基因總覽
TNFRSF1B 是蛋白質編碼基因，產物 TNF receptor superfamily member 1B 屬於腫瘤壞死因子受體超家族，作為 TNF/TNFSF2 與 LTA/TNFSF1 的受體。它具有不同配體親和力：對 TNF/TNFSF2 的親和力較高，對 LTA/TNFSF1 的親和力約低五倍。配體結合後可啟動 TNF 訊息傳遞。其膜受體形式及可分泌的異構型，呈現此基因產物在細胞表面受體與可溶性形式上的差異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376259 ★ | 12,166,991–12,209,220 | 10 |
| ENST00000857300 | 12,166,970–12,209,227 | 10 |
| ENST00000857301 | 12,166,970–12,209,221 | 10 |
| ENST00000857302 | 12,166,970–12,209,221 | 3 |
| ENST00000857303 | 12,166,970–12,209,227 | 11 |
| ENST00000857304 | 12,166,970–12,209,221 | 11 |
| ENST00000941754 | 12,166,970–12,209,221 | 7 |
| ENST00000941755 | 12,166,970–12,209,221 | 9 |
| ENST00000941756 | 12,166,970–12,209,221 | 10 |
| ENST00000941757 | 12,166,970–12,209,221 | 11 |
| ENST00000941758 | 12,166,970–12,209,227 | 11 |
| ENST00001105673 | 12,166,970–12,203,706 | 10 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFRSF1B 的配體包括 TNF/TNFSF2 與 LTA/TNFSF1。兩者結合受體後會啟動 TNF 訊息傳遞路徑；受體對 TNF/TNFSF2 的親和力較高，對 LTA/TNFSF1 的親和力約低五倍。配體結合也會促使形成訊息傳遞多蛋白複合體，參與決定細胞後續反應的調控。
TNF 訊息傳遞可導向不同結果：一方面，透過活化典型 NF-kappa-B 路徑促進細胞存活與發炎；另一方面，也可能引發程序性細胞死亡，包括 apoptosis 與 necroptosis。因此，TNFRSF1B 的作用與配體所引發的訊息複合體及其後續反應相關，不能簡化為只促進存活或只促進死亡。
另有資料指出，TNFRSF1B 可阻斷 TNF 誘導的 apoptosis；這項觀察提示它可能藉由拮抗 TNF 的生物活性來調節 TNF 功能。此結果描述的是對 TNF 誘導細胞死亡的抑制，不代表所有配體或訊息情境下的效應均相同。
Promoter 與基因調控
>TNFRSF1B ENST00000376259 GRCh38 chr1:12165991-12167091 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACATTCTCTCCCAGCCTCTGTTCATCTGCCCCCTGCCTGGGCAGGAGACTTGAGCAGGGAAGTGCAGAGT CTTCTCCCTGTGAGAAGGCTGGATGCGTGTTTAAGGATAAATGAACACGCGAAGAGTAGTAACAACAGCC AAGATTTATAAATGCCTATTGTTATATATGTAGATACTTACTTAAGTATATATAAAGTACAGACTGCATT ATGTATATTACATATCTTTAAATTTTTAGAATAGTCCTATGAGGTCAGTTCAGAGATCCAGACCCAGGTG GTCTGGCTCTAGAGTCTAAACAGGCCGAGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACCTTGGGAGGCC AGAGGCGGGAAGATCACTTGAGGGTGGGAAGAACACGTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAAC ATGGCGAAACCCCATCTCTATAAAGAAATCAGCCTAGCATGGTGGCCCGAGCCTGTAGTCCCAGCTACTC GGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCGCAGGAGTTGGAGGCTGCAGTGAGCTATGGGTGAAAGAGT GAGACCTTGTCTCAAAAAAAATTAAAAAATAAGAATTAAATATATTTAAAATAGAGTCTAAATAAGTGAA TGATCTAGAATTCTCTTGGTTCCCCTAAAGCAGCTGTCAGCTTTGGGGGATGTTTTTCCAAATTAGTGCC TCACCCTCACGGGACAGGGAAGCCTGTGGGAGCTGGGAGGGCAGGTGGAGGCCGGGCAGGTGGAGGCCGG GCAGGTGGAGATGGTGATTCGAAGAGGAGGGGACGATAGGAGGAGGTTGAGGGGTCACCCGAGTGCTGGG AGTGACGCTGGAGGTATCGGCCCAGCGATGCTGGAGTGGTCGGGTCGGAGGCCCAGCAGCGTCTGGGGAG GGGCGTGGGGGAGGCGTGTCCAAGGCCGGCTGGCCCCGCCCCGCCCCGCCGCCTGGCCTCTGGCCCGCTG GGGCGCGGGCTTTCGCTTTCAGTCGAGGGCTAGCGAGCGCAGCGGAGCCTGGAGAGAAGGCGCTGGGCTG CGAGGGCGCGAGGGCGCGAGGGCAGGGGGCAACCGGACCCCGCCCGCACCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFRSF1B_1 ↗ | 1:12,166,991 | 正股 | 12,166,942–12,167,001 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_C37KQ · enhancer · 12161163–12162865 · regulatory
ENSR1_54T8RQ · CTCF_binding_site · 12164406–12164427 · regulatory
ENSR1_54T8TQ · CTCF_binding_site · 12164841–12164862 · regulatory
ENSR1_8CMQ8 · enhancer · 12165444–12165652 · regulatory
ENSR1_96SDH · promoter · 12166593–12167013 · regulatory
ENSR1_54T97Q · CTCF_binding_site · 12166789–12166810 · regulatory
ENSR1_96SDQ · promoter · 12167509–12168009 · regulatory
ENSR1_54T9D4 · CTCF_binding_site · 12167722–12167743 · regulatory
ENSR1_C37L9 · enhancer · 12168194–12169228 · regulatory
ENSR1_96SFJ · enhancer · 12170200–12170631 · regulatory
ENSR1_8CMTT · enhancer · 12171683–12171886 · regulatory
· motif · 12162011–12162019 · motif
· motif · 12162052–12162058 · motif
· motif · 12162323–12162332 · motif
· motif · 12162360–12162369 · motif
· motif · 12163170–12163192 · motif
· motif · 12163170–12163192 · motif
· motif · 12163297–12163306 · motif
· motif · 12163337–12163354 · motif
· motif · 12163635–12163650 · motif
· motif · 12164408–12164424 · motif
· motif · 12164843–12164859 · motif
· motif · 12165584–12165597 · motif
· motif · 12165584–12165597 · motif
· motif · 12166791–12166807 · motif
· motif · 12166809–12166821 · motif
· motif · 12166811–12166818 · motif
· motif · 12166978–12166998 · motif
· motif · 12167050–12167065 · motif
· motif · 12167058–12167071 · motif
· motif · 12167165–12167174 · motif
· motif · 12167167–12167183 · motif
· motif · 12167167–12167183 · motif
· motif · 12167178–12167194 · motif
· motif · 12167178–12167194 · motif
· motif · 12167696–12167705 · motif
· motif · 12167724–12167740 · motif
· motif · 12167786–12167801 · motif
· motif · 12167797–12167810 · motif
· motif · 12167857–12167870 · motif
· motif · 12167857–12167870 · motif
· motif · 12168044–12168050 · motif
· motif · 12168243–12168258 · motif
· motif · 12168278–12168295 · motif
· motif · 12168511–12168518 · motif
· motif · 12168583–12168595 · motif
· motif · 12168585–12168592 · motif
· motif · 12170427–12170439 · motif
· motif · 12171107–12171119 · motif
· motif · 12171852–12171874 · motif
· motif · 12171852–12171874 · motif
· motif · 12171883–12171895 · motif
· motif · 12171889–12171901 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：461 aa
TNF receptor superfamily member 1B 長 461 個胺基酸。其 N 端訊號胜肽位於第 1–22 個胺基酸；細胞外區域為第 23–257 位，含四段 TNFR-Cys 重複序列。第 258–287 位是螺旋型跨膜區，後接第 288–461 位的細胞質區域。資料亦註記細胞外區域第 208–254 位，以及細胞質區域第 321–377 位與第 394–461 位為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
主要形式是單次跨膜的第一型膜蛋白，位於細胞膜。 另有分泌型 Isoform 2；資料也記載 Tumor necrosis factor-binding protein 2 為分泌形式，與膜上的受體形式不同。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- LTAP01374 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TNFP01375 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TRAF1Q13077 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF2Q12933 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- XPNPEP3Q9NQH7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TNF/TNFSF2 或 LTA/TNFSF1 結合其細胞外區域後，會促成 TNFRSF1B 同源三聚體形成。受體與 TRAF1、TRAF2 有交互作用；TRAF2 相關蛋白 BIRC2、BIRC3 及 FADD 隨後可被招募，形成參與細胞存活或程序性細胞死亡決策的訊息複合體。另有資料記載其與 BMX 及活化形式的 XPNPEP3 交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFRSF1B 是 TNF/TNFSF2 與 LTA/TNFSF1 的受體，配體結合可啟動 TNF 訊息傳遞。它對 TNF/TNFSF2 的親和力較高，對 LTA/TNFSF1 約低五倍。此路徑可經典型 NF-kappa-B 促進細胞存活與發炎，也可引發 apoptosis 或 necroptosis；配體結合會促使訊息複合體形成，以調控後續反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for TNF/TNFSF2 and LTA/TNFSF1, which activates the tumor necrosis factor-mediated (TNF) signaling pathway upon ligand-binding. Has high affinity for TNFSF2/TNF and approximately 5-fold lower affinity for LTA/TNFSF1. The TNF signaling pathway acts as a master regulator of the immune system, which either (1) promotes cell survival and inflammation by activating the canonical NF-kappa-B pathway or (2) trigger programmed cell death (apoptosis and necroptosis). TNF/TNFSF2 and LTA/TNFSF1-binding induces formation of a signaling multiprotein complexes that acts as a decision maker to initiate pro-survival or programmed cell death PMID 1328224 ↗ · PMID 2158104 ↗ · PMID 2160731 ↗ · PMID 8548810 ↗ · PMID 9435233 ↗ |
| 功能 | TNFRSF1B 可阻斷 TNF 誘導的 apoptosis。這項觀察提示，它可能藉由拮抗 TNF 的生物活性來調節 TNF 功能；來源未將此作用延伸至其他配體或所有訊息情境。 | 含實驗來源 | 證據與來源Blocks TNF-induced apoptosis, which suggests that it regulates TNF function by antagonizing its biological activity PMID 14688072 ↗ |
| 交互作用 | TNF/TNFSF2 或 LTA/TNFSF1 結合 TNFRSF1B 的細胞外區域後，會促成受體形成同源三聚體。受體與 TRAF1、TRAF2 交互作用；TRAF2 相關蛋白 BIRC2、BIRC3 與 FADD 可被招募至訊息複合體，參與細胞存活或程序性細胞死亡的調控。另記載其與 BMX 及活化形式的 XPNPEP3 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer; binding of TNF/TNFSF2 or LTA/TNFSF1 to the extracellular domain leads to homotrimerization. Interacts with TRAF1 and TRAF2. TRAF2-interacting proteins, such as BIRC2 and BIRC3 and FADD, are then recruited to form signaling multiprotein complexes that acts as a decision maker to initiate pro-survival or programmed cell death. Interacts with BMX. Interacts (activated form) with XPNPEP3 PMID 10206649 ↗ · PMID 12370298 ↗ · PMID 25609706 ↗ · PMID 8069916 ↗ · PMID 8548810 ↗ |
| 細胞定位 | TNFRSF1B 的主要形式是單次跨膜的第一型膜蛋白，定位於細胞膜。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 2; Secreted | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 資料將 Tumor necrosis factor-binding protein 2 註記為分泌形式。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCGAGGGCTAGCGAGCGCAGCGGAGCCTGGAGAGAAGG40CGCTGGGCTGCGAGGGCGCGAGGGCGCGAGGGCAGGGGGC80AACCGGACCCCGCCCGCACCCATGGCGCCCGTCGCCGTCT120GGGCCGCGCTGGCCGTCGGACTGGAGCTCTGGGCTGCGGC160GCACGCCTTGCCCGCCCAGGTGGCATTTACACCCTACGCC200CCGGAGCCCGGGAGCACATGCCGGCTCAGAGAATACTATG240ACCAGACAGCTCAGATGTGCTGCAGCAAATGCTCGCCGGG280CCAACATGCAAAAGTCTTCTGTACCAAGACCTCGGACACC320GTGTGTGACTCCTGTGAGGACAGCACATACACCCAGCTCT360GGAACTGGGTTCCCGAGTGCTTGAGCTGTGGCTCCCGCTG400TAGCTCTGACCAGGTGGAAACTCAAGCCTGCACTCGGGAA440CAGAACCGCATCTGCACCTGCAGGCCCGGCTGGTACTGCG480CGCTGAGCAAGCAGGAGGGGTGCCGGCTGTGCGCGCCGCT520GCGCAAGTGCCGCCCGGGCTTCGGCGTGGCCAGACCAGGA560ACTGAAACATCAGACGTGGTGTGCAAGCCCTGTGCCCCGG600GGACGTTCTCCAACACGACTTCATCCACGGATATTTGCAG640GCCCCACCAGATCTGTAACGTGGTGGCCATCCCTGGGAAT680GCAAGCATGGATGCAGTCTGCACGTCCACGTCCCCCACCC720GGAGTATGGCCCCAGGGGCAGTACACTTACCCCAGCCAGT760GTCCACACGATCCCAACACACGCAGCCAACTCCAGAACCC800AGCACTGCTCCAAGCACCTCCTTCCTGCTCCCAATGGGCC840CCAGCCCCCCAGCTGAAGGGAGCACTGGCGACTTCGCTCT880TCCAGTTGGACTGATTGTGGGTGTGACAGCCTTGGGTCTA920CTAATAATAGGAGTGGTGAACTGTGTCATCATGACCCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。