基因總覽
TMEM245 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 transmembrane protein 245。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q31.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374586 ★ | 109,015,135–109,119,947 | 18 |
| ENST00000413712 | 109,015,135–109,119,975 | 17 |
| ENST00000894208 | 109,015,135–109,119,975 | 17 |
| ENST00000894209 | 109,015,135–109,119,975 | 16 |
| ENST00000894210 | 109,015,135–109,119,975 | 16 |
| ENST00000894211 | 109,015,135–109,119,975 | 17 |
| ENST00000894212 | 109,015,135–109,119,975 | 17 |
| ENST00000894213 | 109,015,135–109,119,975 | 16 |
| ENST00000894214 | 109,015,135–109,119,975 | 18 |
| ENST00000894215 | 109,015,135–109,119,975 | 15 |
| ENST00000894216 | 109,015,135–109,119,975 | 16 |
| ENST00000894217 | 109,015,135–109,119,975 | 16 |
顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TMEM245 ENST00000374586 GRCh38 chr9:109119847-109120947 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TATGGGTAGCAGGCTTGGATCCCAGCACTTTTCCAATAGGGGAACAGAAGCACCTTGTACCGCCCCAGAG TTTCCCTTCCCCCACACAATAACCCTAAAGCAAAAGCTATTATTATTATCATCGCCATGTGACAGAGGAA AACTTGAGATTGGGGGCTTAACTGACATTACATCAAGTCTCAAAAAGAAACAGTGGCAGTTTGAGACTTT GATCTACGACTCTTTTAAGAGTTTAGATTGCGTCCACAGCGAAACCTGCACAAACAGTTGTCAACAGCGG CTGCAAATTACAGGCTTATGAGGAACGTTTGAAAAATGCCAAGAGTTCTTTCCTCAGGCCAAATACTATG GTAGATAAAAGTATAGCCTTTGGAGCCAGAATCCCTGAGTTTGAATCTTGCCTGTGCCACTTGGTAGCTG TGTGACTCTGGCTGCGTACTTAACGGCTCTGTCTCAGTTTTTCTGTTGGTAAAATGAGGATAATAACACC TTCTTTGTAGGGTTGTTCTAAGGATTAAATGAGTTAATAGGAGTGAGCCACTTAGAATAGGGCCTGTTAT ATGGTAATCTCTATTTAAAATCCTGTCAGATACACCAAAGAAAACACTTTAAAAATATCTGTTAAATAAA TCAGTAAAACAGAATCGGGGCATTGGTTCTTTAAAAGTACTCCCCCACGGTATTCTAGTATGCAGCTTGG GTTTTAATATCTGAATGTGGCGCCTTTTGGGATCTCGCCTCGCGAGAAATTGACATTAACGAATGAGTGA AAGGAGCTTCCCCCCCCCCCCCCCTCCAGGAAGATATAGACCCTGCAAACTTGTTAGCAGGACCTTGCGG ACACCAAGGAGGCGGAGGCGTTTTCCCCATTTCCCCTTCGGGAGTTGTAGTTTCCTGCAAGCGCTTGGTG GGTCTGTAAACCAGCGGGGAACTACAACTCCCACAATCTCGCGCGCCTCCCGCCCTGCCTCCCGCCCGCG TTTCTAGCCCGACTCCCATTACCGCCCCTCGGGGGCGGCTGTGGCGGAGGAACGATGGCCGACGGCGGCG GCCCTAAGGACGCGCCAAGCCTGCGGAGCTCTCCCGGGCCGGCGCCGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMEM245_1 ↗ | 9:109,119,927 | 負股 | 109,119,917–109,119,976 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BRMN9 · enhancer · 109114296–109115113 · regulatory
ENSR9_857LQ2 · enhancer · 109116222–109116386 · regulatory
ENSR9_93LBF5 · promoter · 109119927–109120437 · regulatory
ENSR9_857LSZ · enhancer · 109121341–109121572 · regulatory
ENSR9_BRMPJ · enhancer · 109123145–109123667 · regulatory
· motif · 109115293–109115305 · motif
· motif · 109115805–109115817 · motif
· motif · 109116522–109116533 · motif
· motif · 109116831–109116842 · motif
· motif · 109116909–109116923 · motif
· motif · 109116909–109116923 · motif
· motif · 109118303–109118309 · motif
· motif · 109118331–109118344 · motif
· motif · 109118331–109118344 · motif
· motif · 109118522–109118536 · motif
· motif · 109118523–109118536 · motif
· motif · 109119225–109119234 · motif
· motif · 109119393–109119402 · motif
· motif · 109119793–109119808 · motif
· motif · 109119929–109119942 · motif
· motif · 109120004–109120014 · motif
· motif · 109120066–109120080 · motif
· motif · 109120086–109120099 · motif
· motif · 109120153–109120163 · motif
· motif · 109120154–109120164 · motif
· motif · 109120155–109120165 · motif
· motif · 109120156–109120166 · motif
· motif · 109120157–109120167 · motif
· motif · 109120158–109120168 · motif
· motif · 109120159–109120169 · motif
· motif · 109120456–109120468 · motif
· motif · 109123105–109123118 · motif
· motif · 109123119–109123128 · motif
· motif · 109123119–109123128 · motif
· motif · 109123221–109123232 · motif
· motif · 109123281–109123292 · motif
· motif · 109123329–109123342 · motif
· motif · 109123342–109123353 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:879 aa
TMEM245 的蛋白質長 879 個胺基酸,屬於 autoinducer-2 exporter (AI-2E) (TC 2.A.86) 家族。序列註解預測其含有 14 段螺旋型跨膜區域,另有兩段無序區,分別位於胺基酸 1–36 與 293–339。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMEM245 被註解為多次穿膜的膜蛋白;此定位描述未進一步指定其所在的膜區室或細胞內位置。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | TMEM245 被描述為膜蛋白,並具有多次穿越膜的特徵;此敘述未提供更具體的膜區室或細胞內定位資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCGCCCCTCGGGGGCGGCTGTGGCGGAGGAACGATGGCC40GACGGCGGCGGCCCTAAGGACGCGCCAAGCCTGCGGAGCT80CTCCCGGGCCGGCGCCGCGGGTCCCGCGCGCGGTCGGGCC120GAGTGGCGGTGGCGGGGAGACCCCGCGGACCGCGGCGCTG160GCGCTGCGCTTCGACAAGCCCATTAAGCAGGCCTTCTACA200ACACCGGGGCCGTGCTGTTCGTGTGCCTGTGCTGCGGCGC240CGCGGTGCTGGTCTACTTCATCCTGGAGGCCTTCCTGCGG280CCGCTGCTCTGGGCCGTGCTATGCGGCACTTTTCTGCACC320CCTTCAAGAGCTCGCTGACGCGCCTGGGCCGCCACTGGCT360GCAGCGCCTGCACCGCGCGCACACGCCCATCGTCCTGGCC400GCGCTGCTCCTGCCGCTCTGCTTCGTCGACTACGGCGTCG440AGGCCCTGGGCGAGCAGGCGCTGCGCCGCCGCCGCCTGCT480CCTGCTGCTCGGCGCCGGCGGCCCGCTCCTGTACGGCCTC520TACTGCCTCGGCAGCTACTTGGGCGTGCAGGTGCTGCTGG560TGCACGCTGCCACGCTCATCTGCCGCGGGCTGGACTACTT600CAGCAGCCTGTGGATCTGGACGTTGGTGGTTGGCTATGTG640TTGACTGTTTCATTCAAGTGGAATGCAAGCACTGAACGCT680ACTTGAGAGCAGTTTCAATTCCTGTCTGGATTATATTGCT720TTTTCATTTAGCATCCCTGGCTGGCTCATGGAGAATTCCA760GTATTCCTGGTTATTGTTTTCCTGATGTCTGTGGGTACCC800TCTATGAAAAACAGAATGGAAAAGAGTCTTCTGGGGCAGA840GTTACCAGGGCAGGTTATCTCCATGGCAGCTTCTACTCTG880GCAAACTTGGCCATCTCTATCACAGGGTATGAATCAAGCA920GTGAAGACCAGCCCTCCACTCAGCCTGCAGAAGCAGTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。