演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TMOD2NTMOD

tropomodulin 2

TMOD2 編碼 tropomodulin 2,屬於 tropomodulin 家族;來源指出其與 actin 細絲及 tropomyosin 結合,並參與調節 actin 細絲末端的變化。

Homo sapiens15q21.2UniProt Q9NZR1
OFFICIAL SYMBOL
TMOD2
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q9NZR1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TMOD2 是蛋白質編碼基因,其產物為 tropomodulin 2,屬於 tropomodulin 家族。現有資料支持的基本特徵包括其家族歸屬,以及與 actin、tropomyosin 的結合;來源未提供更具體的序列、結構域或蛋白質長度資訊。

Official symbol
TMOD2
Gene name
tropomodulin 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11872
UniProt
Q9NZR1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NTMOD

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.2
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegTMOD2pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:51,751,564–51,816,363
Gene span
64,800 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000249700 ★51,751,597–51,816,36310
ENST0000043512651,751,564–51,816,3639
ENST0000086486051,751,564–51,816,3639
ENST0000096509851,751,564–51,816,36311
ENST0000110589451,751,564–51,767,6462
ENST0000112327051,751,564–51,816,3639
ENST0000113387751,751,564–51,816,36310
ENST0000053996251,751,597–51,816,36311

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tropomodulin 2 在 actin 細絲的 pointed end 阻止細絲延長與解聚,顯示其作用涉及調節細絲在該端的增長和縮短。這項功能描述未提供額外的細胞或實驗條件;相關功能註記標示為 By similarity,因此應視為相似性推論,而非此處直接呈現的實驗證實。

來源另指出,Tmod/TM 複合體有助於形成短的 actin 原絲,而該原絲進一步界定 membrane skeleton 的幾何形態。這描述了由複合體、短 actin 原絲到膜骨架形態的關聯;資料未詳述 TMOD2 在複合體中的具體作用,也未提供此過程的其他機制或生物學情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51751597 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TMOD2 ENST00000249700 GRCh38 chr15:51750597-51751697 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTCAAAATATGCTGCAAAAGTTCAAGAAGGAGAGAGATATCACATCTAATTAGAAAAGGCCTCTGGAAG
TTAAATCTAGATGCCATGTATTTTCATAATGTTGGTCTTTGTCCTATGTCACCCCACTCTGCTGTCATGC
TTCAGAAACTTGACTTTATTTTCTCTATCTTTGGAGCTCTCAAGAACCTGGCAGACAGAACATCTCAGGG
TATATTCAGGGATGAAGTGAACGGGCTCAACGACTAACAAACCCAGTGGATTTTAACATTTACCCAGCCC
AACGAGGTCCAACTATCTTTAGGTTAGCACGACATATAGGACTTTCCCGGCCCAAGAACTCCCTCGGAAA
CCCCAAGGAAGGAACTTTCACTGAGTATGCACTAAGTGCCAGATCCTAAGTGCTATGGGTCGCTTAATCC
TCACAACACTTTTTCAAGCTTGAAGCCTGTTTTACAGATGAGGACGCGAAGGCTCAGACAGGCTAAGTTG
TCCGGTCTCACCTCAGTGAAGCCGCCACTGCGCTTGGGCTCTCCAGCCCCTCACGCCATCACCCTAGAGC
CTTGCTAACTTCCACCTCGCTTACCTCCTTCCCTCCCTAGGCTGCCAACCCAACTACTCTCTCCTCCCAC
GCCCACGCCCAGCCAGGAAAACCTGGGGCGGGCGGGGTCTGTACCTGAGACCGCTCTCAACGCGGCTTCC
GTGTCAGGATGCTCGCTCACAGGAATGCTCATCACAGGCTTGAAAGCCTTTGCCATCCACGCTCTCCGGA
GCCCCGAGCGTCTCCAAAGAGCCTGCCCAGGCTTCTCCCCGACCCAGGTGCTTCCTCCCCTGCAGAGCTG
TGGCGGGGTTCAGACCCCGATTCCGGGAGAGGACACCTGTCGGGGAAGGGCGGGGCTGGGGGACTGCGGG
GCCGCGGCGAGGCTCAGCCGGGAACTACGCTTCCCAGCCTGCTCCGCTGCAGCCGCGCGCCCCGGCGCCG
CGCCCGGCCGGGAGCCGCCTGTTGATCGCCGCGCTCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCTGTTCTCCCGGC
CCCGCTCCACCGGGGCTGACGGACTGACGGCCAGCACAGCCGGCTCCGGGA
TMOD2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TMOD2_1 ↗15:51,751,597正股51,751,548–51,751,607

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_83J47R · promoter · 51751427–51751677 · regulatory

ENSR15_5G6MP5 · CTCF_binding_site · 51751455–51751476 · regulatory

ENSR15_9QJLL · promoter · 51751995–51752495 · regulatory

ENSR15_83J48F · enhancer · 51752496–51752669 · regulatory

· motif · 51751218–51751231 · motif

· motif · 51751224–51751237 · motif

· motif · 51751409–51751418 · motif

· motif · 51751457–51751473 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:351 aa

tropomodulin 2 屬於 tropomodulin 家族。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步資料。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NZR1…

AlphaFold · Q9NZR1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

tropomodulin 2 的註解定位為細胞質與細胞骨架;來源未說明其定位變化的條件或動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NTMODTMOD2PMP22
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tropomodulin 2 與 tropomyosin 的 N 端及 actin 結合。此註解指出的是結合關係,未進一步說明結合條件或提供其他複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tropomodulin 2 在 actin 細絲的 pointed end 阻止細絲延長與解聚。Tmod/TM 複合體有助於形成短的 actin 原絲,該原絲進一步界定 membrane skeleton 的幾何形態;此功能註記為 By similarity。推論支持
證據與來源

Blocks the elongation and depolymerization of the actin filaments at the pointed end. The Tmod/TM complex contributes to the formation of the short actin protofilament, which in turn defines the geometry of the membrane skeleton (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tropomodulin 2 與 tropomyosin 的 N 端以及 actin 結合。資料庫紀錄
證據與來源

Binds to the N-terminus of tropomyosin and to actin

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tropomodulin 2 的註解定位為細胞質與細胞骨架。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000249700 · 9,150 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTGATCGCCGCGCTCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCTG40
41TTCTCCCGGCCCCGCTCCACCGGGGCTGACGGACTGACGG80
81CCAGCACAGCCGGCTCCGGGATGAGCGCACGGACGGTATT120
121CTGAAGTCTCAGGAAACTGGACCATTTAAATGTGCATGGC160
161CCATGAGAAAGGCTTATAAGAAGCCATGGCACTCCCCTTT200
201CAAAAAGAGCTGGAGAAATACAAGAACATTGATGAAGATG240
241AGCTTCTTGGCAAACTCTCAGAAGAGGAACTGAAACAGTT280
281GGAAAATGTTCTAGATGACCTAGATCCTGAGAGTGCCATG320
321CTGCCAGCTGGATTTCGACAGAAAGACCAGACACAGAAGG360
361CAGCCACCGGCCCCTTTGACCGCGAGCACCTCCTCATGTA400
401CCTGGAGAAGGAGGCTTTGGAACAGAAAGACAGAGAGGAC440
441TTTGTGCCCTTCACTGGAGAAAAGAAAGGGAGAGTCTTTA480
481TCCCTAAAGAAAAGCCTATAGAAACTCGTAAAGAAGAAAA520
521AGTGACCCTTGACCCAGAACTGGAAGAAGCTTTGGCCAGT560
561GCCTCTGACACCGAACTCTATGATCTTGCAGCTGTCCTTG600
601GAGTACACAATTTGCTCAACAATCCAAAGTTCGATGAAGA640
641AACAGCCAACAATAAAGGTGGCAAAGGACCTGTCAGAAAT680
681GTTGTCAAAGGTGAAAAAGTAAAGCCAGTATTTGAGGAAC720
721CACCAAATCCCACAAATGTGGAAATAAGCCTGCAGCAGAT760
761GAAAGCCAATGATCCTAGCTTGCAAGAAGTCAACCTCAAC800
801AACATTAAGAACATTCCAATTCCAACCCTGAGGGAATTTG840
841CAAAGGCTCTGGAGACCAACACTCACGTGAAGAAGTTCAG880
881CCTGGCCGCAACTCGCAGCAATGACCCTGTGGCCATTGCT920
921TTTGCAGACATGCTGAAAGTAAACAAGACCTTGACAAGTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。