演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TMEM245CG-2

transmembrane protein 245

TMEM245 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens9q31.3UniProt Q9H330
OFFICIAL SYMBOL
TMEM245
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q9H330
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TMEM245 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 transmembrane protein 245。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q31.3。

Official symbol
TMEM245
Gene name
transmembrane protein 245
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1363
UniProt
Q9H330
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CG-2C9orf5

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q31.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTMEM245pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:109,015,135–109,119,975
Gene span
104,841 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374586 ★109,015,135–109,119,94718
ENST00000413712109,015,135–109,119,97517
ENST00000894208109,015,135–109,119,97517
ENST00000894209109,015,135–109,119,97516
ENST00000894210109,015,135–109,119,97516
ENST00000894211109,015,135–109,119,97517
ENST00000894212109,015,135–109,119,97517
ENST00000894213109,015,135–109,119,97516
ENST00000894214109,015,135–109,119,97518
ENST00000894215109,015,135–109,119,97515
ENST00000894216109,015,135–109,119,97516
ENST00000894217109,015,135–109,119,97516

顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 109119947 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TMEM245 ENST00000374586 GRCh38 chr9:109119847-109120947 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATGGGTAGCAGGCTTGGATCCCAGCACTTTTCCAATAGGGGAACAGAAGCACCTTGTACCGCCCCAGAG
TTTCCCTTCCCCCACACAATAACCCTAAAGCAAAAGCTATTATTATTATCATCGCCATGTGACAGAGGAA
AACTTGAGATTGGGGGCTTAACTGACATTACATCAAGTCTCAAAAAGAAACAGTGGCAGTTTGAGACTTT
GATCTACGACTCTTTTAAGAGTTTAGATTGCGTCCACAGCGAAACCTGCACAAACAGTTGTCAACAGCGG
CTGCAAATTACAGGCTTATGAGGAACGTTTGAAAAATGCCAAGAGTTCTTTCCTCAGGCCAAATACTATG
GTAGATAAAAGTATAGCCTTTGGAGCCAGAATCCCTGAGTTTGAATCTTGCCTGTGCCACTTGGTAGCTG
TGTGACTCTGGCTGCGTACTTAACGGCTCTGTCTCAGTTTTTCTGTTGGTAAAATGAGGATAATAACACC
TTCTTTGTAGGGTTGTTCTAAGGATTAAATGAGTTAATAGGAGTGAGCCACTTAGAATAGGGCCTGTTAT
ATGGTAATCTCTATTTAAAATCCTGTCAGATACACCAAAGAAAACACTTTAAAAATATCTGTTAAATAAA
TCAGTAAAACAGAATCGGGGCATTGGTTCTTTAAAAGTACTCCCCCACGGTATTCTAGTATGCAGCTTGG
GTTTTAATATCTGAATGTGGCGCCTTTTGGGATCTCGCCTCGCGAGAAATTGACATTAACGAATGAGTGA
AAGGAGCTTCCCCCCCCCCCCCCCTCCAGGAAGATATAGACCCTGCAAACTTGTTAGCAGGACCTTGCGG
ACACCAAGGAGGCGGAGGCGTTTTCCCCATTTCCCCTTCGGGAGTTGTAGTTTCCTGCAAGCGCTTGGTG
GGTCTGTAAACCAGCGGGGAACTACAACTCCCACAATCTCGCGCGCCTCCCGCCCTGCCTCCCGCCCGCG
TTTCTAGCCCGACTCCCATTACCGCCCCTCGGGGGCGGCTGTGGCGGAGGAACGATGGCCGACGGCGGCG
GCCCTAAGGACGCGCCAAGCCTGCGGAGCTCTCCCGGGCCGGCGCCGCGGG
TMEM245 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TMEM245_1 ↗9:109,119,927負股109,119,917–109,119,976

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_BRMN9 · enhancer · 109114296–109115113 · regulatory

ENSR9_857LQ2 · enhancer · 109116222–109116386 · regulatory

ENSR9_93LBF5 · promoter · 109119927–109120437 · regulatory

ENSR9_857LSZ · enhancer · 109121341–109121572 · regulatory

ENSR9_BRMPJ · enhancer · 109123145–109123667 · regulatory

· motif · 109115293–109115305 · motif

· motif · 109115805–109115817 · motif

· motif · 109116522–109116533 · motif

· motif · 109116831–109116842 · motif

· motif · 109116909–109116923 · motif

· motif · 109116909–109116923 · motif

· motif · 109118303–109118309 · motif

· motif · 109118331–109118344 · motif

· motif · 109118331–109118344 · motif

· motif · 109118522–109118536 · motif

· motif · 109118523–109118536 · motif

· motif · 109119225–109119234 · motif

· motif · 109119393–109119402 · motif

· motif · 109119793–109119808 · motif

· motif · 109119929–109119942 · motif

· motif · 109120004–109120014 · motif

· motif · 109120066–109120080 · motif

· motif · 109120086–109120099 · motif

· motif · 109120153–109120163 · motif

· motif · 109120154–109120164 · motif

· motif · 109120155–109120165 · motif

· motif · 109120156–109120166 · motif

· motif · 109120157–109120167 · motif

· motif · 109120158–109120168 · motif

· motif · 109120159–109120169 · motif

· motif · 109120456–109120468 · motif

· motif · 109123105–109123118 · motif

· motif · 109123119–109123128 · motif

· motif · 109123119–109123128 · motif

· motif · 109123221–109123232 · motif

· motif · 109123281–109123292 · motif

· motif · 109123329–109123342 · motif

· motif · 109123342–109123353 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:879 aa

1 aa879 aa功能區域跨膜區
依 Q9H330 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TMEM245 的蛋白質長 879 個胺基酸,屬於 autoinducer-2 exporter (AI-2E) (TC 2.A.86) 家族。序列註解預測其含有 14 段螺旋型跨膜區域,另有兩段無序區,分別位於胺基酸 1–36 與 293–339。

跨膜區Helical60–80 aa
跨膜區Helical119–139 aa
跨膜區Helical148–168 aa
跨膜區Helical185–205 aa
跨膜區Helical219–239 aa
跨膜區Helical241–261 aa
跨膜區Helical354–374 aa
跨膜區Helical377–397 aa
跨膜區Helical460–480 aa
跨膜區Helical626–646 aa
跨膜區Helical650–670 aa
跨膜區Helical732–752 aa
跨膜區Helical776–796 aa
跨膜區Helical815–835 aa
功能區域Disordered1–36 aa
功能區域Disordered293–339 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H330…

AlphaFold · Q9H330

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

TMEM245 被註解為多次穿膜的膜蛋白;此定位描述未進一步指定其所在的膜區室或細胞內位置。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位TMEM245 被描述為膜蛋白,並具有多次穿越膜的特徵;此敘述未提供更具體的膜區室或細胞內定位資訊。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374586 · 7,999 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCGCCCCTCGGGGGCGGCTGTGGCGGAGGAACGATGGCC40
41GACGGCGGCGGCCCTAAGGACGCGCCAAGCCTGCGGAGCT80
81CTCCCGGGCCGGCGCCGCGGGTCCCGCGCGCGGTCGGGCC120
121GAGTGGCGGTGGCGGGGAGACCCCGCGGACCGCGGCGCTG160
161GCGCTGCGCTTCGACAAGCCCATTAAGCAGGCCTTCTACA200
201ACACCGGGGCCGTGCTGTTCGTGTGCCTGTGCTGCGGCGC240
241CGCGGTGCTGGTCTACTTCATCCTGGAGGCCTTCCTGCGG280
281CCGCTGCTCTGGGCCGTGCTATGCGGCACTTTTCTGCACC320
321CCTTCAAGAGCTCGCTGACGCGCCTGGGCCGCCACTGGCT360
361GCAGCGCCTGCACCGCGCGCACACGCCCATCGTCCTGGCC400
401GCGCTGCTCCTGCCGCTCTGCTTCGTCGACTACGGCGTCG440
441AGGCCCTGGGCGAGCAGGCGCTGCGCCGCCGCCGCCTGCT480
481CCTGCTGCTCGGCGCCGGCGGCCCGCTCCTGTACGGCCTC520
521TACTGCCTCGGCAGCTACTTGGGCGTGCAGGTGCTGCTGG560
561TGCACGCTGCCACGCTCATCTGCCGCGGGCTGGACTACTT600
601CAGCAGCCTGTGGATCTGGACGTTGGTGGTTGGCTATGTG640
641TTGACTGTTTCATTCAAGTGGAATGCAAGCACTGAACGCT680
681ACTTGAGAGCAGTTTCAATTCCTGTCTGGATTATATTGCT720
721TTTTCATTTAGCATCCCTGGCTGGCTCATGGAGAATTCCA760
761GTATTCCTGGTTATTGTTTTCCTGATGTCTGTGGGTACCC800
801TCTATGAAAAACAGAATGGAAAAGAGTCTTCTGGGGCAGA840
841GTTACCAGGGCAGGTTATCTCCATGGCAGCTTCTACTCTG880
881GCAAACTTGGCCATCTCTATCACAGGGTATGAATCAAGCA920
921GTGAAGACCAGCCCTCCACTCAGCCTGCAGAAGCAGTGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。