基因總覽
TNFRSF25 是位於人類第 1 號染色體 1p36.31 的蛋白質編碼基因，產物屬於腫瘤壞死因子受體超家族。TNF receptor superfamily member 25 是單次穿膜的細胞膜受體，具有胞外區、跨膜區及胞質區；胞外部分包含四個 TNFR-Cys 重複區，胞質部分則含有 Death domain。這些結構特徵構成其受體架構；其所接收的配體與相關細胞作用見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000356876 ★ | 6,460,786–6,466,173 | 10 |
| ENST00000647810 | 6,460,786–6,465,470 | 9 |
| ENST00000377782 | 6,460,786–6,466,190 | 10 |
| ENST00000351959 | 6,460,786–6,466,190 | 9 |
| ENST00000871991 | 6,460,786–6,466,190 | 9 |
| ENST00000925609 | 6,460,786–6,466,190 | 7 |
| ENST00001145712 | 6,460,786–6,466,190 | 10 |
| ENST00000348333 | 6,461,434–6,466,107 | 9 |
| ENST00000351748 | 6,461,434–6,466,107 | 5 |
| ENST00000481401 | 6,462,637–6,465,630 | 7 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFRSF25 的產物是 TNFSF12/APO3L/TWEAK 的受體。配體與受體的關係將其定位為該訊號的接收端；來源並未進一步說明配體結合的條件或下游分子步驟，因此不宜據此推定更細的作用機制。
此受體可與接頭蛋白 TRADD 直接互動，並介導 NF-kappa-B 活化，也能誘導細胞凋亡。這些資料指出，TNFRSF25 與兩類不同的細胞反應相關：一方面涉及 NF-kappa-B 訊號活化，另一方面可促使細胞進入凋亡。來源未提供兩種反應之間的先後順序、相對強度或特定情境，故不能進一步判定其如何選擇不同反應。
此外，TNFRSF25 可能參與淋巴球恆定調節。此作用以「可能」描述，表示來源提出的是潛在角色，而非確定的調節機制；現有資料亦未詳述其影響哪些淋巴球類型或如何維持恆定。綜合而言，來源支持其作為 TNFSF12/APO3L/TWEAK 受體、與 TRADD 直接互動，並連結 NF-kappa-B 活化、細胞凋亡及可能的淋巴球恆定調節。
Promoter 與基因調控
>TNFRSF25 ENST00000356876 GRCh38 chr1:6466073-6467173 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTACGTATTTATTGAGCTTTTGGTTCTTTTATAAAGACTTGTCTAGACTCCACTGGGAAGAGTCCTTTGC TTTGGGGCCCAGTGACTCGGGGCACTTGAGTTCAGGGCGGCCTCCTTGTGTTCCTGTGCTCCTCCACTTG CCACGGATGGGCCACGGATGGAGCTTGCCATGGGAAGCACTGGGAAGTAATGGGGTGTGGGGTGCCACCA GACCAACACCCCCAGACTTCCCCACCTTCAGCCACCATCAGAGCCTCTCCCCAGGTGCCCCCCGGGGATT CAGGGCTGAATCTGCCCAGTTCCCACACTCAGGCCAGCCCTCTTGGGAAGGTGGGTCCTCCATGGGGGTC CCTTCAGGAACTTTTTTTTTTTTTTTAATACAGAGTCTCACTCTGTCACCTAGGTTGGAGTGCAGTGGTG TGATGTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCCCAGCCACTCTAGTAGC TGGAACTGCAGGTGTGCACCACCACGCCGGGCTAGTTTTTGTATTTTAAGTAGAGACGGCATTTCACCAT ATTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCCCAAGTGTTCCGCCCGCCTCTGCCTCCCATAGTGCTAGAA TTACAGGCCTGAGCTACTGCGCTTGGCCCCTTGCGGTACTTTTGGCCCAACCTCCTCCATGGCTGGGGAC GCGGAGGCCGAGAGAGAAGTCACTTGCCCTGGCTCTACCTTGAAGTGGTTCTCAGGGTTGGGGCGAGAGT CGGGGTGGGGACCGAGATGCAGCTCTATCCTGTGCCCCTGGTCGCAGCAGGCAGCCCAGCGCTTCGCGTG TTCTACTTGGCCTGTCCGCTGCCGCCTAATGAGCTCAGGTCTAGGCCGAGCAGAGGGGGCACCTGGTCGG ACTCGGTTGGGCTCGGGCGGCCCCGCCTCCCCCCGCCCGCCAGGCGGGCCCTTCTCGACGGCGCGGGGCG GGCCCTGCGGGCGCGGGGCTGAAGGCGGAACCACGACGGGCAGAGAGCACGGAGCCGGGAAGCCCCTGGG CGCCCGTCGGAGGGCTATGGAGCAGCGGCCGCGGGGCTGCGCGGCGGTGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFRSF25_1 ↗ | 1:6,466,152 | 負股 | 6,466,142–6,466,201 |
| TNFRSF25_2 ↗ | 1:6,469,123 | 負股 | 6,469,113–6,469,172 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_94KB3 · promoter · 6466097–6466522 · regulatory
· motif · 6463877–6463890 · motif
· motif · 6463877–6463890 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：417 aa
TNF receptor superfamily member 25 長 417 個胺基酸。其第 1–24 位為訊號肽，第 25–199 位為胞外區，第 200–220 位為螺旋型跨膜區，第 221–417 位為胞質區。胞外區含四個 TNFR-Cys 重複區；胞質區第 332–413 位註記為 Death domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1、2、9 與 11 註記為單次穿膜的細胞膜蛋白；Isoform 3、4、5、6、7、8、10 與 12 則註記為分泌型。 這些資料呈現不同異構型的定位差異，未提供定位轉換的條件或動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TNFRSF25 可形成同源二聚體。其 Death domain 與 TNFRSF1、TRADD 有強烈互動，並與至少兩條不同訊號級聯相關，分別為細胞凋亡與 NF-kappa-B 訊號；另有與 BAG4 互動的註記。來源未進一步說明 BAG4 互動的性質或功能。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 14 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFRSF25 是 TNFSF12/APO3L/TWEAK 的受體，能直接與接頭蛋白 TRADD 互動，並介導 NF-kappa-B 活化及誘導細胞凋亡；此外，它可能參與淋巴球恆定調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for TNFSF12/APO3L/TWEAK. Interacts directly with the adapter TRADD. Mediates activation of NF-kappa-B and induces apoptosis. May play a role in regulating lymphocyte homeostasis PMID 8875942 ↗ · PMID 8994832 ↗ · PMID 9052839 ↗ |
| 交互作用 | TNFRSF25 可形成同源二聚體，並透過 Death domain 與 TNFRSF1、TRADD 強烈互動，連結至少兩種不同訊號級聯：細胞凋亡與 NF-kappa-B 訊號；另有與 BAG4 互動的註記。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts strongly via the death domains with TNFRSF1 and TRADD to activate at least two distinct signaling cascades, apoptosis and NF-kappa-B signaling. Interacts with BAG4 PMID 9915703 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1 註記為細胞膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 2 註記為細胞膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 9 註記為細胞膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 11 註記為細胞膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 3; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 4; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 5; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 6; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 7; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 8; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 10; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 12; Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GAAGGCGGAACCACGACGGGCAGAGAGCACGGAGCCGGGA40AGCCCCTGGGCGCCCGTCGGAGGGCTATGGAGCAGCGGCC80GCGGGGCTGCGCGGCGGTGGCGGCGGCGCTCCTCCTGGTG120CTGCTGGGGGCCCGGGCCCAGGGCGGCACTCGTAGCCCCA160GGTGTGACTGTGCCGGTGACTTCCACAAGAAGATTGGTCT200GTTTTGTTGCAGAGGCTGCCCAGCGGGGCACTACCTGAAG240GCCCCTTGCACGGAGCCCTGCGGCAACTCCACCTGCCTTG280TGTGTCCCCAAGACACCTTCTTGGCCTGGGAGAACCACCA320TAATTCTGAATGTGCCCGCTGCCAGGCCTGTGATGAGCAG360GCCTCCCAGGTGGCGCTGGAGAACTGTTCAGCAGTGGCCG400ACACCCGCTGTGGCTGTAAGCCAGGCTGGTTTGTGGAGTG440CCAGGTCAGCCAATGTGTCAGCAGTTCACCCTTCTACTGC480CAACCATGCCTAGACTGCGGGGCCCTGCACCGCCACACAC520GGCTACTCTGTTCCCGCAGAGATACTGACTGTGGGACCTG560CCTGCCTGGCTTCTATGAACATGGCGATGGCTGCGTGTCC600TGCCCCACGAGCACCCTGGGGAGCTGTCCAGAGCGCTGTG640CCGCTGTCTGTGGCTGGAGGCAGATGTTCTGGGTCCAGGT680GCTCCTGGCTGGCCTTGTGGTCCCCCTCCTGCTTGGGGCC720ACCCTGACCTACACATACCGCCACTGCTGGCCTCACAAGC760CCCTGGTTACTGCAGATGAAGCTGGGATGGAGGCTCTGAC800CCCACCACCGGCCACCCATCTGTCACCCTTGGACAGCGCC840CACACCCTTCTAGCACCTCCTGACAGCAGTGAGAAGATCT880GCACCGTCCAGTTGGTGGGTAACAGCTGGACCCCTGGCTA920CCCCGAGACCCAGGAGGCGCTCTGCCCGCAGGTGACATGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。