演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TNFRSF10ADR4

TNF receptor superfamily member 10a

TNFRSF10A(TNF receptor superfamily member 10a)是細胞表面受體,可辨識細胞毒性配體 TNFSF10/TRAIL,並參與啟動細胞凋亡訊號。

Homo sapiens8p21.3UniProt O00220
OFFICIAL SYMBOL
TNFRSF10A
CHROMOSOME
8
UNIPROT
O00220
PDB / ALPHAFOLD
5CIR
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TNFRSF10A(TNF receptor superfamily member 10a)是由蛋白質編碼基因 TNFRSF10A 產生的單次跨膜型 I 膜蛋白,屬於 TNF receptor superfamily。其胞外區含有三段 TNFR-Cys 重複序列,跨膜區為螺旋結構;胞質區則包含 Death domain。這些區域構成其受體架構,使蛋白質能接收細胞外配體訊號,並將訊息連結至細胞內反應。

Official symbol
TNFRSF10A
Gene name
TNF receptor superfamily member 10a
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11904
UniProt
O00220
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DR4Apo2TRAILR-1CD261TRAILR1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p21.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegTNFRSF10Apq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:23,183,123–23,225,145
Gene span
42,023 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000221132 ★23,190,452–23,225,10210
ENST0000111417823,183,123–23,225,12810
ENST0000113326423,190,452–23,225,12810
ENST0000090150323,191,020–23,225,1289
ENST0000061347223,191,649–23,225,0619
ENST0000052415823,199,886–23,224,6007

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TNFRSF10A 是細胞毒性配體 TNFSF10/TRAIL 的受體。配體與受體作用後,活化的受體可促使接頭分子 FADD 招募 caspase-8,形成 death-inducing signaling complex(DISC)。在此複合體中,caspase-8 受到蛋白水解活化,進而啟動後續 caspase 級聯反應;這些 caspase 是天冬胺酸特異性半胱胺酸蛋白酶,所引發的反應可介導細胞凋亡。

除了連結細胞凋亡路徑,TNFRSF10A 也促進 NF-kappa-B 活化。來源未進一步說明這項作用與細胞凋亡訊號之間的調節關係,因此可確認的功能範圍是其參與兩類訊號結果:一方面透過 FADD、caspase-8 與下游 caspase 啟動凋亡級聯,另一方面促進 NF-kappa-B 活化。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23225102 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TNFRSF10A ENST00000221132 GRCh38 chr8:23225002-23226102 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCCTGGGAGTTCTTCGCAGGCAGGACCGTGACTCGCGTGGCTTTCGGGAGGCTGATTACCCACGCCCCA
TGCCCGTGCAGCGCTGGGTGCAGAGGAACCGCTGGAAGGACCTGTCCCCCGTGGGACCCCCACCAAGTCT
CATCCCGTGTCATGTGCCAGATAGTCTCCCGTGGTTTAAGGACTTTCAAGACTCTTAACAGGTTAGGAAA
ATCCAGAAGAAAGGCAGAATTGGGTCCCTCGGGCTTGCCTGACACCAGGGACGGTGGAGTTGAGGTGACA
TTTCACTGGCATGGAGACCTGAAACCAAAAGCAGGATGAGCCGGGCACGGTGGCTCACGCTTGTAATCCC
AGCACTTTGTAAGGCCGAAGCGGGCGGATCACGAGATCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAAAACAGTG
AAACCCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAAAAAATTAGCCGGACGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGT
TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTG
CCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTTGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGG
CTGAATCACTCGCCCGGTAGTGACGGAGGAGGCCGTAAAAGCCTCTTAGAGGCCAGACCCCGCAGTGGCC
TCTGTGTCCTTCATTCCGCCACCCATCCGTCCACCGAGCGCCTGCTGGGTGCCAGGAACTGGGTCACAGA
AAGGCTGAGGTCAACTCCCGACCGAGAAGCCTGGCGCTGGGACCAAGTGGCAAAACGACTCCGAATGCAG
CGGCATCCACGCGGCGGCCGTGGTTGAGGAACAGAAGCTGAGAGCGGCAAGGGCGGTCACAGAGGAAGGA
AGTTCAGGGTTAGCCAACAGGAGCCGCAGGTGCCCCGAAAAGGGGGCGGGGTCAGGGGTGCCCTGAACTC
CGAATGCGAAGTTCTGTCTTGTCATAGCCAAGCACGCTGCTTCTTGGATTGACCTGGCAGGATGGCGCCA
CCACCAGCTAGAGTACATCTAGGTGCGTTCCTGGCAGTGACTCCGAATCCC
TNFRSF10A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TNFRSF10A_1 ↗8:23,225,099負股23,225,089–23,225,148
TNFRSF10A_2 ↗8:23,225,390負股23,225,380–23,225,439

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_9C7W5 · promoter · 23224519–23225019 · regulatory

ENSR8_57GH9R · CTCF_binding_site · 23224694–23224715 · regulatory

ENSR8_8NFRG · promoter · 23225051–23225234 · regulatory

ENSR8_57GHCX · CTCF_binding_site · 23225163–23225184 · regulatory

ENSR8_C4B84 · enhancer · 23225235–23226292 · regulatory

· motif · 23220648–23220661 · motif

· motif · 23221250–23221258 · motif

· motif · 23224696–23224712 · motif

· motif · 23225135–23225147 · motif

· motif · 23225138–23225145 · motif

· motif · 23225165–23225181 · motif

· motif · 23225204–23225221 · motif

· motif · 23225237–23225254 · motif

· motif · 23225316–23225328 · motif

· motif · 23225319–23225326 · motif

· motif · 23225657–23225668 · motif

· motif · 23226327–23226338 · motif

· motif · 23226559–23226574 · motif

· motif · 23227693–23227704 · motif

· motif · 23228290–23228305 · motif

· motif · 23229907–23229920 · motif

· motif · 23229907–23229920 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:468 aa

1 aa468 aa結構域功能區域重複區訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 O00220 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TNFRSF10A 蛋白質長 468 個胺基酸。其 N 端含訊號序列,胞外區位於第 24–239 個胺基酸,包含 TNFR-Cys 1、TNFR-Cys 2 與 TNFR-Cys 3 三段重複序列;第 240–262 位為螺旋型跨膜區。胞質區延伸至 C 端,並含第 365–448 位的 Death domain。

訊號胜肽1–23 aa
拓樸區域Extracellular24–239 aa
跨膜區Helical240–262 aa
拓樸區域Cytoplasmic263–468 aa
重複區TNFR-Cys 1107–145 aa
重複區TNFR-Cys 2147–188 aa
重複區TNFR-Cys 3189–229 aa
結構域Death365–448 aa
功能區域Disordered17–82 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5CIR…

PDB · 5CIR

X-ray · 3.00 A · E/F/G=125-232

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Membrane raft;Cytoplasm, cytosol

TNFRSF10A 位於細胞膜,並可見於膜筏;也有細胞質、胞質溶膠中的定位註記。 棕櫚醯化是其與膜結合所必需的條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DR4TNFRSF10AARAP1CASP8LGALS3BPTNFSF10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TNFRSF10A 可呈單體,也可形成同寡聚體或與 TNFRSF10B 形成異寡聚體;三個 TNFRSF10A 分子可與 TNFSF10 同源三聚體互作。其互作對象還包括 TRADD、RIPK1、ARAP1、ZDHHC3、PTPN6,以及未受刺激時可互作的 BIRC2、DDX3X、GSK3B。受體刺激會增強其與 BIRC2、DDX3X 的互作,並伴隨兩者裂解。與 PTPN6 的互作可使其透過 LCK 抑制 T 細胞受體訊號。微生物感染時,HCMV 蛋白 UL141 與 TNFRSF10A 互作,並阻止其表面表現。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TNFRSF10A 是細胞毒性配體 TNFSF10/TRAIL 的受體。受體活化後,接頭分子 FADD 招募 caspase-8 至受體,形成 death-inducing signaling complex(DISC);DISC 促使 caspase-8 經蛋白水解活化,進一步啟動介導細胞凋亡的 caspase 級聯反應。此外,TNFRSF10A 也促進 NF-kappa-B 活化。含實驗來源
證據與來源

Receptor for the cytotoxic ligand TNFSF10/TRAIL. The adapter molecule FADD recruits caspase-8 to the activated receptor. The resulting death-inducing signaling complex (DISC) performs caspase-8 proteolytic activation which initiates the subsequent cascade of caspases (aspartate-specific cysteine proteases) mediating apoptosis. Promotes the activation of NF-kappa-B

PMID 19090789 ↗ · PMID 38532423 ↗ · PMID 9430227 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TNFRSF10A 可呈單體,亦可形成同寡聚體或與 TNFRSF10B 形成異寡聚體;三個 TNFRSF10A 分子可與 TNFSF10 同源三聚體互作。其互作對象包括 TRADD、RIPK1、ARAP1、ZDHHC3 與 PTPN6;未受刺激時也與 BIRC2、DDX3X、GSK3B 互作。受體受到刺激後,與 BIRC2、DDX3X 的互作進一步增強,並伴隨兩者裂解。與 PTPN6 的互作可透過 LCK 抑制 T 細胞受體訊號。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Homooligomers and heterooligomers with TNFRSF10B. Three TNFRSF10A molecules interact with the TNFSF10 homotrimer. Can interact with TRADD and RIPK1. Interacts with ARAP1. In the absence of stimulation, interacts with BIRC2, DDX3X and GSK3B. The interaction with BIRC2 and DDX3X is further enhanced upon receptor stimulation and accompanied by DDX3X and BIRC2 cleavage. Interacts with ZDHHC3. Interacts with PTPN6; this interaction enables the inhibition of T-cell receptor signaling via LCK

PMID 18165900 ↗ · PMID 18846110 ↗ · PMID 19090789 ↗ · PMID 22240897 ↗ · PMID 26457518 ↗ · PMID 38532423 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,TNFRSF10A 可與 HCMV 蛋白 UL141 互作;此互作會阻止 TNFRSF10A 在細胞表面表現。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with HCMV protein UL141; this interaction prevents TNFRSF10A cell surface expression

PMID 23498957 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TNFRSF10A 定位於細胞膜與膜筏,也有細胞質、胞質溶膠的定位註記。棕櫚醯化是其與膜結合所必需的條件。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft; Cytoplasm, cytosol; Palmitoylation is required for association with membranes

PMID 22240897 ↗ · PMID 19090789 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000221132 · 2,690 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTCATAGCCAAGCACGCTGCTTCTTGGATTGACCTGGCAG40
41GATGGCGCCACCACCAGCTAGAGTACATCTAGGTGCGTTC80
81CTGGCAGTGACTCCGAATCCCGGGAGCGCAGCGAGTGGGA120
121CAGAGGCAGCCGCGGCCACACCCAGCAAAGTGTGGGGCTC160
161TTCCGCGGGGAGGATTGAACCACGAGGCGGGGGCCGAGGA200
201GCGCTCCCTACCTCCATGGGACAGCACGGACCCAGTGCCC240
241GGGCCCGGGCAGGGCGCGCCCCAGGACCCAGGCCGGCGCG280
281GGAAGCCAGCCCTCGGCTCCGGGTCCACAAGACCTTCAAG320
321TTTGTCGTCGTCGGGGTCCTGCTGCAGGTCGTACCTAGCT360
361CAGCTGCAACCATCAAACTTCATGATCAATCAATTGGCAC400
401ACAGCAATGGGAACATAGCCCTTTGGGAGAGTTGTGTCCA440
441CCAGGATCTCATAGATCAGAACATCCTGGAGCCTGTAACC480
481GGTGCACAGAGGGTGTGGGTTACACCAATGCTTCCAACAA520
521TTTGTTTGCTTGCCTCCCATGTACAGCTTGTAAATCAGAT560
561GAAGAAGAGAGAAGTCCCTGCACCACGACCAGGAACACAG600
601CATGTCAGTGCAAACCAGGAACTTTCCGGAATGACAATTC640
641TGCTGAGATGTGCCGGAAGTGCAGCAGAGGGTGCCCCAGA680
681GGGATGGTCAAGGTCAAGGATTGTACGCCCTGGAGTGACA720
721TCGAGTGTGTCCACAAAGAATCAGGCAATGGACATAATAT760
761ATGGGTGATTTTGGTTGTGACTTTGGTTGTTCCGTTGCTG800
801TTGGTGGCTGTGCTGATTGTCTGTTGTTGCATCGGCTCAG840
841GTTGTGGAGGGGACCCCAAGTGCATGGACAGGGTGTGTTT880
881CTGGCGCTTGGGTCTCCTACGAGGGCCTGGGGCTGAGGAC920
921AATGCTCACAACGAGATTCTGAGCAACGCAGACTCGCTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。