基因總覽
TNFSF13 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 TNF superfamily member 13。其產物屬於 tumor necrosis factor family，並具有細胞激素性質。來源指出，這種細胞激素可與 TNFRSF13B/TACI 及 TNFRSF17/BCMA 結合，並可能參與腫瘤細胞生長調控及單核球／巨噬細胞介導的免疫過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338784 ★ | 7,558,750–7,561,601 | 6 |
| ENST00000483039 | 7,558,292–7,561,292 | 5 |
| ENST00000380535 | 7,558,292–7,561,608 | 5 |
| ENST00000396542 | 7,558,292–7,560,835 | 6 |
| ENST00000349228 | 7,558,292–7,561,600 | 5 |
| ENST00000625791 | 7,558,292–7,560,838 | 5 |
| ENST00000396545 | 7,558,292–7,561,601 | 7 |
| ENST00000994518 | 7,558,292–7,561,601 | 6 |
| ENST00001057862 | 7,558,292–7,561,601 | 6 |
| ENST00001127200 | 7,558,292–7,561,601 | 6 |
| ENST00001138589 | 7,558,292–7,561,601 | 6 |
| ENST00000438470 | 7,558,300–7,560,394 | 5 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFSF13 的產物是一種細胞激素，可與 TNFRSF13B/TACI 及 TNFRSF17/BCMA 結合。來源列出這兩種受體作為其結合對象，但未進一步說明結合後的分子訊號或作用機制，因此不宜據此延伸描述下游反應。
此細胞激素被指出在腫瘤細胞生長的調控中具有作用。來源未交代其影響方向、作用條件或涉及的細胞與分子途徑，故只能確認其與腫瘤細胞生長調控相關，不能據此判定它促進或抑制生長。
此外，TNFSF13 可能參與由單核球／巨噬細胞介導的免疫過程。這項描述具有不確定性，來源未指出具體免疫反應、作用方式或實驗情境；因此可將其視為可能的免疫相關功能，而非已界定的特定機制。
Promoter 與基因調控
>TNFSF13 ENST00000338784 GRCh38 chr17:7557750-7558850 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGGAGTTCCCAAATGTGAGGGGCGAGAAACAAGACAAGCTCCTCCCTTGAGAATTCCCTGTGGATTTTT AAAACAGATATTATTTTTATTATTATTGTGACAAAATGTTGATAAATGGATATTAAATAGAATAAGTCAT AGTCTCTCTCTTTATTGGGGCTCAGGGGACACTCTCAGGGTAGCTGGGGGCCACGTGAAGGGGGGCGTTG CGGAGCGGCACAGCTGGAACTCCGGGATGATGTTCAGGCTTGGGGGCGGGGACCTCCATGCCTCCAGCCC CCAGGTGGGAGCAGAGGTAGGAAGGCACACTGCCCAGGAAAAAAATCAATCCTCCGCCCAAGGTACAGCA GAAGCGGCCTCCTTGGCCTAGGAGGCAGACTTCCTCCTGCGGGGAAATCCCTTCCTGGCTGGGAGGAGCA GGGGCCCTTCCTCTTGGTGGCCTCGGACATTCAGCAGGTGCTGGCACAGGCCCTGGCTGGGAGGTGGGGC GGGCAGGAGCCAGCCTGGAGGAGGGGCTGAGAGTCAGCAGGCACACGGGAACCCGGAACCCTGTGTGCTG GGGAGGAATCCCGCAGTGGCCGGGGGGCTTGAGGCCGCTGCTTTGTCTCTTCGTCCAGAGCCTTATGTAA GAGCTTTTCTCGGGAAACAGGAAGTCCTGCTTGCCAATTTCAGCACAGGGAGTAGTGCAGGCCTTATTCC AACACACCCGGCCCAGCCTTAACCCCAGAACTCAGCCAGTTTCTTGCTTCCGTGCCCCTGGTTCTCCTCC CCATCGAGCCCACCCCTCCTTTCCCACCTTCAGTCACCCCTAGTGAACTGCCCCAGCGATCTCTGCTGTG CTTGACCCCGAGGGTCTTCCACCCTCGCCCTGACCCTGGACACTGCCCAGCTTGGCCCCCCATCCTGCTC CTGGCACAATGCCCTCTAGCCAGCCAACCTTCCCTCCCCCAACCCTGGGGCCGCCCCAGGGTTCCTGCGC ACTGCCTGTTCCTCCTGGGTGTCACTGGCAGCCCTGTCCTTCCTAGAGGGACTGGAACCTAATTCTCCTG AGGCTGAGGGAGGGTGGAGGGTCTCAAGGCAACGCTGGCCCCACGACGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF13_1 ↗ | 17:7,558,282 | 正股 | 7,558,233–7,558,292 |
| TNFSF13_4 ↗ | 17:7,558,453 | 正股 | 7,558,404–7,558,463 |
| TNFSF13_3 ↗ | 17:7,558,750 | 正股 | 7,558,701–7,558,760 |
| TNFSF13_2 ↗ | 17:7,559,002 | 正股 | 7,558,953–7,559,012 |
| TNFSF13_5 ↗ | 17:7,560,492 | 正股 | 7,560,443–7,560,502 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_53QZJ4 · CTCF_binding_site · 7555472–7555493 · regulatory
ENSR17_94ZZ8 · enhancer · 7555559–7555858 · regulatory
ENSR17_B3HHH · promoter · 7557802–7558797 · regulatory
ENSR17_53R25Z · CTCF_binding_site · 7559122–7559143 · regulatory
ENSR17_9522J · promoter · 7559870–7560370 · regulatory
ENSR17_53R2HB · CTCF_binding_site · 7561134–7561155 · regulatory
ENSR17_53R2J2 · CTCF_binding_site · 7561291–7561312 · regulatory
ENSR17_9522Z · promoter · 7561429–7561929 · regulatory
ENSR17_53R2KS · CTCF_binding_site · 7561680–7561701 · regulatory
ENSR17_B3HJ4 · enhancer · 7561930–7562866 · regulatory
· motif · 7555474–7555490 · motif
· motif · 7558202–7558211 · motif
· motif · 7558385–7558396 · motif
· motif · 7558392–7558405 · motif
· motif · 7558394–7558405 · motif
· motif · 7558902–7558922 · motif
· motif · 7558928–7558937 · motif
· motif · 7558928–7558937 · motif
· motif · 7559124–7559140 · motif
· motif · 7559140–7559151 · motif
· motif · 7561136–7561152 · motif
· motif · 7561293–7561309 · motif
· motif · 7561467–7561476 · motif
· motif · 7561682–7561698 · motif
· motif · 7561807–7561818 · motif
· motif · 7561807–7561818 · motif
· motif · 7561896–7561907 · motif
來源指出，phorbol myristate acetate/ionomycin 處理會使 TNFSF13 下調；未提供處理條件或下調幅度等細節。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：250 aa
TNFSF13 蛋白質長 250 個胺基酸，屬於 tumor necrosis factor family。其第 116–250 位胺基酸區段註記為 THD 結構域；第 61–82 位與第 89–108 位區段則分別註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFSF13 的定位註記為分泌型；來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- TNFRSF13BO14836 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TNFSF13 被註記為同源三聚體（homotrimer）。這項資訊描述其亞基組成；來源未進一步提供其複合體形成條件或其他實體結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFSF13 產物是一種可與 TNFRSF13B/TACI 和 TNFRSF17/BCMA 結合的細胞激素，並在腫瘤細胞生長調控中具有作用；它也可能參與由單核球／巨噬細胞介導的免疫過程。來源未具體說明生長調控方向、分子機制或免疫過程細節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that binds to TNFRSF13B/TACI and to TNFRSF17/BCMA. Plays a role in the regulation of tumor cell growth. May be involved in monocyte/macrophage-mediated immunological processes PMID 10973284 ↗ |
| 交互作用 | Homotrimer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | phorbol myristate acetate/ionomycin 處理與 TNFSF13 下調相關。來源未提供處理條件、下調幅度或其涉及的分子機制，因此此處僅保留處理後表現下調的描述。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTCACTGGCAGCCCTGTCCTTCCTAGAGGGACTGGAACCT40AATTCTCCTGAGGCTGAGGGAGGGTGGAGGGTCTCAAGGC80AACGCTGGCCCCACGACGGAGTGCCAGGAGCACTAACAGT120ACCCTTAGCTTGCTTTCCTCCTCCCTCCTTTTTATTTTCA160AGTTCCTTTTTATTTCTCCTTGCGTAACAACCTTCTTCCC200TTCTGCACCACTGCCCGTACCCTTACCCGCCCCGCCACCT240CCTTGCTACCCCACTCTTGAAACCACAGCTGTTGGCAGGG280TCCCCAGCTCATGCCAGCCTCATCTCCTTTCTTGCTAGCC320CCCAAAGGGCCTCCAGGCAACATGGGGGGCCCAGTCAGAG360AGCCGGCACTCTCAGTTGCCCTCTGGTTGAGTTGGGGGGC400AGCTCTGGGGGCCGTGGCTTGTGCCATGGCTCTGCTGACC440CAACAAACAGAGCTGCAGAGCCTCAGGAGAGAGGTGAGCC480GGCTGCAGGGGACAGGAGGCCCCTCCCAGAATGGGGAAGG520GTATCCCTGGCAGAGTCTCCCGGAGCAGAGTTCCGATGCC560CTGGAAGCCTGGGAGAATGGGGAGAGATCCCGGAAAAGGA600GAGCAGTGCTCACCCAAAAACAGAAGAAGCAGCACTCTGT640CCTGCACCTGGTTCCCATTAACGCCACCTCCAAGGATGAC680TCCGATGTGACAGAGGTGATGTGGCAACCAGCTCTTAGGC720GTGGGAGAGGCCTACAGGCCCAAGGATATGGTGTCCGAAT760CCAGGATGCTGGAGTTTATCTGCTGTATAGCCAGGTCCTG800TTTCAAGACGTGACTTTCACCATGGGTCAGGTGGTGTCTC840GAGAAGGCCAAGGAAGGCAGGAGACTCTATTCCGATGTAT880AAGAAGTATGCCCTCCCACCCGGACCGGGCCTACAACAGC920TGCTATAGCGCAGGTGTCTTCCATTTACACCAAGGGGATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。