基因總覽
TMF1 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 TATA element modulatory factor 1。其產物與轉錄調節及細胞內運輸相關，但現有資料未提供其蛋白質家族分類或更完整的基本結構描述。來源所列功能包含可能的 Androgen receptor 共活化作用，以及轉錄與蛋白質降解相關活動；這些功能的具體條件與作用方式在下方說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000398559 ★ | 69,019,827–69,052,333 | 17 |
| ENST00000646304 | 69,019,827–69,052,382 | 15 |
| ENST00000646708 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00000936590 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00000948162 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00000948163 | 69,019,827–69,052,382 | 16 |
| ENST00000948164 | 69,019,827–69,052,382 | 16 |
| ENST00000948165 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00000948167 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00001144988 | 69,019,827–69,052,382 | 17 |
| ENST00000948166 | 69,022,332–69,052,382 | 17 |
| ENST00001130572 | 69,046,891–69,052,382 | 2 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TMF1 被描述為 Androgen receptor 的潛在共活化因子，表示它可能協助受體促進轉錄活性；來源沒有進一步交代此作用發生的條件或分子機制，因此不宜將其視為已確立的普遍作用。另一方面，TMF1 可結合 HIV-1 的 TATA element，並抑制 TATA-binding protein（TBP）所促進的轉錄活化，顯示其與轉錄調節有關，且在此描述的系統中作用方向為抑制。
Promoter 與基因調控
>TMF1 ENST00000398559 GRCh38 chr3:69052233-69053333 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGGATTTTGTCTTTAACTTGGGCCCAAACCAAATATAGCTGCAGACTGGATTAGGAAGGCCACCAATTT AAGGTATTTTCCCATGTCCAAATGTTCGAAGAGAATGCACACAGAAAAGGTTATGTTTTAAGTAATATGC ACAGTGCACATTGTTAGGATAACAGCTTTAGTGCTTCCTAGGTGTCTTAGTCCATTTGGACTGCTGTAAC AAATTGCCATAAACTGGGTGGCTTATAAGCAGTAGCAATTTGTTTCTTAACAGTTCTAGAGGCTGAGAAG TCCAAGATAAGGAGCCGGCAGATTTGGTGTCTGGTGAGGGCTGCTATTCTGGCTTAGAGTTGGTGCCTTC TTGCCGTGAGCTCCCTTGGGCCTCTCTTATAAGGGCACTAACCCCATTTATGAGGGCTCCATCATCATCT AATCATCTCCTAAAGGCTCCCCTTAATACTGTCCCATTGGAGATTAGGTTTCAACATAGGAATTTGTGCA GGGGACACCGACAGACCACAGTATTAGGGGTATTTTGACTGCAGCAATGAGTTTACTACTATTTTGAGAG AGAGGTTGTGCTTTATGCACCATGTGTTCCACGAGTTGGACACAGTGTTCATACGTGATCCTGTCTTTTA GGCAAGCCCAAACAAGTGTTTCTCCTTACAATACCAAGTTAATACAGAGCTTATTAAATATTTGAGACAA AGGGCTAAGAGAAGTGTGAGGCCCAATTTCCCTTTGCAATTATTGCTGGCAAGGTGCAAGCTTTTAGCAC GTGAACTATTTTCCTGGAAAGCACACACACGAAAACTTGAATATTCCTTCCGGGGAAATCGACCTCTATC GGTAGCCATAGCTTCCCCTTCGCTAAGAACTGCTGTAAGCACGAAATCGACATCAATAGAAACCCTTCCG CGTTCCTCGGTAACTAACGGCAACCCTGCGCTCCCGGATGTGACGTCAACGTTCTTCTGTTCTTCCGTCT GTCGACCGAACTCTGGGCTCGTAGATTTGGTTGCTGTGTACGTGGAAGAAGCAAGCGCATGCGCACATGG GCCCCCTTCGTCTCAGCTGTGCGGGAACGGCCGAGGGTAACATCCCGGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMF1_1 ↗ | 3:69,052,274 | 負股 | 69,052,264–69,052,323 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_C8T23 · enhancer · 69050780–69052322 · regulatory
ENSR3_932F2H · promoter · 69052323–69052829 · regulatory
ENSR3_5L8J9H · CTCF_binding_site · 69052488–69052509 · regulatory
· motif · 69049116–69049128 · motif
· motif · 69051487–69051495 · motif
· motif · 69051487–69051504 · motif
· motif · 69051830–69051841 · motif
· motif · 69051830–69051841 · motif
· motif · 69052289–69052300 · motif
· motif · 69052289–69052300 · motif
· motif · 69052295–69052306 · motif
· motif · 69052373–69052386 · motif
· motif · 69052373–69052386 · motif
· motif · 69052382–69052391 · motif
· motif · 69052420–69052431 · motif
· motif · 69052420–69052431 · motif
· motif · 69052490–69052506 · motif
· motif · 69052508–69052519 · motif
· motif · 69052510–69052519 · motif
· motif · 69052561–69052577 · motif
· motif · 69052561–69052577 · motif
· motif · 69052746–69052755 · motif
TMF1 在惡性腦腫瘤中被報告為下調；來源未提供此變化的調控機制或其對腫瘤的因果影響。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1093 aa
TMF1 蛋白質長 1,093 個胺基酸。序列註解預測多段無序區，分別位於第 38–80、108–189、229–260、266–285 與 919–939 個胺基酸。第 333–342 位則標註為與 Elongin BC complex 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMF1 被記錄於細胞質、細胞核及 Golgi apparatus 膜；另有資料指出其集中在 cisternae 末端、局部形成的出芽結構。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CMTM5Q96DZ9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NR3C1P04150 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TMF1 是 SNF/SWI transcription factor complexes 的組成成分，並與 RAB6A、STAT3、FER 及 TCEB1 互作。另有資料指出 TMF1 與 TRNP1 互作，且可能調節 TRNP1 的蛋白酶體降解；此降解調節關係標示為依相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TMF1 可能是 Androgen receptor 的共活化因子，並可介導 STAT3 降解。它可能參與兩種依賴 RAB6 的逆向運輸：一種由胞內體至 Golgi，另一種由 Golgi 至 ER。此外，TMF1 可結合 HIV-1 的 TATA element，並抑制 TATA-binding protein（TBP）所促進的轉錄活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Potential coactivator of the androgen receptor. Mediates STAT3 degradation. May play critical roles in two RAB6-dependent retrograde transport processes: one from endosomes to the Golgi and the other from the Golgi to the ER. This protein binds the HIV-1 TATA element and inhibits transcriptional activation by the TATA-binding protein (TBP) PMID 10428808 ↗ · PMID 1409643 ↗ · PMID 15467733 ↗ · PMID 17698061 ↗ |
| 交互作用 | TMF1 與 TRNP1 互作，並可能調節 TRNP1 的蛋白酶體降解；此項作用是依相似性推定。TMF1 是 SNF/SWI transcription factor complexes 的組成成分，並與 RAB6A、STAT3、FER 及 TCEB1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TRNP1; may regulate TRNP1 proteasomal degradation (By similarity). Component of the SNF/SWI transcription factor complexes. Interacts with RAB6A. Interacts with STAT3 and FER. Interacts with TCEB1 PMID 12044884 ↗ · PMID 15467733 ↗ · PMID 17698061 ↗ |
| 細胞定位 | TMF1 被記錄於細胞質、細胞核及 Golgi apparatus 膜，並集中在 cisternae 末端的出芽結構。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Golgi apparatus membrane; Concentrated at the budding structures localized at the tips of cisternae |
| 調控 | TMF1 在惡性腦腫瘤中呈下調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTAGATTTGGTTGCTGTGTACGTGGAAGAAGCAAGCGCAT40GCGCACATGGGCCCCCTTCGTCTCAGCTGTGCGGGAACGG80CCGAGGGTAACATCCCGGGCTCGCGGGAGGCTGTCGGGGT120AATGGCCACACGCTGACAGAACCAGCCGAGTGGAAAAGGG160GAGCGAAGCCGTTCCTCTGCACCCTTCCCCAGGCCTGAGG200CCTTCCCGCTTGGTGCTGCCGCCGCCACTGCCGGCTGAGG240AGGGGCGATGAGTTGGTTCAACGCCTCCCAGCTCTCCAGC280TTCGCTAAGCAGGCCCTGTCCCAGGCCCAGAAGTCTATTG320ACAGGGTTCTGGACATCCAGGAAGAGGAGCCGAGCATCTG360GGCCGAGACCATTCCGTATGGAGAGCCGGGAATAAGTTCC400CCTGTCAGTGGAGGATGGGATACTTCAACCTGGGGGTTGA440AATCAAACACTGAACCTCAGAGTCCACCAATAGCCTCTCC480TAAAGCAATCACAAAGCCAGTTCGGAGGACTGTGGTCGAT520GAATCTGAAAATTTCTTCAGTGCCTTTCTCTCGCCAACTG560ATGTCCAGACCATTCAGAAGAGTCCAGTGGTATCAAAACC600TCCAGCAAAATCACAACGACCAGAAGAAGAAGTGAAAAGC640AGCTTACATGAATCCTTGCACATTGGCCAGTCAAGAACTC680CTGAAACAACTGAATCACAAGTAAAAGACTCTTCTTTGTG720TGTTTCAGGGGAAACTCTGGCAGCAGGTACTTCATCACCT760AAAACTGAAGGCAAGCACGAAGAAACTGTTAATAAAGAAT800CGGATATGAAGGTGCCAACTGTAAGTTTGAAAGTATCTGA840AAGTGTAATTGATGTGAAAACAACTATGGAAAGTATATCT880AATACGTCTACGCAGTCTCTCACAGCAGAAACAAAGGACA920TAGCTTTGGAACCTAAGGAACAAAAACATGAAGACAGGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。