基因總覽
TMEM187 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 transmembrane protein 187。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Xq28。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369982 ★ | 153,972,754–153,983,194 | 2 |
| ENST00000855602 | 153,972,290–153,983,194 | 2 |
| ENST00000855603 | 153,972,290–153,983,194 | 3 |
| ENST00001135793 | 153,972,290–153,983,194 | 2 |
| ENST00000425274 | 153,972,858–153,982,260 | 2 |
| ENST00000855604 | 153,973,468–153,983,194 | 2 |
| ENST00000431598 | 153,980,606–153,982,161 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TMEM187 ENST00000369982 GRCh38 chrX:153971754-153972854 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TACGGCAGAAGAAGCGGTAACGGCAGGGCGCTCATGCCTCCTCCCTGGGAGCCGCCATCTTGTGTGAAGA AGTAACAACTAAACATGGCGGCAGCGGCGCCGGCGGTCGGGCGAGGAGGCGGAGCCGGGTGACGTCACCG CTTCCCCCCACTCGCCCTCGCACCGCTTCGCCCCTGGGCCCAAGCCTCTTAAAGGACCCCTGCGCTGCCT CGCGGCGGGGGTGGGGGTCGGCGCTGCCGCGCGCTGGGCTAAAGCTCGAGTCGCGCTCAGATCAGGTGCA GGCGCAGGCGCGCCCCGCCCCACGGCCCCCCCACCGGGCGAGCCTCCACGCCTCCGCCCTGGGAGCCGCC ATCTTGCCACTTCCCCTCGCCCGGCCGTCCGCGGGCGTCAATAGCGACTTTCAGCACAAAACAAAGATGG CGGCGGCGGCATCTCGGAAATGCCCGGATGAGACTGCTAACCCCTCCGACGCGCTCGGCCCCGCCCCCTT GGGAACGGTCTCTCGGGTTGATAAGGGACGCACGCCCGAAGAACTGCCTTTAACCAGCACTGGGGACAGC GGCACGCAGGTGGCCGGGGTTGGCGAACAGCCACTGCAGCCGCGCCTGCGGCCGGGAAGCGAGCATTTTC GCGCCCTGCACACCCAGCAGCCGCAGGAGGCGGCCCGAGGCGCGCCGCGGGGGAGCCGGGGGCGGGGCGA CAGTGGGAGGCGACGCAGCCGAGCGCCGGCGCCCGGGGGTGGAGCCTCCGCCCGCTCCCAGGCTCCCAGG CTGCGGGGCCCGCCCTCGGGCGCCACCGCCTCCGCCCGCGCCGCAGCAAAATGAGCCGGGCCGCGCGCCC CAGACCGCCGCGCGCTCGGCCGCCCCCACTGCCGAGAGGCCCGCAGTCGGGCCGGTGGCGCACGAGCCGG GCGGGCGACCGCGGGAGGCGTCCGCGTCATCTCGCGTCACCTCGCCCCGCCCGCTTCCCAGGCTTCGAGT CCCGCCCTGCGCGCAGGCGCACCGGCGCTGCTCGGATCCTCCCTTTTCGGAGATTTGAATTTCCCCCAGC GAGGCGAGTGAGGCGAAATACCCGTATGGTGATAGCTGGCCTTTTCGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMEM187_3 ↗ | X:153,972,160 | 正股 | 153,972,111–153,972,170 |
| TMEM187_2 ↗ | X:153,972,291 | 正股 | 153,972,242–153,972,301 |
| TMEM187_1 ↗ | X:153,972,754 | 正股 | 153,972,705–153,972,764 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:261 aa
transmembrane protein 187 長 261 個胺基酸,序列註解包含六段螺旋型跨膜區,分別位於第 8–28、43–63、88–108、113–133、140–162 與 190–210 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMEM187 被註解為多次跨膜蛋白,定位於膜;現有資料未提供更具體的膜區室或定位變化資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- ARL13BQ3SXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CGRRF1Q99675 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CISD2Q8N5K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COMTP21964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM210BQ96KR6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GORABQ5T7V8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LEUTXA8MZ59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MUC1P15941-11 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PGRMC2O15173 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SAR1AQ9NR31 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPAG4Q9NPE6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAS2R5Q9NYW4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM14BQ9NUH8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | TMEM187 的定位註解將其描述為膜蛋白,並指出它具有多次跨膜的特徵。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCGGCGCTGCTCGGATCCTCCCTTTTCGGAGATTTGAAT40TTCCCCCAGCGAGGCGAGTGAGGCGAAATACCCGTATGGT80GATAGCTGGCCTTTTCGCGCCAATACTGAAAAAGGCAGAA120CGTTCCTCCGCTGGCGCCAGCCAATCAGCAGGACTCCTGC160CTTCCTTCGGGGCAAGGTCGCAGCATCTGCCTCGGAAATC200ACGAAATCACGGGGCTTCTTTCTGCTGGCTCAGCCGGGAG240GCCCAGAGTGTTCTGCAGAGGCTGCGTATTGAAGGCTGCT280CTCTGAAGCTCCCTGCCCCAGGTCACGCCGCCGGTTCCAG320ATGAATCCAGAGTGGGGGCAGGCCTTCGTGCACGTGGCCG360TGGCCGGTGGCCTCTGTGCCGTGGCTGTGTTCACGGGCAT400TTTCGACAGTGTTTCCGTGCAAGTGGGCTATGAGCACTAC440GCCGAGGCGCCCGTGGCCGGCCTCCCTGCCTTCCTGGCCA480TGCCGTTCAACTCACTCGTGAACATGGCCTACACGCTGCT520GGGGCTGTCGTGGCTGCACAGGGGCGGCGCGATGGGGCTG560GGTCCCCGCTACCTGAAGGACGTGTTCGCAGCCATGGCCC600TGCTCTATGGCCCCGTGCAGTGGCTGCGCCTGTGGACGCA640GTGGCGCCGTGCCGCGGTGCTGGACCAGTGGCTCACACTG680CCCATCTTTGCATGGCCCGTGGCCTGGTGCCTCTACCTAG720ACCGCGGCTGGCGGCCCTGGCTGTTCCTCTCTCTTGAGTG760CGTCTCCCTGGCCAGTTATGGCCTCGCTCTGCTGCATCCC800CAGGGCTTCGAGGTCGCACTGGGTGCTCACGTGGTGGCCG840CTGTGGGGCAGGCGCTGCGCACCCACAGGCACTATGGCAG880CACCACCTCGGCTACCTACTTAGCTTTGGGGGTGCTCTCT920TGCCTGGGCTTTGTGGTCCTCAAGCTGTGTGACCATCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。