基因總覽
TNFRSF10D 是蛋白質編碼基因，產物 TNF receptor superfamily member 10d 屬於 TNF receptor superfamily。這種單次穿膜的第一型膜蛋白具有細胞外區、穿膜區與細胞質區；細胞外部分含有三個 TNFR-Cys 重複序列，細胞質部分則帶有截短的 death domain。其作為 TRAIL 受體的基本特性，與完整誘導凋亡的能力不同；細胞凋亡及相關訊息作用的具體描述見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312584 ★ | 23,135,588–23,164,027 | 9 |
| ENST00001040776 | 23,135,588–23,164,030 | 9 |
| ENST00001071045 | 23,135,588–23,164,030 | 9 |
| ENST00001099015 | 23,135,588–23,164,030 | 8 |
| ENST00001136714 | 23,135,588–23,164,030 | 9 |
| ENST00000870290 | 23,137,471–23,163,935 | 9 |
| ENST00001071048 | 23,154,518–23,164,030 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNF receptor superfamily member 10d 是細胞毒性配體 TRAIL 的受體。雖能與此配體相關聯，其 death domain 為截短形式，因此不具誘導細胞凋亡的能力。相反地，資料指出它可保護細胞免於 TRAIL 介導的凋亡，呈現與促進細胞死亡不同的作用結果。
TNFRSF10D 對 NF-kappa-B 路徑的影響尚有互相矛盾的報告。一項研究報告指出此受體不能誘導該路徑，另一項研究則報告可以；現有資料因此無法將其對 NF-kappa-B 的作用定論為單一方向。這項差異應保留為研究報告不一致，而不宜視為已確立的促進或抑制效果。
Promoter 與基因調控
>TNFRSF10D ENST00000312584 GRCh38 chr8:23163927-23165027 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTATCCTCTTCTATCTACCATGTGAGGGGTCAGGAGCCGACTCATCCCAAGGGTCTAGGAGTCCTGCCAT TGACCTTACTGCTTAGGGTCACAAGCTGGCACCCTTCAAAACCACACATTGGGTCTGCCCTCACAGCGGC AGTGTGTTCAACTGGATGGGGAGGTAAGTAGCCCAAGGTCAGACAGTTGGACCTGGGTAGACAATAGACT TGGGGACAGACTTTGGAAGGCACTCCCCTGATTCCCCTGTCTCCATGGGGCCTCAATACTAGAGCCCTCA AGGTTGGTCAGGGAGTGTTTGTGCTTTGACCATGCAAAGGGTGCCAGGTTGTGGCTAGGGATGCCCCCGG CGTTCCTCTCCCTCCTACCTACTCCTCAGCCTCTGCAGGTGCCTGTCATGGCCTCTGTGTCCTTCATTCT GTCCACTCATGTGTTCACTGGGCCCCTCCTTGGTGCCAGGCACCCGCTACTGAGGGATACCAAGCCCCTG CCAGAGAAGCTTGGAGCTGGGTCACAGCAGCAAGGAGGCTGGAGACATCAGTGGCATCAGTGCACTGGTC AGTGAGGCCGCTGTGGGAGGAGGGAGTGGGAGCAGAAGCTAAGAGTGGACTGAAGTCCTGAGGCCAGGAA GTAGTTCAGGGTTTAAGAAGAGGAGAGACAGGCGGCCCGGGGAGGGAGCAGGCTCAGGATGGGCCTCCAG TGCCTCCTCTGGAGCTCACTACCCAGACTACAGCAGCGCAGCGGGCAGCGCCTCAGCTCCTTCCCCTTCT GCTGCCTACAGCCTGGACAGGACCCGGAATCAAACCGCAGGCCCTGGGTCACCGCTGCCGGAAAGAGCCA GTTCCTGTCCGTCCATGCACCCACCCACACAACCTGGGCCCTCCTGGAGGTGCTGGGGGAGACCCAGCCT GAGTGCCTGGAAGTGACTGCGGGAAGGGAGTACAACTGACCACGCCTTTTTTCCGGGGTATAAAAGCGGA GGAGCACGTTCTATTCTGGCAGTGTAGCTGCGAGAACCTTTGCACGCGCACAAACTACGGGGACGATTTC TGATTGATTTTTGGCGCTTTCGATCCACCCTCCTCCCTTCTCATGGGACTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFRSF10D_1 ↗ | 8:23,164,027 | 負股 | 23,164,017–23,164,076 |
| TNFRSF10D_2 ↗ | 8:23,164,325 | 負股 | 23,164,315–23,164,374 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_9C77G · enhancer · 23160072–23160389 · regulatory
ENSR8_57G4JM · CTCF_binding_site · 23162028–23162049 · regulatory
ENSR8_57G4RQ · CTCF_binding_site · 23163559–23163580 · regulatory
ENSR8_9C78L · promoter · 23164017–23164517 · regulatory
· motif · 23160264–23160275 · motif
· motif · 23161070–23161083 · motif
· motif · 23161769–23161781 · motif
· motif · 23161780–23161792 · motif
· motif · 23162030–23162046 · motif
· motif · 23162395–23162404 · motif
· motif · 23162407–23162420 · motif
· motif · 23162522–23162535 · motif
· motif · 23162522–23162535 · motif
· motif · 23162524–23162533 · motif
· motif · 23163321–23163336 · motif
· motif · 23163326–23163338 · motif
· motif · 23163329–23163336 · motif
· motif · 23163561–23163577 · motif
· motif · 23163741–23163750 · motif
· motif · 23163928–23163941 · motif
· motif · 23163928–23163941 · motif
· motif · 23164211–23164226 · motif
· motif · 23164218–23164226 · motif
· motif · 23164383–23164396 · motif
· motif · 23165850–23165857 · motif
· motif · 23165887–23165900 · motif
· motif · 23165892–23165904 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：386 aa
TNF receptor superfamily member 10d 長 386 個胺基酸。其 N 端有訊號序列，細胞外區含三個 TNFR-Cys 重複序列；其後為螺旋型穿膜區，C 端位於細胞質。細胞質區的 death domain 為截短形式。另有兩段區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNF receptor superfamily member 10d 是單次穿膜的第一型膜蛋白，具有細胞外區與細胞質區。 來源未提供定位變動條件或不同異構型的定位差異。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- APOL3O95236-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARFIP1P53367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIAO2AQ9H5X1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MIEF1Q9NQG6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTERF4Q7Z6M4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PCYT1AP49585 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- PLPP6Q8IY26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POLLQ9UGP5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBP1P09455 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RMDN2Q96LZ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEMA4GQ9NTN9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SENP2Q9HC62 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC39A7Q92504 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUCLA2Q9P2R7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TARS2Q9BW92 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBRG4Q969Z0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- THAP4Q8WY91 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFSF10P50591 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFRSF10D 是細胞毒性配體 TRAIL 的受體。其 death domain 為截短形式，因此不能誘導細胞凋亡，但可保護細胞免於 TRAIL 介導的凋亡。至於是否能誘導 NF-kappa-B 路徑，研究報告彼此矛盾：有報告指出不能誘導，也有報告指出可以。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for the cytotoxic ligand TRAIL. Contains a truncated death domain and hence is not capable of inducing apoptosis but protects against TRAIL-mediated apoptosis. Reports are contradictory with regards to its ability to induce the NF-kappa-B pathway. According to, it cannot but according to, it can induce the NF-kappa-B pathway PMID 9382840 ↗ · PMID 9430226 ↗ · PMID 9537512 ↗ |
| 細胞定位 | TNF receptor superfamily member 10d 位於膜上，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTGTAGCTGCGAGAACCTTTGCACGCGCACAAACTACGG40GGACGATTTCTGATTGATTTTTGGCGCTTTCGATCCACCC80TCCTCCCTTCTCATGGGACTTTGGGGACAAAGCGTCCCGA120CCGCCTCGAGCGCTCGAGCAGGGCGCTATCCAGGAGCCAG160GACAGCGTCGGGAACCAGACCATGGCTCCTGGACCCCAAG200ATCCTTAAGTTCGTCGTCTTCATCGTCGCGGTTCTGCTGC240CGGTCCGGGTTGACTCTGCCACCATCCCCCGGCAGGACGA280AGTTCCCCAGCAGACAGTGGCCCCACAGCAACAGAGGCGC320AGCCTCAAGGAGGAGGAGTGTCCAGCAGGATCTCATAGAT360CAGAATATACTGGAGCCTGTAACCCGTGCACAGAGGGTGT400GGATTACACCATTGCTTCCAACAATTTGCCTTCTTGCCTG440CTATGTACAGTTTGTAAATCAGGTCAAACAAATAAAAGTT480CCTGTACCACGACCAGAGACACCGTGTGTCAGTGTGAAAA520AGGAAGCTTCCAGGATAAAAACTCCCCTGAGATGTGCCGG560ACGTGTAGAACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCA600GTAATTGTACGCCCCGGAGTGACATCAAGTGCAAAAATGA640ATCAGCTGCCAGTTCCACTGGGAAAACCCCAGCAGCGGAG680GAGACAGTGACCACCATCCTGGGGATGCTTGCCTCTCCCT720ATCACTACCTTATCATCATAGTGGTTTTAGTCATCATTTT760AGCTGTGGTTGTGGTTGGCTTTTCATGTCGGAAGAAATTC800ATTTCTTACCTCAAAGGCATCTGCTCAGGTGGTGGAGGAG840GTCCCGAACGTGTGCACAGAGTCCTTTTCCGGCGGCGTTC880ATGTCCTTCACGAGTTCCTGGGGCGGAGGACAATGCCCGC920AACGAGACCCTGAGTAACAGATACTTGCAGCCCACCCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。