基因總覽
TNFRSF21 是蛋白質編碼基因，產物 TNF receptor superfamily member 21 屬於 TNF receptor superfamily。此蛋白質為單次穿膜的第一型膜蛋白，包含細胞外區段、穿膜區段及細胞質區段。細胞外區段具有四個 TNFR-Cys 重複序列；細胞質區段則含有 Death domain。其功能涵蓋細胞存活與死亡調節、免疫反應，以及少突膠質細胞相關生物學過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296861 ★ | 47,231,532–47,309,905 | 6 |
| ENST00001034404 | 47,231,531–47,310,006 | 6 |
| ENST00000877798 | 47,231,532–47,310,006 | 7 |
| ENST00000911387 | 47,231,532–47,310,006 | 3 |
| ENST00000952535 | 47,231,532–47,310,006 | 5 |
| ENST00000952536 | 47,231,532–47,310,006 | 6 |
| ENST00001083408 | 47,231,532–47,310,006 | 5 |
| ENST00001135162 | 47,231,532–47,310,006 | 6 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFRSF21 參與細胞凋亡調節。來源指出，它可能透過涉及 NF-kappa-B 活化的途徑促進凋亡；也可促進由 BAX 介導的凋亡，以及 cytochrome c 從粒線體釋放至細胞質所相關的凋亡過程。這些作用顯示 TNFRSF21 涉及多種凋亡訊號途徑，但來源未將其限定為單一機制。
在營養因子缺乏時，細胞表面的 APP 會經 beta-secretase 切割，釋出 sAPP-beta；sAPP-beta 隨後再被切割，產生 APP 的 N 端片段 N-APP。來源將這段切割事件列於 TNFRSF21 的功能敘述中，並指出它與營養因子缺乏的情境相關。
在神經系統相關過程中，TNFRSF21 負向調節少突膠質細胞的存活、成熟與髓鞘形成。這表示它與少突膠質細胞發育及其髓鞘相關功能的調節有關；來源並未提供更細的細胞或分子作用步驟。
TNFRSF21 也參與 T 細胞受體刺激所引發的訊號級聯，以及適應性免疫反應，並調節 T 細胞分化與增殖。它會負向調節 T 細胞反應，並抑制 Th2 細胞釋放 IL4、IL5、IL10、IL13 與 IFNG 等細胞激素；在抗原刺激下，也負向調節 IgG、IgM 和 IgM 的產生。此外，它可能抑制 T 細胞受刺激後 JNK 的活化，但此作用仍以可能性描述。
在焦性凋亡調節方面，活性氧（ROS）及其後續氧化會促使 TNFRSF21 招募 CASP8，進而活化 GSDMC。來源將這一作用描述為 TNFRSF21 調節焦性凋亡的方式，並未進一步界定其適用的細胞或條件。
Promoter 與基因調控
>TNFRSF21 ENST00000296861 GRCh38 chr6:47309805-47310905 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGGAGACTCGGCCTTCCCCCAGGTGAAACAAAGAAAAGGATAACAGCTGCTCTCTTACATTCAGAAGTG TGTGAGATACCAACATCCACGAGAATATTCCAGTTCTCCTTCTGAAGCAGAATACTACCTATTCTACCAC CCACATCCTGACAAGGCCTTTGGAAATCAACTCAAAAATTTTTAGCATTATTTTTTGGGGGAAGGGTGAT TAAAAAAAATCTCAGGGATAATCCGATTCAAAACTCTTGATTTTTAAATTAGGAAAATGCATCTTTTGAT ACATTTCAAGGAGTTCAAAAGTCCCTCCAAGACCATCCATGGACCCAACACCAATGACTCTGGGTTTTAA ATCCTTTTAGTTTGGATTTCCTTAATTGCATTCATAAGCCCATATTAAAATTAAAATATAAAAAATTAAA ATCTTTGCCCCATATTAAAATCACCCTGAAAACTTAAAAAACAAACAAACAACAACAACAACAAACCTCA ATGCCCAGACCAGATCCTGTCCTGTTCCAATTAAATCAGAGTCTCTAGAGGTGGGACCCAAGAATCAATA TATATGTTTTGAACTCTCCAGGTGATTCCACAGGGCAGCAAAGTTTGAGAAGCAACACACAGGTCTCCTT TTTCGTCACGCAGTTGATCTAAGTGCTCTGTGGTCTATTCACCATCGCTCTCTGATTTAATCATCGTGTC CGAAACAATGGAAAGGCGTATGTAGCTGAAATAATTTAGTTGGAATTATCTCGGAAAAAATAAGTAAAGT TAGATCAGGAGTGAGATGCTTTCTCAGCGCTTTCCCTGGGTCAACAGGCGCGTGCAATTTCCTCAGCGAA CGCCAAGGGGCACCCTCTCCCTCCCCGCTCTACCTGGAACGCCTTCGCCTTTCCAACCGCACAAAGAGCC CGGCCTCCTCCCGGGTGACATCACAAAGGGCCGGTCCCCCGCCCCTTCGGCGCCACCACGTGTGTCCCTG CGCCCGGTGGCCACCGACTCAGTCCCTCGCCGACCAGTCTGGGCAGCGGAGGAGGGTGGTTGGCAGTGGC TGGAAGCTTCGCTATGGGAAGTCGTTCCTTTGCTCTCTCGCGCCCAGTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFRSF21_1 ↗ | 6:47,309,905 | 負股 | 47,309,895–47,309,954 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9NQZP · enhancer · 47307968–47308412 · regulatory
ENSR6_C6NQ8 · enhancer · 47308540–47309894 · regulatory
ENSR6_5F5FZS · CTCF_binding_site · 47309140–47309161 · regulatory
ENSR6_5F5G3X · CTCF_binding_site · 47309592–47309613 · regulatory
ENSR6_83DK2G · promoter · 47309895–47310036 · regulatory
ENSR6_5F5G5H · CTCF_binding_site · 47309929–47309950 · regulatory
ENSR6_9NR2B · enhancer · 47310037–47310409 · regulatory
· motif · 47307794–47307803 · motif
· motif · 47307794–47307803 · motif
· motif · 47309142–47309158 · motif
· motif · 47309594–47309610 · motif
· motif · 47309931–47309947 · motif
· motif · 47309932–47309941 · motif
· motif · 47309932–47309941 · motif
· motif · 47309970–47309983 · motif
· motif · 47309970–47309983 · motif
· motif · 47310102–47310113 · motif
· motif · 47310106–47310120 · motif
· motif · 47310106–47310120 · motif
TNF 會上調 TNFRSF21。來源未提供此調控的進一步條件或作用機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：655 aa
TNF receptor superfamily member 21 長 655 個胺基酸。其 N 端訊號胜肽位於第 1–41 位；細胞外區段為第 42–349 位，含四個 TNFR-Cys 重複序列。第 350–370 位是螺旋型穿膜區，細胞質區段為第 371–655 位。Death domain 位於第 415–498 位。另有兩段被註記為無序區，分別位於第 243–286 位及第 318–337 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFRSF21 位於細胞膜，屬單次穿膜的第一型膜蛋白。 在活性氧（ROS）引發氧化後，該蛋白質會被內吞，顯示其定位可隨氧化條件改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NGFRP08138 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PI16Q6UXB8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TNFRSF21 與 TRADD、NGFR 及 CASP8 有交互作用。另在微生物感染情境下，它會與 hepatitis C virus（HCV）的非結構蛋白 5A 交互作用；此交互作用使病毒得以依賴 DR6 調節 JNK、p38 MAPK、STAT3 與 Akt 訊號途徑。來源未將這些關係一概描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFRSF21 可能透過涉及 NF-kappa-B 活化的途徑促進細胞凋亡，也可促進 BAX 介導的凋亡，以及 cytochrome c 從粒線體釋至細胞質相關的凋亡。營養因子缺乏時，表面 APP 經 beta-secretase 切割產生 sAPP-beta，之後再切割形成 N-APP。TNFRSF21 負向調節少突膠質細胞存活、成熟與髓鞘形成，並參與 T 細胞受體訊號、適應性免疫及 T 細胞分化增殖；它也抑制 T 細胞反應、Th2 細胞激素釋放及抗原誘發的免疫球蛋白產生，且可能抑制受刺激後的 JNK 活化。ROS 引發氧化時，它可招募 CASP8，促進 GSDMC 活化並調節焦性凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Promotes apoptosis, possibly via a pathway that involves the activation of NF-kappa-B. Can also promote apoptosis mediated by BAX and by the release of cytochrome c from the mitochondria into the cytoplasm. Trophic-factor deprivation triggers the cleavage of surface APP by beta-secretase to release sAPP-beta which is further cleaved to release an N-terminal fragment of APP (N-APP). Negatively regulates oligodendrocyte survival, maturation and myelination. Plays a role in signaling cascades triggered by stimulation of T-cell receptors, in the adaptive immune response and in the regulation of T-cell differentiation and proliferation. Negatively regulates T-cell responses and the release of cytokines such as IL4, IL5, IL10, IL13 and IFNG by Th2 cells. Negatively regulates the production of IgG, IgM and IgM in response to antigens. May inhibit the activation of JNK in response to T-cell stimulation. Also acts as a regulator of pyroptosis: recruits CASP8 in response to reactive oxygen species (ROS) and subsequent oxidation, leading to activation of GSDMC PMID 21725297 ↗ · PMID 22761420 ↗ · PMID 34012073 ↗ · PMID 9714541 ↗ |
| 交互作用 | TNFRSF21 與 TRADD 有關聯，並與 NGFR 及 CASP8 發生交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Associates with TRADD. Interacts with NGFR. Interacts with CASP8 PMID 23559013 ↗ · PMID 34012073 ↗ · PMID 9714541 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TNFRSF21 與 hepatitis C virus（HCV）的非結構蛋白 5A 交互作用。此作用使病毒得以透過 DR6 調節 JNK、p38 MAPK、STAT3 與 Akt 訊號途徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with hepatitis C virus (HCV) non-structural protein 5A; this interaction allows the modulation by the virus of JNK, p38 MAPK, STAT3, and Akt signaling pathways in a DR6-dependent manner PMID 28743875 ↗ |
| 細胞定位 | TNFRSF21 位於細胞膜，屬單次穿膜的第一型膜蛋白；在活性氧（ROS）引發氧化後會被內吞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Endocytosed following oxidation in response to reactive oxygen species (ROS) PMID 19654028 ↗ |
| 調控 | TNF 會上調 TNFRSF21。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCTCGCCGACCAGTCTGGGCAGCGGAGGAGGGTGGT40TGGCAGTGGCTGGAAGCTTCGCTATGGGAAGTCGTTCCTT80TGCTCTCTCGCGCCCAGTCCTCCTCCCTGGTTCTCCTCAG120CCGCTGTCGGAGGAGAGCACCCGGAGACGCGGGCTGCAGT160CGCGGCGGCTTCTCCCCGCCTGGGCGGCCGCGCCGCTGGG200CAGGTGCTGAGCGCCCCTAGAGCCTCCCTTGCCGCCTCCC240TCCTCTGCCCGGCCGCAGCAGTGCACATGGGGTGTTGGAG280GTAGATGGGCTCCCGGCCCGGGAGGCGGCGGTGGATGCGG320CGCTGGGCAGAAGCAGCCGCCGATTCCAGCTGCCCCGCGC360GCCCCGGGCGCCCCTGCGAGTCCCCGGTTCAGCCATGGGG400ACCTCTCCGAGCAGCAGCACCGCCCTCGCCTCCTGCAGCC440GCATCGCCCGCCGAGCCACAGCCACGATGATCGCGGGCTC480CCTTCTCCTGCTTGGATTCCTTAGCACCACCACAGCTCAG520CCAGAACAGAAGGCCTCGAATCTCATTGGCACATACCGCC560ATGTTGACCGTGCCACCGGCCAGGTGCTAACCTGTGACAA600GTGTCCAGCAGGAACCTATGTCTCTGAGCATTGTACCAAC640ACAAGCCTGCGCGTCTGCAGCAGTTGCCCTGTGGGGACCT680TTACCAGGCATGAGAATGGCATAGAGAAATGCCATGACTG720TAGTCAGCCATGCCCATGGCCAATGATTGAGAAATTACCT760TGTGCTGCCTTGACTGACCGAGAATGCACTTGCCCACCTG800GCATGTTCCAGTCTAACGCTACCTGTGCCCCCCATACGGT840GTGTCCTGTGGGTTGGGGTGTGCGGAAGAAAGGGACAGAG880ACTGAGGATGTGCGGTGTAAGCAGTGTGCTCGGGGTACCT920TCTCAGATGTGCCTTCTAGTGTGATGAAATGCAAAGCATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。