基因總覽
TNFAIP6 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 TNF alpha induced protein 6。其產物為分泌型蛋白質，具有 Link 與 CUB 兩個結構域，能與多種細胞外分子互動。這些特性使它可參與細胞外基質的組織與重塑，並在不同生物學情境中調節基質分子及其相關訊號。來源所述功能涵蓋生殖、發炎反應與骨骼重塑等過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000243347 ★ | 151,357,592–151,380,046 | 6 |
| ENST00001114223 | 151,357,585–151,366,574 | 3 |
| ENST00001138323 | 151,357,585–151,380,931 | 6 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TNFAIP6 的主要角色是調節組織重塑期間的細胞外基質組織。它催化 inter-alpha-inhibitor（I-alpha-I）複合體中的 heavy chain（HC）轉移至 hyaluronan：先切開 HC C 端與該複合體 chondroitin sulfate 鏈上 GalNAc 殘基之間的酯鍵，再將 HC 轉酯至 hyaluronan。此過程也會釋出游離 bikunin，增強 I-alpha-I 複合體的抗蛋白酶功能。
在生殖過程中，TNFAIP6 催化 hyaluronan-HC 寡聚體形成，並促成包圍 cumulus cell-oocyte complex 的富含 hyaluronan 基質；此步驟是卵母細胞受精的必要條件。它也組裝細胞周圍的 hyaluronan 基質，這類基質可作為受體聚集與訊號傳遞的平台。
在免疫細胞移動方面，TNFAIP6 可促進巨噬細胞表面的 hyaluronan 與淋巴內皮 LYVE1 結合，協助巨噬細胞外滲；它也能改變血管內皮上 hyaluronan 與功能上處於潛伏狀態的 CD44 之結合，使 CD44 轉為活化狀態，支持白血球滾動。此外，它會調節趨化因子與細胞外基質成分及內皮表面 proteoglycans 的互動，可能因此避免趨化因子梯度形成。在負回饋機制中，它可能藉由拮抗 CXCL8 與血管內皮 glycosaminoglycans 的結合，限制發炎部位過度招募嗜中性球。
TNFAIP6 亦參與成骨作用與骨骼重塑。它會抑制 BMP2 依賴的間質幹細胞分化為成骨細胞，並在發炎期間抑制 TNFSF11/RANKL 依賴的破骨細胞活化，因而有助於防止骨侵蝕。
Promoter 與基因調控
>TNFAIP6 ENST00000243347 GRCh38 chr2:151356592-151357692 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGGGAAGCAATTTGAGACCAAAAGTAGAGAATCTAAGTAGCAAAAAATGACCAATTTTGTAAAAAAATC AAAAGTTGCCAATAAATGGCTATCAATGAACAATAGGAAATGCCATTAGCATCAGCGGTAGTGGGAGTAT TATCAGATATGTTACCCAAGGATTCTACACAAAGGAAGAGGAAAGTTTGGGATATTTGAAGACATGATGA CTTTACTGTAATAATTATTATCTATTACCTTGATCGTCTTCTTCAAAGTTAGAGTGGTCTAGGGAAGCTA GGGACAAGTTTTTATTAACTTTGTTAGTCTACCCACCTTTCTCCCAACACTTCAAGAATTTGTGGCCTGG GAAAACTGTGTTATAATAGGACATCCCAAAGCTGCTGGAACATCCTGACGCTCTGAAATTGAAATACTTT TCTGGGAGCTGATACATTTATTTAGCTGCTGACCATAACACACCAAAGACTGCAACAGACCCCACCCTGG AAGAAAAGCAGGCAGAGAATAAGGAAGTCATATATCACTGGAGAAAAATTAGGATTCTCCAAGCTGTGCA TACTTTTTGTTTTAAATTTTTTACACAGGCTTGACAATGTTTAGAAAAGCCAGTCCAACATTACCAATAA AAGATTAGTGTTTAACCCCATATCCCATAATTGACACTGCAAATAAGACATTTAGGATTTATCTTGAAAT TCCTACTGAAGTTCGATTTTCTTTTAATCACTGCTAAATCTGCATCAAGTTACACAAACTTTCTAACAGA AAAGTGTTTGTGACTAACAATAAATGAACTCCGTTCTTAGTAAGTTAATTTTAAAACATAGATGATCATT CTATCTCCTTAGTTTTGGTTGCCAATGCAAATGAGTCAGAGGATTTGCTTCAGACACTGAGATAATTGTG TAACTCTACAGCGGAAAATGCCATTGGAGAGTACTTGCTGACCTCACAGTTGAAAAAAACTATTTAAAAG ATGTGGAAACCAGATGTTTCAGTCACATTTCAGCCACTGCTCTGAGAATTTGTGAGCAGCCCCTAACAGG CTGTTACTTCACTACAACTGACGATATGATCATCTTAATTTACTTATTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TNFAIP6_1 ↗ | 2:151,357,592 | 正股 | 151,357,543–151,357,602 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_94843J · promoter · 151357178–151357602 · regulatory
ENSR2_86G65T · enhancer · 151358663–151358858 · regulatory
ENSR2_94844X · enhancer · 151362051–151362344 · regulatory
· motif · 151354774–151354787 · motif
· motif · 151354774–151354787 · motif
· motif · 151357496–151357505 · motif
發炎細胞激素 TNF 會使周邊血液單核細胞、高內皮微靜脈、氣道上皮與黏膜下腺中的 TNFAIP6 表現上升。相對地，間質幹細胞分化為成骨細胞時，TNFAIP6 表現會下降。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：277 aa
TNFAIP6 蛋白質長 277 個胺基酸。其 N 端第 1–17 位為訊號序列；第 36–129 位為 Link 結構域，第 135–247 位為 CUB 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TNFAIP6 的定位註解為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- BMP2P12643 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCL19Q99731 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL2P13500 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL7P80098 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL8P10145 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- FN1P02751 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- GDF5P43026 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GDF6Q6KF10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTX3P26022 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TNFSF11O14788 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TNFAIP6 與多種分子有直接互動，包括 I-alpha-I 的 bikunin、ITIH2/HC2、ITIH1、趨化因子、BMP2、TNFSF11 與 FN1；其中 ITIH2/HC2 的互動是 HC 轉酯至 hyaluronan 所必需。Chondroitin sulfate 可能有助於複合體穩定。TNFAIP6 與趨化因子的結合會干擾趨化因子結合 glycosaminoglycans；hyaluronan 則會抑制 TNFAIP6 與 BMP2 的互動。TNFAIP6 與 FN1 的結合可增強 fibronectin 原纖維組裝，且可能作為 FN1 與 THBS1 之間的橋接分子。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TNFAIP6 是組織重塑期間細胞外基質組織的重要調節因子，能將 I-alpha-I 複合體的 HC 轉移至 hyaluronan，並藉釋出游離 bikunin 增強其抗蛋白酶功能。它促成卵母細胞周圍基質形成、調節 hyaluronan 相關的免疫細胞移動與趨化因子作用，也可能限制嗜中性球過度招募；此外參與骨骼重塑，抑制 BMP2 依賴的成骨分化及 TNFSF11/RANKL 依賴的破骨細胞活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Major regulator of extracellular matrix organization during tissue remodeling. Catalyzes the transfer of a heavy chain (HC) from inter-alpha-inhibitor (I-alpha-I) complex to hyaluronan. Cleaves the ester bond between the C-terminus of the HC and GalNAc residue of the chondroitin sulfate chain in I-alpha-I complex followed by transesterification of the HC to hyaluronan. In the process, potentiates the antiprotease function of I-alpha-I complex through release of free bikunin. Acts as a catalyst in the formation of hyaluronan-HC oligomers and hyaluronan-rich matrix surrounding the cumulus cell-oocyte complex, a necessary step for oocyte fertilization. Assembles hyaluronan in pericellular matrices that serve as platforms for receptor clustering and signaling. Enables binding of hyaluronan deposited on the surface of macrophages to LYVE1 on lymphatic endothelium and facilitates macrophage extravasation. Alters hyaluronan binding to functionally latent CD44 on vascular endothelium, switching CD44 into an active state that supports leukocyte rolling. Modulates the interaction of chemokines with extracellular matrix components and proteoglycans on endothelial cell surface, likely preventing chemokine gradient formation. In a negative feedback mechanism, may limit excessive neutrophil recruitment at inflammatory sites by antagonizing the association of CXCL8 with glycosaminoglycans on vascular endothelium. Has a role in osteogenesis and bone remodeling. Inhibits BMP2-dependent differentiation of mesenchymal stem cell to osteoblasts. Protects against bone erosion during inflammation by inhibiting TNFSF11/RANKL-dependent osteoclast activation PMID 15060082 ↗ · PMID 15917224 ↗ · PMID 16771708 ↗ · PMID 16873769 ↗ · PMID 18042364 ↗ · PMID 18586671 ↗ · PMID 20463016 ↗ · PMID 24501198 ↗ · PMID 26468290 ↗ · PMID 26823460 ↗ · PMID 27044744 ↗ |
| 交互作用 | TNFAIP6 透過 Link 或 CUB 結構域與 bikunin、ITIH2/HC2、ITIH1、趨化因子、BMP2、TNFSF11 及 FN1 互動；ITIH2/HC2 對 HC 轉酯至 hyaluronan 為必要，chondroitin sulfate 可能維持複合體穩定。TNFAIP6 與趨化因子的結合會干擾其與 glycosaminoglycans 結合；hyaluronan 可抑制其與 BMP2 互動。與 FN1 結合能增強 fibronectin 原纖維組裝，且 TNFAIP6 可能橋接 FN1 與 THBS1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via Link domain) with inter-alpha-inhibitor (I-alpha-I) component bikunin. Interacts with ITIH2/HC2; this interaction is required for transesterification of the HC to hyaluronan. Interacts (via Link and CUB domains) with ITIH1. Chondroitin sulfate may be required for the stability of the complex. Interacts (via Link domain) with various C-X-C and C-C chemokines including PF4, CXCL8, CXCL11, CXCL12, CCL2, CCL7, CCL19, CCL21, and CCL27; this interaction interferes with chemokine binding to glycosaminoglycans. Interacts (primarily via Link domain) with BMP2; this interaction is inhibited by hyaluronan. Interacts (via both Link and CUB domains) with TNFSF11. Interacts (via CUB domain) with FN1 (via type III repeats 9-14); this interaction enhances fibronectin fibril assembly. TNFAIP6 may act as a bridging molecule between FN1 and THBS1 PMID 15917224 ↗ · PMID 16771708 ↗ · PMID 18042364 ↗ · PMID 18586671 ↗ · PMID 20463016 ↗ · PMID 24501198 ↗ · PMID 26468290 ↗ · PMID 27044744 ↗ · PMID 7516184 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | 發炎細胞激素 TNF 會使周邊血液單核細胞、高內皮微靜脈、氣道上皮與黏膜下腺中的 TNFAIP6 表現上升；間質幹細胞分化為成骨細胞時，TNFAIP6 表現則會下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated in peripheral blood mononuclear cells, high endothelial venules, airway epithelium and submucosal gland in response to inflammatory cytokine TNF. Down-regulated upon differentiation of mesenchymal stem cells to osteoblasts PMID 16771708 ↗ · PMID 16873769 ↗ · PMID 1730767 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCACATTTCAGCCACTGCTCTGAGAATTTGTGAGCAGC40CCCTAACAGGCTGTTACTTCACTACAACTGACGATATGAT80CATCTTAATTTACTTATTTCTCTTGCTATGGGAAGACACT120CAAGGATGGGGATTCAAGGATGGAATTTTTCATAACTCCA160TATGGCTTGAACGAGCAGCCGGTGTGTACCACAGAGAAGC200ACGGTCTGGCAAATACAAGCTCACCTACGCAGAAGCTAAG240GCGGTGTGTGAATTTGAAGGCGGCCATCTCGCAACTTACA280AGCAGCTAGAGGCAGCCAGAAAAATTGGATTTCATGTCTG320TGCTGCTGGATGGATGGCTAAGGGCAGAGTTGGATACCCC360ATTGTGAAGCCAGGGCCCAACTGTGGATTTGGAAAAACTG400GCATTATTGATTATGGAATCCGTCTCAATAGGAGTGAAAG440ATGGGATGCCTATTGCTACAACCCACACGCAAAGGAGTGT480GGTGGCGTCTTTACAGATCCAAAGCAAATTTTTAAATCTC520CAGGCTTCCCAAATGAGTACGAAGATAACCAAATCTGCTA560CTGGCACATTAGACTCAAGTATGGTCAGCGTATTCACCTG600AGTTTTTTAGATTTTGACCTTGAAGATGACCCAGGTTGCT640TGGCTGATTATGTTGAAATATATGACAGTTACGATGATGT680CCATGGCTTTGTGGGAAGATACTGTGGAGATGAGCTTCCA720GATGACATCATCAGTACAGGAAATGTCATGACCTTGAAGT760TTCTAAGTGATGCTTCAGTGACAGCTGGAGGTTTCCAAAT800CAAATATGTTGCAATGGATCCTGTATCCAAATCCAGTCAA840GGAAAAAATACAAGTACTACTTCTACTGGAAATAAAAACT880TTTTAGCTGGAAGATTTAGCCACTTATAAAAAAAAAAAAA920AGGATGATCAAAACACACAGTGTTTATGTTGGAATCTTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。