演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNFSF10TRAIL

TNF superfamily member 10

TNFSF10 編碼 TNF superfamily member 10,屬於 TNF 家族的細胞激素,可結合多種受體並誘導細胞凋亡。

Homo sapiens3q26.31UniProt P50591
OFFICIAL SYMBOL
TNFSF10
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P50591
PDB / ALPHAFOLD
1DG6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNFSF10 是蛋白質編碼基因,其產物 TNF superfamily member 10 為 TNF 家族的細胞激素。它可與 TNFRSF10A、TNFRSF10B、TNFRSF10C 和 TNFRSF10D 結合,也可能與 TNFRSF11B 結合。這些受體結合關係構成其基本分子特性;其中部分受體無法誘導細胞凋亡,可能調節 TNFSF10 的活性。

Official symbol
TNFSF10
Gene name
TNF superfamily member 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11925
UniProt
P50591
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TRAILApo-2LTL2CD253TANCR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q26.31
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegTNFSF10pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:172,505,503–172,523,529
Gene span
18,027 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000241261 ★172,505,508–172,523,4305
ENST00001144641172,505,508–172,523,4765
ENST00000855868172,505,510–172,523,4764
ENST00000967485172,505,517–172,523,4764
ENST00000855869172,505,519–172,523,4764
ENST00000420541172,505,662–172,523,4763
ENST00000855870172,505,674–172,523,4765
ENST00001040999172,505,677–172,523,4764
ENST00001102937172,505,726–172,523,4762
ENST00000855871172,506,404–172,523,4765
ENST00000855872172,506,404–172,523,4766

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNF superfamily member 10 是一種細胞激素,可與多種受體結合並誘導細胞凋亡。已列出的受體包括 TNFRSF10A(TRAILR1)、TNFRSF10B(TRAILR2)、TNFRSF10C(TRAILR3)及 TNFRSF10D(TRAILR4);此外,它也可能與 TNFRSF11B(OPG)結合。

不同受體的功能並不相同。TNFRSF10C、TNFRSF10D 與 TNFRSF11B 被描述為誘餌受體,無法誘導細胞凋亡。TNFSF10 與這些受體結合時,其活性可能受到調節;來源未進一步說明調節的方向或程度。因此,不能將所有受體結合都視為直接引發凋亡的訊號。

這些特性顯示,TNFSF10 的作用與受體種類有關:它能誘導細胞凋亡,而誘餌受體的結合則可能改變其活性。現有資料支持其細胞激素性質、受體結合對象及凋亡相關作用,但未提供更細部的分子機制或其他生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 172523430 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNFSF10 ENST00000241261 GRCh38 chr3:172523330-172524430 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAGGAAAGAATAGAAAAGAAAAGAAAGA
AAGAAAGAAAGGAAGAAAAGGAAAGAAAGAAATGCTGAATAAGATATAGAGACAACATACAGCTGGGCCA
GCTTATGACATCTGATAGTGGGGAGATTTGGGGCTGGGTCCTGAATCTGAGGGTAATTAACTCCCTGTAA
CTTCTTTTCCTAATCTGTAAAAGGATAGTGACAGCGAGACATTGTGATGGGGTTAATATTTTGGAAAACA
TCCACATGTTTTTTTCCTTTGCCTTTCTGAGTGTGTCAACTACTTCCTACCTGTCCAGCCTAACACACAG
GCATGTTGTCTTGGTAGGGATGGAGATCTGAGAAGGAGATTAGAATTTGTGTCTGAAGGTTTGCAAAGAG
GAAGAAGTCGTCAATATTTAGATTCTGACATTCAAGATGGAATTATGTAGCAAGACCATTGCTATGAGAC
AGTATTTCTATTTTCCTTTATCCACTCCCACCCTGCCCTCTTCCCACCCTCACAGTAGCATGAGAAAAAC
CACATATGGAAGTTTCAGGTCATAAAAATTATCTTATAATTTAGAAAACAGGCCTTGTGCCTATGACAGC
CAGGCCATGAGGCTTAGAGCTCTGTGGTAGAATGAGGATATGTTAGGGAAAAGCAAAGAAAATCCCTCCC
CTCTTTGGCTGAGGACATTATCAAAAGGAGAGCAAGAAAGAGAAGAGAGAAATGGGCTTGAGGTGAGTGC
AGATAAGGGGTGCATGGATCCTGAGGGCAAGGAGAGGAGCTTCTTTCAGTTTCCCTCCTTTCCAACGACT
ACTTTGAGACAAGAGCTGTCCCTGGGCAGTAGGAAAGGGGAGGGACAGTTGCAGGTTCAATAGATGTGGG
TGGGGCCAAGGCCACAGAACCCAGAAAAACAACTCATTCGCTTTCATTTCCTCACTGACTATAAAAGAAT
AGAGAAGGAAGGGCTTCAGTGACCGGCTGCCTGGCTGACTTACAGCAGTCAGACTCTGACAGGATCATGG
CTATGATGGAGGTCCAGGGGGGACCCAGCCTGGGACAGACCTGCGTGCTGA
TNFSF10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNFSF10_1 ↗3:172,523,467負股172,523,457–172,523,516

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_53HKLLB · CTCF_binding_site · 172519907–172519928 · regulatory

ENSR3_B398FK · enhancer · 172520290–172520885 · regulatory

ENSR3_873XQC · enhancer · 172522305–172522475 · regulatory

ENSR3_B398G2 · promoter · 172523420–172523965 · regulatory

ENSR3_873XRQ · enhancer · 172524725–172524897 · regulatory

· motif · 172519160–172519169 · motif

· motif · 172519909–172519925 · motif

· motif · 172523495–172523512 · motif

· motif · 172523497–172523512 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:281 aa

1 aa281 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 P50591 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNF superfamily member 10 長 281 個胺基酸,屬於 TNF 家族。蛋白質 N 端第 1–17 位為細胞質區,第 18–38 位是作為第二型膜蛋白訊號錨定的螺旋跨膜區;第 39–281 位位於細胞外。第 122–280 位註記為 THD 結構域,第 124–144 位則註記為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–17 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein18–38 aa
拓樸區域Extracellular39–281 aa
結構域THD122–280 aa
功能區域Disordered124–144 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1DG6…

PDB · 1DG6

X-ray · 1.30 A · A=91-281

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Secreted

TNFSF10 存在於細胞膜,也可呈分泌型;資料指出它同時具有膜結合型與可溶型。 其跨膜區註記為第二型膜蛋白的訊號錨定區。 來源未提供不同形式出現的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TRAILTNFSF10CUL3TNFRSF10ATNFRSF10BTNFRSF10CTNFRSF10D
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNFSF10 可形成同源三聚體。每個 TNFSF10 同源三聚體可與三個 TNFSF10A 單體互作,也可與三個 TNFSF10B 單體互作。這些資料描述的是三聚體與單體之間的互作;未進一步說明其是否構成其他複合體或具有何種功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNFSF10 是一種可結合 TNFRSF10A/TRAILR1、TNFRSF10B/TRAILR2、TNFRSF10C/TRAILR3 與 TNFRSF10D/TRAILR4 的細胞激素,也可能結合 TNFRSF11B/OPG。它能誘導細胞凋亡;與無法誘導凋亡的誘餌受體 TNFRSF10C、TNFRSF10D 或 TNFRSF11B 結合時,活性可能受到調節。含實驗來源
證據與來源

Cytokine that binds to TNFRSF10A/TRAILR1, TNFRSF10B/TRAILR2, TNFRSF10C/TRAILR3, TNFRSF10D/TRAILR4 and possibly also to TNFRSF11B/OPG. Induces apoptosis. Its activity may be modulated by binding to the decoy receptors TNFRSF10C/TRAILR3, TNFRSF10D/TRAILR4 and TNFRSF11B/OPG that cannot induce apoptosis

PMID 10549288 ↗ · PMID 26457518 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNFSF10 可形成同源三聚體。每個 TNFSF10 同源三聚體與三個 TNFSF10A 單體互作;另有資料指出,每個三聚體也可與三個 TNFSF10B 單體互作。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer. One TNFSF10 homotrimer interacts with three TNFSF10A monomers. One TNFSF10 homotrimer interacts with three TNFSF10B monomers

PMID 10549288 ↗ · PMID 26457518 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNFSF10 位於細胞膜,屬於單次跨膜的第二型膜蛋白,也可被分泌。資料指出它同時具有膜結合型與可溶型。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type II membrane protein; Secreted; Exists both as membrane-bound and soluble form

PMID 14609566 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000241261 · 1,876 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GACCGGCTGCCTGGCTGACTTACAGCAGTCAGACTCTGAC40
41AGGATCATGGCTATGATGGAGGTCCAGGGGGGACCCAGCC80
81TGGGACAGACCTGCGTGCTGATCGTGATCTTCACAGTGCT120
121CCTGCAGTCTCTCTGTGTGGCTGTAACTTACGTGTACTTT160
161ACCAACGAGCTGAAGCAGATGCAGGACAAGTACTCCAAAA200
201GTGGCATTGCTTGTTTCTTAAAAGAAGATGACAGTTATTG240
241GGACCCCAATGACGAAGAGAGTATGAACAGCCCCTGCTGG280
281CAAGTCAAGTGGCAACTCCGTCAGCTCGTTAGAAAGATGA320
321TTTTGAGAACCTCTGAGGAAACCATTTCTACAGTTCAAGA360
361AAAGCAACAAAATATTTCTCCCCTAGTGAGAGAAAGAGGT400
401CCTCAGAGAGTAGCAGCTCACATAACTGGGACCAGAGGAA440
441GAAGCAACACATTGTCTTCTCCAAACTCCAAGAATGAAAA480
481GGCTCTGGGCCGCAAAATAAACTCCTGGGAATCATCAAGG520
521AGTGGGCATTCATTCCTGAGCAACTTGCACTTGAGGAATG560
561GTGAACTGGTCATCCATGAAAAAGGGTTTTACTACATCTA600
601TTCCCAAACATACTTTCGATTTCAGGAGGAAATAAAAGAA640
641AACACAAAGAACGACAAACAAATGGTCCAATATATTTACA680
681AATACACAAGTTATCCTGACCCTATATTGTTGATGAAAAG720
721TGCTAGAAATAGTTGTTGGTCTAAAGATGCAGAATATGGA760
761CTCTATTCCATCTATCAAGGGGGAATATTTGAGCTTAAGG800
801AAAATGACAGAATTTTTGTTTCTGTAACAAATGAGCACTT840
841GATAGACATGGACCATGAAGCCAGTTTTTTTGGGGCCTTT880
881TTAGTTGGCTAACTGACCTGGAAAGAAAAAGCAATAACCT920
921CAAAGTGACTATTCAGTTTTCAGGATGATACACTATGAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。