基因總覽
TM4SF4（transmembrane 4 L six family member 4）是蛋白質編碼基因，產物屬於 L6 tetraspanin 家族。此蛋白質長 202 個胺基酸，具有四段穿膜螺旋，並在膜兩側包含胞質區域與胞外區域。這些結構特徵使 TM4SF4 成為多次穿膜蛋白；來源將其主要角色描述為調節腸上皮細胞的黏附與增殖狀態。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305354 ★ | 149,474,697–149,503,394 | 5 |
| ENST00000865228 | 149,473,937–149,503,394 | 6 |
| ENST00000977166 | 149,473,937–149,503,394 | 5 |
| ENST00001116603 | 149,473,937–149,503,281 | 5 |
| ENST00001116604 | 149,473,937–149,503,394 | 4 |
| ENST00001130667 | 149,473,937–149,488,283 | 4 |
| ENST00001140045 | 149,473,937–149,503,394 | 5 |
| ENST00000465758 | 149,474,699–149,487,687 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TM4SF4 參與調節腸上皮細胞的黏附與增殖狀態，並可介導依細胞密度而變化的細胞增殖。來源將這兩項作用指向同一類細胞，但沒有進一步界定黏附改變的方向、增殖受促進或受抑制的條件，也未說明相關分子機制，因此不宜將其延伸解讀為特定的訊號路徑或細胞行為。
依細胞密度而變化的增殖，表示 TM4SF4 的作用與細胞密度相關；然而，現有資料未描述密度變化的範圍、實驗條件，或這種作用如何與細胞黏附調節相連。資料也未提供其他細胞類型、組織或生理情境下的功能資訊。
Promoter 與基因調控
>TM4SF4 ENST00000305354 GRCh38 chr3:149473697-149474797 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTAAAATATTCGACCTATTTTAACCTCTAGATTCTCAATGAAGAACTAGTAAGACTTCCAGTTCCACCTC TTAATCCTTCAGCTGTTATGTAATACCAGTACCAGGCAGGGCCATCGCATAATGTAGAGCTTGGTCCAGG CGTGGCAGAGAACTTCTTAAGTGACACAAAGCAAATGAATGAATCATGCCCCTGGCAGTTGGCAAACTTT CTAATAGGGGTGTGTTTTACTGCCTCCTGCACTCTATAACTGCTCTTCCAACTGTGTCTTCTCCCCAGTC AACTCATCAGGACCTTTTCTCTCCCTCTCTACCAATGCTGACCTTCCTTTCCCCTTAGCCTTAGTGGATG ATGGTTTCTTTATTCCTATATGGAAGACATAGCTGAGAAAGTTGATTAGGAAAACTGTTTTTGCTAATTC CATCACATCGTGTAGGGAAAAGATAGAACTTAATTACTTAATTGCGTAACAAGTAGAGAAACACAGCAAT CAGACAATAAAATGAACAGTAGCTTTTTGCCTTAAACAATTCTTTTAAGTCTGAGCTCAATGATACACAA CTAGACCATCAAATTATTTTGATATTGAGGAAAACAGAAGCTCTTTTGGATAACCCTGAATTCCAGGCTT TCAGTGGAAAAGACAAAGACACGCACTGTACACCATTAAGTACTTGGGAGACATGATTTTAACCAGGATG TAACTCAATTATATTAGTGATTTATAAAGAGTCTGGAGAAAATATTTCTTTATTTGGGCATGGGCACTGT CAGATTAAAGGTGCAGTGGTTCTAAATGCTGTTTGTTCCAGCCCTGTCTTCGATTGCAACAATGTGAGTG TCTTGTCTGTGCTGGTGGATTATTAACAGAGGTTATTGGTCTCCATGGCAAAACGATTGAATGATTGCTC TGAACGTAATCTCATTTATGGGGGTGCAAAAAACAAAGCACTTCAGGTCAGGGAGAATGTATAAATGTCC ATTGCCATCGAGGTTCTGCTATTTTTGAGAAGCTGAAGCAACTCCAAGGACACAGTTCACAGAAATTTGG TTCTCAGCCCCAAAATACTGATTGAATTGGAGACAATTACAAGGACTCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TM4SF4_1 ↗ | 3:149,474,697 | 正股 | 149,474,648–149,474,707 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_B34MX4 · enhancer · 149472084–149472967 · regulatory
ENSR3_B34MX8 · enhancer · 149473306–149474250 · regulatory
ENSR3_86DMQF · enhancer · 149474403–149474567 · regulatory
ENSR3_CJSH4 · enhancer · 149479660–149480734 · regulatory
· motif · 149474157–149474166 · motif
· motif · 149474157–149474166 · motif
· motif · 149474387–149474398 · motif
· motif · 149475171–149475184 · motif
· motif · 149476499–149476514 · motif
· motif · 149476534–149476547 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：202 aa
TM4SF4 蛋白質長 202 個胺基酸，屬於 L6 tetraspanin 家族。序列註解包含四段螺旋型跨膜區，分別位於第 10–30、46–66、94–114 及 159–179 位胺基酸；其間具有胞外與胞質拓樸區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TM4SF4 被註記為膜蛋白及多次穿膜蛋白，具有四段跨膜螺旋。 來源未提供不同條件下的定位變化、異構型差異或動態資訊。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- APH1BQ8WW43 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC17AQ6ZS10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM2Q8TAZ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FATE1Q969F0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FFAR2O15552 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB1P08034 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB4Q9NTQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB5O95377 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR101Q96P66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR37L1O60883 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR42O15529 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNK5O95279 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHFPL5Q8TAF8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPRM1P35372-10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC10A6Q3KNW5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBXA2RQ0VAB0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM14BQ9NUH8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TM4SF4 可調節腸上皮細胞的黏附與增殖狀態，也能介導依細胞密度而變化的細胞增殖；來源未說明這些作用的方向或具體機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Regulates the adhesive and proliferative status of intestinal epithelial cells. Can mediate density-dependent cell proliferation |
| 細胞定位 | TM4SF4 被描述為膜上的多次穿膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATTTTTGAGAAGCTGAAGCAACTCCAAGGACACAGTTCAC40AGAAATTTGGTTCTCAGCCCCAAAATACTGATTGAATTGG80AGACAATTACAAGGACTCTCTGGCCAAAAACCCTTGAAGA120GGCCCCGTGAAGGAGGCAGTGAGGAGCTTTTGATTGCTGA160CCTGTGTCGTACCACCCCAGAATGTGCACTGGGGGCTGTG200CCAGATGCCTGGGGGGGACCCTCATTCCCCTTGCTTTTTT240TGGCTTCCTGGCTAACATCCTGTTATTTTTTCCTGGAGGA280AAAGTGATAGATGACAACGACCACCTTTCCCAAGAGATCT320GGTTTTTCGGAGGAATATTAGGAAGCGGTGTCTTGATGAT360CTTCCCTGCGCTGGTGTTCTTGGGCCTGAAGAACAATGAC400TGCTGTGGGTGCTGCGGCAACGAGGGCTGTGGGAAGCGAT440TTGCGATGTTCACCTCCACGATATTTGCTGTGGTTGGATT480CTTGGGAGCTGGATACTCGTTTATCATCTCAGCCATTTCA520ATCAACAAGGGTCCTAAATGCCTCATGGCCAATAGTACAT560GGGGCTACCCCTTCCACGACGGGGATTATCTCAATGATGA600GGCCTTATGGAACAAGTGCCGAGAGCCTCTCAATGTGGTT640CCCTGGAATCTGACCCTCTTCTCCATCCTGCTGGTCGTAG680GAGGAATCCAGATGGTTCTCTGCGCCATCCAGGTGGTCAA720TGGCCTCCTGGGGACCCTCTGTGGGGACTGCCAGTGTTGT760GGCTGCTGTGGGGGAGATGGACCCGTTTAAACCTCCGAGA800TGAGCTGCTCAGACTCTACAGCATGACGACTACAATTTCT840TTTCATAAAACTTCTTCTCTTCTTGGAATTATTAATTCCT880ATCTGCTTCCTAGCTGATAAAGCTTAGAAAAGGCAGTTAT920TCCTTCTTTCCAACCAGCTTTGCTCGAGTTAGAATTTTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。