基因總覽
TMBIM6（transmembrane BAX inhibitor motif containing 6）是人類蛋白質編碼基因，其產物為內質網膜上的多次穿膜蛋白，屬於 BI1 家族。蛋白質長 237 個胺基酸，包含多段跨膜螺旋；其拓撲註解顯示，跨膜區段之間分布於細胞質側與內質網腔側的區域。這些基本特徵界定了 TMBIM6 作為膜蛋白的性質；其對細胞壓力反應與其他生物學過程的影響，見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000267115 ★ | 49,741,557–49,764,934 | 10 |
| ENST00000548809 | 49,707,725–49,752,526 | 4 |
| ENST00000551154 | 49,707,733–49,753,039 | 4 |
| ENST00000860405 | 49,707,739–49,764,934 | 10 |
| ENST00000941134 | 49,707,746–49,764,934 | 11 |
| ENST00000546796 | 49,738,993–49,758,483 | 6 |
| ENST00000860422 | 49,741,340–49,764,709 | 10 |
| ENST00000860406 | 49,741,510–49,764,935 | 10 |
| ENST00000552699 | 49,741,536–49,764,737 | 11 |
| ENST00000860407 | 49,741,536–49,764,934 | 11 |
| ENST00000549966 | 49,741,544–49,758,265 | 6 |
| ENST00000547832 | 49,741,547–49,758,462 | 7 |
顯示 12/73 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TMBIM6 是一種具抗凋亡作用的內質網蛋白，能限制發生於內質網及粒線體周邊的多種壓力誘發途徑，從而提供細胞保護。其作用也涉及內質網未摺疊蛋白反應中的關鍵感受器 IRE1alpha/ERN1：TMBIM6 可直接抑制該感受器的活性，也可透過阻止 BAX/BAK 與其結合而達成抑制效果。
TMBIM6 亦參與內質網鈣離子平衡，並以鈣離子漏通道的方式調節鈣離子狀態。這項作用與其對內質網壓力途徑的調節，共同構成來源所述的細胞保護功能。
此外，TMBIM6 負向調節自噬及自噬體形成，這項調節在營養缺乏期間尤其受到關注。來源指出，TMBIM6 的此一作用會降低細胞在飢餓狀態下的存活；此項功能註記標示為相似性推論，而非直接實驗證據。
Promoter 與基因調控
>TMBIM6 ENST00000267115 GRCh38 chr12:49740557-49741657 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTACACTACAGCAAAAATTAGGTTGTATTATAGAAAATTAACTTTTTTGGTTTTTTTGAGACGGGGTCTC GCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCAGGGTCAAG CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGTTGGGATTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTT TAAATTTTTAATAGAGATGGGGTTTTACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGAT CTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTAAGCCACCACGCCCAGCCGAAAATTAACT TCTATTAATTGCATACCTGGGTTTGCCTACTGAGAATCATACCCTGGATATTTGTATTCTTTACTGAAAA GAACTGTTCTATCTTTCCAGAAAGTGGTTTCCTAAATTCTGGTTTTCCTCCTGGAATCCTGCTATTTCCT TCTCGCATACTCTAGAGAAATCGAAGTGTTTTCAAAGGTGCTCTGAAGCTTACGCTCCACTAGTTTCACA GTAAATCGCCCCTTGCGAGGGCGCTTTTTTTTTTTTTTTAATGTGTTCTCTGAATCGCTTTCCCCCTTTA ACACTGCATGACAAGACTAAAGCCAGAATCCCAAGACTGCAGCGCTACCCCTTCACAAGCCGTCGGGCTG TCCCGGGCGGGGCCGGCCCATTTTCACTTTCTCCACTAGAGGCAGCAGCGCACCGTGACCCTGGCTTACT ACGGTAAGAAAGCGGAGACCTTTTGCTTCGAGGCGGTTGGTGGCCAGTAGTCTTGATCGACAAGCTCAGG CCTCTGAACTAAGCAGCCGCTGTTTATGCACGTACAGCCAATGGAAAGGCAGGAGTGCGGCCAACGGCCA ATGAGGACTGGTCTTAAGCGGACCACAGGGCGGGGTTTCCCTCGAGAGGCGAACGCCGGGTAAAAGATCG GGAGCGGAAGTGGGCGAGTCAGAGCACATCCGGTGTTAGAAGCGCTGGTAGGCCTTGGAGAGGCGGGTTA GGAAGGTACGTCTGAACCTAGTACTGGGCGAACTGGGAGTGAGAAATGGAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMBIM6_1 ↗ | 12:49,741,557 | 正股 | 49,741,508–49,741,567 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BCTJC · enhancer · 49740876–49741390 · regulatory
ENSR12_5FNW2Q · CTCF_binding_site · 49741285–49741306 · regulatory
ENSR12_9PQ3S · promoter · 49741391–49741819 · regulatory
· motif · 49737112–49737125 · motif
· motif · 49737112–49737125 · motif
· motif · 49741287–49741303 · motif
· motif · 49741300–49741316 · motif
· motif · 49741308–49741320 · motif
· motif · 49741537–49741548 · motif
· motif · 49741539–49741548 · motif
· motif · 49741561–49741570 · motif
· motif · 49741641–49741661 · motif
· motif · 49741671–49741685 · motif
· motif · 49741797–49741808 · motif
· motif · 49741797–49741808 · motif
· motif · 49741817–49741830 · motif
· motif · 49741828–49741841 · motif
· motif · 49741842–49741855 · motif
· motif · 49742131–49742146 · motif
· motif · 49742131–49742146 · motif
· motif · 49742132–49742145 · motif
· motif · 49742132–49742145 · motif
· motif · 49742469–49742482 · motif
· motif · 49742469–49742482 · motif
· motif · 49742490–49742500 · motif
· motif · 49742514–49742528 · motif
· motif · 49742598–49742611 · motif
· motif · 49742598–49742612 · motif
· motif · 49742598–49742613 · motif
· motif · 49743060–49743075 · motif
· motif · 49743061–49743075 · motif
· motif · 49743062–49743075 · motif
· motif · 49743642–49743656 · motif
· motif · 49743642–49743656 · motif
· motif · 49744530–49744537 · motif
· motif · 49745799–49745814 · motif
· motif · 49745804–49745816 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：237 aa
TMBIM6 蛋白質長 237 個胺基酸，屬於 BI1 family。序列註解列出六段螺旋跨膜區，並標示其間的細胞質側與內質網腔側區域；N 端及 C 端也有細胞質側拓撲區段註記。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TMBIM6 定位於內質網膜，並註記為多次穿膜膜蛋白。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 63 個夥伴
- ADIPOR2Q86V24 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP13A1Q9HD20-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C5orf46Q6UWT4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CD300LGQ6UXG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD99L2Q8TCZ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC7O00311 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN22Q8N7P3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COBLL1A0A7P0TAB9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EBPQ15125 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENPP4Q9Y6X5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERP29P30040 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ESAMQ96AP7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFBP2Q9BYJ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FXYD3Q14802-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJA5P36382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJA8P48165 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB4Q9NTQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPHB5Q86YW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR151Q8TDV0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR42O15529 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GYPAP02724 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TMBIM6 與 BCL2、BCL2L1 及 ERN1 有互作註記。來源僅記載互作，未進一步說明這些分子是否同屬特定複合體；TMBIM6 對 ERN1 活性的調節則屬功能關係，不等同於互作本身的證據描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TMBIM6 是駐留於內質網的抗凋亡蛋白，可藉由限制內質網及粒線體周邊的多種壓力誘發途徑提供細胞保護。它能直接抑制未摺疊蛋白反應感受器 IRE1alpha/ERN1，也可透過阻止 BAX/BAK 結合而抑制其活性；此外，TMBIM6 作為鈣離子漏通道調節內質網鈣離子平衡。相似性推論指出，它在營養缺乏時負向調節自噬與自噬體形成，並降低細胞飢餓時的存活。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum (ER)-resident protein that confers cellular protection as an anti-apoptotic protein by limiting multiple stress-inducing pathways surrounding the endoplasmic reticulum and mitochondria. Inhibits the activities of the key sensor for the endoplasmic reticulum unfolded protein response IRE1alpha/ERN1 both directly and by blocking BAX/BAK binding. Modulates ER calcium homeostasis by acting as a calcium-leak channel. Negatively regulates autophagy and autophagosome formation, especially during periods of nutrient deprivation, and reduces cell survival during starvation (By similarity) PMID 19328063 ↗ · PMID 21068390 ↗ · PMID 21075086 ↗ · PMID 22128171 ↗ |
| 交互作用 | TMBIM6 有與 BCL2 和 BCL2L1 互作的註記，也與 ERN1 互作。來源未在此處進一步交代互作的條件或其形成的複合體。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TMBIM6 定位於內質網膜，並被註記為多次穿膜膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein PMID 21068390 ↗ · PMID 21075086 ↗ · PMID 22128171 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGCACATCCGGTGTTAGAAGCGCTGGTAGGCCTTGGAG40AGGCGGGTTAGGAAGAGTGGAGACTGCTGCACGGACTCTG80GAACCATGAACATATTTGATCGAAAGATCAACTTTGATGC120GCTTTTAAAATTTTCTCATATAACCCCGTCAACGCAGCAG160CACCTGAAGAAGGTCTATGCAAGTTTTGCCCTTTGTATGT200TTGTGGCGGCTGCAGGGGCCTATGTCCATATGGTCACTCA240TTTCATTCAGGCTGGCCTGCTGTCTGCCTTGGGCTCCCTG280ATATTGATGATTTGGCTGATGGCAACACCTCATAGCCATG320AAACTGAACAGAAAAGACTGGGACTTCTTGCTGGATTTGC360ATTCCTTACAGGAGTTGGCCTGGGCCCTGCCCTGGAGTTT400TGTATTGCTGTCAACCCCAGCATCCTTCCCACTGCTTTCA440TGGGCACGGCAATGATCTTTACCTGCTTCACCCTCAGTGC480ACTCTATGCCAGGCGCCGTAGCTACCTCTTTCTGGGAGGT520ATCTTGATGTCAGCCCTGAGCTTGTTGCTTTTGTCTTCCC560TGGGGAATGTTTTCTTTGGATCCATTTGGCTTTTCCAGGC600AAACCTGTATGTGGGACTGGTGGTCATGTGTGGCTTCGTC640CTTTTTGATACTCAACTCATTATTGAAAAGGCCGAACATG680GAGATCAAGATTATATCTGGCACTGCATTGATCTCTTCTT720AGATTTCATTACTGTCTTCAGAAAACTCATGATGATCCTG760GCCATGAATGAAAAGGATAAGAAGAAAGAGAAGAAATGAA800GTGACCATCCAGCCTTTCCCAATTAGACTTCCTCTCCTTC840CACCCCTCATTTCCTTTTTGCACACATTACAGGTGGTGTG880TTCTGTGATAATGAAAAGCATCAGAAAAGCTTTTGTACTT920TGTGGTTTCCTCTATTTTGAATTTTTTGATCAAAAAACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。