基因總覽
TM4SF5 的正式名稱為 transmembrane 4 L six family member 5，屬於 protein-coding gene，產物是 L6 tetraspanin family 的多次穿膜蛋白。來源描述其參與 lysosome 膜上的精胺酸感知，並與細胞週期 G1/S 期進程有關。蛋白質包含四段跨膜螺旋，並具有細胞質側與細胞外側區域；其膜穿越拓樸構成此蛋白的基本結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270560 ★ | 4,771,886–4,783,211 | 5 |
| ENST00000861274 | 4,771,835–4,783,220 | 4 |
| ENST00000861275 | 4,771,835–4,783,220 | 6 |
| ENST00001098037 | 4,771,835–4,783,220 | 5 |
| ENST00001141559 | 4,771,835–4,783,220 | 5 |
| ENST00001098038 | 4,771,886–4,783,220 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TM4SF5 可作為 lysosome 膜上的精胺酸感測器。它會與 MTOR 及 SLC38A9 在 lysosome 膜形成複合體；此複合體受到精胺酸調節，並促進精胺酸外流。這項精胺酸外流使 mTORC1 得以活化，接續引發 RPS6KB1 與 EIF4EBP1 的磷酸化，將精胺酸狀態與 mTORC1 下游訊號連結起來。
此外，TM4SF5 可促進細胞週期由 G1 期進入 S 期，並促使 CDK4-CCND1 複合體轉位至細胞核。來源指出，CDKN1B 與 RHOA/ROCK 訊號活性參與 TM4SF5 介導的 G1/S 期加速；但未進一步說明這些因子的具體作用順序或分子機制。因此，TM4SF5 的功能涵蓋營養感知訊號及細胞週期進程，兩者分別涉及 lysosome 上的精胺酸調節與細胞核內 CDK4-CCND1 複合體轉位。
Promoter 與基因調控
>TM4SF5 ENST00000270560 GRCh38 chr17:4770886-4771986 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGCAGGATAGAACGCTCTCATCAATGAGGCCTAGGTCCCGAGCCCACCCTGAGAGACAGGCAGTGGCCT CAAGAGGAGGAGACATCAATAATCAAATACCAGGAAGACGAAATGCAAGGACAATAAGAGCCCACAATCA CCTCTTTAATTTCTCCCTGGGAAGAATGCTGCCTGAGAGGCTGGCAGAAACGAAGAGGCCACCACACATC TGCTCTGTGCTTCCTAGTTTACAAAATACTTCTCAGGTTGTCCCATTTAATCCTCACAAGTAGCCCACAA GGCAAGTGGCATCACTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTATTTATTTATTTACTTTTTGAGACAGAGT TTCATTCTTGTCACTTTATTTACTTATTTATTTATTTTTCGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGC TGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGGTTCAAGTGATCCTCCTGCTTC AGCCTCTCGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCATGCACAGATAACTTTTGCATTTTTAGTAGTG ACGGGGTTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCTCCTCGGCCT CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGACACAAGTGGCAACTGAGACTTAAGAGAC ATGAAGGGGCTTGGCTAAGTTGCAAAGCAGGTATGGAACCAACAGAGGGGCTGTGGAGCTGTGCAGAAAA AACAGGAAGGCACTAACCCAGGGTAATGTGTCCATAGCCCCCACCTTGTCCAGCACCACATCCTCCCTTC ACCTCAGGGCTGCAGCTCCTCCGCCTCTGCCTCCTCAGGGCCCACATCCTGTGCCTCTCTCCCTTATCAT TCTGATCCTGCCAGTTTCTGCCACGCCTCTGTCTGAACTTTGCTCCGTGCTCCAGGCTTGTTTTCCTCTG GACCTGGGAACCACTGGCTTACTTTCACTCACCGCCTGTCCTTCCTGACACCTCACCATGTGTACGGGAA AATGTGCCCGCTGTGTGGGGCTCTCCCTCATTACCCTCTGCCTCGTCTGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TM4SF5_1 ↗ | 17:4,771,886 | 正股 | 4,771,837–4,771,896 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_85R8B · enhancer · 4769735–4769905 · regulatory
ENSR17_85R9F · promoter · 4771652–4771896 · regulatory
· motif · 4771815–4771825 · motif
· motif · 4771827–4771842 · motif
· motif · 4771827–4771842 · motif
· motif · 4771828–4771842 · motif
· motif · 4771829–4771842 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：197 aa
TM4SF5 蛋白長 197 個胺基酸，屬於 L6 tetraspanin family，具有四段跨膜螺旋：第 10–30、47–67、91–111 與 158–178 位胺基酸。其 N 端及 C 端均位於細胞質側，並有兩段細胞外區域。第 91–197 位胺基酸區域註記為與 MTOR 和 CASTOR1 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TM4SF5 是多次穿膜蛋白，可定位於 lysosome 膜與細胞膜。 精胺酸缺乏時，其在細胞膜的定位增加；精胺酸補充後，則可觀察到它轉位至 lysosome 膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- AMIGO1Q86WK6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASTOR1Q8WTX7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MTORP42345 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SLC38A9Q8NBW4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TM4SF5 與 MTOR、SLC38A9、SLC7A1 及 CASTOR1 有互作。與 MTOR 的互作受精胺酸正向調節、受 leucine 負向調節；與 SLC7A1 的互作受精胺酸負向調節。與 CASTOR1 的互作受 leucine 正向調節、受精胺酸負向調節。來源未提供 SLC38A9 互作的調節條件。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TM4SF5 是 lysosome 膜上的精胺酸感測器，並與 MTOR、SLC38A9 形成受精胺酸調節的複合體，促進精胺酸外流及 mTORC1 活化，進而引發 RPS6KB1、EIF4EBP1 磷酸化。它也促進 G1/S 期進程及 CDK4-CCND1 核轉位；CDKN1B 與 RHOA/ROCK 訊號活性參與此細胞週期效應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a lysosomal membrane arginine sensor. Forms a complex with MTOR and SLC38A9 on lysosomal membranes in an arginine-regulated manner, leading to arginine efflux which enables the activation of mTORC1 which subsequently leads to RPS6KB1 and EIF4EBP1 phosphorylations. Facilitates cell cycle G1/S phase progression and the translocation of the CDK4-CCND1 complex into the nucleus. CDKN1B and RHOA/ROCK signaling activity are involved in TM4SF5-mediated acceleration of G1/S phase progression PMID 20399237 ↗ · PMID 30956113 ↗ |
| 交互作用 | TM4SF5 與 MTOR、SLC38A9、SLC7A1 及 CASTOR1 互作。精胺酸正向調節 TM4SF5 與 MTOR 的互作，卻負向調節其與 SLC7A1、CASTOR1 的互作；leucine 對 MTOR 互作為負向調節，對 CASTOR1 互作則為正向調節。來源未說明 SLC38A9 互作的調節條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with MTOR; the interaction is positively regulated by arginine and is negatively regulated by leucine. Interacts with SLC38A9. Interacts with SLC7A1; the interaction is negatively regulated by arginine. Interacts with CASTOR1; the interaction is positively regulated by leucine and is negatively regulated by arginine PMID 30956113 ↗ |
| 細胞定位 | TM4SF5 是多次穿膜蛋白，定位於 lysosome 膜及細胞膜。其在細胞膜的定位會於精胺酸缺乏時增加；精胺酸補充後，則可觀察到 TM4SF5 轉位至 lysosome 膜，顯示其膜定位會隨精胺酸條件改變。 | 含實驗來源 | 證據與來源Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localization to cell membrane increases during conditions of arginine depletion and translocation to lysosome membrane seen upon arginine repletion PMID 30956113 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTTTCACTCACCGCCTGTCCTTCCTGACACCTCACCATG40TGTACGGGAAAATGTGCCCGCTGTGTGGGGCTCTCCCTCA80TTACCCTCTGCCTCGTCTGCATTGTGGCCAACGCCCTCCT120GCTGGTACCTAATGGGGAGACCTCCTGGACCAACACCAAC160CATCTCAGCTTGCAAGTCTGGCTCATGGGCGGCTTCATTG200GCGGGGGCCTAATGGTACTGTGTCCGGGGATTGCAGCCGT240TCGGGCAGGGGGCAAGGGCTGCTGTGGTGCTGGGTGCTGT280GGAAACCGCTGCAGGATGCTGCGCTCGGTCTTCTCCTCGG320CGTTCGGGGTGCTTGGTGCCATCTACTGCCTCTCGGTGTC360TGGAGCTGGGCTCCGAAATGGACCCAGATGCTTAATGAAC400GGCGAGTGGGGCTACCACTTCGAAGACACCGCGGGAGCTT440ACTTGCTCAACCGCACTCTATGGGATCGGTGCGAGGCGCC480CCCTCGCGTGGTCCCCTGGAATGTGACGCTCTTCTCGCTG520CTGGTGGCCGCCTCCTGCCTGGAGATAGTACTGTGTGGGA560TCCAGCTGGTGAACGCGACCATTGGTGTCTTCTGCGGCGA600TTGCAGGAAAAAACAGGACACACCTCACTGAGGCTCCACT640GACCGCCGGGTTACACCTGCTCCTTCCTGGACGCTCACTC680CCTTGCTCGCTAGAATAAACTGCTTTGCGCTCTC714cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。