基因總覽
TMSB4Y 是位於 Y 染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 thymosin beta 4 Y-linked。其產物屬於 thymosin beta 家族,蛋白質長 44 個胺基酸;序列註解將整段標示為無序區域。來源所述的 actin 相關功能是依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000284856 ★ | 13,703,899–13,706,024 | 2 |
| ENST00001007598 | 13,702,892–13,706,032 | 3 |
| ENST00001104683 | 13,702,892–13,705,652 | 3 |
| ENST00001130124 | 13,702,892–13,707,652 | 3 |
| ENST00001104684 | 13,703,894–13,706,024 | 2 |
| ENST00001131404 | 13,703,894–13,706,024 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thymosin beta 4 Y-linked 被認為參與細胞骨架的組織。依相似性推定,它可結合 actin 單體(G actin)並將其隔離,因而抑制 actin 聚合。這項作用描述了它與細胞骨架組織的關聯;來源未提供更詳細的作用條件或其他生物學過程。
Promoter 與基因調控
>TMSB4Y ENST00000284856 GRCh38 chrY:13702899-13703999 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCCGCGGTGGACACTGTGTAGACTAGATTTCACTCCCTTACGCGCCTGGCTTAGGTAAGCCCCAGGGCC CCTGCATCCTTACTCCTTCTACCCTCCCCTTCATGCCGCGCTTGCCCCTTCATTATTCGCGTCCCTGTGA AGACATCCCCTAAAGCCAAGCCGAGTGATTATCCCCGGGAAAGCTGCCTTGGGGAGGTGGGGATGCGAAA CACCCTAGATGCTGGGTAATGCGGTGGGGAAATCGATGATTTAAGAACAAAGCAAATAAACCGGCGTTTA TGTACTGCCGCTCGGAGGGTTCGTGTTAAAATTTCTTAGTGTGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGG AGATGAAGACCATCCCGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCG TAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC GGAGCTTGCAGTGAGCCGAAATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGTCTCCGTCTCAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTCTTAGTGTTTGC TCTCAAAGGTATTGTGCGTTGTCTTGGAGGCTGAGATGTGGGAACAGACAGATCCTTTGTTCTGAGGCTC ACTCATCTCCCGAGCCCCGAGCCGTCTCCCAGCCTCAGACGGCTCTGCGGGCTGCATCTGTGCAGCCTGG CAGCGGCGGCGCTGCGCTGTGACATTTTCACAGCCCTTCTTGCAGAGGCATGTGTGCTAGGGATGCCGAA ATGCCGAGAGCGCCGGCAGGACTAGCTTCCGGGCCGCGCTTTGTGTGCTGGGCTGCAGTGTGGCGCGGGC GAGGAAGCTGGTAGGGCGGTTGTCGCAAGCTCCAGCTGCAGCCTCCGCCTACGTGAGAAGACTAGAAAGC GGGCGCAGGACCAGGCCTGCGTTGTTTGCAGAGAGGCCGTGGCTACAAAATGGAAGTGCTTTTGCGACCT GGGCTCCATTTTAGGAATTCTTGCCCGATTTTAACCACTTGAACGCGGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRY_97FT7 · promoter · 13703476–13703912 · regulatory
ENSRY_5582SD · CTCF_binding_site · 13704191–13704212 · regulatory
· motif · 13704193–13704209 · motif
· motif · 13704469–13704478 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:44 aa
thymosin beta 4 Y-linked 長 44 個胺基酸,屬於 thymosin beta 家族。序列註解將第 1 至第 44 個胺基酸範圍標示為無序區域,涵蓋整條蛋白質序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
thymosin beta 4 Y-linked 的定位註解為細胞質與細胞骨架;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TERF2IPQ9NYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thymosin beta 4 Y-linked 參與細胞骨架的組織,並可結合及隔離 actin 單體(G actin),因此抑制 actin 聚合。這項功能屬於依相似性推定,並非此處直接證據所確認。 | 推論支持 | 證據與來源Plays an important role in the organization of the cytoskeleton. Binds to and sequesters actin monomers (G actin) and therefore inhibits actin polymerization (By similarity) |
| 細胞定位 | thymosin beta 4 Y-linked 的細胞內定位註解包括細胞質與細胞骨架。這筆資料僅列出位置,沒有說明特定條件下的定位變化或其他定位細節。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTTGTTTGCAGAGAGGCCGTGGCTACAAAATGGAAGTGCT40TTTGCGACCTGGGCTCCATTTTAGGAATTCTTGCCCGATT80TTAACCACTTGAACGCGGAAGTGGCTTTCCTATTCTCTTC120CAAGCCAGCCTTTAATTTTAAACGCTGTAATTAACAGTTC160ACAGGGGTCAAATTCCTTTATTCCGGAACATTCCACTTTG200AGAGGGATCTGTCCTCTTTGGTCCCCTGCGTTTTCAAATA240TTTGAGGAAAGGTGTCGCCTCTTTTTCTGTGGAAAGAGGA280AGCTCATGAGCGCGAAACAGCAGGGGACGGAGGGCGAGAA320GGGCTTTCTCAGGTTGCGGGTCGGAGGGCAGAAGCACAGT360TCCCAGTACAGAGACCCGGACAGGTGGCTGTTTCTCACGC400TCACTTTGGATTGCTCCCTACGGCTTCCTCCGCAGCCATG440TCTGACAAACCTGGTATGGCTGAGATCGAGAAATTCGATA480AGTCGAAACTGAAGAAGACAGAAACGCAAGAGAAGAATCC520ATTGTCTTCCAAAGAAACTATCGAACAGGAGAGGCAAGCA560GGCGAATCTTAAACAGGCATGTGCCACCAATATCTACTGT600ACATTCTACAAGCATTGCTTTCTTATTTTACTTCTTTTAC640TTGTTTAACTTGGTTAGATGCAAACACGTTGGATGAGTTT680GAAAGGACTATGCTGCCCTTTTGACATCAAAGACCTGCTG720ACAATGGAGGCCACGCCTGCTTCTCCCATCGCCTGTCTGG760CTGGCAGGGAAGGAAAATAGCTTGAATGTTGGTGAAAGAC800TTAGCGGAGTGGGAGGGCAGTGAAATCTAGAGTAAAACCA840AGTTGGGCCAAGTGTCCTGCAGAATCTAAAATGAAGTTTA880ATCAGCGTGCCATTTTTGTTGTTGTTTGAAAGATTTTAAT920TTTTGGAATGCACAGTTTTTATTTAAAAAAGACATTTTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。