基因總覽
TMOD2 是蛋白質編碼基因,其產物為 tropomodulin 2,屬於 tropomodulin 家族。現有資料支持的基本特徵包括其家族歸屬,以及與 actin、tropomyosin 的結合;來源未提供更具體的序列、結構域或蛋白質長度資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000249700 ★ | 51,751,597–51,816,363 | 10 |
| ENST00000435126 | 51,751,564–51,816,363 | 9 |
| ENST00000864860 | 51,751,564–51,816,363 | 9 |
| ENST00000965098 | 51,751,564–51,816,363 | 11 |
| ENST00001105894 | 51,751,564–51,767,646 | 2 |
| ENST00001123270 | 51,751,564–51,816,363 | 9 |
| ENST00001133877 | 51,751,564–51,816,363 | 10 |
| ENST00000539962 | 51,751,597–51,816,363 | 11 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
tropomodulin 2 在 actin 細絲的 pointed end 阻止細絲延長與解聚,顯示其作用涉及調節細絲在該端的增長和縮短。這項功能描述未提供額外的細胞或實驗條件;相關功能註記標示為 By similarity,因此應視為相似性推論,而非此處直接呈現的實驗證實。
來源另指出,Tmod/TM 複合體有助於形成短的 actin 原絲,而該原絲進一步界定 membrane skeleton 的幾何形態。這描述了由複合體、短 actin 原絲到膜骨架形態的關聯;資料未詳述 TMOD2 在複合體中的具體作用,也未提供此過程的其他機制或生物學情境。
Promoter 與基因調控
>TMOD2 ENST00000249700 GRCh38 chr15:51750597-51751697 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTCAAAATATGCTGCAAAAGTTCAAGAAGGAGAGAGATATCACATCTAATTAGAAAAGGCCTCTGGAAG TTAAATCTAGATGCCATGTATTTTCATAATGTTGGTCTTTGTCCTATGTCACCCCACTCTGCTGTCATGC TTCAGAAACTTGACTTTATTTTCTCTATCTTTGGAGCTCTCAAGAACCTGGCAGACAGAACATCTCAGGG TATATTCAGGGATGAAGTGAACGGGCTCAACGACTAACAAACCCAGTGGATTTTAACATTTACCCAGCCC AACGAGGTCCAACTATCTTTAGGTTAGCACGACATATAGGACTTTCCCGGCCCAAGAACTCCCTCGGAAA CCCCAAGGAAGGAACTTTCACTGAGTATGCACTAAGTGCCAGATCCTAAGTGCTATGGGTCGCTTAATCC TCACAACACTTTTTCAAGCTTGAAGCCTGTTTTACAGATGAGGACGCGAAGGCTCAGACAGGCTAAGTTG TCCGGTCTCACCTCAGTGAAGCCGCCACTGCGCTTGGGCTCTCCAGCCCCTCACGCCATCACCCTAGAGC CTTGCTAACTTCCACCTCGCTTACCTCCTTCCCTCCCTAGGCTGCCAACCCAACTACTCTCTCCTCCCAC GCCCACGCCCAGCCAGGAAAACCTGGGGCGGGCGGGGTCTGTACCTGAGACCGCTCTCAACGCGGCTTCC GTGTCAGGATGCTCGCTCACAGGAATGCTCATCACAGGCTTGAAAGCCTTTGCCATCCACGCTCTCCGGA GCCCCGAGCGTCTCCAAAGAGCCTGCCCAGGCTTCTCCCCGACCCAGGTGCTTCCTCCCCTGCAGAGCTG TGGCGGGGTTCAGACCCCGATTCCGGGAGAGGACACCTGTCGGGGAAGGGCGGGGCTGGGGGACTGCGGG GCCGCGGCGAGGCTCAGCCGGGAACTACGCTTCCCAGCCTGCTCCGCTGCAGCCGCGCGCCCCGGCGCCG CGCCCGGCCGGGAGCCGCCTGTTGATCGCCGCGCTCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCTGTTCTCCCGGC CCCGCTCCACCGGGGCTGACGGACTGACGGCCAGCACAGCCGGCTCCGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMOD2_1 ↗ | 15:51,751,597 | 正股 | 51,751,548–51,751,607 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR15_83J47R · promoter · 51751427–51751677 · regulatory
ENSR15_5G6MP5 · CTCF_binding_site · 51751455–51751476 · regulatory
ENSR15_9QJLL · promoter · 51751995–51752495 · regulatory
ENSR15_83J48F · enhancer · 51752496–51752669 · regulatory
· motif · 51751218–51751231 · motif
· motif · 51751224–51751237 · motif
· motif · 51751409–51751418 · motif
· motif · 51751457–51751473 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:351 aa
tropomodulin 2 屬於 tropomodulin 家族。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tropomodulin 2 的註解定位為細胞質與細胞骨架;來源未說明其定位變化的條件或動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
tropomodulin 2 與 tropomyosin 的 N 端及 actin 結合。此註解指出的是結合關係,未進一步說明結合條件或提供其他複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tropomodulin 2 在 actin 細絲的 pointed end 阻止細絲延長與解聚。Tmod/TM 複合體有助於形成短的 actin 原絲,該原絲進一步界定 membrane skeleton 的幾何形態;此功能註記為 By similarity。 | 推論支持 | 證據與來源Blocks the elongation and depolymerization of the actin filaments at the pointed end. The Tmod/TM complex contributes to the formation of the short actin protofilament, which in turn defines the geometry of the membrane skeleton (By similarity) |
| 交互作用 | tropomodulin 2 與 tropomyosin 的 N 端以及 actin 結合。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | tropomodulin 2 的註解定位為細胞質與細胞骨架。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTTGATCGCCGCGCTCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCTG40TTCTCCCGGCCCCGCTCCACCGGGGCTGACGGACTGACGG80CCAGCACAGCCGGCTCCGGGATGAGCGCACGGACGGTATT120CTGAAGTCTCAGGAAACTGGACCATTTAAATGTGCATGGC160CCATGAGAAAGGCTTATAAGAAGCCATGGCACTCCCCTTT200CAAAAAGAGCTGGAGAAATACAAGAACATTGATGAAGATG240AGCTTCTTGGCAAACTCTCAGAAGAGGAACTGAAACAGTT280GGAAAATGTTCTAGATGACCTAGATCCTGAGAGTGCCATG320CTGCCAGCTGGATTTCGACAGAAAGACCAGACACAGAAGG360CAGCCACCGGCCCCTTTGACCGCGAGCACCTCCTCATGTA400CCTGGAGAAGGAGGCTTTGGAACAGAAAGACAGAGAGGAC440TTTGTGCCCTTCACTGGAGAAAAGAAAGGGAGAGTCTTTA480TCCCTAAAGAAAAGCCTATAGAAACTCGTAAAGAAGAAAA520AGTGACCCTTGACCCAGAACTGGAAGAAGCTTTGGCCAGT560GCCTCTGACACCGAACTCTATGATCTTGCAGCTGTCCTTG600GAGTACACAATTTGCTCAACAATCCAAAGTTCGATGAAGA640AACAGCCAACAATAAAGGTGGCAAAGGACCTGTCAGAAAT680GTTGTCAAAGGTGAAAAAGTAAAGCCAGTATTTGAGGAAC720CACCAAATCCCACAAATGTGGAAATAAGCCTGCAGCAGAT760GAAAGCCAATGATCCTAGCTTGCAAGAAGTCAACCTCAAC800AACATTAAGAACATTCCAATTCCAACCCTGAGGGAATTTG840CAAAGGCTCTGGAGACCAACACTCACGTGAAGAAGTTCAG880CCTGGCCGCAACTCGCAGCAATGACCCTGTGGCCATTGCT920TTTGCAGACATGCTGAAAGTAAACAAGACCTTGACAAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。