演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TMEM204FLJ20898

transmembrane protein 204

TMEM204(transmembrane protein 204)是多次穿越細胞膜的蛋白質,可能參與細胞間連結,並影響細胞旁通透性。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9BSN7
OFFICIAL SYMBOL
TMEM204
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9BSN7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TMEM204(transmembrane protein 204)是由蛋白質編碼基因產生的膜蛋白。其蛋白質全長為 226 個胺基酸,含有四段穿膜螺旋,並具有分布於細胞內與細胞外的區段。現有資料將其與黏著型細胞連結及細胞旁通透性的調節相關聯,提供了其基本的細胞位置與可能角色;至於更詳細的作用方式,現有來源未作說明。

Official symbol
TMEM204
Gene name
transmembrane protein 204
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14158
UniProt
Q9BSN7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ20898CLP24C16orf30

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTMEM204pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:1,528,674–1,555,580
Gene span
26,907 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000566264 ★1,533,666–1,555,5683
ENST000002539341,528,674–1,555,5804
ENST000008894701,533,567–1,555,5802
ENST000010336031,533,567–1,555,5803
ENST000010336041,533,567–1,555,5804
ENST000011169591,533,567–1,555,5684
ENST000011233541,533,567–1,555,5773
ENST000011233561,533,567–1,540,2953
ENST000011233571,533,567–1,540,3062
ENST000011233581,533,567–1,540,2972
ENST000011326201,533,567–1,555,5803

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TMEM204 可能影響細胞旁通透性,也可能透過黏著型細胞連結參與細胞與細胞之間的互動。細胞旁通透性描述物質經由相鄰細胞之間的區域通過的程度,因此來源所述的影響,指出 TMEM204 可能與細胞間界面的通透狀態有關。

來源以「可能參與」描述 TMEM204 和細胞間互動的關係,並將這項關聯連結至 adherens(黏著型)連結。不過,資料未進一步說明 TMEM204 如何影響這類連結、細胞旁通透性改變的方向或幅度,也沒有指出其作用所需的條件。因此,目前能支持的功能描述限於它可能參與細胞間互動,並可能影響細胞旁通透性;不宜據此推定具體分子機制或生理結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1533666 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TMEM204 ENST00000566264 GRCh38 chr16:1532666-1533766 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACGGATGTGGGACACCTGCATTCACGAAGCTTTGGAGCCTGGGTAGGCTGGGAATCCCATGCTGGGTTTC
GGGTCTCTGGAGATGGGACAGAGTAGGAGACCCTCTCGTGGTGTCTGCCCAGCTGGGCAGAATAATTCTG
AGCAGAATAGACGAAGATGCTTCTGAGCTCCCTGGCAGCATAAGCTCTGCCCGAGAGCCTGACCACTCAC
AAGGTGACCTGCCTAGTCCTGTCCCCAGCTGTGGGGGGTGACCGTTCCCATCAATAGCAGAGGTGGCCCA
GGCCCCACGTGACATTCGCTCTGTCCCAGGCCCCGCTGAGAGCCCCACCCAGCACATCCAGAATCTTACC
CTTCTTGCCACCTAAGAATGACCTGGCCTCGAGGTCCTCCAAGTACAGGTCCCTGGCCCCGAGGTCCTCC
AAGTACAGGTCCCTGGCCCCAAGGCCCTCCAAGTACAGGTCCCTGGCCCCGAGGTCCTCCAAGTACAGGT
CCCTGGCCCTGCAGGTCTGGGTGAACTTGCTCCCTCCAGGCACACGGGTCTCTCCCCTTCCCAGCAATCC
TGTGATATCTGCCCCCCTTTTGAGGGCAGCATTCCCGTGGCGGGGGCAGGCCTGGAACACACGGGCGGGG
GGAGGCTTGTGGTTCCTATGGTCCTGGGGGTACCTATGGTCCTGGGGGCAACTGGATGGCTGGGGGGTGT
GAAGTCCCCAGGGCAGGCAATAGTCGCTCAGTACCAGCCTCCAGGCCCCGGGGGCCACCAGGCTTAAAAG
CAACAGGCGAGACGAGGGATCTGTCCCGCACCCGGCATCCCTGGCCTCTCCTCTGGGACAGGAAGATGGG
GAGGGGCGGCAGGAGGTGGGCCTGGAGCAGGGCCTCAGAAGTCTCCTGGCCTTTCCCATCAGGAAGCACA
TCCTGTTGGTGTCTGGCTGCCGCGGCAGGGCCGCTATTTGTTGCGGTTGGCTACGCCTTCCAGCTCACCA
AAAACAGTCTCAAAAACAACCATTTCCTCTCTGCTGAGAGCCAGGGAAGGCGAGCTCTGCGCACACGGGC
GTCCCTGCAGCAGCCACTCTGCTTTCCAGGACCGGCCAACTGCCCTGGAGG
TMEM204 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TMEM204_2 ↗16:1,528,678正股1,528,629–1,528,688
TMEM204_1 ↗16:1,533,667正股1,533,618–1,533,677

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_74FJ9 · promoter · 1528598–1528698 · regulatory

ENSR16_BB7J · enhancer · 1530778–1531621 · regulatory

ENSR16_C64S · enhancer · 1531881–1532944 · regulatory

ENSR16_837TD · enhancer · 1533334–1533483 · regulatory

ENSR16_837TH · promoter · 1533484–1533676 · regulatory

ENSR16_5CQ3D · CTCF_binding_site · 1534105–1534126 · regulatory

ENSR16_5CQ64 · CTCF_binding_site · 1534686–1534707 · regulatory

ENSR16_9LGD · enhancer · 1535585–1536026 · regulatory

ENSR16_BB8M · enhancer · 1538640–1539249 · regulatory

· motif · 1528667–1528673 · motif

· motif · 1528919–1528928 · motif

· motif · 1534107–1534123 · motif

· motif · 1534688–1534704 · motif

TMEM204 的調控資料標示其與缺氧有關,但未說明缺氧對其表現或活性的影響方向、幅度及具體機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:226 aa

1 aa226 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9BSN7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TMEM204 蛋白質長 226 個胺基酸,含四段穿膜螺旋:第 6–26、104–124、137–157 與 171–191 位胺基酸。註解預測其第 1–5、125–136 及 192–226 位區段位於細胞質側;第 27–103 與 158–170 位區段位於細胞外。

拓樸區域Cytoplasmic1–5 aa
跨膜區Helical6–26 aa
拓樸區域Extracellular27–103 aa
跨膜區Helical104–124 aa
拓樸區域Cytoplasmic125–136 aa
跨膜區Helical137–157 aa
拓樸區域Extracellular158–170 aa
跨膜區Helical171–191 aa
拓樸區域Cytoplasmic192–226 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BSN7…

AlphaFold · Q9BSN7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell junction, adherens junction;Cell membrane

TMEM204 被註記位於細胞膜及黏著型細胞連結,並與 beta-catenin adherins 共定位。 來源未描述不同條件或異構型造成的定位變化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell junction, adherens junction。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ20898TMEM204
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TMEM204 可能影響細胞旁通透性,並可能透過黏著型連結參與細胞與細胞之間的互動;來源未進一步說明作用機制或影響方向。資料庫紀錄
證據與來源

Can influence paracellular permeability. Appears to be involved in cell-cell interactions through adherens

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TMEM204 被註記位於細胞連結中的黏著型連結及細胞膜,屬於多次穿膜蛋白,並與 beta-catenin adherins 共定位。含實驗來源
證據與來源

Cell junction, adherens junction; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Colocalizes with the beta-catenin adherins

PMID 15206924 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控TMEM204 的調控註記與缺氧有關;來源未指出缺氧造成的影響方向或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

By hypoxia

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000566264 · 1,833 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CATTTCCTCTCTGCTGAGAGCCAGGGAAGGCGAGCTCTGC40
41GCACACGGGCGTCCCTGCAGCAGCCACTCTGCTTTCCAGG80
81ACCGGCCAACTGCCCTGGAGGCATCCACACAGGGGCCCAG120
121GCAGCACAGAGGAGCTGTGAACCCGCTCCACACCGGCCAC160
161CCTGCCCGGAGCCTGGCACTCACAGCAGGCCGGTGCTAAG200
201GAGTGTGGCGCGGGCTCGACTCCCACTGCTGCCGGCCTCC240
241CGAGTGACTCTGTTTTCCACTGCTGCAGGCGAGAAGAGGC280
281ACGCGCGGCACAGGCCGGCCTCCGCTTCCCGGGAAGACGG320
321CGCACTCCTGGCCCTGGGTTCTTGCTGCTGCCCACCCTCT360
361GCTCCCTGGGATGGGCCCCGAGGCGAGCAGCTTCAGCACA400
401GGCCTGGCCCTGCTCCAGGTGCAGGAAGGAGGATAAGGCC440
441GGGCCGAGAGGCGGCACACCTGGACCATCCCATGGGCCTC480
481CGCCCGCGCCGCCCCGAGGATGAGTGGTGATGTCCTCTAG520
521CCACCCCTAGCAGCGTCGGCTCTCCCTGGACGTGCGGCCG560
561CGGACTGGGACTTGGCTTTCTCCGGATAAGCGGCGGCACC600
601GGCGTCAGCGATGACCGTGCAGAGACTCGTGGCCGCGGCC640
641GTGCTGGTGGCCCTGGTCTCACTCATCCTCAACAACGTGG680
681CGGCCTTCACCTCCAACTGGGTGTGCCAGACGCTGGAGGA720
721TGGGCGCAGGCGCAGCGTGGGGCTGTGGAGGTCCTGCTGG760
761CTGGTGGACAGGACCCGGGGAGGGCCGAGCCCTGGGGCCA800
801GAGCCGGCCAGGTGGACGCACATGACTGTGAGGCGCTGGG840
841CTGGGGCTCCGAGGCAGCCGGCTTCCAGGAGTCCCGAGGC880
881ACCGTCAAACTGCAGTTCGACATGATGCGCGCCTGCAACC920
921TGGTGGCCACGGCCGCGCTCACCGCAGGCCAGCTCACCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。