamily member 15。來源將此蛋白描述為細胞激素，並指出它屬於 tumor necrosis factor family。蛋白質具有單次穿膜的第二型膜蛋白拓撲：N 端位於細胞質側，接著是跨膜區，較長的 C 端區段位於細胞外。這些特徵說明 TNFSF15 是具有膜相關形式的細胞外訊號分子；來源亦記載其有分泌形式。其主要生物學角色與訊號作用見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374045 ★ | 114,784,652–114,806,039 | 4 |
| ENST00001136653 | 114,784,652–114,806,094 | 4 |
| ENST00000374044 | 114,789,320–114,792,108 | 1 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFSF15 是細胞激素，可透過 TNFRSF25 受體傳遞訊號。在 T 細胞中，它具有共同刺激作用，能提高細胞對 IL-2 的反應，並促進促發炎細胞激素分泌；這些作用與 T 細胞活化及增殖增強相關，也有助於活化後 T 細胞存活。
TNFSF15 的作用不只涉及 T 細胞。體外研究指出，它可抑制血管內皮細胞生長及血管新生；此結果的證據範圍限於體外條件，不宜直接推及生物體內的效應。
TNFSF15 也可與誘餌受體 TNFRSF6B 結合。此結合會阻斷通常由 TNFSF15 觸發的活化作用，並伴隨 T 細胞活化降低及發炎減少。因此，TNFRSF6B 可透過攔截 TNFSF15，限制其促進免疫活化的訊號。
Promoter 與基因調控
>TNFSF15 ENST00000374045 GRCh38 chr9:114805939-114807039 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTGTGCTTTATTTTCTTATGTGTAAAATGAGAATGATAGCTTTATTGTCACAAAATTTATCTCAGGAT TGAATAATTTTATTGATGTATTTAACTTAGAGCAGTGATTGGCACAAAGTAAGCACTTAATAAATATAAT CTTTTATTACATGTTGTGGCCCCCACACCCAACTGCAGGCAAAGCACATCACATGATCAATTAACTTTAG ACTAATCAGGGAGTAGTGGTTAATGTTCTACCCTCACAGACAGTCACCTCGATCTGTGGCCTCATACTCT GATTAAACAATGGTCAATGCAGACTGGAAATACTTTCCTTTCATGGGCAGTCATGTGCTAGAGGTTACAA CTCCAAGCCGTGATTTAGAACTAGGTCATCTTCCTAGCTCCTCTGTCTTCATCCTTGGATGACCTAGGAC AAGTGCCTTCACCTTTTAGAACTTTGCTATTCCCATCTGTACACTGAGAATGAATTTCTATGAGGTTCAA AATGACAGAGGGCTAGGCAGCACTTTGCAAAGAGCTGATGCAAATGTGATTTCCGTTTCCCAATCTGCAA ACCACACACCTCTCATCCCTCACTTTCACTTCCAGAAGCACACTCCCCAGACTGGCACAGCTGGTAAGCC TCCAGTGCAGGGAACAGGTATATTTTAATTTGCCCCACCCACTGACTTGATGAATTCTTTCTCTCCTCCT TCAGGGACTTTCCTAACTTCCTTCTGTAAACGAAGGAAGGAGCACATGAGCATACTGTATATAAATATGC TTGGGAAAGCTTTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCAAACCAAACTTG GTTTCTGTTGTAGGCGGTGCATTCTCTAGCAGGGTAGGGCCACAGTGTGCTCTTGAAGAGGGGAGGGGAG AGGAAAAGGGAAGGAGGAGACTGAGTGATTAAGTCACCCACTGTGAGAGCTGGTCTTCTATTTAATGGGG GCTCTCTCTGCCCAGGAGTCAGAGGTGCCTCCAGGAGCAGCAGGAGCATGGCCGAGGATCTGGGACTGAG CTTTGGGGAAACAGCCAGTGTGGAAATGCTGCCAGAGCACGGCAGCTGCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF15_1 ↗ | 9:114,806,039 | 負股 | 114,806,029–114,806,088 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BSR6F · enhancer · 114803947–114804957 · regulatory
ENSR9_93NKCF · promoter · 114806029–114806529 · regulatory
· motif · 114802166–114802180 · motif
· motif · 114802166–114802180 · motif
· motif · 114802360–114802374 · motif
· motif · 114802360–114802374 · motif
· motif · 114804629–114804642 · motif
· motif · 114806466–114806475 · motif
· motif · 114806466–114806481 · motif
· motif · 114806473–114806481 · motif
· motif · 114806473–114806488 · motif
IL1A（interleukin-1 alpha）與 TNF 可上調 TNFSF15。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：251 aa
TNFSF15 蛋白長 251 個胺基酸，屬於 tumor necrosis factor family。其第 1–35 位胺基酸為細胞質區，第 36–56 位為具螺旋結構的跨膜區，並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區；第 57–251 位則位於細胞外。細胞外區的第 95–251 位標註為 THD。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFSF15 有單次穿膜的第二型膜蛋白形式，另有分泌形式。 來源未提供兩種形式在何種條件下轉換或各自的動態差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HTRA2O43464 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFRSF6BO95407 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TNFSF15 可形成同源三聚體；另與誘餌受體 TNFRSF6B 以 3:3 化學計量比結合。前者為自身亞基組成的複合體，後者則是與受體的實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFSF15 是透過 TNFRSF25 傳遞訊號的細胞激素，並可共同刺激 T 細胞，提高其對 IL-2 的反應及促發炎細胞激素分泌，進而增強 T 細胞活化、增殖與活化後存活。體外資料顯示它抑制血管內皮生長和血管新生；與誘餌受體 TNFRSF6B 結合則會阻斷其原有活化作用，降低 T 細胞活化與發炎。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that signals through TNFRSF25 receptor. Functions as a T-cell costimulator, that increases IL-2 responsiveness and secretion of pro-inflammatory cytokines which enhances T-cell activation, proliferation and the survival of activated T-cells. Inhibits vascular endothelial growth and angiogenesis (in vitro). Binds to the decoy receptor TNFRSF6B, blocking the activation normally triggered by TNFSF15 and leading to decreased T-cell activation and reduced inflammation PMID 10597252 ↗ · PMID 11911831 ↗ · PMID 11923219 ↗ · PMID 21300286 ↗ · PMID 9872942 ↗ |
| 交互作用 | TNFSF15 可形成同源三聚體；此外，TNFSF15 與 TNFRSF6B 的結合具有 3:3 化學計量比。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TNFSF15 位於膜上，屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | TNFSF15 有分泌形式，該形式位於細胞外。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | IL1A（interleukin-1 alpha）與 TNF 可上調 TNFSF15。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGGTGCCTCCAGGAGCAGCAGGAGCATGGCCGAGGATC40TGGGACTGAGCTTTGGGGAAACAGCCAGTGTGGAAATGCT80GCCAGAGCACGGCAGCTGCAGGCCCAAGGCCAGGAGCAGC120AGCGCACGCTGGGCTCTCACCTGCTGCCTGGTGTTGCTCC160CCTTCCTTGCAGGACTCACCACATACCTGCTTGTCAGCCA200GCTCCGGGCCCAGGGAGAGGCCTGTGTGCAGTTCCAGGCT240CTAAAAGGACAGGAGTTTGCACCTTCACATCAGCAAGTTT280ATGCACCTCTTAGAGCAGACGGAGATAAGCCAAGGGCACA320CCTGACAGTTGTGAGACAAACTCCCACACAGCACTTTAAA360AATCAGTTCCCAGCTCTGCACTGGGAACATGAACTAGGCC400TGGCCTTCACCAAGAACCGAATGAACTATACCAACAAATT440CCTGCTGATCCCAGAGTCGGGAGACTACTTCATTTACTCC480CAGGTCACATTCCGTGGGATGACCTCTGAGTGCAGTGAAA520TCAGACAAGCAGGCCGACCAAACAAGCCAGACTCCATCAC560TGTGGTCATCACCAAGGTAACAGACAGCTACCCTGAGCCA600ACCCAGCTCCTCATGGGGACCAAGTCTGTATGCGAAGTAG640GTAGCAACTGGTTCCAGCCCATCTACCTCGGAGCCATGTT680CTCCTTGCAAGAAGGGGACAAGCTAATGGTGAACGTCAGT720GACATCTCTTTGGTGGATTACACAAAAGAAGATAAAACCT760TCTTTGGAGCCTTCTTACTATAGGAGGAGAGCAAATATCA800TTATATGAAAGTCCTCTGCCACCGAGTTCCTAATTTTCTT840TGTTCAAATGTAATTATAACCAGGGGTTTTCTTGGGGCCG880GGAGTAGGGGGCATTCCACAGGGACAACGGTTTAGCTATG920AAATTTGGGGCCCAAAATTTCACACTTCATGTGCCTTACT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。