演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TMEM237JBTS14

transmembrane protein 237

TMEM237 是多次跨膜蛋白,位於初級纖毛的 transition zone,並參與纖毛形成。

Homo sapiens2q33.1UniProt Q96Q45
OFFICIAL SYMBOL
TMEM237
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q96Q45
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TMEM237(transmembrane protein 237)是蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 TMEM237 family。其產物為多次跨膜膜蛋白,蛋白質序列包含多個螺旋型跨膜區域。TMEM237 是初級纖毛 transition zone 的組成部分;其細胞定位與膜蛋白特徵,構成認識此蛋白質的基本資訊。

Official symbol
TMEM237
Gene name
transmembrane protein 237
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14432
UniProt
Q96Q45
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
JBTS14ALS2CR4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q33.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegTMEM237pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:201,620,184–201,643,570
Gene span
23,387 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000409883 ★201,620,186–201,643,50313
ENST00000409444201,620,184–201,642,94413
ENST00000621467201,620,184–201,642,67013
ENST00001137740201,620,184–201,643,50313

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TMEM237 是初級纖毛 transition zone 的組成部分,並且是纖毛形成所必需的蛋白質。這兩項資訊指出,TMEM237 不只是位於纖毛相關區域,也與纖毛生成過程有直接的功能關聯;不過,現有資料未進一步說明它在纖毛形成中的具體分子步驟或作用方式。

初級纖毛的 transition zone 是來源所指明的功能位置,TMEM237 在此區域的組成角色與其纖毛形成必要性相互呼應。依據目前提供的資料,可以確認其功能重點涵蓋此區域的組成及纖毛生成,但不能據此推定更細的調控機制、下游作用或對其他生物學過程的影響。

因此,來源支持的功能描述集中於兩個層次:TMEM237 是初級纖毛 transition zone 的一部分,以及它對 ciliogenesis(纖毛形成)不可或缺。現有資料未提供不同細胞或實驗條件下的功能差異,也未界定其必要性涉及纖毛形成的哪一階段。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 201643503 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TMEM237 ENST00000409883 GRCh38 chr2:201643403-201644503 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGCTAAATAAAACGCCTAAACTTCTTCCATTGTGAGATTAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAGCAAAC
TGGCTGAAAGTGGTTAGTACTAACACGGATGGCTACCTGGAGTCTGTACAAAATGAGCTTGCTGGCGTCA
CAGCTTGAATCTTTCCCCATGTTTCACACTGACTCCCTCCAAAATTTGCACATGCGACCCATGAAGGGAC
ATGAAGAGGTAACTGCGAACGCCAGAGGATTTTCCAGATGGCTTCTTTCCTTCCACCAATCACCTACTAA
TCCCAGAATCCACCCCCTAAACGTTTTCTAATAAAAATACTGTCTTAAAGCCAACACAGGGAGACAGATT
AGAGCTATACTCCTGTCTCCTTGTTAGCTGACTCACAATGAAAACTTTTCTCAAAAAATCAGCGCCATAA
TATTGGCTTCTGTGCGTATAGGGCAACAAGCCCCGTTTGTTTGGTAACAAGATTAGGATGCCATTACAAA
GTGCTGTTTCTCTTTCTTTCCCCAGATTTGAGATTTCCAGGCGCTTTCCCTGTCCCTGTATCTGTTCATC
TTCTGCATCATTCTCTTCTCCATATCCACACCATTCTTCCATCTTTCCCATTTCTTTCTTAACTGTAAAA
CAGAATGCATGATTCAAAATATTTGTAGTTCTCTGTTACTTAAAGTGAAAGTTATCTTTAAAAAAAAACA
AACCCAACCAAACCAAACGATGCAAATCAGGTAGTTTGTAGTGATATTTATGTGAGGTTGGATTTGATTT
TAAGGTTGAGAAAAAGTTTTTCCAAATTTGATTTACACAGTTGTGGGATGAAGGGTAAGCAATCGGAGAA
AATGTGAGAATTGCCTATATTAATACACATCCACACACCCAGGCCTGCACAGACTCGTTGGTCCTGGAGA
GTAAACGCATTCCTCCCAAACCCAGCAGCGCCTGGCAGGACAGAGGCGGGCGGGGACCTGGCTCAGGGGG
CGGCTGCCTCGCCAGGCGCCACGAAGCCCCGGCGTCCCACAGGTCCCGGAGGCCGCTGCGTCGCGGGGAG
CTGGGCTCGGGCCGCCGGCGGTTGCGCCGGGGCAGCCCCGCGGGGAGAGCA
TMEM237 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TMEM237_1 ↗2:201,642,670負股201,642,660–201,642,719

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_B3H2GQ · enhancer · 201641765–201642659 · regulatory

ENSR2_B3H2GW · promoter · 201642660–201643408 · regulatory

ENSR2_94Z2XZ · promoter · 201643493–201643993 · regulatory

· motif · 201642664–201642673 · motif

· motif · 201642700–201642711 · motif

· motif · 201642700–201642711 · motif

· motif · 201642771–201642779 · motif

· motif · 201642934–201642945 · motif

· motif · 201642941–201642957 · motif

· motif · 201643071–201643093 · motif

· motif · 201643071–201643093 · motif

· motif · 201643120–201643135 · motif

· motif · 201644817–201644828 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:408 aa

1 aa408 aa功能區域跨膜區
依 Q96Q45 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TMEM237 蛋白質長 408 個胺基酸,屬於 TMEM237 family。序列註解指出,前 137 個胺基酸區段為無序區;另有四段螺旋型跨膜區,分別位於第 227–247、268–288、303–323 與 358–378 個胺基酸。這些區域資訊描述其序列特徵,不代表未提供的結構或功能細節。

跨膜區Helical227–247 aa
跨膜區Helical268–288 aa
跨膜區Helical303–323 aa
跨膜區Helical358–378 aa
功能區域Disordered1–137 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96Q45…

AlphaFold · Q96Q45

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Cell projection, cilium

TMEM237 是多次跨膜膜蛋白,定位於細胞突起中的初級纖毛,並觀察到位於纖毛近端區域,符合其處於 transition zone 的定位。 RPGRIP1L 將 TMEM237 錨定於 transition zone。

未繪示構造:Membrane;Cell projection, cilium。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
JBTS14TMEM237CFTRABHD16AADAM33ADIPOQAPODAPOL3AQP1ARLNATP13A1BET1BLCAPBNIP2BTN2A2CBLIFCCDC167CD53CDS1CFHR5CLDN4CLN6CNIH3CXCL9CYB5BEFNA5EMC6ERMP1EXTL1FKBP14FXYD6FZD7GJB2GKN2GPR152GPR25GPR42GRM2GUCA2AGYPAIER3IP1IFNGR1IGFBP5INSIG1INSIG2JAGN1LATLEPROTL1LPAR3LRP10LTAMFF
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 119 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TMEM237 是 tectonic-like complex(亦稱 B9 complex)的組成部分;來源另指出它與 TMEM107 互作。資料未進一步說明 TMEM107 是否透過該複合體與 TMEM237 結合,或此互作所產生的功能結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 TMEM237 的變異與 Joubert syndrome 14(JBTS14)相關。此病為自體隱性疾病,特徵包括嚴重智能障礙、肌張力低下、嬰兒期呼吸異常及特殊面容;影像學可見小腦蚓部發育不全或缺如、小腦上腳增厚並改變方向,以及腳間窩異常擴大,形成軸位影像上的 molar tooth sign。其他可變表現包括腎病、眼球運動異常及軸後多指症。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TMEM237 是初級纖毛 transition zone 的組成部分,也是纖毛形成所必需的蛋白質。此資料指出其與該區域及纖毛生成的關聯,但未說明具體分子機制或參與的形成階段。含實驗來源
證據與來源

Component of the transition zone in primary cilia. Required for ciliogenesis

PMID 22152675 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TMEM237 是 tectonic-like complex 的一部分,此複合體亦稱 B9 complex;資料另指出 TMEM237 與 TMEM107 互作,未提供互作方式或其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Part of the tectonic-like complex (also named B9 complex). Interacts with TMEM107

PMID 26595381 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TMEM237 是多次跨膜膜蛋白,定位於細胞突起中的初級纖毛。觀察到其位於纖毛近端區域,與 transition zone 定位相符;RPGRIP1L 將 TMEM237 錨定於該區域。含實驗來源
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Cell projection, cilium; Localizes at the proximal region of primary cilia were observed, consistent with localization to the transition zone. Anchored to the transition zone by RPGRIP1L

PMID 22152675 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 TMEM237 的變異與自體隱性疾病 Joubert syndrome 14(JBTS14)相關。表現包括嚴重智能障礙、肌張力低下、嬰兒期呼吸異常與特殊面容;影像特徵有小腦蚓部發育不全或缺如、小腦上腳增厚且方向改變、腳間窩擴大所形成的 molar tooth sign。腎病、眼球運動異常及軸後多指症也可能出現。含實驗來源
證據與來源

Joubert syndrome 14 JBTS14 An autosomal recessive disorder characterized by severe intellectual disability, hypotonia, breathing abnormalities in infancy, and dysmorphic facial features. Neuroradiologically, it is characterized by cerebellar vermian hypoplasia/aplasia, thickened and reoriented superior cerebellar peduncles, and an abnormally large interpeduncular fossa, giving the appearance of a molar tooth on transaxial slices (molar tooth sign). Additional variable features include renal disease, abnormal eye movements, and postaxial polydactyly. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614424

PMID 22152675 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000409883 · 5,399 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACGAAGCCCCGGCGTCCCACAGGTCCCGGAGGCCGCTGCG40
41TCGCGGGGAGCTGGGCTCGGGCCGCCGGCGGTTGCGCCGG80
81GGCAGCCCCGCGGGGAGAGCACCATGAGGACTGACTCGGG120
121GGCTCGGCTGGAGGAGGGCCACCTGCGTCCTCCACGAGCT160
161CTTCCACCTGTGCCAAGTCAAGATGATATTCCACTTAGTC200
201GTCCTAAGAAAAAGAAGCCCAGAACAAAAAACACACCAGC240
241AAGTGCTTCTTTGGAAGGCCTTGCTCAGACTGCTGGTCGA280
281AGGCCCTCTGAGGGCAATGAGCCATCAACTAAAGAACTCA320
321AAGAGCACCCAGAGGCTCCTGTTCAAAGAAGACAGAAAAA360
361GACAAGGCTACCTCTTGAATTGGAGACTTCCTCCACCCAA400
401AAGAAGTCATCTAGTTCATCTTTATTACGAAATGAAAATG440
441GTATTGATGCGGAGCCAGCTGAGGAGGCAGTTATTCAAAA480
481ACCTCGGAGGAAGACAAAGAAAACCCAGCCAGCAGAATTA520
521CAGTATGCCAATGAGCTAGGAGTAGAAGATGAAGACATAA560
561TCACTGATGAGCAAACTACTGTGGAACAGCAGTCTGTATT600
601CACTGCACCCACTGGCATTAGCCAGCCTGTAGGCAAAGTA640
641TTTGTGGAAAAAAGCCGGAGATTCCAGGCTGCTGATCGTT680
681CAGAGTTGATAAAGACCACAGAAAACATAGATGTGTCAAT720
721GGACGTGAAGCCTTCCTGGACCACCAGAGATGTGGCACTT760
761ACAGTGCACCGGGCTTTCAGGATGATTGGTCTCTTTTCTC800
801ATGGATTCTTGGCTGGCTGTGCTGTGTGGAATATTGTTGT840
841GATATATGTTCTAGCAGGAGATCAGCTATCCAACCTCTCA880
881AACCTTCTGCAACAATACAAGACCCTAGCGTATCCATTCC920
921AGAGTCTTCTGTACTTGCTTTTGGCTCTGAGTACAATTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。