基因總覽
TNFRSF10B 是蛋白質編碼基因，其產物為 TNF receptor superfamily member 10b，屬於腫瘤壞死因子受體超家族。此蛋白是單次穿膜的第一型膜蛋白：胞外區位於膜外，跨膜區將蛋白固定於膜上，胞質區則延伸至細胞內。胞外部分含有多個 TNFR-Cys 重複序列及 TAPE 區域；胞質部分具有 Death domain。這些區域構成其受體的基本結構，使其能在細胞表面接收外部訊號，並將訊號連結至細胞內反應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000276431 ★ | 23,020,133–23,069,031 | 9 |
| ENST00000347739 | 23,020,133–23,069,121 | 10 |
| ENST00000867256 | 23,020,133–23,069,121 | 8 |
| ENST00000867257 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00000867258 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00000931215 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00000931216 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00000945966 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00001136788 | 23,020,133–23,069,121 | 9 |
| ENST00001113532 | 23,023,678–23,069,121 | 8 |
| ENST00001113533 | 23,023,680–23,069,121 | 9 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFRSF10B 的產物可作為細胞毒性配體 TNFSF10/TRAIL 的受體。配體與受體作用後，受體被活化，並組成促進細胞凋亡的訊號平台。此受體因此將細胞外的配體訊號傳入細胞內，啟動後續的凋亡相關反應。
在受體活化後，接合蛋白 FADD 會將 caspase-8 招募至受體。由受體、FADD 與相關分子形成的 death-inducing signaling complex（DISC），促使 caspase-8 經蛋白水解活化。活化的 caspase-8 接著引發後續 caspase 的連鎖反應；這些 caspase 是天冬胺酸專一性的半胱胺酸蛋白酶，能介導細胞凋亡。
除凋亡訊號外，TNFRSF10B 也能促進 NF-kappa-B 活化，顯示其訊號作用不只涉及細胞死亡。來源亦指出，TNFRSF10B 對內質網壓力誘發的細胞凋亡至關重要；這項功能描述的是其在該壓力條件下的必要性，並未進一步提供相關分子步驟。整體來說，來源支持 TNFRSF10B 參與配體誘發的凋亡訊號、NF-kappa-B 活化，以及內質網壓力相關凋亡。
Promoter 與基因調控
>TNFRSF10B ENST00000276431 GRCh38 chr8:23068931-23070031 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACACGCCGCCTTTAAGAACTGTAACACTCACCGCGAGGGTCCGAGGCTTCATTCTTGAAGGCAGTGAGAC CAAGAACCCACCAATTCCGGACACAGTACCATGAAGGAATGAAAATACATAACAATGTGATGTATCATGT TTTATTTCCTAGACTAGTGACAAATGAAAGCTAAGTGTAGCAAGGGTGCAGGGACACAGGCACATTTGTG GACTAGGTGTGAGTGTAAGCTGGGTTCGATGGTCTTTTGGCCAACATAGTGAACCCCTGTGTCTACTAAA AATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGTAGTCCCAGCTACATGGGAGGCTGAGGTGGGAG TATCGCTTGAACCTGGGAGACGGAAGTTGCAGTGAGCCGGGATCACACCACCGCTCACCAATCTGAGCCA CAGAGAGACTGTCTCAAAAAATAAACCACAAGGAAGGGAGGTAGGGGGAGGGGGAGGGAGGGAGGAAAGA GAAAGAGAGAAAGGAAGGAAAGAGAAAGCAGGAAGGACGGAAAGAAGACGAAAGAACGAAAGAAAACGAA AGAAAAAAGGAAAGAAGAGAGAAGGAGAGAACAGAAGGGGCAGGTGCCCCTGGGAAGGGGAGAAGATCAA GACGCGCCTGGAAAGCGGACTCTGAACCTCAAGACCCTGTTCACAGCCAAGCGCGCGACCCCGGGAGGCG TCAACTCCCCAAGTGCCTCCCTCAACTCATTTCCCCCAAGTTTCGGTGCCTGTCCTGGCGCGGACAGGAC CCAGAAACAAACCACAGCCCGGGGCGCAGCCGCCAGGGCGAAGGTTAGTTCCGGTCCCTTCCCCTCCCCT CCCCACTTGGACGCGCTTGCGGAGGATTGCGTTGACGAGACTCTTATTTATTGTCACCAACCTGTGGTGG AATTTGCAGTTGCACATTGGATCTGATTCGCCCCGCCCCGAATGACGCCTGCCCGGAGGCAGTGAAAGTA CAGCCGCGCCGCCCCAAGTCAGCCTGGACACATAAATCAGCACGCGGCCGGAGAACCCCGCAATCTCTGC GCCCACAAAATACACCGACGATGCCCGATCTACTTTAAGGGCTGAAACCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFRSF10B_1 ↗ | 8:23,069,031 | 負股 | 23,069,021–23,069,080 |
| TNFRSF10B_2 ↗ | 8:23,069,549 | 負股 | 23,069,539–23,069,598 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_C49RG · enhancer · 23064422–23065542 · regulatory
ENSR8_9C67Q · promoter · 23067739–23068239 · regulatory
ENSR8_57FHFD · CTCF_binding_site · 23068007–23068028 · regulatory
ENSR8_9C685 · promoter · 23069011–23069521 · regulatory
ENSR8_B6KLP · enhancer · 23070100–23070677 · regulatory
ENSR8_B6KM3 · enhancer · 23072506–23073029 · regulatory
· motif · 23064545–23064557 · motif
· motif · 23064547–23064554 · motif
· motif · 23064547–23064560 · motif
· motif · 23064712–23064723 · motif
· motif · 23064823–23064835 · motif
· motif · 23066631–23066646 · motif
· motif · 23067558–23067571 · motif
· motif · 23067558–23067571 · motif
· motif · 23067574–23067591 · motif
· motif · 23067583–23067591 · motif
· motif · 23067985–23067998 · motif
· motif · 23068009–23068025 · motif
· motif · 23068244–23068261 · motif
· motif · 23068409–23068423 · motif
· motif · 23068436–23068451 · motif
· motif · 23068499–23068509 · motif
· motif · 23068659–23068669 · motif
· motif · 23068661–23068671 · motif
· motif · 23069067–23069078 · motif
· motif · 23069082–23069092 · motif
· motif · 23069169–23069180 · motif
· motif · 23069169–23069180 · motif
· motif · 23069192–23069202 · motif
· motif · 23069207–23069216 · motif
· motif · 23069215–23069228 · motif
· motif · 23069238–23069253 · motif
· motif · 23069245–23069253 · motif
· motif · 23069284–23069294 · motif
· motif · 23069373–23069387 · motif
· motif · 23069373–23069388 · motif
· motif · 23069373–23069388 · motif
· motif · 23069415–23069428 · motif
· motif · 23069505–23069516 · motif
· motif · 23069581–23069589 · motif
· motif · 23069654–23069665 · motif
· motif · 23069654–23069665 · motif
· motif · 23069806–23069818 · motif
· motif · 23072865–23072877 · motif
· motif · 23072867–23072874 · motif
· motif · 23072902–23072917 · motif
· motif · 23072902–23072917 · motif
· motif · 23073034–23073049 · motif
TNFRSF10B 的調控與內質網壓力相關，並受 p53/TP53 調節；來源未進一步說明調控方向或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：440 aa
TNFRSF10B 蛋白長 440 個胺基酸，含 1–55 位的訊號序列。胞外區為 56–210 位，包含 TNFR-Cys 1、TNFR-Cys 2、TNFR-Cys 3 三段重複序列，以及 TAPE 區域；211–231 位為螺旋型跨膜區，232–440 位為胞質區。胞質區的 339–422 位具有 Death domain。另有兩段被註記為無序區：1–32 位及 60–84 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFRSF10B 是膜上的單次穿膜第一型膜蛋白。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- ASPHQ12797-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MUC1P15941-11 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFSF10P50591 · UniProt INTERACTION · 22 experiments
- ZDHHC15Q96MV8 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TNFRSF10B 可單體存在；TNFSF10 同源三聚體可與三個 TNFRSF10B 分子作用。它也能與 TRADD、RIPK1 互作。未受刺激時，TNFRSF10B 可與 BIRC2、DDX3X 及 GSK3B 互作；受體受刺激後，與 BIRC2 和 DDX3X 的互作進一步增強，並伴隨兩者被切割。HCMV 蛋白 UL141 可與兩個 TNFRSF10B 單體形成互作，並阻止 TNFRSF10B 表現在細胞表面。
疾病與遺傳關聯
來源列出 TNFRSF10B 與頭頸部鱗狀細胞癌（HNSCC）的疾病關聯，並指出影響該基因的變異可能造成此疾病。此處描述的是可能的變異關聯，未提供特定變異或直接因果證據。來源所附疾病說明亦提及皮膚鱗狀細胞癌的特徵為正常表皮角質形成細胞發生惡性轉化。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFRSF10B 是細胞毒性配體 TNFSF10/TRAIL 的受體。受體活化後，FADD 將 caspase-8 招募至受體；形成的 DISC 促進 caspase-8 蛋白水解活化，進而啟動後續 caspase 連鎖反應並介導細胞凋亡。此外，TNFRSF10B 可促進 NF-kappa-B 活化，且對內質網壓力誘發的細胞凋亡至關重要。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for the cytotoxic ligand TNFSF10/TRAIL. The adapter molecule FADD recruits caspase-8 to the activated receptor. The resulting death-inducing signaling complex (DISC) performs caspase-8 proteolytic activation which initiates the subsequent cascade of caspases (aspartate-specific cysteine proteases) mediating apoptosis. Promotes the activation of NF-kappa-B. Essential for ER stress-induced apoptosis PMID 10542098 ↗ · PMID 10549288 ↗ · PMID 15322075 ↗ |
| 交互作用 | TNFRSF10B 可單體存在，並與 TRADD、RIPK1 及 HCMV 蛋白 UL141 互作；UL141 互作會阻止受體表現在細胞表面，且一個 UL141 同源二聚體可與兩個受體單體互作。TNFSF10 同源三聚體可與三個 TNFRSF10B 分子互作。未受刺激時，受體與 BIRC2、DDX3X、GSK3B 互作；受體受刺激後，與 BIRC2、DDX3X 的互作增強，並伴隨兩者切割。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Can interact with TRADD and RIPK1. Interacts with HCMV protein UL141; this interaction prevents TNFRSF10B cell surface expression. Two TNFRSF10B monomers interact with a UL141 homodimer. Three TNFRSF10B molecules interact with TNFSF10 homotrimer. In the absence of stimulation, interacts with BIRC2, DDX3X and GSK3B. The interaction with BIRC2 and DDX3X is further enhanced upon receptor stimulation and accompanied by DDX3X and BIRC2 cleavage PMID 10549288 ↗ · PMID 18846110 ↗ · PMID 23498957 ↗ · PMID 23555243 ↗ |
| 細胞定位 | TNFRSF10B 位於膜上，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | TNFRSF10B 的調控與內質網壓力有關，並受 p53/TP53 調節；資料未提供調控方向或具體方式。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 來源列出 TNFRSF10B 與頭頸部鱗狀細胞癌（HNSCC）的關聯，並指出影響該基因的變異可能造成此疾病。附帶說明將皮膚鱗狀細胞癌描述為非黑色素瘤皮膚癌，並指出其特徵為正常表皮角質形成細胞發生惡性轉化；資料未列出特定變異或因果證據。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Squamous cell carcinoma of the head and neck HNSCC A non-melanoma skin cancer affecting the head and neck. The hallmark of cutaneous SCC is malignant transformation of normal epidermal keratinocytes. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 275355 |
核酸與蛋白質序列
AGCCTGGACACATAAATCAGCACGCGGCCGGAGAACCCCG40CAATCTCTGCGCCCACAAAATACACCGACGATGCCCGATC80TACTTTAAGGGCTGAAACCCACGGGCCTGAGAGACTATAA120GAGCGTTCCCTACCGCCATGGAACAACGGGGACAGAACGC160CCCGGCCGCTTCGGGGGCCCGGAAAAGGCACGGCCCAGGA200CCCAGGGAGGCGCGGGGAGCCAGGCCTGGGCCCCGGGTCC240CCAAGACCCTTGTGCTCGTTGTCGCCGCGGTCCTGCTGTT280GGTCTCAGCTGAGTCTGCTCTGATCACCCAACAAGACCTA320GCTCCCCAGCAGAGAGCGGCCCCACAACAAAAGAGGTCCA360GCCCCTCAGAGGGATTGTGTCCACCTGGACACCATATCTC400AGAAGACGGTAGAGATTGCATCTCCTGCAAATATGGACAG440GACTATAGCACTCACTGGAATGACCTCCTTTTCTGCTTGC480GCTGCACCAGGTGTGATTCAGGTGAAGTGGAGCTAAGTCC520CTGCACCACGACCAGAAACACAGTGTGTCAGTGCGAAGAA560GGCACCTTCCGGGAAGAAGATTCTCCTGAGATGTGCCGGA600AGTGCCGCACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCGG640TGATTGTACACCCTGGAGTGACATCGAATGTGTCCACAAA680GAATCAGGTACAAAGCACAGTGGGGAAGTCCCAGCTGTGG720AGGAGACGGTGACCTCCAGCCCAGGGACTCCTGCCTCTCC760CTGTTCTCTCTCAGGCATCATCATAGGAGTCACAGTTGCA800GCCGTAGTCTTGATTGTGGCTGTGTTTGTTTGCAAGTCTT840TACTGTGGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGAAAGGCATCTG880CTCAGGTGGTGGTGGGGACCCTGAGCGTGTGGACAGAAGC920TCACAACGACCTGGGGCTGAGGACAATGTCCTCAATGAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。