基因總覽
TLR2(toll like receptor 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Toll-like receptor 家族,為單次穿膜的第一型膜蛋白。其胞外區域包含多個 LRR 重複序列及 LRRCT 結構域,接續一段跨膜區;胞質端則含有 TIR 結構域。這種分區結構使 TLR2 能以胞外部分參與微生物成分的辨識,並透過胞質端連結細胞內訊號。其主要角色是參與對細菌脂蛋白及其他微生物細胞壁成分的先天免疫反應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000642700 ★ | 153,684,280–153,706,260 | 3 |
| ENST00000714431 | 153,684,050–153,708,537 | 3 |
| ENST00000714433 | 153,684,050–153,708,537 | 3 |
| ENST00000714436 | 153,684,050–153,705,452 | 4 |
| ENST00000855788 | 153,684,050–153,708,537 | 3 |
| ENST00000966792 | 153,684,050–153,708,537 | 3 |
| ENST00000966793 | 153,684,050–153,708,537 | 2 |
| ENST00000966795 | 153,684,050–153,708,537 | 4 |
| ENST00000646900 | 153,684,070–153,708,537 | 3 |
| ENST00000714432 | 153,684,070–153,708,537 | 4 |
| ENST00000260010 | 153,684,070–153,705,699 | 3 |
| ENST00000714434 | 153,684,070–153,708,537 | 3 |
顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLR2參與辨識細菌脂蛋白、脂肽及其他微生物細胞壁成分,並與LY96協同作用。它也會與TLR1或TLR6搭配辨識不同微生物脂質:例如與TLR6共同辨識支原體的MALP-2、結核分枝桿菌可溶性因子STF、phenol-soluble modulin(PSM)及伯氏疏螺旋體外表面蛋白OspA-L。對雙醯化脂肽與三醯化脂肽,TLR2分別可形成含TLR6或TLR1的受體組合,並可再與CD14、CD36等受體共同組成活化簇。
受體活化後,TLR2透過MYD88與TRAF6傳遞訊號,促使NF-kappa-B活化、細胞激素分泌及發炎反應。特定刺激也能引發MAPK訊號:在體外以結核分枝桿菌PstS1刺激單核球時,p38 MAPK與ERK1/2主要經由TLR2活化,但TLR4亦有部分參與;細菌肽聚醣引發的MAPK活化也涉及TLR2。結核分枝桿菌脂蛋白LprA、LprG、LpqH與PstS1可作為此受體的促效劑,部分脂蛋白還依賴TLR1、CD14及/或CD36等共同受體,進而調節抗原呈現細胞對病原體的反應。
不同微生物成分可引發不同的受體群集,這些群集先從細胞表面啟動訊號,之後沿脂筏依賴的途徑移向高基氏體。TLR2也參與結核分枝桿菌的正常攝取,而該過程會受該菌LppM抑制。結核分枝桿菌HSP70(dnaK)可經由TLR2刺激NF-kappa-B表現,但HSP65(groEL-2)則未見此作用。來源另指出,在小鼠中,結核分枝桿菌EsxA(ESAT-6)可被TLR2辨識並抑制下游MYD88依賴訊號;此項結果屬於相似性推論。脂蛋白的脂質部分也可能使TLR2活化免疫細胞並促進細胞凋亡。
Promoter 與基因調控
>TLR2 ENST00000642700 GRCh38 chr4:153683280-153684380 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCATATCTCACTTTGTGAAAATCAAATGTAATTATGAACATAAAAGGTAGATTATTAACATTAAGGCAGT TGAATTTTAAAAGCTTGTTTTCTTCCCTTATACATATTCCTAACCGTGGAGACAGCTAGGTTCTGTGGCA ATGAAGAAAATTGATCAATGACTGTTTTTGGTATTACTTTGGGAAGTAGGGATGGAATAGGGGCAAGGGA AGGGCTTAGCTTCAAACTGTAGACAGAAGTGGGAAGCCCAAATCTTTGCATGGTGAGAAGTGGGATGGAA TGTAGGTGCTAGAGATGGTGCACCAGTAGGGACTGTCACTGGATTGGGGAAAAAAATCCGGGGCTGTCCT TATCTGCTCCCTTAGGCAAAATCGTTCTGTGTTAGTCTGGAGGGTGAACCTATTTTAATGCAGGAGGGCA TAGACTTTTGGGTGGAAGCGGACCCTGGAGATGTACTGGCAGGTGAATAGAGTGTGGAAAAGTGGGGAAA GGAGAAGCACGATTCATGAGCCTGAGTTCGGGCTTCCATGGATGGAAAAGCATCAGGAGTGGAATTTAAA GACGGTGTGTTTCAGGTGATGTGAGGTCCTGGATGCCCGAAGCTTCAAGAAAATACTGGTTGGGCACTTA GCTTTCCCTGTGGTTGCCAATCCCACGCAGGCCGCCTCTAGCGTCTCGATTCGCTTTTCTCTGACCTGGA ACCTCCGCCAAGCCCCCAGCTCTCTTCTTCGACCCAGCCTTGCACGGGGCAGCTGTCGGGGCAGGACCCG CCTCTGGCCTGTCGCAGCCTAGCTCACGGTCAAGGGCGGGAGCCTGCTGGGAAGCACGGCCGCGGGGGCT CGCTCGGGGCCACCTGCCTGGAACTCAGCGCGAGGTCCAGAGTTCCCTCCGGCTGCGCAGCGGCGCACGT GCCCCGTGGAAGGGGCGGTTCCCGCACCCCAGAAGGAGGGGGCGCCCGGCCGCGCGGACTTTCCCTTTTG CTTACTTCCTAGTCCCGGGCAGGCCGGCTCGGAGGCAGCGAGAAAGCGCAGCCAGGCGGCTGCTCGGCGT TCTCTCAGGTGACTGCTCGGAGTTCTCCCAGGTACGTCGTGCGCTCCCCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_53C5Z4P · CTCF_binding_site · 153679610–153679631 · regulatory
ENSR4_948ZZQ · promoter · 153683812–153684290 · regulatory
ENSR4_53C5ZW3 · CTCF_binding_site · 153684217–153684238 · regulatory
ENSR4_B35HHH · enhancer · 153684291–153685243 · regulatory
· motif · 153679612–153679628 · motif
· motif · 153684152–153684166 · motif
· motif · 153684152–153684167 · motif
· motif · 153684183–153684192 · motif
· motif · 153684183–153684192 · motif
· motif · 153684219–153684235 · motif
· motif · 153687685–153687700 · motif
· motif · 153687685–153687700 · motif
· motif · 153687716–153687731 · motif
· motif · 153687716–153687731 · motif
在微生物感染情境下,巨噬細胞中的TLR2表現會受SARS-CoV-2感染誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:784 aa
TLR2蛋白長784個胺基酸,N端含訊號胜肽;胞外區位於第21至588位,包含LRR重複序列及LRRCT結構域。第589至609位為螺旋型跨膜區,胞質區延伸至C端,含第639至782位的TIR結構域。第761至778位另有ATG16L1-binding motif。TLR2屬於Toll-like receptor家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLR2是單次穿膜蛋白,位於細胞膜及吞噬體膜。 未受刺激時不位於脂筏;有微生物配體時,TLR2會逐漸累積於脂筏。 雙醯化脂蛋白促使TLR2:TLR6異源二聚體進入脂筏,三醯化脂蛋白則促使TLR2:TLR1採取相同途徑;此募集與後續移向高基氏體相關。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane;Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CXCR4P61073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYD88Q99836 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TLR1Q15399 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR10Q9BXR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR6Q9Y2C9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZG16BQ96DA0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLR2可經胞外區與LY96、TLR1及TLR6互作;刺激前似已與TLR1或TLR6形成異源二聚體,受相應配體刺激後可組成更大的寡聚體,並進一步與CD14及/或CD36形成異型關聯。其TIR結構域可結合MYD88;另有資料記載其與TICAM1、TICAM2、TIRAP、CNPY3、ATG16L1及PPP1R11互作。微生物感染時,TLR2亦與結核分枝桿菌EsxA、牛分枝桿菌MPB83及金黃色葡萄球菌蛋白SSL5互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLR2與LY96協同辨識細菌脂蛋白及其他微生物細胞壁成分,並可搭配TLR1或TLR6辨識脂蛋白與脂肽。訊號可經MYD88、TRAF6促成NF-kappa-B活化、細胞激素分泌及發炎;特定刺激亦涉及MAPK活化。其受體群集依配體而異,並參與結核分枝桿菌攝取;EsxA抑制訊號的觀察來自小鼠,屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cooperates with LY96 to mediate the innate immune response to bacterial lipoproteins and other microbial cell wall components. Cooperates with TLR1 or TLR6 to mediate the innate immune response to bacterial lipoproteins or lipopeptides. Acts via MYD88 and TRAF6, leading to NF-kappa-B activation, cytokine secretion and the inflammatory response. May also activate immune cells and promote apoptosis in response to the lipid moiety of lipoproteins. Recognizes mycoplasmal macrophage-activating lipopeptide-2kD (MALP-2), soluble tuberculosis factor (STF), phenol-soluble modulin (PSM) and B.burgdorferi outer surface protein A lipoprotein (OspA-L) cooperatively with TLR6. Stimulation of monocytes in vitro with M.tuberculosis PstS1 induces p38 MAPK and ERK1/2 activation primarily via this receptor, but also partially via TLR4. MAPK activation in response to bacterial peptidoglycan also occurs via this receptor. Acts as a receptor for M.tuberculosis lipoproteins LprA, LprG, LpqH and PstS1, some lipoproteins are dependent on other coreceptors (TLR1, CD14 and/or CD36); the lipoproteins act as agonists to modulate antigen presenting cell functions in response to the pathogen. M.tuberculosis HSP70 (dnaK) but not HSP65 (groEL-2) acts via this protein to stimulate NF-kappa-B expression. Recognizes M.tuberculosis major T-antigen EsxA (ESAT-6) which inhibits downstream MYD88-dependent signaling (shown in mouse) (By similarity). Forms activation clusters composed of several receptors depending on the ligand, these clusters trigger signaling from the cell surface and subsequently are targeted to the Golgi in a lipid-raft dependent pathway. Forms the cluster TLR2:TLR6:CD14:CD36 in response to diacylated lipopeptides and TLR2:TLR1:CD14 in response to triacylated lipopeptides. Required for normal uptake of M.tuberculosis, a process that is inhibited by M.tuberculosis LppM (By similarity) PMID 10426995 ↗ · PMID 10426996 ↗ · PMID 11441107 ↗ · PMID 15809303 ↗ · PMID 16622205 ↗ · PMID 16880211 ↗ · PMID 17889651 ↗ · PMID 19362712 ↗ · PMID 21078852 ↗ |
| 交互作用 | TLR2經胞外區與LY96、TLR1及TLR6互作,並可能在配體刺激前已與TLR1或TLR6形成異源二聚體;刺激後可組成較大的寡聚體,並與CD14及/或CD36建立異型關聯。TLR2另可結合MYD88,並與TICAM1、CNPY3、ATG16L1、PPP1R11、TICAM2及TIRAP互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with LY96, TLR1 and TLR6 (via extracellular domain). TLR2 seems to exist in heterodimers with either TLR1 or TLR6 before stimulation by the ligand. The heterodimers form bigger oligomers in response to their corresponding ligands as well as further heterotypic associations with other receptors such as CD14 and/or CD36. Binds MYD88 (via TIR domain). Interacts with TICAM1. Interacts with CNPY3 (By similarity). Interacts with ATG16L1. Interacts with PPP1R11 (By similarity). Interacts with TICAM2. Interacts with TIRAP PMID 12471095 ↗ · PMID 16880211 ↗ · PMID 17322885 ↗ · PMID 17889651 ↗ · PMID 23376921 ↗ · PMID 25385819 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TLR2與結核分枝桿菌EsxA互作。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TLR2與牛分枝桿菌MPB83互作。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TLR2與金黃色葡萄球菌蛋白SSL5互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TLR2是單次穿膜蛋白,可見於細胞膜、吞噬體膜及脂筏。未受刺激時不位於脂筏;微生物配體存在時會逐漸累積。雙醯化脂蛋白促使TLR2:TLR6異源二聚體進入脂筏,三醯化脂蛋白則對TLR2:TLR1引發相同機制,並與後續移向高基氏體有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Membrane / Single-pass type I membrane protein; Cytoplasmic vesicle, phagosome membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft; Does not reside in lipid rafts before stimulation but accumulates increasingly in the raft upon the presence of the microbial ligand. In response to diacylated lipoproteins, TLR2:TLR6 heterodimers are recruited in lipid rafts, this recruitment determines the intracellular targeting to the Golgi apparatus. Triacylated lipoproteins induce the same mechanism for TLR2:TLR1 heterodimers PMID 16880211 ↗ |
| 調控 | 在微生物感染情境下,SARS-CoV-2感染會誘導巨噬細胞中的TLR2。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGCCGGCTCGGAGGCAGCGAGAAAGCGCAGCCAGGCGGC40TGCTCGGCGTTCTCTCAGGTGACTGCTCGGAGTTCTCCCA80GTTTCTCTTTTAACAGTGTTTGGTGTTGCAAGCAGGATCC120AAAGGAGACCTATAGTGACTCCCAGGAGCTCTTAGTGACC160AAGTGAAGGTACCTGTGGGGCTCATTGTGCCCATTGCTCT200TTCACTGCTTTCAACTGGTAGTTGTGGGTTGAAGCACTGG240ACAATGCCACATACTTTGTGGATGGTGTGGGTCTTGGGGG280TCATCATCAGCCTCTCCAAGGAAGAATCCTCCAATCAGGC320TTCTCTGTCTTGTGACCGCAATGGTATCTGCAAGGGCAGC360TCAGGATCTTTAAACTCCATTCCCTCAGGGCTCACAGAAG400CTGTAAAAAGCCTTGACCTGTCCAACAACAGGATCACCTA440CATTAGCAACAGTGACCTACAGAGGTGTGTGAACCTCCAG480GCTCTGGTGCTGACATCCAATGGAATTAACACAATAGAGG520AAGATTCTTTTTCTTCCCTGGGCAGTCTTGAACATTTAGA560CTTATCCTATAATTACTTATCTAATTTATCGTCTTCCTGG600TTCAAGCCCCTTTCTTCTTTAACATTCTTAAACTTACTGG640GAAATCCTTACAAAACCCTAGGGGAAACATCTCTTTTTTC680TCATCTCACAAAATTGCAAATCCTGAGAGTGGGAAATATG720GACACCTTCACTAAGATTCAAAGAAAAGATTTTGCTGGAC760TTACCTTCCTTGAGGAACTTGAGATTGATGCTTCAGATCT800ACAGAGCTATGAGCCAAAAAGTTTGAAGTCAATTCAGAAT840GTAAGTCATCTGATCCTTCATATGAAGCAGCATATTTTAC880TGCTGGAGATTTTTGTAGATGTTACAAGTTCCGTGGAATG920TTTGGAACTGCGAGATACTGATTTGGACACTTTCCATTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。