基因總覽
TMSB10 是蛋白質編碼基因,產物 thymosin beta 10 屬於 thymosin beta 家族。來源指出,此蛋白質與細胞骨架的組織有關;其分子作用的描述帶有 By similarity 的證據註記,因此應視為依相似性推定的功能,而非在此來源中直接確立的結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233143 ★ | 84,905,656–84,906,671 | 3 |
| ENST00000929522 | 84,904,923–84,906,671 | 4 |
| ENST00000877287 | 84,905,252–84,906,677 | 4 |
| ENST00000929523 | 84,905,603–84,906,680 | 3 |
| ENST00001099004 | 84,905,603–84,906,678 | 3 |
| ENST00000877289 | 84,905,608–84,906,670 | 3 |
| ENST00000929524 | 84,905,608–84,906,680 | 3 |
| ENST00000929525 | 84,905,608–84,906,680 | 3 |
| ENST00001099002 | 84,905,608–84,906,678 | 3 |
| ENST00001099003 | 84,905,608–84,906,677 | 3 |
| ENST00001099005 | 84,905,608–84,906,678 | 3 |
| ENST00001099006 | 84,905,608–84,906,679 | 3 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thymosin beta 10 被描述為參與細胞骨架的組織。依相似性推定,它可結合並隔離 actin 單體(G actin),因而抑制 actin 聚合。來源未提供此作用的實驗系統或其他條件,因此這項分子作用應保留為相似性推定,不宜表述為已直接證實的機制。
Promoter 與基因調控
>TMSB10 ENST00000233143 GRCh38 chr2:84904656-84905756 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTATGGAACTTATTACCTAACGGTGTTGCACAGGCTGAAAATACAACTTTTCTAAGAAAGATGTGAATAA TTGCAGTATACCACTCCTACAATGGGTTAATAAGAAAAACAAGAACGTTTGTAGGCATGTGGGTCTCTAT TATCCTCAAGGTTAACTTCAAGGAGGAAAACCGCACCCGCTGATACAGTGTTTCTAGGAGCTCGACGAGA AAAGGCAAACTGCGAGCCTTCTCGGGACGCCCTGTTCCCACCACAGCCCTTCACACAATGCGTCTAACAG CATTTAAGGAACACCCGCCACGCCAACGATCCTGCTGGAACCGCCCAGTTCAGGGAACAGGGGACGACTG ACCAGAAGGCAACCGCCCCCAACCTGAGCAAAGAGCGCTGGAAACCTATTCCCCCCTCCCCCTACACCCC CCCGCCCCCCGCTCCACTACGGGACCCTCGGCTCGAATTCTTTTAGTGCAGGACCACCTTAGGACTCAGC CTCCCTAAGGAGAGGAAAAGTGGGGGAGGGAAGGGGACTCTGGAGGAGCAAAAGCAAGAGGCCTGGGGGC GACTGGGGTGGGGCGTCTCCTAGAGCGAGGATTGCTGCAGAGTGCGCGTGCACGCCCGCACATCCACACC CACGGCTACACATCATATCTGCACACGCACAAAACCACACACCCTCCCACGCCGGTCCCATATCCTTTCT GCGGGGTGAGCAGCAGATTCCCGGAAAGGGGGAAATGTAGCCGCAAAAGCAAAGCCGGGGGCCTGGCGCC CACTCTGGCGGCGACTACAGCCCCCACGCTGGGCACACTGCGAGCTGGGGGTGCCCGGCGCGGGAGAAGC CGCGCCCAGCCGGGCTGGTAGCCCAGCGGGGGGCGCGGCAGGGCGAGGAGCAGCCCGCGCTGCTCCCGCC CCTCGGGTGCCAGCACCGCCCCTGCTGCGGCGGGTGAGGGGCGGGGCGGGGCGCGGCGTATATAAGGCTA GGGGCGGGCGCCGCTCTTTTGTTTCTTGCTGCAGCAACGCGAGTGGGAGCACCAGGATCTCGGGCTCGGA ACGAGACTGCACGGTGAGTGCGGCGCCGGGGCGGGGGGCCCACCCAGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMSB10_1 ↗ | 2:84,905,656 | 正股 | 84,905,607–84,905,666 |
| TMSB10_2 ↗ | 2:84,905,915 | 正股 | 84,905,866–84,905,925 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_BLSX8 · enhancer · 84901572–84902139 · regulatory
ENSR2_938NWJ · promoter · 84905166–84905666 · regulatory
ENSR2_5PZ7K5 · CTCF_binding_site · 84905514–84905535 · regulatory
ENSR2_84HDS9 · enhancer · 84905667–84905842 · regulatory
ENSR2_5PZ7KS · CTCF_binding_site · 84905668–84905689 · regulatory
ENSR2_938NX2 · promoter · 84906843–84907343 · regulatory
ENSR2_CBFH4 · enhancer · 84907344–84909318 · regulatory
· motif · 84905317–84905325 · motif
· motif · 84905516–84905532 · motif
· motif · 84905557–84905579 · motif
· motif · 84905557–84905579 · motif
· motif · 84905670–84905686 · motif
· motif · 84905972–84905984 · motif
· motif · 84906016–84906026 · motif
· motif · 84906212–84906225 · motif
· motif · 84906234–84906248 · motif
· motif · 84906505–84906520 · motif
· motif · 84907062–84907077 · motif
· motif · 84907223–84907234 · motif
· motif · 84907243–84907256 · motif
· motif · 84907802–84907812 · motif
· motif · 84909041–84909056 · motif
· motif · 84909325–84909337 · motif
· motif · 84909604–84909616 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:44 aa
thymosin beta 10 全長為 44 個胺基酸,屬於 thymosin beta 家族。序列註解將第 1 至第 44 位胺基酸標示為無序區域,涵蓋整條蛋白質序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
thymosin beta 10 位於細胞質與細胞骨架。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ALAS1P13196 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP9-2Q9BYQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POT1Q9NUX5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thymosin beta 10 被描述為在細胞骨架組織中具有重要作用。依相似性推定,該蛋白質可結合並隔離 actin 單體(G actin),因此抑制 actin 聚合;此作用的證據性質應保留為相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Plays an important role in the organization of the cytoskeleton. Binds to and sequesters actin monomers (G actin) and therefore inhibits actin polymerization (By similarity) |
| 細胞定位 | thymosin beta 10 的定位註記為細胞質與細胞骨架。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTTTCTTGCTGCAGCAACGCGAGTGGGAGCACCAGGATCT40CGGGCTCGGAACGAGACTGCACGGATTGTTTTAAGAAAAT80GGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGAT120AAGGCCAAGCTGAAGAAAACGGAGACGCAGGAGAAGAACA160CCCTGCCGACCAAAGAGACCATTGAGCAGGAGAAGCGGAG200TGAAATTTCCTAAGATCCTGGAGGATTTCCTACCCCCGTC240CTCTTCGAGACCCCAGTCGTGATGTGGAGGAAGAGCCACC280TGCAAGATGGACACGAGCCACAAGCTGCACTGTGAACCTG320GGCACTCCGCGCCGATGCCACCGGCCTGTGGGTCTCTGAA360GGGACCCCCCCCCAATCGGACTGCCAAATTCTCCGGTTTG400CCCCGGGATATTATAGAAAATTATTTGTATGAATAATGAA440AATAAAACACACCTCGTGGCA461cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。