基因總覽
TMEM9B（TMEM9 domain family member B）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 TMEM9 family。蛋白質長 198 個胺基酸，序列註解包含位於第 1 至 33 個胺基酸的訊號胜肽，以及第 105 至 125 個胺基酸的單次跨膜區。其已知角色涉及促發炎細胞激素生成，也與 TNF 啟動的訊息傳遞有關；相關作用細節見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000534025 ★ | 8,947,202–8,964,442 | 5 |
| ENST00000309134 | 8,946,992–8,964,441 | 4 |
| ENST00000525069 | 8,946,992–8,965,011 | 5 |
| ENST00000931335 | 8,946,992–8,964,974 | 4 |
| ENST00000981125 | 8,946,992–8,964,974 | 6 |
| ENST00001034130 | 8,946,992–8,964,974 | 6 |
| ENST00001138069 | 8,946,992–8,964,974 | 5 |
| ENST00000931334 | 8,947,294–8,964,974 | 5 |
| ENST00000528117 | 8,952,692–8,964,402 | 3 |
| ENST00000530136 | 8,953,262–8,964,180 | 5 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TMEM9B 可增強由 TNF、IL1B 或 TLR 配體誘導的促發炎細胞激素生成。這表示在這些刺激條件下，TMEM9B 與細胞激素產生量的提升有關；來源未進一步指出涉及哪些特定細胞激素，也未描述其直接作用於生成流程的哪個步驟。
此外，TMEM9B 參與 TNF 對 NF-kappaB 與 MAPK 兩條訊息傳遞途徑的活化。此功能描述限於 TNF 誘發的途徑活化，並未提供 TMEM9B 如何影響兩條途徑的分子機制。綜合而言，現有資料支持 TMEM9B 在特定促發炎刺激下促進細胞激素生成，並參與 TNF 相關訊息傳遞；尚不足以據此推定其作用方式或其他生物學效應。
Promoter 與基因調控
>TMEM9B ENST00000534025 GRCh38 chr11:8964342-8965442 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAATCTGTTTACAGAGGTAAAAACACGGGTATTACATGGAGCATAATTTGAAATCCATTCCCTCATATTC AGCCAAGAACTACAGGCCCAGAGAAGGGAAGTGATTTGCCAAAGGTCATTCAACAAATCCCTAGGGGCTG TGATGATCCGTGTCCTTGCCATTACCTCCCTTGTCTCCACTAACAAAAATATTTCAATGGGAGAATGTGC CGATCTAAGGCACTCCTAAAGTACTTGCTGAGAATGACAGCCCTGGGGAGACAGGTCGGCAGCCCTGAAC AGGCACTGCCTTACCCGGGCGTAGTGCCCCAATTCGCCACCTCTTGGAGTCCTAGGCGGAGGATACTACT GGGGCAGTTGTTTCGCCAATTCCACATCTCCCGGAGCCTGGCCTGGCCCAGCCCAGCCCCGTCGCTGTGA CCCACTTCCTAGCTGCAGGCTGGACCAAGGGGAGGCACATGGGGAGCTCCACAGGGAGGCCACGCCCACG AGGGCAGCTCACAGAATTAGAAAGCCGACGGGGTGCTGTGGTCAGGAGGCGCGTGGGCGGCAGGTTAGTA CTTAAGGTGCAGAGACCACCCCCAACCCTTTGACTGGCGGTGGGCATCCCGGAAAGGCATGGCTCGGCCA ATTCCAGCCCCGTTTCCACGCTCAGCACCCGCCCTGCCTGTGCGCGAACGGCTCCGGCCCGCACGGGTCG CCAGAGGCGACTGTGTGACACTCGGAGTTTGCTGGGGTCTCCGTGGGCGGGAGGACTTTCCAGCGCAATG GCGACTCCCTAAGCCCCGCAGCTTCTGCGCCCGGGAAAGATATCCAAGAGATGCAAAGCTCTACTGGGCC CAGGCTGCCACCCCAGAGGCCCCCTTCCGTCCCGGGGCCGGGGCTAGGCCAAGGCGGGCACCAGGACTGC CCAGCCTCCCGGCCCTTCGCACTGGTAACCGGTTCCGGGGCGGATGCTTTTTGCATCTGACCCGGCGCGC CCGGTGACGCCTTCGCGTCCAGACGGAAGTGCGGGCGGAGGATCCCCAGCCGGGTCCCAAGCCTGTGCCT GAGCCTGAGCCTGAGCCTGAGCCCGAGCCGGGAGCCGGTCGCGGGGGCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMEM9B_1 ↗ | 11:8,964,442 | 負股 | 8,964,432–8,964,491 |
| TMEM9B_2 ↗ | 11:8,964,740 | 負股 | 8,964,730–8,964,789 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_B3R29 · enhancer · 8959426–8960096 · regulatory
ENSR11_544WBC · CTCF_binding_site · 8959748–8959769 · regulatory
ENSR11_8954W · enhancer · 8962889–8963117 · regulatory
ENSR11_95K3P · promoter · 8963710–8964210 · regulatory
ENSR11_95K3X · promoter · 8964392–8964891 · regulatory
ENSR11_7J8B4 · enhancer · 8964892–8965000 · regulatory
ENSR11_95K45 · promoter · 8965001–8965501 · regulatory
ENSR11_544X87 · CTCF_binding_site · 8965112–8965133 · regulatory
· motif · 8959750–8959766 · motif
· motif · 8962716–8962727 · motif
· motif · 8962718–8962727 · motif
· motif · 8962778–8962789 · motif
· motif · 8963060–8963066 · motif
· motif · 8964305–8964315 · motif
· motif · 8964432–8964441 · motif
· motif · 8964432–8964443 · motif
· motif · 8964432–8964443 · motif
· motif · 8964667–8964677 · motif
· motif · 8964689–8964700 · motif
· motif · 8964690–8964700 · motif
· motif · 8964692–8964705 · motif
· motif · 8964694–8964711 · motif
· motif · 8964887–8964903 · motif
· motif · 8964887–8964903 · motif
· motif · 8964892–8964905 · motif
· motif · 8964949–8964962 · motif
· motif · 8964954–8964964 · motif
· motif · 8965114–8965130 · motif
· motif · 8965304–8965317 · motif
· motif · 8965304–8965317 · motif
· motif · 8968133–8968145 · motif
· motif · 8968201–8968213 · motif
· motif · 8968203–8968210 · motif
· motif · 8968203–8968218 · motif
· motif · 8968456–8968468 · motif
· motif · 8968458–8968465 · motif
· motif · 8968458–8968473 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：198 aa
TMEM9B 蛋白質長 198 個胺基酸，屬於 TMEM9 family。序列註解標示第 1 至 33 個胺基酸為訊號胜肽，第 105 至 125 個胺基酸為螺旋型跨膜區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMEM9B 被定位於溶小體膜與早期胞內體膜，兩處皆註記為單次跨膜蛋白。 資料未指出定位是否會隨條件改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- FKBP6O75344 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TMEM9B 可增強 TNF、IL1B 與 TLR 配體所誘導的促發炎細胞激素生成；此外，TMEM9B 參與 TNF 對 NF-kappaB 及 MAPK 訊息傳遞途徑的活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Enhances production of pro-inflammatory cytokines induced by TNF, IL1B, and TLR ligands. Has a role in TNF activation of both the NF-kappaB and MAPK pathways PMID 18541524 ↗ |
| 細胞定位 | TMEM9B 定位於溶小體膜及早期胞內體膜，兩處均註記為單次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Lysosome membrane / Single-pass membrane protein; Early endosome membrane / Single-pass membrane protein PMID 18541524 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACGGAAGTGCGGGCGGAGGATCCCCAGCCGGGTCCCAA40GCCTGTGCCTGAGCCTGAGCCTGAGCCTGAGCCCGAGCCG80GGAGCCGGTCGCGGGGGCTCCGGGCTGTGGGACCGCTGGG120CCCCCAGCGATGGCGACCCTGTGGGGAGGCCTTCTTCGGC160TTGGCTCCTTGCTCAGCCTGTCGTGCCTGGCGCTTTCCGT200GCTGCTGCTGGCGCAGCTGTCAGACGCCGCCAAGAATTTC240GAGGATGTCAGATGTAAATGTATCTGCCCTCCCTATAAAG280AAAATTCTGGGCATATTTATAATAAGAACATATCTCAGAA320AGATTGTGATTGCCTTCATGTTGTGGAGCCCATGCCTGTG360CGGGGGCCTGATGTAGAAGCATACTGTCTACGCTGTGAAT400GCAAATATGAAGAAAGAAGCTCTGTCACAATCAAGGTTAC440CATTATAATTTATCTCTCCATTTTGGGCCTTCTACTTCTG480TACATGGTATATCTTACTCTGGTTGAGCCCATACTGAAGA520GGCGCCTCTTTGGACATGCACAGTTGATACAGAGTGATGA560TGATATTGGGGATCACCAGCCTTTTGCAAATGCACACGAT600GTGCTAGCCCGCTCCCGCAGTCGAGCCAACGTGCTGAACA640AGGTAGAATATGCACAGCAGCGCTGGAAGCTTCAAGTCCA680AGAGCAGCGAAAGTCTGTCTTTGACCGGCATGTTGTCCTC720AGCTAATTGGGAATTGAATTCAAGGTGACTAGAAAGAAAC760AGGCAGACAACTGGAAAGAACTGACTGGGTTTTGCTGGGT800TTCATTTTAATACCTTGTTGATTTCACCAACTGTTGCTGG840AAGATTCAAAACTGGAAGCAAAAACTTGCTTGATTTTTTT880TTCTTGTTAACGTAATAATAGAGACATTTTTAAAAGCACA920CAGCTCAAAGTCAGCCAATAAGTCTTTTCCTATTTGTGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。