基因總覽
TMEM184B(transmembrane protein 184B)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TMEM184 family。現有資料將其與 MAP kinase 訊號傳遞路徑的可能活化作用相連,但未進一步說明其分子機制或作用條件。蛋白質特徵資料顯示此產物具有多段跨膜螺旋,符合多次穿越膜的蛋白質特性;相關序列與區域資訊見蛋白質特徵及定位欄。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361906 ★ | 38,219,291–38,273,010 | 9 |
| ENST00001107297 | 38,215,914–38,273,043 | 9 |
| ENST00001114507 | 38,215,914–38,273,010 | 9 |
| ENST00000883833 | 38,219,290–38,258,115 | 9 |
| ENST00000883823 | 38,219,291–38,273,043 | 9 |
| ENST00000883824 | 38,219,291–38,273,043 | 9 |
| ENST00000883834 | 38,219,291–38,248,070 | 8 |
| ENST00000883835 | 38,219,291–38,248,070 | 8 |
| ENST00001135023 | 38,219,291–38,273,043 | 9 |
| ENST00001028728 | 38,219,293–38,273,043 | 9 |
| ENST00000883825 | 38,219,295–38,273,043 | 10 |
| ENST00000883827 | 38,219,300–38,273,010 | 9 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註解指出,TMEM184B 可能活化 MAP kinase 訊號傳遞路徑。這項描述呈現的是可能的功能關聯,並未提供具體的訊號分子、作用步驟或活化條件,因此不能據此推定其直接作用對象或完整機制。資料也未說明此作用發生的細胞類型、刺激條件或生物學結果;目前可支持的功能描述僅限於它可能參與該訊號路徑的活化。
Promoter 與基因調控
>TMEM184B ENST00000361906 GRCh38 chr22:38272910-38274010 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTGGAACAAGGGAGAGGGGTTAGCAGAACTCTGCAATAATCCTGTGCAAATACTGGACCAGGGTGGTAG CACTGGAGGAGGAGTGGCAGACATCTGAGTCTAGATCTATTTTGCAGGTAGAGCCAACAGGATCTCCTGC CTGCCTTATTGGGTAGCGGGCAGAAGGGGGGCATTCATTCACAGCTGACTCCGAGTTCTGGCCTGGGGAC TGGAAGGATGGAATTGTCAACAGCTGATGGAGGCAAAGCTGAGAGGGAGCAGGTTTTTGTGTGTGGAAGT GGGGTTGGCTCAGCTCAGACACGCTGACTTTGAGATGCCTGCTGGAGCTCCAAGGAAGAGGTGTTGGGTA GACAGTTCAGGCGAGGAGTCTGGAGACATAAATACATTTGGGGATCTTGAGCACATCAATGCCAGAACTT AATTGCATTTTATCTTGTTCAGTTAACCTAGGTGATGTCTGGACCGGCAAACAGAAATGGACTAGGCGGC TTGAACCCTATCTGAAGACTTTTGCTAGTTCGGCAGCCTAGAGCCAGACGGGGCAAGAAAGAATCGCTGC TAAGCGGAGTGGGAAAAAAAGGCCTCTTTCAGTGCTTTGCCATTTCATCTGGCCTAATTGCACACAACAC TCGGTCCACGTTCATTCCACAATTCCACACGCATCCTTCACTCAACAAATAGCCATTGTATTTCGTTTCA TCTTCAAAACAGGCTCAAATGGAGGAAATTAGGGTTAAAAGAAGTGAAGCACCAGCGAGGGTCAGGGGCA GAGATCGCAGCCCAGAAAGCTCTCGCGGTTGGGGGCCGGTCGTAGCTGGTTTTGTGAGTGGCAAGAGAAC CCGGGTCGCGCCCCAACCCGCGGGGCGGCGGGCTGGGGTTCGGGGCGGCGGGCTGGGGTTCGGGGCGCGG CCCCTTTAAGGCCCAGGCAGTGATCTCAGCCGCGTCCGCCGCCCCGCCCTCCCCGGCGGCGAGCCCAGAG CGCATGCGCGCCGCGGCTGCACTCCACTGGGCCCGGGACGCGCCGGCGGCGGCGGAGACTCCGGGGCTGC GGCGCCGCCCGCCCCGCCCGCAGAGTCCGGCTGCCGCGCATCGTCCGCAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMEM184B_1 ↗ | 22:38,273,005 | 負股 | 38,272,995–38,273,054 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9K75P · enhancer · 38270659–38270963 · regulatory
ENSR22_B9L43 · enhancer · 38271701–38272653 · regulatory
ENSR22_B9L47 · promoter · 38272654–38273500 · regulatory
ENSR22_748QR5 · enhancer · 38276118–38276242 · regulatory
ENSR22_835DF9 · enhancer · 38277332–38277468 · regulatory
· motif · 38272282–38272302 · motif
· motif · 38272842–38272855 · motif
· motif · 38272842–38272855 · motif
· motif · 38273021–38273032 · motif
· motif · 38273021–38273032 · motif
· motif · 38273243–38273255 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:407 aa
TMEM184B 蛋白質長 407 個胺基酸,屬於 TMEM184 family。序列註解標示七段跨膜螺旋,分布於胺基酸 40–60、84–104、121–141、178–198、214–234、249–269 及 290–310;N 端 1–25 與靠近 C 端的 369–395 區域則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMEM184B 被註記為膜蛋白及多次穿膜蛋白。 現有定位資料未指出更具體的膜區室、定位變化條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TMEM184B 可能活化 MAP kinase 訊號傳遞路徑。此註解以「可能」表達其功能推論,未提供活化所需的條件、具體作用機制或下游結果,因此不宜將其描述為已確立的直接作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TMEM184B 被註記為膜蛋白,且屬於多次穿膜蛋白。此定位描述未進一步指出所在的具體膜區室,也未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCCACTGGGCCCGGGACGCGCCGGCGGCGGCGGAGACT40CCGGGGCTGCGGCGCCGCCCGCCCCGCCCGCAGAGTCCGG80CTGCCGCGCATCGTCCGCAGACGCCGCCACCGCCATGGGC120TCCTGAGGCTAGCTTGTCACTTTCTGCAAAGGTTTCCCTC160AGGGAGCCTCCTGCTGCCAGGCACCATGACAGTGAGGGGG200GATGTGCTGGCCCCGGATCCAGCGTCGCCCACGACCGCAG240CAGCCTCGCCCAGCGTCTCCGTGATCCCCGAGGGCAGCCC280CACTGCCATGGAGCAGCCTGTGTTCCTGATGACAACTGCC320GCTCAGGCCATCTCTGGCTTCTTCGTGTGGACGGCCCTGC360TCATCACATGCCACCAGATCTACATGCACCTGCGCTGCTA400CAGCTGCCCCAACGAGCAGCGCTACATCGTGCGCATCCTC440TTCATCGTGCCCATCTACGCCTTTGACTCCTGGCTCAGCC480TCCTCTTCTTCACCAACGACCAGTACTACGTGTACTTCGG520CACCGTCCGCGACTGCTATGAGGCCTTGGTCATCTATAAT560TTCCTGAGCCTGTGCTATGAGTACCTAGGAGGAGAAAGTT600CCATCATGTCGGAGATCAGAGGAAAACCCATTGAGTCCAG640CTGTATGTATGGCACCTGCTGCCTCTGGGGAAAGACTTAT680TCCATCGGATTTCTGAGGTTCTGCAAACAGGCCACCCTGC720AGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCGGTCAGCACTGT760GGTCCTCCAGGCCTTCGGCAAGTACCGGGATGGGGACTTT800GACGTCACCAGTGGCTACCTCTACGTGACCATCATCTACA840ACATCTCCGTCAGCCTGGCCCTCTACGCCCTCTTCCTCTT880CTACTTCGCCACCCGGGAGCTGCTCAGCCCCTACAGCCCC920GTCCTCAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATCTTTCTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。