基因總覽
TNFSF12 是蛋白質編碼基因，產物 TNF superfamily member 12 屬於 tumor necrosis factor family。這種蛋白質具有膜型與分泌型相關註記，並有名為 TWE-PRIL 的異構型；其序列包含跨膜區與細胞外區域，構成認識此蛋白質基本性質的結構線索。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000293825 ★ | 7,549,058–7,557,881 | 7 |
| ENST00000700015 | 7,548,938–7,557,889 | 7 |
| ENST00000700051 | 7,548,938–7,551,779 | 5 |
| ENST00000700052 | 7,548,938–7,557,889 | 6 |
| ENST00000700053 | 7,548,938–7,557,889 | 7 |
| ENST00000946751 | 7,548,938–7,557,889 | 7 |
| ENST00001105786 | 7,548,938–7,551,377 | 5 |
| ENST00001140329 | 7,549,058–7,557,889 | 7 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNF superfamily member 12 可與 FN14 結合，並可能也與 TNRFSF12/APO3 結合。來源對後者的描述帶有可能性，因此不能視為已確定的結合關係。這些受體相關作用構成其細胞訊息功能的一部分。
此蛋白質能介導 NF-kappa-B 活化，並參與發炎細胞激素的誘導；此外，來源指出它可促進 IL8 分泌。這些作用將 TNF superfamily member 12 與發炎訊息及細胞激素反應連結，但資料未提供更具體的訊息步驟或條件。
在血管相關功能方面，TNF superfamily member 12 促進血管生成，也促進內皮細胞增殖。這些作用涉及血管形成與內皮細胞生長兩類結果；來源未進一步限定其發生的組織或生理情境。
它在某些細胞類型中是弱效的凋亡誘導因子。此描述限定於部分細胞類型，且指出誘導能力較弱，不宜概括為普遍或強烈的促凋亡作用。合併來看，來源支持 TNF superfamily member 12 參與細胞存活相關訊息、發炎反應與血管生成，但各項作用的條件並未在此資料中詳述。
Promoter 與基因調控
>TNFSF12 ENST00000293825 GRCh38 chr17:7548058-7549158 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAGGCGTGAACCATCGCGCCCAG CCAATTTTGGTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCC TCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTTTGAGACAAGGTCTGTTGCCCAGG CTGGAGTGTAGTGGTGCAATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAACAATCCTCCTACCT CGGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGGGCTAATTTTTTAAAACTTTTCTGTAGAGATGGGGTCT TGCTCTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGGCCCCCAGCCTTGGCCTTCTGGGATTACAGGCGTAAGCC ACCTGCCGGACCAATTTTGGTGTTTCTTTTGCATGCTGCTGGTCCTCCTCAGATGCTTGGCAATCATTGG TAATGATGGGCTTCAGAACGTGCTACCGGCACAGTGAGTGTTTTAAGCTGAAGGAATTTGAGAAAACCGC AGAAGCCGAAGGATCTTTCTTACCTTCTCCTGCCCTTCTTCCCTGAACCAGGTCATACAACCTGGAACTC CCTGCCCTTTTCCTGAAGAAGCAAATAACAGCCTCCTGCGAGAGGCGCCCTCCCTGCACCTGGGGGAAAG GAGGGTCCTTATCTCTGAAGACACAGGGACACAGAAGAATCTGAACCAACAGGCCTTCCTGAGTTCCCCA CCTCCCCGCAGGAGGTGCCCGCACACGCATAGCCCCGTCGCTCCCGCGGCCGCACGCAACGGACCTCGCC CTGGTGGTGCACGCCCGGGCTGGGCGCTCAGAGGTCGGGTGGGCGCCCACTCCGTTCGCTGCGCGCACAG CGCCCGGCGAGAGGCTCGGAGTTTGATCACACACAGCGTCCGGCTTCCTGTCCCCAGCGCCCCCTCCCGC CCCGTTTCCCTTGCCCCTCCCTCTCCCCGGCCCGATCCGCCCGCCGGCTCCCCCTCCCCCGATCCCTCGG GTCCCGGGATGGGGGGGCGGTGAGGCAGGCACAGCCCCCCGCCCCCATGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFSF12_2 ↗ | 17:7,548,942 | 正股 | 7,548,893–7,548,952 |
| TNFSF12_1 ↗ | 17:7,549,058 | 正股 | 7,549,009–7,549,068 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B3HG5 · promoter · 7548448–7549109 · regulatory
ENSR17_53QXF7 · CTCF_binding_site · 7549021–7549042 · regulatory
ENSR17_B3HGP · enhancer · 7552576–7553200 · regulatory
· motif · 7548611–7548619 · motif
· motif · 7548611–7548628 · motif
· motif · 7549023–7549039 · motif
· motif · 7549420–7549433 · motif
· motif · 7549584–7549593 · motif
· motif · 7549614–7549623 · motif
· motif · 7552547–7552562 · motif
· motif · 7552916–7552928 · motif
· motif · 7552932–7552949 · motif
· motif · 7552935–7552945 · motif
· motif · 7552995–7553008 · motif
· motif · 7553527–7553533 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：249 aa
TNF superfamily member 12 長 249 個胺基酸，屬於 tumor necrosis factor family。其 N 端具有細胞質區域，接著是第 22–42 位的螺旋跨膜區，該區被註記為第二型膜蛋白的訊號錨定區；其後為細胞外區域。THD domain 位於第 107–248 位，而第 55–85 位被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNF superfamily member 12 的主要註記包括細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白，以及分泌型。 另有 TWE-PRIL 異構型被註記為細胞膜上的單次跨膜蛋白；資料未說明不同形式之間的轉換條件或動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDK1P06493 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT3P35638 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DICER1Q9UPY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFRSF12AQ9NP84 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- tnfrsf12a.LQ6SIX7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TNF superfamily member 12 可能以同源三聚體形式存在，此項組成註記屬於推定。另有資料指出它與血管生成因子 AGGF1/VG5Q 互作；來源未將此互作描述為特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNF superfamily member 12 可與 FN14 結合，並可能也與 TNRFSF12/APO3 結合；它在某些細胞類型中是弱效的凋亡誘導因子，也能介導 NF-kappa-B 活化。此蛋白質促進血管生成與內皮細胞增殖，並參與發炎細胞激素誘導及 IL8 分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds to FN14 and possibly also to TNRFSF12/APO3. Weak inducer of apoptosis in some cell types. Mediates NF-kappa-B activation. Promotes angiogenesis and the proliferation of endothelial cells. Also involved in induction of inflammatory cytokines. Promotes IL8 secretion PMID 10085077 ↗ · PMID 23667509 ↗ |
| 交互作用 | TNF superfamily member 12 被推定可能形成同源三聚體；此外，它與血管生成因子 AGGF1/VG5Q 有互作關係。來源未進一步說明此互作是否構成特定複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer (Probable). Interacts with the angiogenic factor AGGF1/VG5Q PMID 14961121 ↗ · PMID 23667509 ↗ |
| 細胞定位 | TNF superfamily member 12 有細胞膜定位註記，並被描述為單次跨膜的第二型膜蛋白。此筆資料未提供其他定位條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12 的分泌型被註記為分泌狀態。此筆資料未提供分泌的條件、細胞情境或與其他形式的轉換關係。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TWE-PRIL 異構型被註記位於細胞膜，並具有單次跨膜蛋白的特徵。此筆資料未說明該異構型的其他定位，或其與其他蛋白形式之間的動態關係。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCCCCGGCCCGATCCGCCCGCCGGCTCCCCCTCCCCC40GATCCCTCGGGTCCCGGGATGGGGGGGCGGTGAGGCAGGC80ACAGCCCCCCGCCCCCATGGCCGCCCGTCGGAGCCAGAGG120CGGAGGGGGCGCCGGGGGGAGCCGGGCACCGCCCTGCTGG160TCCCGCTCGCGCTGGGCCTGGGCCTGGCGCTGGCCTGCCT200CGGCCTCCTGCTGGCCGTGGTCAGTTTGGGGAGCCGGGCA240TCGCTGTCCGCCCAGGAGCCTGCCCAGGAGGAGCTGGTGG280CAGAGGAGGACCAGGACCCGTCGGAACTGAATCCCCAGAC320AGAAGAAAGCCAGGATCCTGCGCCTTTCCTGAACCGACTA360GTTCGGCCTCGCAGAAGTGCACCTAAAGGCCGGAAAACAC400GGGCTCGAAGAGCGATCGCAGCCCATTATGAAGTTCATCC440ACGACCTGGACAGGACGGAGCGCAGGCAGGTGTGGACGGG480ACAGTGAGTGGCTGGGAGGAAGCCAGAATCAACAGCTCCA520GCCCTCTGCGCTACAACCGCCAGATCGGGGAGTTTATAGT560CACCCGGGCTGGGCTCTACTACCTGTACTGTCAGGTGCAC600TTTGATGAGGGGAAGGCTGTCTACCTGAAGCTGGACTTGC640TGGTGGATGGTGTGCTGGCCCTGCGCTGCCTGGAGGAATT680CTCAGCCACTGCGGCGAGTTCCCTCGGGCCCCAGCTCCGC720CTCTGCCAGGTGTCTGGGCTGTTGGCCCTGCGGCCAGGGT760CCTCCCTGCGGATCCGCACCCTCCCCTGGGCCCATCTCAA800GGCTGCCCCCTTCCTCACCTACTTCGGACTCTTCCAGGTT840CACTGAGGGGCCCTGGTCTCCCCGCAGTCGTCCCAGGCTG880CCGGCTCCCCTCGACAGCTCTCTGGGCACCCGGTCCCCTC920TGCCCCACCCTCAGCCGCTCTTTGCTCCAGACCTGCCCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。