演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNFRSF17BCM

TNF receptor superfamily member 17

TNFRSF17 編碼 TNF receptor superfamily member 17,是可辨識 BAFF 與 APRIL 的受體,參與 B 細胞存活及體液免疫調節。

Homo sapiens16p13.13UniProt Q02223
OFFICIAL SYMBOL
TNFRSF17
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q02223
PDB / ALPHAFOLD
4ZFO
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNFRSF17 是蛋白質編碼基因,其產物為 TNF receptor superfamily member 17,屬於腫瘤壞死因子受體超家族。這是一種單次穿膜的 III 型膜蛋白,具有細胞外區段、跨膜區段與細胞質區段;細胞外區含有 TNFR-Cys 重複。其受體角色與 B 細胞存活及體液免疫調節相關,並可辨識 TNFSF13B/BLyS/BAFF 與 TNFSF13/APRIL。這些基本特性使其成為連結細胞外配體與細胞內訊息反應的膜受體。

Official symbol
TNFRSF17
Gene name
TNF receptor superfamily member 17
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11913
UniProt
Q02223
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BCMCD269TNFRSF13ABCMA

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.13
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTNFRSF17pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:11,965,138–11,968,068
Gene span
2,931 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000053243 ★11,965,210–11,968,0683
ENST0000039649511,965,138–11,968,0682
ENST0000113542711,965,138–11,968,0683
ENST0000056238511,965,350–11,967,7044

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNFRSF17 的產物是 TNFSF13B/BLyS/BAFF 與 TNFSF13/APRIL 的受體。這兩種配體與受體的辨識,構成其參與免疫調節的主要分子角色;來源未進一步說明兩種配體各自作用的條件或差異。

此受體促進 B 細胞存活,並參與體液免疫的調節。換言之,TNFRSF17 所介導的訊息與維持 B 細胞存活及體液免疫相關,但現有資料未提供其在不同 B 細胞階段或免疫情境中的具體作用細節。

受體活化可啟動 NF-kappa-B 與 JNK。這指出其訊息傳遞涉及這兩條路徑;來源並未描述下游分子、活化過程的先後次序,或各路徑對 B 細胞存活及體液免疫調節的個別貢獻。因此,這些內容可支持受體與細胞內訊息反應相連的說明,但不宜據此推定更細緻的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 11965210 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNFRSF17 ENST00000053243 GRCh38 chr16:11964210-11965310 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACTGTGGATTTTTAAAATGGTTTTATCTGCTCATCTGTATTTCTAAATTTTCAACAATGGAACATAGATT
ATTGTATTATTATTATAATACCCCAAACCTATCTTCCTCTCAGCCCTCTTTCCACGAGCTCTTACCCTAA
ATGTCTCTTTTTCTGTCAGTGGCATTGTGCGTCTTCCTTAGTGCATCACCTCTGATCTTCCTGTAGAATT
TTTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTTGCTTTGTCACCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCCTGATCTTGGCTTAC
TGCAAACTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCACGTCTCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCATAGGT
GCCTGCCACCATGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG
TTCTGGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGAGAGCG
CCACGGCGCCCAGCTTACACCAGACTACTTTTTAAAATGTTTTTGTAAAGTCAGGGTTTCGCCATGTTGC
CCAGGCTGATTTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTTTTGCCTTTTGACTCCCAAAGTCCTGGGATTAC
AGGTGTGAACCCCTGCAGCTGGCCTCAATGTTAAGATCTTAAGGGGCACAGCACAGACCTTGTCTTGTCT
ATCTCCCTGGCACCTCTCACAGAGTACAGCTTATTAACAGATGTTCCAGAAACTGTTACTGAACATTCGG
CTTGATGCTGTGGGCTTGTCTGCATCTTGCAACTGTCACCTGGCTGAGAAATTTCTTCTATAAATAAGCA
GTTTCTGTTTCAGATGTGATATGCCCTGATATTTACACCCTGTCTCTTACCCCATCCAAGACTCAAACTT
AGAAACTTGAATTAGATGTGGTATTCAAATCCTTAGCTGCCGCGAAGACACAGACAGCCCCCGTAAGAAC
CCACGAAGCAGGCGAAGTTCATTGTTCTCAACATTCTAGCTGCTCTTGCTGCATTTGCTCTGGAATTCTT
GTAGAGATATTACTTGTCCTTCCAGGCTGTTCTTTCTGTAGCTCCCTTGTT
TNFRSF17 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNFRSF17_1 ↗16:11,965,210正股11,965,161–11,965,220

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_8CHFT · enhancer · 11964344–11964555 · regulatory

ENSR16_96Q84 · promoter · 11964720–11965223 · regulatory

· motif · 11961527–11961549 · motif

· motif · 11961527–11961549 · motif

· motif · 11962843–11962858 · motif

· motif · 11962849–11962861 · motif

· motif · 11962851–11962858 · motif

· motif · 11962902–11962913 · motif

· motif · 11963146–11963161 · motif

· motif · 11963162–11963174 · motif

· motif · 11963164–11963171 · motif

· motif · 11963164–11963179 · motif

· motif · 11964633–11964648 · motif

· motif · 11964638–11964650 · motif

· motif · 11964641–11964648 · motif

· motif · 11964807–11964822 · motif

· motif · 11964837–11964846 · motif

· motif · 11964839–11964851 · motif

· motif · 11965036–11965047 · motif

· motif · 11965038–11965051 · motif

· motif · 11965484–11965496 · motif

· motif · 11966107–11966118 · motif

· motif · 11966192–11966204 · motif

· motif · 11966393–11966407 · motif

· motif · 11966513–11966525 · motif

· motif · 11968421–11968435 · motif

· motif · 11968766–11968777 · motif

· motif · 11969144–11969159 · motif

· motif · 11969146–11969161 · motif

· motif · 11969146–11969161 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:184 aa

1 aa184 aa重複區跨膜區拓樸區域
依 Q02223 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNF receptor superfamily member 17 長 184 個胺基酸。其第 1–54 位為細胞外區,第 55–77 位為螺旋型跨膜區,並作為 III 型膜蛋白的訊號錨定區;第 78–184 位位於細胞質側。細胞外第 7–41 位註記為 TNFR-Cys 重複。

拓樸區域Extracellular1–54 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type III membrane protein55–77 aa
拓樸區域Cytoplasmic78–184 aa
重複區TNFR-Cys7–41 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4ZFO…

PDB · 4ZFO

X-ray · 1.90 A · F/K=1-54

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Endomembrane system

TNFRSF17 產物的定位註記包括細胞膜、內膜系統,以及核周的 Golgi-like structures;資料亦將其描述為單次穿膜的 III 型膜蛋白。 來源未提供這些位置間轉換的條件或動態差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BCMTNFRSF17CMTM7PEX16TMBIM6TNFSF13B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNFRSF17 與 TRAF1、TRAF2、TRAF3、TRAF5 及 TRAF6 有關聯。資料使用「associates」描述這些關係,未進一步界定其是否為直接結合或同一複合體成員,因此不將其延伸解讀為特定結合機制。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

涉及 TNFRSF17 的染色體異常曾見於一種 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL)。所列異常為與 IL2 相關的 t(4;16)(q26;p13) 易位;此資料描述的是疾病中的染色體異常,不足以據此判定 TNFRSF17 對疾病具有因果作用。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNFRSF17 產物是 TNFSF13B/BLyS/BAFF 與 TNFSF13/APRIL 的受體,可促進 B 細胞存活並參與體液免疫調節;受體活化會啟動 NF-kappa-B 與 JNK。含實驗來源
證據與來源

Receptor for TNFSF13B/BLyS/BAFF and TNFSF13/APRIL. Promotes B-cell survival and plays a role in the regulation of humoral immunity. Activates NF-kappa-B and JNK

PMID 10801128 ↗ · PMID 10903733 ↗ · PMID 10973284 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNFRSF17 與 TRAF1、TRAF2、TRAF3、TRAF5 及 TRAF6 有關聯。來源未進一步說明這些關係是否為直接結合,或涉及何種複合體。含實驗來源
證據與來源

Associates with TRAF1, TRAF2, TRAF3, TRAF5 and TRAF6

PMID 12721620 ↗ · PMID 15542592 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNFRSF17 產物的定位註記包含細胞膜與內膜系統,並列出核周的 Golgi-like structures;亦描述為單次穿膜的 III 型膜蛋白。來源未說明不同位置間的轉換條件。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type III membrane protein; Endomembrane system / Single-pass type III membrane protein; Perinuclear Golgi-like structures

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯涉及 TNFRSF17 的染色體異常曾見於一種 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL),所列異常為與 IL2 相關的 t(4;16)(q26;p13) 易位。此項描述為疾病關聯,未確立因果關係。含實驗來源
證據與來源

A chromosomal aberration involving TNFRSF17 is found in a form of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Translocation t(4;16)(q26;p13) with IL2

PMID 1396583 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000053243 · 891 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTGTTCTCAACATTCTAGCTGCTCTTGCTGCATTTGCTC40
41TGGAATTCTTGTAGAGATATTACTTGTCCTTCCAGGCTGT80
81TCTTTCTGTAGCTCCCTTGTTTTCTTTTTGTGATCATGTT120
121GCAGATGGCTGGGCAGTGCTCCCAAAATGAATATTTTGAC160
161AGTTTGTTGCATGCTTGCATACCTTGTCAACTTCGATGTT200
201CTTCTAATACTCCTCCTCTAACATGTCAGCGTTATTGTAA240
241TGCAAGTGTGACCAATTCAGTGAAAGGAACGAATGCGATT280
281CTCTGGACCTGTTTGGGACTGAGCTTAATAATTTCTTTGG320
321CAGTTTTCGTGCTAATGTTTTTGCTAAGGAAGATAAACTC360
361TGAACCATTAAAGGACGAGTTTAAAAACACAGGATCAGGT400
401CTCCTGGGCATGGCTAACATTGACCTGGAAAAGAGCAGGA440
441CTGGTGATGAAATTATTCTTCCGAGAGGCCTCGAGTACAC480
481GGTGGAAGAATGCACCTGTGAAGACTGCATCAAGAGCAAA520
521CCGAAGGTCGACTCTGACCATTGCTTTCCACTCCCAGCTA560
561TGGAGGAAGGCGCAACCATTCTTGTCACCACGAAAACGAA600
601TGACTATTGCAAGAGCCTGCCAGCTGCTTTGAGTGCTACG640
641GAGATAGAGAAATCAATTTCTGCTAGGTAATTAACCATTT680
681CGACTCGAGCAGTGCCACTTTAAAAATCTTTTGTCAGAAT720
721AGATGATGTGTCAGATCTCTTTAGGATGACTGTATTTTTC760
761AGTTGCCGATACAGCTTTTTGTCCTCTAACTGTGGAAACT800
801CTTTATGTTAGATATATTTCTCTAGGTTACTGTTGGGAGC840
841TTAATGGTAGAAACTTCCTTGGTTTCATGATTAAACTCTT880
881TTTTTTCCTGA891

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。