演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TMOD4Sk-Tmod

tropomodulin 4

TMOD4 編碼 tropomodulin 4,屬於 tropomodulin 家族;其作用與肌動蛋白絲尖端的生長及解聚調控,以及膜骨架形態形成有關。

Homo sapiens1q21.3UniProt Q9NZQ9
OFFICIAL SYMBOL
TMOD4
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9NZQ9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TMOD4 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 tropomodulin 4,產物屬於 tropomodulin 家族。其蛋白質長 345 個胺基酸,序列中第 42 至 63 位被註記為無序區域。這些資料勾勒出其家族歸屬與基本序列特徵;其在肌動蛋白絲上的作用則與細胞骨架及膜骨架的組織相關。

Official symbol
TMOD4
Gene name
tropomodulin 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11874
UniProt
Q9NZQ9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Sk-Tmod

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegTMOD4pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:151,169,984–151,176,284
Gene span
6,301 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000295314 ★151,169,987–151,175,98110
ENST00000945625151,169,984–151,176,0699
ENST00000945626151,169,984–151,176,0699
ENST00000945627151,169,984–151,176,06910
ENST00000945628151,169,984–151,176,0698
ENST00000945629151,169,984–151,176,0699
ENST00000945630151,169,984–151,176,06910
ENST00000945631151,169,984–151,175,97210
ENST00001054481151,169,984–151,176,0699
ENST00001054487151,169,984–151,176,0698
ENST00001145594151,169,984–151,176,06910
ENST00000466891151,169,986–151,172,3154

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tropomodulin 4 參與調節肌動蛋白絲尖端的動態,可阻止肌動蛋白絲在尖端延長,也可抑制其解聚。這表示其作用與維持肌動蛋白絲尖端的穩定有關,涵蓋絲狀結構增長與拆解兩個方向。

Tmod/TM 複合體則參與形成短的肌動蛋白原絲。這些短原絲進一步界定膜骨架的幾何形態,因此 tropomodulin 4 所屬的調控系統,不僅涉及肌動蛋白絲本身的長度變化,也與膜骨架結構的組織方式相連。來源未進一步說明該複合體形成原絲的具體步驟或其在不同細胞情境中的作用差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 151175981 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TMOD4 ENST00000295314 GRCh38 chr1:151175881-151176981 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACCCGTCAACCCCCCTGCTCGCTGCTCACGTACCTTCATCACTTTTAGTGATGATGCAACTTTCGAGGA
ATGGTTCCCCCAAGGGCGGCCCCCAAAAGTCCCTGTTCGTGAGGTCTGTCCAGTGACCCATCGTCCAGCC
CTATACCGGGACCCTGTTACAGACATACCCTATGCCACTGCTCGAGCCTTCAAGATCATTCGTGAGGCTT
ACAAGAAGTACATTACTGCCCATGGACTGCCGCCCACTGCCTCAGCCCTGGGCCCCGGCCCGCCACCTCC
TGAGCCCCTCCCTGGCTCTGGGCCCCGAGCCTTGCGCCAGAAAATTGTCATTAAATGAAGAGATGTCTAG
TCCTCAGAAACTTCTTTCCTGCCCTGATTGGGGCTCTTGCTGTTCCGTTTCTTCTCCCTGCTTCTCCCCT
TTGTCATCTCTGATCTTTGCCTAATCTGTTTCTTTTTCCTTTTCCCCTAGTTCTTACAGGTTTCGTTGTG
TTTTTTAATCTAATAAAATAGAAAGATCCCTTTTGTCTGGTGTCCAGTCTAGGGTTGGGAGCAAGAAGTA
TTTGAATACCTGCATATATTTGGGTCTTTATTCGATAGCATTTATTATGAGCTGTCCTTTCTAAATTGTA
TTCATTCCTCCAACTAAATTATAAACATCTGAAAATTGCACACCAAAACACATCCTTGTATTGACCTTCC
TATCACTTTACACTCACTGTTTTGAATACAGCAGGCACCAAATAAGGAGGAACTGGCTGATTCTAGTCGA
ACTCATATGTCTCAGACTGGGGCTTGTATGAAGGGAAGTGGAAGAGATGCCATGGCTGTTAATGACCACT
AGAGGCTCTCAGGGCTGGGCAGGGTATGGGGGCTGTGTATATGTGATCTCCCACTACCCCCCACCTGGCC
AGAGCTAAAATAATAAAATGCTGAGCTCACTGTTCCCCCACCCTCTCCCCCGGCACCGGGCTCCTCCTGC
TGCTGGGACAGTGCTCTAGTAGAACAGACAGACCTACTGACACAGGGGAGGTGAGAAGGGAGGTGACCAC
CAGGACTGGTAGGTGGGGAAGACAGGGGGCTTATGGATGAGAGCCCGGTGG
TMOD4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TMOD4_2 ↗1:151,175,981負股151,175,971–151,176,030
TMOD4_1 ↗1:151,177,999負股151,177,989–151,178,048
TMOD4_3 ↗1:151,184,315負股151,184,305–151,184,364

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_94824S · enhancer · 151175094–151175365 · regulatory

ENSR1_86G283 · enhancer · 151175791–151175970 · regulatory

ENSR1_948254 · promoter · 151175971–151176266 · regulatory

ENSR1_53BK3SJ · CTCF_binding_site · 151176133–151176154 · regulatory

· motif · 151175524–151175538 · motif

· motif · 151175944–151175966 · motif

· motif · 151175944–151175966 · motif

· motif · 151176135–151176151 · motif

· motif · 151176227–151176240 · motif

· motif · 151176364–151176377 · motif

· motif · 151180817–151180831 · motif

· motif · 151180817–151180831 · motif

· motif · 151180824–151180835 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:345 aa

1 aa345 aa功能區域
依 Q9NZQ9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tropomodulin 4 長 345 個胺基酸,屬於 tropomodulin 家族。蛋白質序列第 42 至 63 位註記為無序區域;此項序列特徵未附帶更具體的結構或功能描述。

功能區域Disordered42–63 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NZQ9…

AlphaFold · Q9NZQ9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

tropomodulin 4 位於細胞質與細胞骨架。 在具有肌節結構的肌原纖維中,它定位於肌動蛋白細絲的尖端。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Sk-TmodTMOD4TXN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tropomodulin 4 可與 tropomyosin 的 N 端及 actin 結合。來源未提供其他複合體成員或結合條件的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TMOD4 可阻止肌動蛋白絲在尖端延長及解聚。Tmod/TM 複合體參與形成短的肌動蛋白原絲,而這些原絲會界定膜骨架的幾何形態。資料庫紀錄
證據與來源

Blocks the elongation and depolymerization of the actin filaments at the pointed end. The Tmod/TM complex contributes to the formation of the short actin protofilament, which in turn defines the geometry of the membrane skeleton

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TMOD4 可與 tropomyosin 的 N 端及 actin 結合。資料庫紀錄
證據與來源

Binds to the N-terminus of tropomyosin and to actin

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TMOD4 位於細胞質與細胞骨架;在具有肌節結構的肌原纖維中,定位於肌動蛋白細絲的尖端。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; In myofibrils with sarcomeric structure, localizes to the pointed end of actin thin filaments

PMID 25250574 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000295314 · 1,232 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAACAGACAGACCTACTGACACAGGGGAGGTGAGAAGGG40
41AGGTGACCACCAGGACTGGCTCTGTGAGTACCACACAGTG80
81GGGAGGGGGTGGGGGCCACCATGTCATCATATCAGAAGGA120
121ACTGGAGAAATACAGAGACATAGATGAAGATGAGATCCTA160
161AGGACCTTGAGCCCCGAGGAGCTAGAGCAGCTGGACTGCG200
201AACTACAGGAGATGGATCCTGAGAACATGCTCCTGCCAGC240
241TGGACTAAGACAACGTGACCAGACAAAGAAGAGCCCAACG280
281GGGCCACTGGACCGAGAGGCCCTTTTGCAGTACTTGGAGC320
321AACAGGCACTAGAAGTCAAAGAGCGTGATGACTTGGTGCC360
361CTTCACAGGCGAGAAGAAGGGGAAACCCTATATTCAGCCC400
401AAGAGGGAAATCCCAGCAGAGGAGCAGATCACCCTGGAGC440
441CTGAGCTGGAGGAGGCACTGGCACATGCCACAGATGCTGA480
481AATGTGTGACATTGCAGCAATTCTGGACATGTACACACTG520
521ATGAGTAACAAGCAATACTATGATGCCCTCTGCAGTGGAG560
561AAATCTGCAACACTGAAGGCATTAGCAGTGTGGTACAGCC600
601TGACAAGTATAAGCCAGTGCCGGATGAACCCCCAAATCCC640
641ACAAACATTGAGGAGATACTAAAGAGGGTCCGAAGCAATG680
681ACAAGGAGCTGGAGGAGGTGAACTTGAATAATATACAGGA720
721CATCCCAATACCCATGCTAAGTGAGCTGTGTGAGGCAATG760
761AAGGCAAATACCTATGTGCGGAGCTTCAGTCTGGTAGCCA800
801CGAGGAGTGGTGACCCCATTGCCAATGCAGTGGCTGACAT840
841GTTGCGTGAGAATCGTAGCCTCCAGAGCCTAAACATCGAA880
881TCCAACTTCATTAGCAGCACAGGACTCATGGCTGTGCTGA920
921AGGCAGTTCGGGAAAATGCCACACTCACTGAGCTCCGTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。