基因總覽
TMSB4X 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 thymosin beta 4 X-linked。其產物 Thymosin beta-4 屬於 thymosin beta 家族，是一種長度為 44 個胺基酸的蛋白質；序列註解將全長區域標示為無序區。此蛋白質與細胞骨架組織有關，並涉及骨髓來源幹細胞的分化調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451311 ★ | 12,975,110–12,977,223 | 3 |
| ENST00000876159 | 12,975,003–12,977,227 | 3 |
| ENST00000931313 | 12,975,003–12,977,227 | 3 |
| ENST00000931314 | 12,975,003–12,977,227 | 4 |
| ENST00001105215 | 12,975,003–12,977,227 | 3 |
| ENST00001105216 | 12,975,003–12,977,228 | 3 |
| ENST00001133832 | 12,975,003–12,977,223 | 3 |
| ENST00000876160 | 12,975,084–12,977,226 | 3 |
| ENST00000931312 | 12,975,107–12,977,227 | 3 |
| ENST00000380636 | 12,975,110–12,977,226 | 2 |
| ENST00000380635 | 12,975,122–12,977,227 | 3 |
| ENST00000876161 | 12,975,122–12,977,226 | 3 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Thymosin beta-4 參與細胞骨架的組織。它會結合 actin 單體（G actin）並將其隔離，使 actin 不易進行聚合；藉由調節可供聚合的單體，蛋白質可影響細胞骨架的組織狀態。來源指出這項作用與細胞骨架組織相關，但未提供更細的細胞情境或作用步驟。
此外，Thymosin beta-4 被描述為骨髓來源幹細胞分化的強效抑制因子。其作用方式的說明指出，造血多能幹細胞進入 S 期受到抑制；此機制標示為依相似性推定，因此不能視為已在此蛋白質上直接證實。細胞週期進入受阻與幹細胞分化抑制相連，但來源未詳述兩者間的其他中間步驟。
這些資料顯示，TMSB4X 產物涉及兩類不同的細胞活動：一方面透過結合 G actin 調節 actin 聚合，另一方面與骨髓來源幹細胞分化及造血多能幹細胞進入 S 期相關。來源並未說明兩種作用是否相互連結，故應分別理解其對細胞骨架與幹細胞活動的描述。
Promoter 與基因調控
>TMSB4X ENST00000451311 GRCh38 chrX:12974110-12975210 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGTATTCACAGAGTCAGGTGCCATTTTGAAAACTGCTTCCCTCTACCCGAATCTCTTATATTTCCAGATG CAGATGCACTTCAGCGATGTCCTAGTGCTGGAAACGCTCCCTTGAAAATATAATTTGATTTTTGAATTTC ATCTTAAGACATTAGAGATAATGTAACTGTAGTCTTTGGAATTCAACGCTGGCCTCCTTAGCCATCACTT TTAAAATTTATGAAAATAAGGAAGAGGAAGGTAAAGAACTTCCTCATTGTCCGGCAGTAAAGTCAATGGC AGAGCTTGAGCTTGACTTATTTTGCTAAGAGGGAGGTGTTTTACCCTATAAACTCCAAATTACCTTACAC CCAGCAAATACTACTGTTGAGTGCTCACAAAAATTATGCTGATGAAACAATATGGATGTTTCAGTGATGA AACTTTCTCTTTTAAAATCACTTAAGGGTGCTTTACGTCCCACCCAAGGCAAGAGGAACGCCAGCGAGGA AGACAAAGAGGCCCGGGGTGGGGCGCATGCCCGCCACTGGACTGAAAGCTGAGTCACAGGAATCGTACCC CTGCAGCGGGCCAGGCCCTCCAGGGAGGGACACCGCGCCCTTGTGTGGAGATGTCCACAGTAGACAAAGG CAGTTTCGAAATAAAAGAATGCCTGTCACCCCAGGTGCCACCCCGACCCTTAGTTATTATGCACTGGTCC CCAAGAGCAATTTCTGCGCTGCTGTTGCAAAAATTCATCGTAATGAAATAAACGTAAAAGGGGAAAATGT GTTATGAAGTGTTGGAGGGTGCTTTGCTCATTTTTTTCGCCATCGTTGTGGTTAGGGTGCATGCACTAGT GGACCCCGGGTGGGGGTGGGGCTCCCCTCCCCAAAAGCCCGGCAGGCCTCCGGATGCCGTTCCGAGACGC GGCGCGAAGGAGTTAAGCGGGCCGGCGGGTGACATCACCTCATTTACATAGGAGCGCCCATAAAGCTGCG CCCGCCGCACCCCGCCCGACAACTCGGTGGTGGCCACTGCGCAGACCAGACTTCGCTCGTACTCGTGCGC CTCGCTTCGGTGAGCCCCAGGGCCCCTGCCTCCTTCCTCCTGCCGTCCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMSB4X_1 ↗ | X:12,975,111 | 正股 | 12,975,062–12,975,121 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_97629 · promoter · 12971022–12971522 · regulatory
ENSRX_B4KHP · enhancer · 12971523–12972278 · regulatory
ENSRX_7QL4D · promoter · 12972393–12972493 · regulatory
ENSRX_9762R · promoter · 12972984–12973282 · regulatory
ENSRX_97632 · promoter · 12973664–12974164 · regulatory
ENSRX_553DKX · CTCF_binding_site · 12973801–12973822 · regulatory
ENSRX_C39QL · promoter · 12974620–12975668 · regulatory
ENSRX_553DW4 · CTCF_binding_site · 12975560–12975581 · regulatory
ENSRX_C39QN · enhancer · 12975669–12977079 · regulatory
· motif · 12970729–12970738 · motif
· motif · 12970814–12970825 · motif
· motif · 12970814–12970825 · motif
· motif · 12971016–12971031 · motif
· motif · 12971016–12971031 · motif
· motif · 12971735–12971755 · motif
· motif · 12971769–12971780 · motif
· motif · 12973405–12973418 · motif
· motif · 12973405–12973418 · motif
· motif · 12973792–12973805 · motif
· motif · 12973803–12973819 · motif
· motif · 12973817–12973830 · motif
· motif · 12973879–12973892 · motif
· motif · 12973953–12973973 · motif
· motif · 12974046–12974056 · motif
· motif · 12974491–12974502 · motif
· motif · 12974495–12974509 · motif
· motif · 12974495–12974509 · motif
· motif · 12974648–12974656 · motif
· motif · 12974925–12974933 · motif
· motif · 12974959–12974969 · motif
· motif · 12974961–12974971 · motif
· motif · 12975046–12975059 · motif
· motif · 12975046–12975059 · motif
· motif · 12975058–12975071 · motif
· motif · 12975212–12975225 · motif
· motif · 12975361–12975381 · motif
· motif · 12975432–12975443 · motif
· motif · 12975562–12975578 · motif
· motif · 12976156–12976169 · motif
· motif · 12976163–12976178 · motif
· motif · 12977195–12977208 · motif
· motif · 12977195–12977208 · motif
· motif · 12977199–12977212 · motif
· motif · 12977516–12977531 · motif
· motif · 12977761–12977774 · motif
· motif · 12978330–12978338 · motif
· motif · 12978730–12978741 · motif
· motif · 12978780–12978793 · motif
· motif · 12978929–12978942 · motif
· motif · 12978929–12978942 · motif
· motif · 12978970–12978978 · motif
· motif · 12979529–12979540 · motif
· motif · 12979530–12979541 · motif
· motif · 12979936–12979951 · motif
來源指出 TMSB4X 受 alpha interferons 調控；此外，THP-1 細胞經重組 interferon-lambda 處理後，TMSB4X 水準下降。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：44 aa
Thymosin beta-4 長度為 44 個胺基酸，歸屬於 thymosin beta 家族。序列註解將第 1 至第 44 位標示為無序區，涵蓋整條蛋白質序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Thymosin beta-4 位於細胞質與細胞骨架。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- AKAP8LQ9ULX6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COG6Q9Y2V7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL3Q13643 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT36O76013-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP8-1Q8IUC2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MLH1P40692 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- UHMK1Q8TAS1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TMSB4X 曾被鑑定於含 ACTA1、COBL、GSN 與 TMSB4X 的複合體中；另有依相似性推定的資料指出其與 SERPINB1 互作，該互作的證據性質不同於前述複合體鑑定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TMSB4X 產物參與細胞骨架組織，並藉由結合及隔離 actin 單體（G actin），抑制 actin 聚合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays an important role in the organization of the cytoskeleton. Binds to and sequesters actin monomers (G actin) and therefore inhibits actin polymerization PMID 10848969 ↗ · PMID 1999398 ↗ |
| 功能 | TMSB4X 產物是骨髓來源幹細胞分化的強效抑制因子；其作用被描述為抑制造血多能幹細胞進入 S 期，而此機制屬依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Potent inhibitor of bone marrow derived stem cell differentiation. Acts by inhibits the entry of hematopoietic pluripotent stem cells into the S-phase (By similarity) PMID 7694679 ↗ |
| 交互作用 | TMSB4X 曾被鑑定於由 ACTA1、COBL、GSN 與 TMSB4X 組成的複合體中；另有依相似性推定的資料指出 TMSB4X 與 SERPINB1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Identified in a complex composed of ACTA1, COBL, GSN AND TMSB4X. Interacts with SERPINB1 (By similarity) PMID 23009842 ↗ |
| 細胞定位 | TMSB4X 的定位記錄包括細胞質與細胞骨架。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | TMSB4X 受 alpha interferons 調控；在 THP-1 細胞中，重組 interferon-lambda 處理後可觀察到其水準下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源By alpha interferons. Decreased levels in THP-1 cells after treatment with recombinant interferon-lambda PMID 3500230 ↗ · PMID 6548414 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AACTCGGTGGTGGCCACTGCGCAGACCAGACTTCGCTCGT40ACTCGTGCGCCTCGCTTCGCTTTTCCTCCGCAACCATGTC80TGACAAACCCGATATGGCTGAGATCGAGAAATTCGATAAG120TCGAAACTGAAGAAGACAGAGACGCAAGAGAAAAATCCAC160TGCCTTCCAAAGAAACGATTGAACAGGAGAAGCAAGCAGG200CGAATCGTAATGAGGCGTGCGCCGCCAATATGCACTGTAC240ATTCCACAAGCATTGCCTTCTTATTTTACTTCTTTTAGCT280GTTTAACTTTGTAAGATGCAAAGAGGTTGGATCAAGTTTA320AATGACTGTGCTGCCCCTTTCACATCAAAGAACTACTGAC360AACGAAGGCCGCGCCTGCCTTTCCCATCTGTCTATCTATC400TGGCTGGCAGGGAAGGAAAGAACTTGCATGTTGGTGAAGG440AAGAAGTGGGGTGGAAGAAGTGGGGTGGGACGACAGTGAA480ATCTAGAGTAAAACCAAGCTGGCCCAAGGTGTCCTGCAGG520CTGTAATGCAGTTTAATCAGAGTGCCATTTTTTTTTTTGT560TCAAATGATTTTAATTATTGGAATGCACAATTTTTTTAAT600ATGCAAATAAAAAGTTTAAAAA622cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。