演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNFRSF10CDcR1

TNF receptor superfamily member 10c

TNFRSF10C 編碼 TNF receptor superfamily member 10c,是可結合細胞毒性配體 TRAIL 的受體。它缺少啟動細胞凋亡所需的胞內死亡結構域,因此可作為誘餌受體,降低 TRAIL 誘發的細胞凋亡。

Homo sapiens8p21.3UniProt O14798
OFFICIAL SYMBOL
TNFRSF10C
CHROMOSOME
8
UNIPROT
O14798
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNFRSF10C 是蛋白質編碼基因,其產物 TNF receptor superfamily member 10c 屬於 TNF receptor superfamily。這是一種可結合 TRAIL 的受體,但不具備啟動細胞凋亡所需的胞內死亡結構域。它能與功能性 TRAIL 受體 TNFRSF10A、TNFRSF10B 競爭配體,因而具有誘餌受體的作用。

Official symbol
TNFRSF10C
Gene name
TNF receptor superfamily member 10c
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11906
UniProt
O14798
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DcR1TRAILR3LITTRIDCD263

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p21.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegTNFRSF10Cpq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:23,102,921–23,122,014
Gene span
19,094 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000356864 ★23,102,921–23,117,4455
ENST0000087763623,102,921–23,118,7726
ENST0000112230023,102,921–23,122,0146

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNF receptor superfamily member 10c 可作為 TRAIL 的受體。TRAIL 是細胞毒性配體;此受體能與其結合,但本身不含啟動細胞凋亡所需的胞內死亡結構域。因此,它與能傳遞凋亡訊號的功能性 TRAIL 受體不同,不能藉由自身的胞內死亡結構域啟動該過程。

其主要功能來自對 TRAIL 的競爭性結合。TNF receptor superfamily member 10c 與功能性受體 TNFRSF10A、TNFRSF10B 競爭同一配體;當 TRAIL 與此誘餌受體結合時,可減少配體與功能性受體結合的機會。這種競爭使它能調節 TRAIL 對細胞的作用,而非直接傳遞促凋亡訊號。

由於缺少胞內死亡結構域,TNF receptor superfamily member 10c 對細胞的影響表現為抑制而非啟動 TRAIL 誘發的細胞凋亡。來源將其描述為保護細胞免於 TRAIL 誘發凋亡的誘餌受體;此保護作用與它競爭配體、牽制 TRAIL 的可用性相關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23102921 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNFRSF10C ENST00000356864 GRCh38 chr8:23101921-23103021 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCTTTTATCCACCATGTGAGAGGTCAGGAGCCGACTCACCCCAAGGGTCTAGGAGTTGTGCCATTGACC
TTACTGCCTAGGGTCACAGGCTGGCACCCTTCAGTACCACACATTGGATCTCTCCACACAGCAGCAGTGT
GCTTAACTCAATGGGGAGGTGAGTAGCCCAAGGTCAGATAGTTGGACCTGGATAGACACTTGACTGGGGG
ACAGGCTTTGGAAGCCACTCCCCTGGGCCTCCTCTGTCCATGGGGCCTCAATACTAGAGCCCACAAGGTC
GGCCAGAGAGTGTCTGTGCCTCGACCATGCAAAGGGTGCCAGGTTGTGGCTAGGGATGCCCCCGGGGTTC
CTCTCCCTCCTACCTACTCCTCAGCCTCTGCATGTGCCCGTCATGGCCCCTGTGTCCTTCATTCTGTCCA
CTCATGTGTTCACTGGGCCCCTCCTTGGTGCCAGGCACCCGCTACTGAGGGATACCAAGCCCCTGCCAGA
GAAGCTTGGAGCTGGGTCACAGCAGCAAGGAGGCTGGAGACATCAGTGGCATCAGTGCACTGGTCAGTGA
GGCCGCTGTGGGAGGAGGGAGTGGGAGCAGAAGCTAAGAGTGGACTGAAGTCCTTAGGCCAGGAGGTAGT
TCAGGGTTTAAGAAGAGGAGAGACAGGCGTCCCGGGGAGGGAGCAGGCTCAGGATGGGCCTCCAGTGCCT
CCTCTGGAGCTCACTACCCAGACTACAGCAGCGCAGTGGGCAGCGCCTCAGCTCCTTCCCCTTCTGCTGC
CTACAGCCTGGACAGGACCCGGAATCAAACCGCAGGCCCTGGGTCACCGCTGCCGGAAAGAGCCAGTTCC
TGTCCGTCCATGCACCCACCACCAAAACCCAGGCCTTCCTGGAGGTGCTAGGGGAGGCCATGCCCCTTTT
CTGAGTGCTTGGAAGTGACTGCTGCAAGTGACAAGTGACCACGCCTTTTCCCCCGCGGGTATAAATTCAG
AGGCGCTGCGCTCCGATTCTGGCAGTGCAGCTGTGGGAACCTCTCCACGCGCACGAACTCAGCCAACGAT
TTCTGATAGATTTTTGGGAGTTTGACCAGAGATGCAAGGGGTGAAGGAGCG
TNFRSF10C 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNFRSF10C_4 ↗8:23,102,618正股23,102,569–23,102,628
TNFRSF10C_1 ↗8:23,102,921正股23,102,872–23,102,931
TNFRSF10C_3 ↗8:23,103,150正股23,103,101–23,103,160

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_9C6KR · promoter · 23102431–23102931 · regulatory

ENSR8_B6KRH · enhancer · 23102932–23103879 · regulatory

ENSR8_57FPGF · CTCF_binding_site · 23103224–23103245 · regulatory

ENSR8_8NC7L · enhancer · 23104350–23104535 · regulatory

ENSR8_8NC86 · enhancer · 23105289–23105506 · regulatory

ENSR8_B6KRT · enhancer · 23105772–23106290 · regulatory

· motif · 23102717–23102725 · motif

· motif · 23102717–23102732 · motif

· motif · 23103217–23103226 · motif

· motif · 23103226–23103242 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:259 aa

1 aa259 aa功能區域重複區訊號胜肽
依 O14798 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNF receptor superfamily member 10c 長 259 個胺基酸,具有位於第 1–25 位的訊號序列。胞外區域包含兩段 TNFR-Cys 重複序列(第 68–109 位及第 110–149 位),以及五段 TAPE 重複序列(第 162–236 位)。註解亦標示第 30–56 位及第 160–224 位為無序區域。

訊號胜肽1–25 aa
重複區TNFR-Cys 168–109 aa
重複區TNFR-Cys 2110–149 aa
重複區TAPE 1162–176 aa
重複區TAPE 2177–191 aa
重複區TAPE 3192–206 aa
重複區TAPE 4207–221 aa
重複區TAPE 5222–236 aa
功能區域Disordered30–56 aa
功能區域Disordered160–224 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14798…

AlphaFold · O14798

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

TNF receptor superfamily member 10c 定位於細胞膜,並以脂質錨定或 GPI 錨定方式連接。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 24 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DcR1TNFRSF10CAQP6ARL13BASZ1CD79ACOQ9CREB3L1CYB5R3DNAJC1ERGIC3FAM209AGPR152GPR37L1KCNJ6KCNK5MGST1MRPS18BPDZK1IP1SGTASLC30A4STOMSYAP1TMEM45BTMEM80TNFSF10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNF receptor superfamily member 10c 可結合細胞毒性配體 TRAIL,但缺少啟動細胞凋亡所需的胞內死亡結構域。它會與功能性 TRAIL 受體 TNFRSF10A、TNFRSF10B 競爭配體,因此作為誘餌受體,保護細胞免於 TRAIL 誘發的細胞凋亡。含實驗來源
證據與來源

Acts as a receptor for the cytotoxic ligand TRAIL but does not contain the intracellular death domain required to initiate apoptosis. By competing with the functional TRAIL receptors TNFRSF10A and TNFRSF10B for ligand binding, it functions as a decoy receptor that protects cells from TRAIL-induced apoptosis

PMID 9242610 ↗ · PMID 9242611 ↗ · PMID 9314565 ↗ · PMID 9325248 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNF receptor superfamily member 10c 定位於細胞膜,並可透過脂質錨定或 GPI 錨定連接。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor

PMID 9314565 ↗ · PMID 9242611 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000356864 · 1,395 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCAGTGCAGCTGTGGGAACCTCTCCACGCGCACGAACTC40
41AGCCAACGATTTCTGATAGATTTTTGGGAGTTTGACCAGA80
81GATGCAAGGGGTGAAGGAGCGCTTCCTACCGTTAGGGAAC120
121TCTGGGGACAGAGCGCCCCGGCCGCCTGATGGCCGAGGCA160
161GGGTGCGACCCAGGACCCAGGACGGCGTCGGGAACCATAC200
201CATGGCCCGGATCCCCAAGACCCTAAAGTTCGTCGTCGTC240
241ATCGTCGCGGTCCTGCTGCCAGTCCTAGCTTACTCTGCCA280
281CCACTGCCCGGCAGGAGGAAGTTCCCCAGCAGACAGTGGC320
321CCCACAGCAACAGAGGCACAGCTTCAAGGGGGAGGAGTGT360
361CCAGCAGGATCTCATAGATCAGAACATACTGGAGCCTGTA400
401ACCCGTGCACAGAGGGTGTGGATTACACCAACGCTTCCAA440
441CAATGAACCTTCTTGCTTCCCATGTACAGTTTGTAAATCA480
481GATCAAAAACATAAAAGTTCCTGCACCATGACCAGAGACA520
521CAGTGTGTCAGTGTAAAGAAGGCACCTTCCGGAATGAAAA560
561CTCCCCAGAGATGTGCCGGAAGTGTAGCAGGTGCCCTAGT600
601GGGGAAGTCCAAGTCAGTAATTGTACGTCCTGGGATGATA640
641TCCAGTGTGTTGAAGAATTTGGTGCCAATGCCACTGTGGA680
681AACCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCCCGGGG720
721ACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCC760
761CGGGGACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGACCAC800
801CAGCCCGGGGACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATG840
841ACCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGA880
881CAATGATCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCTCTTCTCATTA920
921CCTCTCATGCACCATCGTAGGGATCATAGTTCTAATTGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。