基因總覽
TNFSF14 是蛋白質編碼基因，其產物 TNF superfamily member 14 屬於腫瘤壞死因子家族，是一種細胞激素。蛋白質全長 240 個胺基酸，具有細胞膜型與可溶型形式；另有一種異構型標示為 Isoform 2。其序列包含細胞質區、單次跨膜區與細胞外區，並具有 THD 結構域。這些特徵描述其膜相關形式及細胞外部分的基本組成；具體的受體結合與免疫調節作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000675206 ★ | 6,661,253–6,670,160 | 4 |
| ENST00001004815 | 6,659,357–6,670,170 | 4 |
| ENST00000245912 | 6,661,253–6,670,170 | 4 |
| ENST00000599359 | 6,664,555–6,670,621 | 5 |
| ENST00000896417 | 6,664,557–6,670,621 | 5 |
| ENST00000896418 | 6,664,557–6,670,293 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNF superfamily member 14 是參與免疫系統調節的細胞激素，可與 TNFRSF3/LTB 及 TNFRSF14/HVEM 結合。來源指出它在免疫調節中具有重要作用，但未進一步詳述其透過 TNFRSF3/LTB 作用的具體結果。
當 TNFSF14 結合 TNFRSF14/HVEM 時，會向 T 細胞提供共刺激訊號。此訊號促進 T 細胞增殖，並使 IFNG 產生增加，因此 TNFSF14 可透過受體結合影響 T 細胞的活化相關反應。
TNFSF14 也能結合 TNFRSF6B；此受體被描述為誘餌受體。TNFRSF6B 的結合會干擾 TNFSF14 所啟動的活化訊號，並造成 T 細胞活化降低。這項作用與 TNFRSF14/HVEM 所介導的共刺激效果不同，呈現出受體結合對 T 細胞反應的調節方向可能因受體而異。
Promoter 與基因調控
>TNFSF14 ENST00000675206 GRCh38 chr19:6670060-6671160 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGCACATGCATGCATGTACATGGACCACATGCACATGCACACAGATGACCATACACATATGCATGCACC TGCCCACATATGCACGCACATTTACATGCCAGCACATGTATGATACACAGGCATGCGCCTGCACATGTGT ACATGATACACACTTGCATGCACACAACTGAATACACACATTCACATGCACACACTGCACACATATATGC ATGCAGACAAGCACACACACAGAGCACACATCCACTCCTTTATTCCACTCTTGTGTTTTTCACTGCACTT GTCACATCAAAACACAACAGAAGGCCGGGCATGGTGCGGCTCACGTTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG CTGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCGACATGGTGAAAACCCATCTC TACTAAAAATACAAAAAGCAGCCAGGCGTGGTGGCACGCGCCTGTAATCCCCGCTACTTGGGAGGCTGAG GCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGTAGTAAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC TGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAACAAAACAAATAAACGAACAAAAAAACCCACAACGTATTA TTTTCTTGTTTACGAGGTTTCTTGTCTCTCTGGCTCCACCAGAAGAGGAGCAGGGACCCTTCTTGCTGTT GTTCATTGCTGCATCCCCCACACCGAGAGCAGAGCCTGGCATGGGCAGAAAGTCCTCAGTCGATATTTGG TGGCCCCAAGCGAATGAAGCATCCAAGAAGGGAAAGCTGGGGGCTCCCCACTGCACTTGCCACCTGAGTC ACATTTTCAGAAGCCTCTGGAAAGTGTGAGAGTCTGTATGAGTGAGAGTGAGACAGGGCCAAGACCGGGG GCGGCGGGTACCGGAAGAAGAGGAGGGTGAGTGGGGGAAGGGGTGGGGCTGAACCCCAGCTCTAAAGGCG GCCCACGGGTGCCTGTCCGCAGCGTGCACAGCCCAGGAGTGTTGAGCAATTTCGGTTTCCTCTGAGGTTG AAGGACCCAGGCGTGTCAGCCCTGCTCCAGACACCTTGGGCATGGAGGAGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF14_1 ↗ | 19:6,670,160 | 負股 | 6,670,150–6,670,209 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_94MG8 · enhancer · 6667181–6667616 · regulatory
ENSR19_94MH3 · promoter · 6670107–6670468 · regulatory
ENSR19_B3BQP · enhancer · 6674673–6675366 · regulatory
· motif · 6667070–6667082 · motif
· motif · 6667073–6667080 · motif
· motif · 6667074–6667087 · motif
· motif · 6667105–6667127 · motif
· motif · 6667105–6667127 · motif
· motif · 6667133–6667140 · motif
· motif · 6667133–6667148 · motif
· motif · 6667163–6667175 · motif
· motif · 6667165–6667178 · motif
· motif · 6667372–6667384 · motif
· motif · 6667404–6667412 · motif
· motif · 6667749–6667764 · motif
· motif · 6667771–6667783 · motif
· motif · 6667823–6667835 · motif
· motif · 6667825–6667832 · motif
· motif · 6667825–6667840 · motif
· motif · 6668844–6668859 · motif
· motif · 6668851–6668859 · motif
· motif · 6669818–6669827 · motif
· motif · 6670232–6670241 · motif
· motif · 6670246–6670259 · motif
· motif · 6670288–6670300 · motif
· motif · 6670319–6670327 · motif
· motif · 6670728–6670739 · motif
· motif · 6670775–6670790 · motif
· motif · 6670780–6670792 · motif
· motif · 6670783–6670790 · motif
· motif · 6671087–6671096 · motif
· motif · 6671095–6671108 · motif
· motif · 6671095–6671108 · motif
· motif · 6671168–6671180 · motif
· motif · 6671201–6671216 · motif
· motif · 6671220–6671229 · motif
· motif · 6671248–6671264 · motif
· motif · 6671264–6671279 · motif
· motif · 6671328–6671344 · motif
· motif · 6672508–6672523 · motif
· motif · 6674588–6674608 · motif
· motif · 6675016–6675031 · motif
· motif · 6675016–6675033 · motif
· motif · 6675043–6675054 · motif
· motif · 6675050–6675058 · motif
· motif · 6675082–6675091 · motif
T 細胞活化後，TNFSF14 的表現量會上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：240 aa
TNF superfamily member 14 長 240 個胺基酸，屬於腫瘤壞死因子家族。其第 1–37 位胺基酸為細胞質區，第 38–58 位為單次跨膜螺旋，並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區；第 59–240 位位於細胞外。THD 結構域位於第 94–240 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFSF14 的膜型位於細胞膜，屬單次跨膜的第二型膜蛋白；另有可溶型，定位為分泌型。 Isoform 2 則標示位於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 23 個夥伴
- ADAM33Q08AM2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADIPOQQ15848 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BMP10O95393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN11O75508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN19Q8N6F1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JAGN1Q8N5M9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHFPL3Q86UP9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LTBRP36941 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MALP21145 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- OLFM4Q6UX06 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLLPQ9Y342 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTTG1IPP53801 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEC22AQ96IW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEC23AQ15436 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYS1Q8N2H4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM11P17152 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TNFRSF14Q92956 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TNFRSF6BO95407 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- UPK2O00526 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZDHHC24Q6UX98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LtbrP50284 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Tnfrsf14Q71F55 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TNFSF14 可形成同源三聚體，並以 3:3 化學計量比與 TNFRSF6B 結合；另有與 TNFRSF14 的交互作用記錄。這些資料分別描述其寡聚狀態與受體結合關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFSF14 是參與免疫系統調節的細胞激素，可結合 TNFRSF3/LTB 與 TNFRSF14/HVEM。結合 TNFRSF14/HVEM 時會向 T 細胞提供共刺激訊號，促進其增殖及 IFNG 產生；結合誘餌受體 TNFRSF6B 則會干擾 TNFSF14 啟動的活化訊號，使 T 細胞活化降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that binds to TNFRSF3/LTB and TNFRSF14/HVEM and plays major roles in immune system regulation. Upon binding to TNFRSF14/HVEM, delivers costimulatory signals to T cells, leading to T cell proliferation and IFNG production. Binds to the decoy receptor TNFRSF6B thereby disrupts the activation signal initiated by TNFSF14, resulting in reduced T-cell activation PMID 10754304 ↗ · PMID 25087510 ↗ · PMID 9462508 ↗ |
| 交互作用 | TNFSF14 可形成同源三聚體，並以 3:3 化學計量比與 TNFRSF6B 結合；另有與 TNFRSF14 交互作用的記錄。來源未進一步說明後者的結合形式或化學計量比。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer. TNFSF14 binds to TNFRSF6B with 3:3 stoichiometry. Interacts with TNFRSF14 PMID 25087510 ↗ · PMID 9462508 ↗ |
| 細胞定位 | TNFSF14 的膜型定位於細胞膜，並屬於單次跨膜的第二型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, membrane form; Cell membrane / Single-pass type II membrane protein |
| 細胞定位 | TNFSF14 的可溶型定位為分泌型。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TNFSF14 的 Isoform 2 標示位於細胞質。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | T 細胞活化後，TNFSF14 的表現量上調。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCGTGCACAGCCCAGGAGTGTTGAGCAATTTCGGTTTCC40TCTGAGGTTGAAGGACCCAGGCGTGTCAGCCCTGCTCCAG80ACACCTTGGGCATGGAGGAGAGTGTCGTACGGCCCTCAGT120GTTTGTGGTGGATGGACAGACCGACATCCCATTCACGAGG160CTGGGACGAAGCCACCGGAGACAGTCGTGCAGTGTGGCCC200GGGTGGGTCTGGGTCTCTTGCTGTTGCTGATGGGGGCCGG240GCTGGCCGTCCAAGGCTGGTTCCTCCTGCAGCTGCACTGG280CGTCTAGGAGAGATGGTCACCCGCCTGCCTGACGGACCTG320CAGGCTCCTGGGAGCAGCTGATACAAGAGCGAAGGTCTCA360CGAGGTCAACCCAGCAGCGCATCTCACAGGGGCCAACTCC400AGCTTGACCGGCAGCGGGGGGCCGCTGTTATGGGAGACTC440AGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGGGCCTCAGCTACCACGA480TGGGGCCCTTGTGGTCACCAAAGCTGGCTACTACTACATC520TACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGTGTGGGCTGCCCGCTGG560GCCTGGCCAGCACCATCACCCACGGCCTCTACAAGCGCAC600ACCCCGCTACCCCGAGGAGCTGGAGCTGTTGGTCAGCCAG640CAGTCACCCTGCGGACGGGCCACCAGCAGCTCCCGGGTCT680GGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGTGGTGTGGTACACCTGGA720GGCTGGGGAGAAGGTGGTCGTCCGTGTGCTGGATGAACGC760CTGGTTCGACTGCGTGATGGTACCCGGTCTTACTTCGGGG800CTTTCATGGTGTGAAGGAAGGAGCGTGGTGCATTGGACAT840GGGTCTGACACGTGGAGAACTCAGAGGGTGCCTCAGGGGA880AAGAAAACTCACGAAGCAGAGGCTGGGCGTGGTGGCTCTC920GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。